Chọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn duroc bằng phương pháp blup kết hợp gen h fabp

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ NÔNG NGHIỆP VÀ PTNT VIỆN CHĂN NUÔI -🙞🙞🙞🙞🙞 - NGUYỄN VĂN HỢP CHỌN LỌC NÂNG CAO TỶ LỆ MỠ GIẮT CỦA LỢN DUROC BẰNG PHƯƠNG PHÁP BLUP KẾT HỢP GEN H-FABP LUẬN ÁN TIẾN SĨ HÀ NỘI, 2023 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ NÔNG NGHIỆP VÀ PTNT VIỆN CHĂN NUÔI -🙞🙞🙞🙞🙞 - NGUYỄN VĂN HỢP CHỌN LỌC NÂNG CAO TỶ LỆ MỠ GIẮT CỦA LỢN DUROC BẰNG PHƯƠNG PHÁP BLUP KẾT HỢP GEN H-FABP Ngành: Di truyền chọn giống vật nuôi Mã số: 9.62.01.08 LUẬN ÁN TIẾN SĨ NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: TS Nguyễn Hữu Tỉnh PGS.TS Ngô Thị Kim Cúc HÀ NỘI, 2023 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu khoa học tơi, kết nghiên cứu trình bày luận án trung thực khách quan nghiên cứu có hợp tác cán nghiên cứu khoa học thuộc Phân viện Chăn nuôi Nam chưa bảo vệ học vị Mọi giúp đỡ trình thực luận án cảm ơn thơng tin trích dẫn luận án rõ nguồn gốc tham khảo Tác giả luận án Nguyễn Văn Hợp LỜI CẢM ƠN Để hoàn thành luận án này, trước hết, xin trân thành cảm ơn Ban giám đốc, Phòng Khoa học, Đào tạo Hợp tác quốc tế Viện chăn nuôi, Phân Viện Chăn nuôi Nam hỗ trợ tạo điều kiện tốt suốt thời gian học tập, nghiên cứu hồn thành luận án Tơi xin bày tỏ lịng kính trọng biết ơn sâu sắc TS Nguyễn Hữu Tỉnh, PGS.TS Ngô Thị Kim Cúc tận tình hướng dẫn, đưa nhiều đóng góp q báu, dành nhiều thời gian cơng sức tạo điều kiện cho tơi suốt q trình học tập thực đề tài Vượt qua khó khăn suốt q trình nghiên cứu hồn thành luận án, thực ghi nhận nhiều hỗ trợ xin gửi lời cảm ơn chân thành tới Ban giám đốc, cán viên chức Trung tâm Nghiên cứu Phát triển Chăn ni heo Bình Thắng tạo điều kiện thuận lợi chuồng trại, đàn giống, máy móc thiết bị chọn giống; cán khoa học Bộ môn Công nghệ Sinh học Vi sinh đồng hành chia sẻ chuyên môn thời triển khai nghiên cứu luận án Ngoài ra, nhận hỗ trợ động viên bạn bè, đồng nghiệp gia đình suốt trình nghiên cứu luận án Xin chân thành cảm ơn tất hỗ trợ Tác giả luận án Nguyễn Văn Hợp ii MỤC LỤC LỜI CAM ĐOAN iii LỜI CẢM ƠN ii MỤC LỤC iii DANH MỤC CÁC TỪ VIẾT TẮT viii DANH MỤC CÁC BẢNG x DANH MỤC CÁC HÌNH VÀ BIỂU ĐỒ xiii MỞ ĐẦU 1.1 Tính cấp thiết 1.2 Mục tiêu nghiên cứu 1.3 Những đóng góp đề tài 1.4 Ý nghĩa khoa học ý nghĩa thực tiễn 1.4.1 Ý nghĩa khoa học 1.4.2 Ý nghĩa thực tiễn CHƯƠNG TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Cơ sở sinh lý di truyền tính trạng mỡ giắt thịt lợn 1.1.1 Cơ sở sinh lý tính trạng mỡ giắt 1.1.2 Cơ sở di truyền tính trạng mỡ giắt 10 1.1.2.1 Khả di truyền tính trạng mỡ giắt 10 1.1.2.2 Tương quan di truyền tính trạng mỡ giắt tính trạng khác lợn 12 1.1.2.3 Cơ sở phân tử tính trạng mỡ giắt 15 1.1.3 Một số hướng tiếp cận cải thiện hàm lượng mỡ giắt lợn 18 1.1.3.1 Hướng tiếp cận di truyền số lượng 18 1.1.3.2 Hướng tiếp cận di truyền phân tử 18 1.2 Tổng quan nghiên cứu nước nước 19 1.2.1 Các nghiên cứu nước 19 1.2.1.1 Ảnh hưởng mỡ giắt đến chất lượng thịt lợn 19 iii 1.2.1.2 Ảnh hưởng giống đến tính trạng mỡ giắt lợn 21 1.2.1.3 Ứng dụng di truyền phân tử chọn lọc mỡ giắt lợn 25 1.2.1.4 Gen H-FABP liên kết với tính trạng mỡ giắt lợn 26 1.2.1.5 Một số tiến di truyền chọn lọc tính trạng mỡ giắt lợn 30 1.2.2.2 Ứng dụng di truyền phân tử cải thiện tỷ lệ mỡ giắt tính trạng liên quan giống lợn Duroc Việt nam 35 1.3 Luận giải cách tiếp cận vấn đề nghiên cứu 39 CHƯƠNG VẬT LIỆU, NỘI DUNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 42 2.1 Thời gian địa điểm nghiên cứu 42 2.2 Vật liệu nghiên cứu 42 2.3 Nội dung nghiên cứu 44 2.3.1 Nội dung 1: Đánh giá khả di truyền tương quan di truyền tính trạng mỡ giắt với tuổi đạt khối lượng 100 kg dày mỡ lưng lợn Duroc 44 2.3.2 Nội dung 2: Phân tích đa hình gen H-FABP liên kết với tỷ lệ mỡ giắt, tuổi đạt khối lượng 100 kg, dày mỡ lưng dày thăn thịt lợn Duroc 44 2.3.3 Nội dung 3: Đánh giá chọn lọc đàn lợn Duroc hạt nhân dựa số đực cuối TSI kết hợp với kiểu gen H-FABP 45 2.3.4 Nội dung 4: Khảo sát suất thịt tỷ lệ mỡ giắt đàn lợn thương phẩm sử dụng đực Duroc có tỷ lệ mỡ giắt khác 45 2.4 Phương pháp nghiên cứu 45 2.4.1 Phương pháp thu thập liệu giai đoạn 2011 - 2016 45 2.4.2 Phương pháp kiểm tra suất cá thể hậu bị 46 2.4.2.1 Kiểm tra suất cá thể hậu bị 46 2.4.2.2 Phương pháp hiệu chỉnh số liệu 47 2.4.3 Thu thập mẫu máu phân tích kiểu gen H-FABP 48 2.4.3.1 Phương pháp thu thập mẫu máu 48 iv 2.4.3.2 Chiết tách DNA từ mẫu máu lợn 49 2.4.3.3 Quy trình PCR-RFLP 49 2.4.4 Phương pháp thiết lập đàn hạt nhân 50 2.4.5 Phương pháp khảo sát lợn thương phẩm 52 2.4.5.1 Thiết kế thí nghiệm 52 2.4.5.2 Chăm sóc ni dưỡng 53 2.4.5.3 Các tiêu theo dõi 53 2.5 Phương pháp xử lý số liệu 54 2.5.1 Ước tính thơng số di truyền giá trị giống tính trạng mỡ giắt, dày mỡ lưng tuổi đạt khối lượng 100 kg 54 2.5.2 Đa hình gen H-FABP 54 2.5.2.1 Xác định tần số kiểu gen H-FABP 54 2.5.2.2 Xác định mối liên kết đa hình kiểu gen H-FABP với tính trạng mỡ giắt, dày mỡ lưng tuổi đạt khối lượng 100 kg 55 2.5.2.3 Ước tính ảnh hưởng cộng gộp ảnh hưởng trội 56 2.5.3 Ước tính khuynh hướng di truyền 56 2.5.4 So sánh tiêu suất thịt tổ hợp lai thương phẩm 57 CHƯƠNG KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 58 3.1 Khả di truyền tương quan di truyền tính trạng mỡ giắt với tuổi đạt khối lượng 100 kg dày mỡ lưng lợn Duroc 58 3.1.1 Ảnh hưởng yếu tố cố định mơ hình thống kê phân tích di truyền tính trạng suất 58 3.1.2 Thành phần phương sai hệ số di truyền tính trạng mỡ giắt, dày mỡ lưng tuổi đạt khối lượng 100 kg 60 3.1.3 Tương quan di truyền tính trạng mỡ giắt với dày mỡ lưng tuổi đạt khối lượng 100 kg 62 3.1.4 Giá trị giống tính trạng chọn lọc lợn Duroc hệ xuất phát 64 v 3.2 Đa hình gen H-FABP liên kết với tỷ lệ mỡ giắt, tuổi đạt khối lượng 100 kg, dày mỡ lưng dày thăn thịt lợn Duroc 66 3.2.1 Kiểu gen H-FABP ba vị trí đa hình với enzyme cắt HaeIII, MspI, HinfI 66 3.2.2 Tần số kiểu gen H-FABP ba vị trí đa hình HaeIII, MspI HinfI 67 3.2.3 Mối liên kết đa hình gen H-FABP ảnh hưởng cộng gộp, ảnh hưởng trội đến tính trạng nghiên cứu 74 3.2.3.1 Ảnh hưởng kiểu gen H-FABP đến tính trạng nghiên cứu 74 3.2.3.2 Mối liên kết đa hình gen H-FABP/HaeIII ảnh hưởng cộng gộp, ảnh hưởng trội đến tính trạng nghiên cứu 75 3.2.3.3 Mối liên kết đa hình gen H-FABP/MspI ảnh hưởng cộng gộp, ảnh hưởng trội đến tính trạng nghiên cứu 76 3.2.3.4 Mối liên kết đa hình gen H-FABP/HinfI ảnh hưởng cộng gộp, ảnh hưởng trội đến tính trạng nghiên cứu 78 3.2.4 Mối liên kết kiểu gen H-FABP kết hợp vị trí đa hình HaeIII, MspI HinfI với tính trạng nghiên cứu 81 3.2.4.1 Ảnh hưởng gen H-FABP kết hợp vị trí đa hình đến tính trạng nghiên cứu 81 3.2.4.2 Mối liên kết kiểu gen H-FABP kết hợp hai vị trí đa hình HaeIII HinfI với tính trạng nghiên cứu 82 3.2.4.3 Mối liên kết kiểu gen H-FABP kết hợp hai vị trí đa hình MspI HinfI với tính trạng nghiên cứu 83 3.2.4.4 Mối liên kết kiểu gen kết hợp hai vị trí đa hình H-FABP/MspI H-FABP/HinfI với tính trạng nghiên cứu 85 3.2.4.5 Mối liên kết kiểu gen H-FABP kết hợp ba vị trí đa hình HaeIII, MspI HinfI với tính trạng nghiên cứu 86 3.3 Kết chọn lọc đàn lợn giống Duroc 89 vi 3.3.1 Kết chọn lọc đàn hạt nhân Duroc hệ xuất phát 89 3.3.2 Năng suất đàn lợn Duroc chọn lọc qua hệ 91 3.3.3 Mức độ ổn định di truyền tính trạng chọn lọc qua ba hệ 94 3.3.4 Khuynh hướng di truyền tính trạng chọn lọc lợn Duroc 97 3.3.4.1 Khuynh hướng di truyền tính trạng mỡ giắt 97 3.3.4.2 Khuynh hướng di truyền tính trạng dày mỡ lưng 99 3.3.4.3 Khuynh hướng di truyền tính trạng tuổi đạt khối lượng 100kg 100 3.3.4.4 Khuynh hướng di truyền số chọn lọc .101 3.4 Ảnh hưởng đực Duroc có tỷ lệ mỡ giắt khác đến số tính trạng suất đàn lợn thương phẩm 102 3.4.1 Mức độ ảnh hưởng đực Duroc có tỷ lệ mỡ giắt khác tính biệt đến tính trạng khảo sát lợn thương phẩm 102 3.4.2 Ảnh hưởng đực Duroc có tỷ lệ mỡ giắt khác đến tiêu khảo sát đàn lợn thương phẩm .104 Chương KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ 111 4.1 Kết luận 111 4.2 Đề nghị .112 TÀI LIỆU THAM KHẢO .113 PHỤ LỤC .133 Một số biểu mẫu thu thập liệu 133 Một số hình ảnh đề tài 134 vii DANH MỤC CÁC TỪ VIẾT TẮT BLUP Best Linear Unbiased Prediction: Phương pháp phân tích dự đốn tuyến tính khơng thiên vị tốt CS Cộng D(LY) Duroc x (Landrace x Yorkshire) D(YL) Duroc x (Yorkshire x Landrace) DNA Deoxyribonucleic Acid DML Dày mỡ lưng DT Dày thăn thịt EBV Estimated Breeding Value – Giá trị giống FAT Fatty – acid translocase: Enzyme chuyển chất béo FFA Free Fatty Acids – axít béo tự GGP Great Grand Parents: Cụ kị GP Grand Parents: Ông bà GTG Giá trị giống h2 Hệ số di truyền He Hệ số dị hợp mong đợi H-FABP Gen Heart Fatty Acid-Binding Protein HYS Herd Year Season - Đàn x Năm x mùa vụ IMF Intramuscular Fat: Mỡ giắt MG Mỡ giắt Mean Giá trị trung bình LPL Enzyme lipoprotein lipase LY Landrace x Yorkshire P Probability value: Giá trị xác suất PIP Porcine Intramuscular Preadipocyte line vii i Yang, J and Ji, J 2020 A large-scale comparison of meat quality and intramuscular fatty acid composition among three Chinese indigenous pig breeds Meat Science 108182 Hwang, Y.-H., Lee, S.-J., Lee, E.-Y and Joo, S.-T 2020 Effects of carcass weight increase on meat quality and sensory properties of pork loin Journal of Animal Science and Technology 62: 753 Ishii, K., Arata, S., Ohnishi, C., Livestock, N., Livestock, N and Station, M Estimates of genetic parameters for meat quality and carcass traits in Duroc pigs Proceedings of the World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Auckland, New Zealand, 2018 11-16 Jankowiak, H., Bocian, M and Barczak, J 2018 The effect of intramuscular fat content on the meat quality of PLW X PL pigs Italian Journal of Food Science 31: 87 - 97 Jankowiak, H., Sielska, N., Kapelański, W., Bocian, M and Zmudzińska, A 2010 The effect of H-FABP gene polymorphism on carcass and meat quality in the Polish native Złotnicka Spotted pig Journal of Central European Agriculture 11: 459-464 Jiao, S., Maltecca, C., Gray, K and Cassady, J 2014a Feed intake, average daily gain, feed efficiency, and real-time ultrasound traits in Duroc pigs: I Genetic parameter estimation and accuracy of genomic prediction Journal of animal science 92: 2377-2386 Jiao, S., Maltecca, C., Gray, K A and Cassady, J P 2014b Feed intake, average daily gain, feed efficiency, and real-time ultrasound traits in Duroc pigs: II Genomewide association J Anim Sci 92: 2846-60 Jung, J H., Shim, K S., Na, C S and Choe, H S 2015 Studies on Intramuscular Fat Percentage in Live Swine Using Real-time Ultrasound to Determine Pork Quality Asian-Australas J Anim Sci 28: 318-22 Kim, J.-M., Lee, S.-H and Ryu, Y.-C 2018a Comparisons of meat quality and muscle fiber characteristics on multiple pig breeds and sexes using principal component analysis Animal Production Science 58: 2091-2099 Kim, J A., Cho, E S., Jeong, Y D., Choi, Y H., Kim, Y S., Woo Choi, J., Kim, J S., Jang, A., Hong, J K and Sa, S J 2020 The effects of breed and gender on meat quality of Duroc, Pietrain, and their crossbred Journal of animal science and technology 62: 1540 - 1547 Kim, Y M., Choi, T J., Cho, K H., Cho, E S., Lee, J J., Chung, H J., Baek, S Y and Jeong, Y D 2018b Effects of sex and breed on meat quality and sensory properties in three-way crossbred pigs sired by Duroc or by a synthetic breed based on a Korean native breed Korean journal for food science of animal resources 38: 543 - 553 Kováčik, A., Bulla, J., Trakovická, A., Žitný, J., Kročková, J and Navrátilová, A 122 2013 The association of heart fatty acid binding protein gene polymorphism on selected production traits in pigs Scientific Papers Animal Science and Biotechnologies 46: 74-78 Kováčik, A., Bulla, J., Trakovická, A., Žitný, J and Lieskovská, Z 2011 Association of H-FABP (HinfI) Gene with Carcass and Meat Quality Characteristics in Pigs Scientific Papers Animal Science and Biotechnologies 44: 263-266 Kowalski, E., Vossen, E., Millet, S., Ampe, B., Callens, B., Van Royen, G., De Smet, S and Aluwé, M 2020 Performance and carcass, loin and ham quality in crossbreds from three terminal sire lines Meat science 167: 108158 Kyriazakis, I and Whittemore, C T 2006 Carcass yield: killing-out percentage Whittemore’s Science and Practice of Pig Production Blackwell Publishing Lee, S.-H., Park, E.-W., Cho, Y.-M., Kim, S.-K., Lee, J.-H., Jeon, J.-T., Lee, C.S., Im, S.-K., Oh, S.-J and Thompson, J 2007 Identification of differentially expressed genes related to intramuscular fat development in the early and late fattening stages of hanwoo steers BMB Reports 40: 757764 Lee, S., Choi, Y., Choe, J., Kim, J., Hong, K C., Park, H and Kim, B.-C 2010 Association between polymorphisms of the heart fatty acid binding protein gene and intramuscular fat content, fatty acid composition, and meat quality in Berkshire breed Meat science 86: 794-800 Lee, Y E., Lee, H J., Kim, M., Yoon, J W., Ryu, M and Jo, C 2021 Analysis on difference of consumer’s evaluation on visual features of pork cuts Journal of Animal Science and Technology 63: 614 - 625 Lei, X., Qin, J.-T., Lin, R., Cui, D.-S., Xi, T., Xiao, S.-J., Zhang, Z.-Y and Huang, L.-S 2022 Effects of carcass weight, sex and breed composition on meat cuts and carcass traits in finishing pigs Journal of Integrative Agriculture 22(5), 1489-1501 Lertpatarakomol, R., Chaosap, C., Chaweewan, K., Sitthigripong, R and Limsupavanich, R 2019 Carcass characteristics and meat quality of purebred Pakchong and crossbred pigs sired by Pakchong or Duroc boar Asian-Australasian journal of animal sciences 32: 585 - 591 Li, B., Zerby, H and Lee, K 2007 Heart fatty acid binding protein is upregulated during porcine adipocyte development Journal of animal science 85: 16511659 Li, M., Zhu, L., Li, X., Shuai, S., Teng, X., Xiao, H., Li, Q., Chen, L., Guo, Y and Wang, J 2008 Expression profiling analysis for genes related to meat quality and carcass traits during postnatal development of backfat in two 123 pig breeds Science in China Series C: Life Sciences 51: 718-733 Lo, L L., Lin, N C., Huang, M C., Lin, R S., Tsou, H L., Huang, S Y., Wang, P H., Huang, T H., Lin, H S and Ju, C C Growth, ultrasound, carcass, meat quality traits, and molecular marker in Duroc and Landrace boars in Taiwan The asian-australasian association of animal production societies, 22-26/9/2008 2008 Hanoi, Vietnam Lonergan, S M., Topel, D G and Marple, D N 2019 Chapter - Fat and fat cells in domestic animals In: LONERGAN, S M., TOPEL, D G.vàMARPLE, D N (eds.) The Science of Animal Growth and Meat Technology (Second Edition) Academic Press Lopez, B I., Seo, K S., Viterbo, V and Song, C W 2019 Estimation of genetic parameters and accuracy of genomic prediction for production traits in Duroc pigs Czech Journal of Animal Science 64: 160-165 Lowell, J E., Schunke, E D., Harsh, B N., Bryan, E E., Overholt, M F., Stahl, C A., Dilger, A C and Boler, D D 2018 Correlation comparisons among early postmortem loin quality and aged loin and pork chop quality characteristics between finishing pigs from either Duroc or Pietrain sires Journal of animal science 96: 4644-4657 Malek, M., Dekkers, J C., Lee, H K., Baas, T J., Prusa, K., Huff-Lonergan, E and Rothschild, M F 2001 A molecular genome scan analysis to identify chromosomal regions influencing economic traits in the pig II Meat and muscle composition Mammalian Genome 12: 637-645 Malgwi, I H., Giannuzzi, D., Gallo, L., Halas, V., Carnier, P and Schiavon, S 2022 Influence of slaughter weight and sex on growth performance, carcass characteristics and Ham traits of Heavy pigs fed ad-libitum Animals 12(215): 1-16 Mathur, P., Liu, Y and Muir, W 2010 Integration of molecular genetics in selection programs for swine [Online] Available: http://www.ccsi.ca/reports/reports_2003/molecular_genetics.pdf Meadus, W., Duff, P., Juarez, M., Roberts, J and Zantinge, J 2018 Identification of Marbling Gene Loci in Commercial Pigs in Canadian Herds Agriculture (122): 1-9 Mikolášová, R and Urban, T 2014 Variability in the leptin, leptin receptor and heart fatty acid binding protein genes in relationship with meat quality traits in pigs Acta Universitatis Agriculturae et Silviculturae Mendelianae Brunensis 53: 87-94 Mikule, V 2020 Traits of Carcass Value in Duroc Pig Breed Depending on Sex Acta Universitatis Agriculturae et Silviculturae Mendelianae Brunensis 68: 329-334 Munoz, M., Rodriguez, M C., Alves, E., Folch, J M., Ibanez-Escriche, N., Silio, 124 L and Fernandez, A I 2013 Genome-wide analysis of porcine backfat and intramuscular fat fatty acid composition using high-density genotyping and expression data BMC Genomics 14: 1-15 Nakev, J and Popova, T 2020 Quality of meat in purebred pigs involved in crossbreeding schemes I Chemical composition and quality characteristics of m Longissimus thoracis Duroc Bulgarian Journal of Agricultural Science 26: 894-898 Nechtelberger, D., Pires, V., Söolknet, J., Stur, I., Brem, G., Mueller, M and Mueller, S 2001 Intramuscular fat content and genetic variants at fatty acid-binding protein loci in Austrian pigs Journal of animal science 79: 2798-2804 Nei, M 1978 Estimation of average heterozygosity and genetic distance from a small number of individuals Genetics 89: 583-590 Noidad, S., Limsupavanich, R., Suwonsichon, S and Chaosap, C 2019 Effect of visual marbling levels in pork loins on meat quality and Thai consumer acceptance and purchase intent Asian-Australasian Journal of Animal Sciences 32: 1923-1932 Ogawa, S., Kimata, M., Tomiyama, M and Satoh, M 2022 Heritability and genetic correlation estimates of semen production traits with litter traits and pork production traits in purebred Duroc pigs Journal of animal science 100: 1-10 Oh, S.-H., Lee, C Y., Song, D.-H., Kim, H.-W., Jin, S K and Song, Y.-M 2022 Effects of the slaughter weight of non-lean finishing pigs on their carcass characteristics and meat quality Journal of Animal Science and Technology 64: 353 - 364 Ohnishi, C and Satoh, M 2018 Estimation of genetic parameters for performance and body measurement traits in Duroc pigs selected for average daily gain, loin muscle area, and backfat thickness Livestock science 214: 161-166 Óvilo, C., Fernández, A., Noguera, J., Barragán, C., Letón, R., Rodríguez, C., Mercadé, A., Alves, E., Folch, J and Varona, L 2005 Fine mapping of porcine chromosome QTL and LEPR effects on body composition in multiple generations of an Iberian by Landrace intercross Genetics Research 85: 57-67 Óvilo, C., Oliver, A., Noguera, J L., Clop, A., Barragán, C., Varona, L., Rodríguez, C., Toro, M., Sánchez, A and Pérez-Enciso, M 2002 Test for positional candidate genes for body composition on pig chromosome Genetics Selection Evolution 34: 465-479 Pang, W.-J., Bai, L and Yang, G.-S 2006 Relationship Among H-FABP Gene Polymorphism, Intramuscular Fat Content, and Adipocyte Lipid Droplet Content in Main Pig Breeds with Different Genotypes in Western China 125 Acta Genetica Sinica 33: 515-524 Paszek, A., Wilkie, P., Flickinger, G., Miller, L M., Louis, C., Rohrer, G., Alexander, L., Beattie, C and Schook, L B 2001 Interval mapping of carcass and meat quality traits in a divergent swine cross Animal Biotechnology 12: 155-165 Patthararangsarith, P 2020 Effects of heart fatty acid binding protein (H-FABP) gene, housing system and sex on carcass and meat quality of commercial crossbred pigs International Journal of Agricultural Technology 16: 97108 Pérez-Enciso, M., Clop, A., Folch, J M., Sánchez, A., Oliver, M A., Ovilo, C., Barragan, C., Varona, L and Noguera, J L 2002 Exploring alternative models for sex-linked quantitative trait loci in outbred populations: Application to an Iberian× Landrace pig intercross Genetics 161: 16251632 Piórkowska, K., Małopolska, M., Ropka-Molik, K., Szyndler-Nędza, M., Wiechniak, A., Żukowski, K., Lambert, B and Tyra, M 2020a Evaluation of SCD, ACACA and FASN Mutations: Effects on Pork Quality and Other Production Traits in Pigs Selected Based on RNA-Seq Results Animals 10: 1-16 Piórkowska, K., Ropka-Molik, K., Szmatoła, T., Zygmunt, K and Tyra, M 2014 Association of a new mobile element in predicted promoter region of ATPbinding cassette transporter 12 gene (ABCA12) with pig production traits Livestock Science 168: 38-44 Piórkowska, K., Tyra, M., Ropka-Molik, K and Podbielska, A 2017 Evolution of peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase (PECR) as candidate gene for meat quality Livestock Science 201: 85-91 Piórkowska, K., Tyra, M., Żukowski, K and Ropka-Molik, K 2020b The ssc15 qtl-rich region mutations affecting intramuscular fat and production traits in pigs Annals of Animal Science 1: 425-444 Piórkowska, K., Żukowski, K., Ropka-Molik, K and Tyra, M 2018 Deep sequencing of a QTL-rich region spanning 128-136Mbp of pig chromosome 15 Gene 647: 268-275 Poklukar, K., Čandek-Potokar, M., Batorek Lukač, N., Tomažin, U and Škrlep, M 2020 Lipid Deposition and Metabolism in Local and Modern Pig Breeds: A Review Animals 10: 1-20 Põldvere, A., Tanavots, A., Saar, R., Torga, T., Kaart, T., Soidla, R., Mahla, T., Andreson, H and Lepsalu, L 2015 Effect of imported Duroc boars on meat quality of finishing pigs in Estonia Agron Res 13: 1040-1052 Pugliese, C and Sirtori, F 2012 Quality of meat and meat products produced from southern European pig breeds Meat science 90: 511-518 126 Puig-Oliveras, A., Revilla, M., Castelló, A., Fernández, A I., Folch, J M and Ballester, M 2016 Expression-based GWAS identifies variants, gene interactions and key regulators affecting intramuscular fatty acid content and composition in porcine meat Scientific reports 6: 1-12 Purslow, P P 2017 New aspects of meat quality: From genes to ethics Woodhead Publishing Quintanilla, R., Pena, R N., Gallardo, D., Cánovas, A., Ramírez, O., Díaz, I., Noguera, J L and Amills, M 2011 Porcine intramuscular fat content and composition are regulated by quantitative trait loci with muscle-specific effects Journal of animal science 89: 2963-2971 Razmaitė, V., Juška, R., Leikus, R and Jatkauskienė, V 2021 Pork quality of two Lithuanian breeds: Effects of breed, gender and feeding regimen Animals 11: 1-16 Redinger, R N 2008 The physiology of adiposity The Journal of the Kentucky Medical Association 106: 53-62 Reixach, J and Estany, J Genetic parameters for intramuscular oleic fatty acid content in a Duroc line 9th world congress on genetics applied to livestock production, 2010 German Society for Animal Science Leipzig, Germany, Rincker, P J., Killefer, J., Ellis, M., Brewer, M S and Mckeith, F K 2008 Intramuscular fat content has little influence on the eating quality of fresh pork loin chops J Anim Sci 86: 730-737 Rohrer, G., Thallman, R., Shackelford, S., Wheeler, T and Koohmaraie, M 2006 A genome scan for loci affecting pork quality in a Duroc–Landrace F2 population Animal genetics 37: 17-27 Ros-Freixedes, R., Gol, S., Pena, R N., Tor, M., Ibanez-Escriche, N., Dekkers, J C and Estany, J 2016 Genome-Wide Association Study Singles Out SCD and LEPR as the Two Main Loci Influencing Intramuscular Fat Content and Fatty Acid Composition in Duroc Pigs PLoS One 11: 1-18 Ros-Freixedes, R., Reixach, J., Bosch, L., Tor, M and Estany, J 2013 Response to selection for decreased backfat thickness at restrained intramuscular fat content in Duroc pigs Journal of Animal Science 91: 3514-3521 Ros-Freixedes, R., Reixach, J., Bosch, L., Tor, M and Estany, J 2014 Genetic correlations of intramuscular fat content and fatty acid composition among muscles and with subcutaneous fat in Duroc pigs Journal of Animal Science 92: 5417-5425 Ros Freixedes, R 2014 Genetic analysis and selection for intramuscular fat and oleic acid content in pigs Universitat de Lleida Rybarczyk, A., Moroch, R and Polasik, D 2018 The effect of DanAvl Duroc and Pulawska boars in crossbred with DanAvl Hybrid on meat quality of finishing pigs Agricultural and Food Science 27: 159–167-159–167 127 Samulin, J., Berget, I., Lien, S and Sundvold, H 2008 Differential gene expression of fatty acid binding proteins during porcine adipogenesis Comparative Biochemistry and Physiology Part B: Biochemistry and Molecular Biology 151: 147-152 Sanchez, M.-P., Iannuccelli, N., Basso, B., Bidanel, J.-P., Billon, Y., Gandemer, G., Gilbert, H., Larzul, C., Legault, C and Riquet, J 2007 Identification of QTL with effects on intramuscular fat content and fatty acid composition in a Duroc× Large White cross BMC genetics 8: 1-9 Sanosaka, M., Minashima, T., Suzuki, K., Watanabe, K., Ohwada, S., Hagino, A., Rose, M T., Yamaguchi, T and Aso, H 2008 A combination of octanoate and oleate promotes in vitro differentiation of porcine intramuscular adipocytes Comparative Biochemistry and Physiology Part B: Biochemistry and Molecular Biology 149: 285-292 Sarri, L., Balcells, J., Seradj, A R., Pena, R N., Ramírez, G A., Tor, M and De La Fuente, G 2022 Age Evolution of Lipid Accretion Rate in Boars Selected for Lean Meat and Duroc Barrows Animals 12: 1-15 Sato, S., Hasebe, H., Sato, S., Asahi, Y., Hayashi, T., Kobayashi, E and Sugimoto, Y 2006 High‐resolution physical mapping and construction of a porcine contig spanning the intramuscular fat content QTL Animal genetics 37: 113-120 Sato, S., Oyamada, Y., Atsuji, K., Nade, T., Sato, S.-I., Kobayashi, E., Mitsuhashi, T., Nirasawa, K., Komatsuda, A and Saito, Y 2003 Quantitative trait loci analysis for growth and carcass traits in a Meishan× Duroc F2 resource population Journal of Animal Science 81: 2938-2949 Sato, S., Uemoto, Y., Kikuchi, T., Egawa, S., Kohira, K., Saito, T., Sakuma, H., Miyashita, S., Arata, S and Suzuki, K 2017 Genome‐wide association studies reveal additional related loci for fatty acid composition in a Duroc pig multigenerational population Animal Science Journal 88: 1482-1490 Schwab, C., Baas, T and Stalder, K 2010 Results from six generations of selection for intramuscular fat in Duroc swine using real-time ultrasound II Genetic parameters and trends Journal of animal science 88: 69-79 Schwab, C., Baas, T., Stalder, K and Nettleton, D 2009a Results from six generations of selection for intramuscular fat in Duroc swine using realtime ultrasound I Direct and correlated phenotypic responses to selection Journal of animal science 87: 2774-2780 Schwab, C R., Baas, T J., Stalder, K J and Nettleton, D 2009b Results from six generations of selection for intramuscular fat in Duroc swine using realtime ultrasound I Direct and correlated phenotypic responses to selection J Anim Sci 87: 2774-2780 Schwab, C R., Baas, T J., Stalder, K J and Nettleton, D 2009c Results from six 128 generations of selection for intramuscular fat in Duroc swine using realtime ultrasound I Direct and correlated phenotypic responses to selection J Anim Sci 87: 2774-2780 Schwab, C R., Mote, B E., Du, Z Q., Amoako, R., Baas, T J and Rothschild, M F 2009d An evaluation of four candidate genes for use in selection programmes aimed at increased intramuscular fat in Duroc swine J Anim Breed Genet 126: 228-236 Schworer, D., Hofer, A., Lorenz, D and Rebsamen, A 2000 Selection progress of intramuscular fat in Swiss pig production PUBLICATIONEUROPEAN ASSOCIATION FOR ANIMAL PRODUCTION 100: 6972 Shi-Zheng, G and Su-Mei, Z 2009 Physiology, affecting factors and strategies for control of pig meat intramuscular fat Recent Patents on Food, Nutrition & Agriculture 1: 59-74 Sirtori, F., Crovetti, A., Zilio, D M., Pugliese, C., Acciaioli, A., Campodoni, G., Bozzi, R and Franci, O 2011 Effect of sire breed and rearing system on growth, carcass composition and meat traits of Cinta Senese crossbred pigs Italian Journal of Animal Science 10: 188-194 Sládek, L and Dračková, E 2020 The Effect of Genotype, Sex and Intramuscular Fat Content on the Colour of Pork Acta Universitatis Agriculturae et Silviculturae Mendelianae Brunensis 68: 101-108 Smathers, R L and Petersen, D R 2011 The human fatty acid-binding protein family: evolutionary divergences and functions Human genomics 5: 1-22 Soares, M H., De Amorim Rodrigues, G., Júnior, D T V., Da Silva, C B., Costa, T C., De Souza Duarte, M and Saraiva, A 2022 Performance, Carcass Traits, Pork Quality and Expression of Genes Related to Intramuscular Fat Metabolism of Two Diverse Genetic Lines of Pigs Foods 11: 1-11 Solanes, F X., Reixach, J., Tor, M., Tibau, J and Estany, J 2009 Genetic correlations and expected response for intramuscular fat content in a Duroc pig line Livestock Science 123: 63-69 Su, Y., Xiong, Y., Jiang, S., Zhang, Q., Lei, M., Zheng, R and Deng, C 2004 Mapping quantitative trait loci for meat quality trait in a Large White x Meishan cross Yi chuan xue bao= Acta genetica Sinica 31: 132-136 Suzuki, K., Irie, M., Kadowaki, H., Shibata, T., Kumagai, M and Nishida, A 2005a Genetic parameter estimates of meat quality traits in Duroc pigs selected for average daily gain, longissimus muscle area, backfat thickness, and intramuscular fat content Journal of Animal Science 83: 2058-2065 Suzuki, K., Kadowaki, H., Shibata, T., Uchida, H and Nishida, A 2005b Selection for daily gain, loin-eye area, backfat thickness and intramuscular fat based on desired gains over seven generations of Duroc pigs Livestock 129 Production Science 97: 193-202 Szulc, K., Nowaczewski, S., Skrzypczak, E and Szyndler-Nędza, M 2018 Effect of slaughter weight and sex on slaughter traits and meat quality of Polish autochthonous ZLotnicka Spotted pigs crossbred with Duroc Annals of animal science 18: 225-237 Szyda, J., Grindflek, E., Liu, Z and Lien, S 2003 Multivariate mixed inheritance models for QTL detection on porcine chromosome Genetics Research 81: 65-73 Te Pas, M F., Madsen, O., Calus, M P and Smits, M A 2017 The importance of endophenotypes to evaluate the relationship between genotype and external phenotype International journal of molecular sciences 18: 1-22 Tinh, N H., Van Hop, N., Anh, N T L., Linh, N T and Bui, A P N 2021 Polymorphisms of Candidate Genes Associated with Growth and Carcass Traits in Canadian Duroc Pigs Indian Journal of Animal Research 1: Tomović, V M., Šević, R., Jokanović, M., Šojić, B., Škaljac, S., Tasić, T., Ikonić, P., Lušnic Polak, M., Polak, T and Demšar, L 2016 Quality traits of longissimus lumborum muscle from White Mangalica, Duroc× White Mangalica and Large White pigs reared under intensive conditions and slaughtered at 150 kg live weight: a comparative study Archives Animal Breeding 59: 401-415 Tongsuk, K., Sivapirunthep, P and Chaosap, C 2020a Influence of Duroc sire lines on carcass and meat quality traits of commercial crossbred pigs Technology 16: 1287-1294 Tongsuk, K., Sivapirunthep, P and Chaosap, C 2020b Influence of Duroc sire lines on carcass and meat quality traits of commercial crossbred pigs International Journal of Agricultural Technology 16: 1287-1294 Trakovická, A., Moravčíková, N., Kukučková, V., Nádaský, R and Kasarda, R 2016 The associations of LEPR and H-FABP gene polymorphisms with carcass traits in pigs Acta agriculturae Slovenica 5: 189-194 Uemoto, Y., Suzuki, K., Kobayashi, E., Sato, S., Shibata, T., Kadowaki, H and Nishida, A 2007 Effects of heart fatty acid-binding protein genotype on intramuscular fat content in Duroc pigs selected for meat production and meat quality traits Asian-australasian journal of animal sciences 20: 622626 Uleberg, E., Widerøe, I., Grindflek, E., Szyda, J., Lien, S and Meuwissen, T 2005 Fine mapping of a QTL for intramuscular fat on porcine chromosome using combined linkage and linkage disequilibrium mapping Journal of Animal Breeding and Genetics 122: 1-6 Upadhaya, S D., Lee, S S., Jin, S G., Wu, Z and Kim, I H 2021 Effect of increasing levels of threonine relative to lysine on the performance and meat 130 quality of finishing pigs Animal Bioscience 34: 1987 - 1994 Urban, T., Mikolasova, R., Kuciel, J., Ernst, M and Ingr, I 2002 A study of associations of the H-FABP genotypes with fat and meat production of pigs Journal of Applied Genetics 43: 505-510 Veerkamp, J., Van Kuppevelt, T., Maatman, R and Prinsen, C 1993 Structural and functional aspects of cytosolic fatty acid-binding proteins Prostaglandins, leukotrienes and essential fatty acids 49: 887-906 Veerkamp, J H and Maatman, R G 1995 Cytoplasmic fatty acid-binding proteins: their structure and genes Progress in lipid research 34: 17-52 Von Rohr, P., Hofer, A and Künzi, N 1999 Economic values for meat quality traits in pigs Journal of Animal Science 77: 2633-2640 Wang, H., Wang, X., Li, M., Sun, H., Chen, Q., Yan, D., Dong, X., Pan, Y and Lu, S 2022 Genome-Wide Association Study of Growth Traits in a FourWay Crossbred Pig Population Genes 13: 1-22 Wei-Jun, P., Liang, B and Gong-She, Y 2006 Relationship among H-FABP gene polymorphism, intramuscular fat content, and adipocyte lipid droplet content in main pig breeds with different genotypes in western China Acta Genetica Sinica 33: 515-524 Willson, H E., Rojas De Oliveira, H., Schinckel, A P., Grossi, D and Brito, L F 2020 Estimation of Genetic Parameters for Pork Quality, Novel Carcass, Primal-Cut and Growth Traits in Duroc Pigs Animals 10: 1-25 Wimmers, K., Murani, E., Te Pas, M., Chang, K., Davoli, R., Merks, J., Henne, H., Muraniova, M., Da Costa, N and Harlizius, B 2007 Associations of functional candidate genes derived from gene‐expression profiles of prenatal porcine muscle tissue with meat quality and muscle deposition Animal genetics 38: 474-484 Won, S., Jung, J., Park, E and Kim, H 2018 Identification of genes related to intramuscular fat content of pigs using genome-wide association study Asian-Australas J Anim Sci 31: 157-162 Wood, J., Enser, M., Fisher, A., Nute, G., Sheard, P., Richardson, R., Hughes, S and Whittington, F 2008 Fat deposition, fatty acid composition and meat quality: A review Meat science 78: 343-358 Xu, A., Wang, Y., Xu, J Y., Stejskal, D., Tam, S., Zhang, J., Wat, N M., Wong, W K and Lam, K S 2006 Adipocyte fatty acid–binding protein is a plasma biomarker closely associated with obesity and metabolic syndrome Clinical chemistry 52: 405-413 Xu, H., Diolintzi, A and Storch, J 2019 Fatty acid-binding proteins: functional understanding and diagnostic implications Current Opinion in Clinical Nutrition & Metabolic Care 22: 407-412 131 Xue, Y., Wu, H., Lei, S., Li, H and Zhao, L 2018 Comparison of Meat Quality from Three-way Crossbred Pigs J Nutr Food Sci 8: 2-7 Zderic, T W and Hamilton, M T 2006 Physical inactivity amplifies the sensitivity of skeletal muscle to the lipid-induced downregulation of lipoprotein lipase activity Journal of Applied Physiology 100: 249-257 Zeng, Y., Wang, G., Wang, C., Wei, S., Wu, Y., Wang, L., Wang, H and Yang, H 2005 Genetic variation of H-FABP gene and association with intramuscular fat content in Laiwu Black and four western pig breeds Asian-australasian journal of animal sciences 18: 13-16 Zhang, J., Chai, J., Luo, Z., He, H., Chen, L., Liu, X and Zhou, Q 2018 Meat and nutritional quality comparison of purebred and crossbred pigs Animal Science Journal 89: 202-210 Warriss, P D., Brown, S N., Franklin, J G and Kestin, S C 1990 The thickness and quality of backfat in various pig breeds and their relationship to intramuscular fat and the setting of joints from the carcasses Meat Sci 28: 21-29 132 PHỤ LỤC Một số biểu mẫu thu thập liệu Biểu mẫu 1: Biểu mẫu thu thập hệ phả đàn nái sinh sản Số tai Mã số nái Giống Ngày sinh Mã số bố Mã số mẹ Biểu mẫu 2: Biểu mẫu thu thập quản lý hệ phả đực giống Số tai Mã số đực Ngày sinh Giống Mã số bố Mã số mẹ Biểu 3: Biểu mẫu thu thập quản lý hệ phả lợn hậu bị KTNS cá thể Mã số Mã Mã số Ngày Nhóm Nguồn gốc cá thể số bố mẹ sinh giống (nơi sinh) Đàn/trại Kiểu chuồng (ni giữ) ni (kín/hở) Biểu 4: Biểu mẫu thu thập tiêu kiểm tra suất cá thể Mã số cá thể Ngày Nhóm Ngày vào sinh giống kiểm tra KL vào kiểm tra (kg) 133 Ngày kết thúc kiểm tra KL kết thúc kiểm tra (kg) Dày mỡ lưng (mm) Một số hình ảnh đề tài Hình ảnh kiểm tra suất cá thể Hình ảnh siêu âm máy Aloka SSV đo lường mỡ giắt Hình ảnh thập mẫu máu 134 Hình ảnh phân tích kiểu gen Hình ảnh lợn đực Duroc chọn lọc Hình ảnh lợn đực Duroc chọn lọc 135 Hình ảnh lợn Duroc chọn lọc Hình ảnh lợn hậu bị kiểm tra suất hệ 136