Nhiễm klebsiella pneumoniae bệnh cảnh lâm sàng và kết quả điều trị tại bệnh viện bệnh nhiệt đới từ 2019 đến 2021

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƢỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH PHẠM VĂN TÂN NHIỄM KLEBSIELLA PNEUMONIAE: BỆNH CẢNH LÂM SÀNG VÀ KẾT QUẢ ĐIỀU TRỊ TẠI BỆNH VIỆN BỆNH NHIỆT ĐỚI TỪ 2019 ĐẾN 2021 LUẬN VĂN TỐT NGHIỆP BÁC SĨ NỘI TRÚ TP HỒ CHÍ MINH, NĂM 2021 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƢỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH PHẠM VĂN TÂN NHIỄM KLEBSIELLA PNEUMONIAE: BỆNH CẢNH LÂM SÀNG VÀ KẾT QUẢ ĐIỀU TRỊ TẠI BỆNH VIỆN BỆNH NHIỆT ĐỚI TỪ 2019 ĐẾN 2021 CHUYÊN NGÀNH: TRUYỀN NHIỄM MÃ SỐ: NT 62 72 38 01 LUẬN VĂN TỐT NGHIỆP BÁC SĨ NỘI TRÚ NGƢỜI HƢỚNG DẪN KHOA HỌC: PGS.TS ĐƠNG THỊ HỒI TÂM TS LÊ BỬU TP HỒ CHÍ MINH, NĂM 2021 CHÂU LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu riêng tơi, kết nghiên cứu bày luận văn trung thực, khách quan chưa công bố nơi Tác giả luận văn PHẠM VĂN TÂN MỤC LỤC LỜI CAM ĐOAN i DANH MỤC TỪ VIẾT TẮT ii DANH MỤC ĐỐI CHIẾU THUẬT NGỮ ANH VIỆT iii DANH MỤC CÁC BẢNG vi DANH MỤC CÁC HÌNH viii DANH MỤC CÁC BIỂU ĐỒ viii MỞ ĐẦU Chƣơng 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Đặc điểm dịch tễ nhiễm K pneumoniae 1.2 Đặc điểm yếu tố nguy liên quan nhiễm trùng K pneumoniae 1.3 Đặc điểm bệnh cảnh lâm sàng nhiễm trùng K pneumoniae 10 1.4 Đặc điểm vi sinh 19 1.5 Đặc điểm gen, yếu tố độc lực kháng thuốc 21 1.6 Chẩn đoán nhiễm trùng K pneumoniae 34 1.7 Điều trị nhiễm trùng K pneumoniae 35 1.8 Tiên lượng nhiễm trùng K pneumoniae 40 Chƣơng 2: ĐỐI TƢỢNG VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 42 2.1 Thiết kế nghiên cứu 42 2.2 Đối tượng nghiên cứu 42 2.3 Thời gian địa điểm nghiên cứu 42 2.4 Cỡ mẫu 42 2.5 Tiêu chuẩn chọn bệnh 42 2.6 Tiêu chuẩn loại trừ 42 2.7 Định nghĩa biến số dùng nghiên cứu 42 2.8 Mô hình nghiên cứu 50 2.9 Phương pháp cấy bệnh phẩm phân lập vi khuẩn 50 2.10 Quy trình nghiên cứu 52 2.11 Sơ đồ nghiên cứu 52 2.12 Phương pháp phân tích liệu 53 2.13 Đạo đức nghiên cứu 53 Chƣơng 3: KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU 55 3.1 Đặc điểm dân số bệnh 55 3.2 Đặc điểm lâm sàng cận lâm sàng 58 3.3 Đặc điểm vi sinh 71 3.4 Đặc điểm điều trị kết cục 76 3.5 Các yếu tố liên quan đến tử vong 78 Chƣơng 4: BÀN LUẬN 82 4.1 Đặc điểm dân số bệnh 82 4.2 Đặc điểm lâm sàng cận lâm sàng 87 4.3 Đặc điểm vi sinh 103 4.4 Đặc điểm kết cục yếu tố liên quan đến tử vong 110 HẠN CHẾ CỦA NGHIÊN CỨU 115 KẾT LUẬN 116 KIẾN NGHỊ 118 TÀI LIỆU THAM KHẢO PHỤ LỤC Phụ lục 1: Bảng thu thập số liệu Phụ lục 2: Phiếu cung cấp thông tin nghiên cứu Phụ lục 3: Phiếu đồng ý tham gia nghiên cứu Phụ lục 4: Danh sách bệnh nhân ii DANH MỤC TỪ VIẾT TẮT TÊN VIẾT TẮT TÊN ĐẦY ĐỦ TIẾNG VIỆT AMC Amoxicillin/acid clavulanic DNT Dịch não tủy KS Kháng sinh KSĐ Kháng sinh đồ KTC Khoảng tin cậy LPS Lipopolysaccharide NST Nhiễm sắc thể NTBV Nhiễm trùng bệnh viện NTCĐ Nhiễm trùng cộng đồng NTH Nhiễm trùng huyết NT LQCSYT Nhiễm trùng liên quan chăm sóc y tế TM Tĩnh mạch TZP Piperacillin/tazobactam VPBV Viêm phổi bệnh viện VPCĐ Viêm phổi cộng đồng VPMNKNP Viêm phúc mạc nhiễm khuẩn nguyên phát iii DANH MỤC ĐỐI CHIẾU THUẬT NGỮ ANH VIỆT CHŨ VIẾT TẮT TÊN TIẾNG ANH TÊN TIẾNG VIỆT AmpC Ampicillin C β-lactamase Ampicillin C β-lactamase APACHE Acute Physiology And Chronic Health Evaluation Đánh giá tình trạng sinh lý cấp tính sức khỏe mãn tính ATS American Thoracic Society Hiệp hội Lồng ngực Hoa Kỳ BAL Bronchoalveolar lavage Dịch rửa phế quản BIA British Infection Association Tổ chức Nhiễm khuẩn Anh Quốc BSAC British Society for Antimicrobial Chemotherapy Hiệp hội Hóa trị liệu Kháng sinh Anh Quốc CDC Centers for Disease Control and Prevention Trung tâm Kiểm sốt Phịng ngừa Dịch bệnh CMY Active on cephamycins Tác dụng lên cephamycin COPD Chronic Obstructive Pulmonary Disease Bệnh phổi tắc nghẽn mạn tính CPS Capsular polysaccharide Lớp polysaccharide vỏ cps locus Capsular polysaccharide synthesis Locus liên quan tổng hợp polysaccharide vỏ CT Computed tomography Chụp cắt lớp vi tính CTX-M Active on cefotaxime Tác dụng lên cefotaxime ECDC European Centre for Disease Trung tâm Kiểm soát iv Prevention and Control Phòng ngừa Dịch bệnh Châu Âu ESBL Extended spectrum β-lactamase β-lactamase phổ rộng ETA Endotracheal aspirate Dịch hút nội khí quản FOX Active on cefoxitin Tác dụng lên cefoxitin GES Guiana-extended spectrum Guiana phổ rộng HIS Healthcare Infection Society Hiệp hội Nhiễm trùng liên quan chăm sóc y tế ICU Intensive Care Unit Khoa hồi sức tích cực IDSA Infectious Diseases Society of America Hiệp hội Bệnh truyền nhiễm Hoa Kỳ IMI Imipenem-hydrolyzing βlactamase β-lactamase thủy phân imipenem IMP Active on meropenem Tác dụng lên meropenem IQR Interquartile range Khoảng phân tứ phân vị KDIGO Kidney Disease Improving Global Outcome Hội đồng Cải thiện Kết Toàn cầu Bệnh thận KPC K pneumoniae carbapenemase K pneumoniae carbapenemase magA Mucoviscosity-associated gene A Gen liên quan kiểu hình nhày nhớt cao A MOX Active on moxalactam Tác dụng lên moxalactam NDM New Delhi metallo-β-lactamase Men New Delhi β-lactamase có chứa gốc kim loại v NIAAA National Institute on Alcohol Abuse and Alcoholism Viện quốc gia Hoa Kỳ Lạm dụng Nghiện rượu NMC Not metallo-enzyme carbapenemase Carbapenemase không chứa gốc kim loại OR Odds ratio Tỷ số chênh OXA Oxacillinase Oxacillinase PCR Polymerase Chain Reaction Phản ứng chuỗi polymerase rmpA gene Regulator of mucoid phenotype A gene Gen điều hịa kiểu hình nhày nhớt A rmpA2 gene Regulator of mucoid phenotype A2 gene Gen điều hịa kiểu hình nhày nhớt A2 SHV Sulfhydryl reagent variable Phản ứng thay đổi với thuốc thử sulfhydryl SME S marcescens enzyme Men S marcescens TEM Temoneira Temoneira VIM Verona integron-encoded metallo-enzyme carbapenemase Carbapenemase chứa gốc kim loại mã hóa integron Verona WHO World Health Organization Tổ chức Y tế giới vi DANH MỤC CÁC BẢNG Trang Bảng 1.1: Một số men β-lactamase K pneumoniae 31 Bảng 3.1: Tần số tỷ lệ bệnh nhân phân bố theo tuổi, giới nơi cư trú 55 Bảng 3.2: Tần số tỷ lệ bệnh nhân phân bố theo bệnh địa 56 Bảng 3.3: Tiền sử dụng kháng sinh nhập viện thời gian trước nhập viện 57 Bảng 3.4: Phân bố theo thể lâm sàng trường hợp NTCĐ NTBV 58 Bảng 3.5: Đặc điểm lâm sàng cận lâm sàng trường hợp áp xe gan 59 Bảng 3.6: Đặc điểm lâm sàng cận lâm sàng trường hợp nhiễm trùng huyết không rõ ngõ vào 60 Bảng 3.7: Đặc điểm trường hợp VPMNKNP 61 Bảng 3.8: Đặc điểm lâm sàng trường hợp viêm màng não mủ 62 Bảng 3.9: Đặc điểm cận lâm sàng bệnh nhân viêm màng não mủ 63 Bảng 3.10: So sánh đặc điểm lâm sàng trường hợp NT LQCSYT NT không LQCSYT 64 Bảng 3.11: Diễn tiến từ thời điểm nhập viện đến lúc lấy bệnh phẩm phân lập Klebsiella pneumoniae 65 Bảng 3.12: Đặc điểm lâm sàng trường hợp VPCĐ 67 Bảng 3.13: Đặc điểm lâm sàng trường hợp VPBV 67 Bảng 3.14: Đặc điểm cận lâm sàng trường hợp VPCĐ VPBV 68 Bảng 3.15: Đặc điểm lâm sàng trường hợp nhiễm trùng tiểu 69 Bảng 3.16: Đặc điểm cận lâm sàng trường hợp nhiễm trùng tiểu 70 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn