Chọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen H-FABP

Chọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABP.Chọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABP.Chọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABP.Chọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABP.Chọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABP.Chọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABP.Chọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABP.Chọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABP.Chọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABP.Chọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABP.Chọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABP.Chọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABP.Chọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABP.Chọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABP.Chọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABP.Chọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABP.Chọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABP.Chọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABP.Chọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABP.Chọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABP.

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ NÔNG NGHIỆP VÀ PTNT VIỆN CHĂN NUÔI -🙞🙞🙞🙞🙞 - NGUYỄN VĂN HỢP CHỌN LỌC NÂNG CAO TỶ LỆ MỠ GIẮT CỦA LỢN DUROC BẰNG PHƯƠNG PHÁP BLUP KẾT HỢP GEN H-FABP LUẬN ÁN TIẾN SĨ HÀ NỘI, 2023 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ NÔNG NGHIỆP VÀ PTNT VIỆN CHĂN NUÔI -🙞🙞🙞🙞🙞 - NGUYỄN VĂN HỢP CHỌN LỌC NÂNG CAO TỶ LỆ MỠ GIẮT CỦA LỢN DUROC BẰNG PHƯƠNG PHÁP BLUP KẾT HỢP GEN H-FABP Ngành: Di truyền chọn giống vật nuôi Mã số: 9.62.01.08 LUẬN ÁN TIẾN SĨ NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: TS Nguyễn Hữu Tỉnh PGS.TS Ngô Thị Kim Cúc HÀ NỘI, 2023 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu khoa học tơi, kết nghiên cứu trình bày luận án trung thực khách quan nghiên cứu có hợp tác cán nghiên cứu khoa học thuộc Phân viện Chăn nuôi Nam chưa bảo vệ học vị Mọi giúp đỡ trình thực luận án cảm ơn thơng tin trích dẫn luận án rõ nguồn gốc tham khảo Tác giả luận án Nguyễn Văn Hợp LỜI CẢM ƠN Để hoàn thành luận án này, trước hết, xin trân thành cảm ơn Ban giám đốc, Phòng Khoa học, Đào tạo Hợp tác quốc tế Viện chăn nuôi, Phân Viện Chăn nuôi Nam hỗ trợ tạo điều kiện tốt suốt thời gian học tập, nghiên cứu hồn thành luận án Tơi xin bày tỏ lịng kính trọng biết ơn sâu sắc TS Nguyễn Hữu Tỉnh, PGS.TS Ngô Thị Kim Cúc tận tình hướng dẫn, đưa nhiều đóng góp q báu, dành nhiều thời gian cơng sức tạo điều kiện cho tơi suốt q trình học tập thực đề tài Vượt qua khó khăn suốt q trình nghiên cứu hồn thành luận án, thực ghi nhận nhiều hỗ trợ xin gửi lời cảm ơn chân thành tới Ban giám đốc, cán viên chức Trung tâm Nghiên cứu Phát triển Chăn ni heo Bình Thắng tạo điều kiện thuận lợi chuồng trại, đàn giống, máy móc thiết bị chọn giống; cán khoa học Bộ môn Công nghệ Sinh học Vi sinh đồng hành chia sẻ chuyên môn thời triển khai nghiên cứu luận án Ngoài ra, nhận hỗ trợ động viên bạn bè, đồng nghiệp gia đình suốt trình nghiên cứu luận án Xin chân thành cảm ơn tất hỗ trợ Tác giả luận án Nguyễn Văn Hợp ii MỤC LỤC LỜI CAM ĐOAN iii LỜI CẢM ƠN ii MỤC LỤC iii DANH MỤC CÁC TỪ VIẾT TẮT viii DANH MỤC CÁC BẢNG x DANH MỤC CÁC HÌNH VÀ BIỂU ĐỒ xiii MỞ ĐẦU 1.1 Tính cấp thiết 1.2 Mục tiêu nghiên cứu 1.3 Những đóng góp đề tài 1.4 Ý nghĩa khoa học ý nghĩa thực tiễn 1.4.1 Ý nghĩa khoa học 1.4.2 Ý nghĩa thực tiễn CHƯƠNG TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Cơ sở sinh lý di truyền tính trạng mỡ giắt thịt lợn .5 1.1.1 Cơ sở sinh lý tính trạng mỡ giắt 1.1.2 Cơ sở di truyền tính trạng mỡ giắt 10 1.1.2.1 Khả di truyền tính trạng mỡ giắt 10 1.1.2.2 Tương quan di truyền tính trạng mỡ giắt tính trạng khác lợn 12 1.1.2.3 Cơ sở phân tử tính trạng mỡ giắt 15 1.1.3 Một số hướng tiếp cận cải thiện hàm lượng mỡ giắt lợn 18 1.1.3.1 Hướng tiếp cận di truyền số lượng 18 1.1.3.2 Hướng tiếp cận di truyền phân tử .18 1.2 Tổng quan nghiên cứu nước nước 19 1.2.1 Các nghiên cứu nước 19 1.2.1.1 Ảnh hưởng mỡ giắt đến chất lượng thịt lợn 19 iii 1.2.1.2 Ảnh hưởng giống đến tính trạng mỡ giắt lợn .21 1.2.1.3 Ứng dụng di truyền phân tử chọn lọc mỡ giắt lợn 25 1.2.1.4 Gen H-FABP liên kết với tính trạng mỡ giắt lợn 26 1.2.1.5 Một số tiến di truyền chọn lọc tính trạng mỡ giắt lợn .30 1.2.2.2 Ứng dụng di truyền phân tử cải thiện tỷ lệ mỡ giắt tính trạng liên quan giống lợn Duroc Việt nam 35 1.3 Luận giải cách tiếp cận vấn đề nghiên cứu .39 CHƯƠNG VẬT LIỆU, NỘI DUNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU .42 2.1 Thời gian địa điểm nghiên cứu 42 2.2 Vật liệu nghiên cứu 42 2.3 Nội dung nghiên cứu 44 2.3.1 Nội dung 1: Đánh giá khả di truyền tương quan di truyền tính trạng mỡ giắt với tuổi đạt khối lượng 100 kg dày mỡ lưng lợn Duroc 44 2.3.2 Nội dung 2: Phân tích đa hình gen H-FABP liên kết với tỷ lệ mỡ giắt, tuổi đạt khối lượng 100 kg, dày mỡ lưng dày thăn thịt lợn Duroc 44 2.3.3 Nội dung 3: Đánh giá chọn lọc đàn lợn Duroc hạt nhân dựa số đực cuối TSI kết hợp với kiểu gen H-FABP 45 2.3.4 Nội dung 4: Khảo sát suất thịt tỷ lệ mỡ giắt đàn lợn thương phẩm sử dụng đực Duroc có tỷ lệ mỡ giắt khác 45 2.4 Phương pháp nghiên cứu 45 2.4.1 Phương pháp thu thập liệu giai đoạn 2011 - 2016 45 2.4.2 Phương pháp kiểm tra suất cá thể hậu bị 46 2.4.2.1 Kiểm tra suất cá thể hậu bị 46 2.4.2.2 Phương pháp hiệu chỉnh số liệu 47 2.4.3 Thu thập mẫu máu phân tích kiểu gen H-FABP 48 2.4.3.1 Phương pháp thu thập mẫu máu 48 iv 2.4.3.2 Chiết tách DNA từ mẫu máu lợn 49 2.4.3.3 Quy trình PCR-RFLP .49 2.4.4 Phương pháp thiết lập đàn hạt nhân .50 2.4.5 Phương pháp khảo sát lợn thương phẩm 52 2.4.5.1 Thiết kế thí nghiệm .52 2.4.5.2 Chăm sóc nuôi dưỡng 53 2.4.5.3 Các tiêu theo dõi 53 2.5 Phương pháp xử lý số liệu .54 2.5.1 Ước tính thơng số di truyền giá trị giống tính trạng mỡ giắt, dày mỡ lưng tuổi đạt khối lượng 100 kg 54 2.5.2 Đa hình gen H-FABP 54 2.5.2.1 Xác định tần số kiểu gen H-FABP 54 2.5.2.2 Xác định mối liên kết đa hình kiểu gen H-FABP với tính trạng mỡ giắt, dày mỡ lưng tuổi đạt khối lượng 100 kg 55 2.5.2.3 Ước tính ảnh hưởng cộng gộp ảnh hưởng trội 56 2.5.3 Ước tính khuynh hướng di truyền 56 2.5.4 So sánh tiêu suất thịt tổ hợp lai thương phẩm 57 CHƯƠNG KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 58 3.1 Khả di truyền tương quan di truyền tính trạng mỡ giắt với tuổi đạt khối lượng 100 kg dày mỡ lưng lợn Duroc 58 3.1.1 Ảnh hưởng yếu tố cố định mơ hình thống kê phân tích di truyền tính trạng suất 58 3.1.2 Thành phần phương sai hệ số di truyền tính trạng mỡ giắt, dày mỡ lưng tuổi đạt khối lượng 100 kg 60 3.1.3 Tương quan di truyền tính trạng mỡ giắt với dày mỡ lưng tuổi đạt khối lượng 100 kg 62 3.1.4 Giá trị giống tính trạng chọn lọc lợn Duroc hệ xuất phát .64 v 3.2 Đa hình gen H-FABP liên kết với tỷ lệ mỡ giắt, tuổi đạt khối lượng 100 kg, dày mỡ lưng dày thăn thịt lợn Duroc 66 3.2.1 Kiểu gen H-FABP ba vị trí đa hình với enzyme cắt HaeIII, MspI, HinfI……… 66 3.2.2 Tần số kiểu gen H-FABP ba vị trí đa hình HaeIII, MspI HinfI 67 3.2.3 Mối liên kết đa hình gen H-FABP ảnh hưởng cộng gộp, ảnh hưởng trội đến tính trạng nghiên cứu 74 3.2.3.1 Ảnh hưởng kiểu gen H-FABP đến tính trạng nghiên cứu 74 3.2.3.2 Mối liên kết đa hình gen H-FABP/HaeIII ảnh hưởng cộng gộp, ảnh hưởng trội đến tính trạng nghiên cứu 75 3.2.3.3 Mối liên kết đa hình gen H-FABP/MspI ảnh hưởng cộng gộp, ảnh hưởng trội đến tính trạng nghiên cứu 76 3.2.3.4 Mối liên kết đa hình gen H-FABP/HinfI ảnh hưởng cộng gộp, ảnh hưởng trội đến tính trạng nghiên cứu 78 3.2.4 Mối liên kết kiểu gen H-FABP kết hợp vị trí đa hình HaeIII, MspI HinfI với tính trạng nghiên cứu .81 3.2.4.1 Ảnh hưởng gen H-FABP kết hợp vị trí đa hình đến tính trạng nghiên cứu 81 3.2.4.2 Mối liên kết kiểu gen H-FABP kết hợp hai vị trí đa hình HaeIII HinfI với tính trạng nghiên cứu 82 3.2.4.3 Mối liên kết kiểu gen H-FABP kết hợp hai vị trí đa hình MspI HinfI với tính trạng nghiên cứu 83 3.2.4.4 Mối liên kết kiểu gen kết hợp hai vị trí đa hình H-FABP/MspI HFABP/HinfI với tính trạng nghiên cứu 85 3.2.4.5 Mối liên kết kiểu gen H-FABP kết hợp ba vị trí đa hình HaeIII, MspI HinfI với tính trạng nghiên cứu 86 3.3 Kết chọn lọc đàn lợn giống Duroc 89 vi 3.3.1 Kết chọn lọc đàn hạt nhân Duroc hệ xuất phát .89 3.3.2 Năng suất đàn lợn Duroc chọn lọc qua hệ .91 3.3.3 Mức độ ổn định di truyền tính trạng chọn lọc qua ba hệ 94 3.3.4 Khuynh hướng di truyền tính trạng chọn lọc lợn Duroc .97 3.3.4.1 Khuynh hướng di truyền tính trạng mỡ giắt 97 3.3.4.2 Khuynh hướng di truyền tính trạng dày mỡ lưng 99 3.3.4.3 Khuynh hướng di truyền tính trạng tuổi đạt khối lượng 100kg .100 3.3.4.4 Khuynh hướng di truyền số chọn lọc 101 3.4 Ảnh hưởng đực Duroc có tỷ lệ mỡ giắt khác đến số tính trạng suất đàn lợn thương phẩm 102 3.4.1 Mức độ ảnh hưởng đực Duroc có tỷ lệ mỡ giắt khác tính biệt đến tính trạng khảo sát lợn thương phẩm 102 3.4.2 Ảnh hưởng đực Duroc có tỷ lệ mỡ giắt khác đến tiêu khảo sát đàn lợn thương phẩm 104 Chương KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ 111 4.1 Kết luận 111 4.2 Đề nghị 112 TÀI LIỆU THAM KHẢO 113 PHỤ LỤC 133 Một số biểu mẫu thu thập liệu 133 Một số hình ảnh đề tài 134 vii DANH MỤC CÁC TỪ VIẾT TẮT BLUP Best Linear Unbiased Prediction: Phương pháp phân tích dự đốn tuyến tính khơng thiên vị tốt CS Cộng D(LY) Duroc x (Landrace x Yorkshire) D(YL) Duroc x (Yorkshire x Landrace) DNA Deoxyribonucleic Acid DML Dày mỡ lưng DT Dày thăn thịt EBV Estimated Breeding Value – Giá trị giống FAT Fatty – acid translocase: Enzyme chuyển chất béo FFA Free Fatty Acids – axít béo tự GGP Great Grand Parents: Cụ kị GP Grand Parents: Ông bà GTG Giá trị giống h2 He Hệ số di truyền H-FABP Gen Heart Fatty Acid-Binding Protein HYS Herd Year Season - Đàn x Năm x mùa vụ IMF Intramuscular Fat: Mỡ giắt MG Mỡ giắt Mean Giá trị trung bình LPL Enzyme lipoprotein lipase LY Landrace x Yorkshire P Probability value: Giá trị xác suất PIP Porcine Intramuscular Preadipocyte line Hệ số dị hợp mong đợi vii i