khảo sát vi khuẩn gram âm đường ruột kháng kháng sinh

B GIÁO DC VÀ ÀO TO TRNG I HC S PHM TP. H CHÍ MINH Nguyn Th Yn Chi KHO SÁT S KHÁNG KHÁNG SINH CA CÁC VI KHUN GRAM ÂM NG RUT THNG GP TRONG BNH VIN SINH ESBL Chuyên ngành: Vi Sinh hc Mã s: 60 42 40 LUN VN THC S SINH HC NGI HNG DN KHOA HC PGS – TS CAO MINH NGA ` Thành ph H Chí Minh – nm 2011 LI CAM OAN Tôi xin cam đoan đây là công trình nghiên cu ca riêng tôi. Các s liu và kt qu nghiên cu trong lun vn là trung thc và cha tng đc ai công b trong bt kì công trình nào khác Tác gi LI CM N Tôi xin chân thành cám n s hng dn tn tình ca cô PGS - TS Cao Minh Nga trong sut quá trình làm lun vn này. ng thi, tôi cng xin chân thành cám n Ban ch nhim B môn, các cán b phòng thí nghim b môn Vi sinh trng i hc Y Dc Thành ph H Chí Minh đã h tr tích cc cho tôi trong vic thc nghim đ tài. MC LC Chú thích các ch vit tt Danh mc các bng Danh mc các hình, biu đ 3TM U3T 1 3TChng 1. TNG QUAN TÀI LIU3T 4 3T1.1. Tng quan v vi khun3T 4 3T1.1.1. Vi khun3T 4 3T1.1.2. Trc khun Gram âm3T 4 3T1.2. Các kháng sinh thuc nhóm -lactam3T 9 3T1.2.1. Phân loi các kháng sinh thuc nhóm -lactam3T 10 3T1.2.2. C ch tác dng3T 12 3T1.3. Hin tng kháng kháng sinh3T 13 3T1.3.1. Tng quan3T 13 3T1.3.2. Bn Cht di truyn và phng thc truyn ti gen3T 14 3T1.3.3. C ch kháng kháng sinh ca vi khun3T 15 3T1. 4. Tng quan v ESBL3T 17 3T1.4.1. S lc v -lactamase3T 17 3T1.4.2. ESBL3T 20 3TChng 2. I TNG VÀ PHNG PHÁP NGHIÊN CU3T 33 3T2.1. i tng nghiên cu3T 33 3T2.2. Phng pháp chn mu3T 33 3T2.3. Phng pháp tin hành3T 33 3T2.3.1. Vt liu3T 33 3T2.3.2. Thit b và dng c3T 34 3T2.3.3. Quy trình thc hin3T 34 3T2.4. X lý s liu3T 37 3TChng 3. KT QU NGHIÊN CU VÀ THO LUN3T 38 3T3.1. T l vi khun đng rut sinh ESBL3T 38 3T3.2. T l các chng vi khun Gram âm đng rut thng gp sinh ESBL3T 39 3T3.3. T l kháng kháng sinh ca vi khun Gram âm đng rut thng gp sinh ESBL 3T 42 3T3.4. T l kháng kháng sinh ca vi khun Gram âm đng rut không sinh ESBL 3T 54 3TChng 4. KT LUN VÀ KIN NGH3T 72 3TTÀI LIU THAM KHO3T 75 3TPH LC3T DANH MC CÁC CH VIT TT AN Amikacin AMC Amox - acid clavulanic AM Ampicillin ASTS Antibiotic Susceptibility Test Surveillance (Chng trình theo dõi s nhy cm kháng sinh) ATM Aztreonam BHI Brain - Heart Infusion Agar (Thch tim - óc hm) CZ Cefazolin FEP Cefepime CFP Cefoperazone CCTX Cefotaxime-acid clavulanic FOX Cefoxitin CAZ Ceftazidime CCAZ Ceftazidime – acid clavulanic CTX Ceftotaxime CRO Ceftriaxone CXM Cefuroxime CIP Ciprofloxacin CTI Citrate CLSI Clinical and Laboratory Standards Institute (Vin các chun mc lâm sàng và xét nghim) C Cloramphenicol EMB Eosin Methylene Blue Agar ESBL Extended – Spectrum Beta Lactamase GM Getamicin G Glucose IPM Imipenem IND Indol LVX Levofloxacin LYS Lysine MC Mac Conkey Agar (Thch Mac Conkey) MEM Meropenem MR Methyl Red MIC Minimum Inhibitory Concentration (Nng đ c ch ti thiu) MOT Motility (Di đng) MHA Mueller Hinton Agar (Thch Mueller Hinton) NCCLS National Committee for Clinical Laboratory Standards NET Neltimicin FT Nitrofurantoin NOR Norffloxacin NA Nutrien Agar (Môi trng dinh dng) PAD Phenylalanine Deaminase TZP Piperacillin-tazobactam Tg Tác gi TE Tetracyline Tp. Thành ph TCC Ticarcilin acid clavuanic TM Tobramycin SXT Trimethoprim –sulfamethoxazole TSI Triple Suger Iron VKDR Vi khun đng rut VP Voges Proskauer DANH MC CÁC BNG 3TUBng 1.1. Tính cht sinh hóa ca mt s loi vi khun đng rut thng gpU3T 5 3TUBng 1.2. Các nhân c bn ca kháng sinh thuc nhóm -lactamU3T 10 3TUBng 1.3. C ch kháng thuc ca vi khunU3T 17 3TUBng 1.4. Xp loi -lactamase theo chc nngU3T 18 3TUBng 1.5. Các lp ESBL chínhU3T 22 3TUBng 1.6. Các type ESBLs CTX-MU3T 24 3TUBng 1.7. Các type ESBL- OXAU3T 25 3TUBng 1.8. Các loi ESBL khácU3T 25 3TUBng 1.9. Mt s phng pháp phân t xác đnh ESBLU3T 29 3TUBng 3.1. T l các loi vi khun đng rut phân lp đc U3T 38 3TUBng 3.2. T l các vi khun Gram âm đng rut thng gp sinh ESBLU3T 39 3TUBng 3.3. T l kháng kháng sinh ca các vi khun Gram âm đng rut thng gpU3T 42 3TUBng 3.4. T l kháng kháng sinh ca tng loài vi khun đng rut thng gp sinh ESBL U3T 46 3TUBng 3. 5. So sánh t l kháng kháng sinh ca E. coli sinh ESBL vi mt s tác gi nghiên cu trc đây U3T 48 3TUBng 3. 6. So sánh t l kháng kháng sinh ca Klebsiella spp. sinh ESBL vi mt s tác gi nghiên cu trc đây U3T 53 3TUBng 3.7. So sánh t l kháng kháng sinh ca vi khun Gram âm đng rut thng gp không sinh ESBL vi các tác gi nghiên cu trc đây U3T 55 3TUBng 3. 8. T l kháng kháng sinh ca tng loài vi khun Gram âm đng rut thng gp không sinh ESBL U3T 59 3TUBng 3.9. So sánh t l kháng kháng sinh ca E. coli không sinh ESBL vi các tác gi nghiên cu trc đây U3T 62 3TUBng 3.10. T l kháng kháng sinh ca vi khun E. coli sinh ESBL và không sinh ESBL U3T 63 3TUBng 3. 11. So sánh t l kháng kháng sinh ca vi khun Klebsiella spp. vi các tác gi nghiên cu trc đó U3T 68 3TUBng 3.12. So sánh t l kháng kháng sinh ca vi khun Klebsiella spp. sinh ESBL và không sinh ESBL U3T 69 . l vi khun đng rut sinh ESBL3T 38 3T3.2. T l các chng vi khun Gram âm đng rut thng gp sinh ESBL3T 39 3T3.3. T l kháng kháng sinh ca vi khun Gram âm đng rut thng gp sinh. SÁT S KHÁNG KHÁNG SINH CA CÁC VI KHUN GRAM ÂM NG RUT THNG GP TRONG BNH VI N SINH ESBL Chuyên ngành: Vi Sinh hc Mã s: 60 42 40 LUN VN THC S SINH HC NGI HNG. các loi vi khun đng rut phân lp đc U3T 38 3TUBng 3.2. T l các vi khun Gram âm đng rut thng gp sinh ESBLU3T 39 3TUBng 3.3. T l kháng kháng sinh ca các vi khun Gram âm đng