Nghiên cứu tác nhân vi khuẩn gây viêm phổi thở máy và gene kháng thuốc bằng kỹ thuật sinh học phân tử

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƢỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH TRẦN MINH GIANG NGHIÊN CỨU TÁC NHÂN VI KHUẨN GÂY VIÊM PHỔI THỞ MÁY VÀ GENE KHÁNG THUỐC BẰNG KỸ THUẬT SINH HỌC PHÂN TỬ Ngành Hồi sức[.]

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƢỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH TRẦN MINH GIANG NGHIÊN CỨU TÁC NHÂN VI KHUẨN GÂY VIÊM PHỔI THỞ MÁY VÀ GENE KHÁNG THUỐC BẰNG KỸ THUẬT SINH HỌC PHÂN TỬ Ngành: Hồi sức cấp cứu chống độc Mã số: 62720122 TÓM TẮT LUẬN ÁN TIẾN SĨ Y HỌC Thành phố Hồ Chí Minh - Năm 2020 Cơng trình hồn thành tại: ĐẠI HỌC Y DƢỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH Người hướng dẫn khoa học: PGS.TS Trần Văn Ngọc Phản biện 1: GS.TS NGUYỄN GIA BÌNH Phản biện 2: PGS.TS ĐỖ THỊ THU THỦY Phản biện 3: PGS.TS HÀ TRẦN HƯNG Luận án bảo vệ Hội đồng đánh giá luận án cấp Trường, họp Đại học Y Dược Thành phố Hồ Chí Minh vào hồi 14 00 phút, ngày tháng năm 2020 Có thể tìm hiểu luận án tại: - Thư viện Quốc gia Việt Nam - Thư viện Khoa học Tổng hợp TPHCM - Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM GIỚI THIỆU LUẬN ÁN Đặt vấn đề Viêm phổi thở máy (VPTM) vấn đề lâm sàng quan trọng không Việt Nam mà cịn giới tần suất mắc bệnh tử vong tăng cao Nghiên cứu nước Âu – Mỹ cho thấy tỉ lệ VPTM 10% Tại Canada, VPTM 18 ca 1000 ngày thở máy Các quốc gia Á Châu VPTM 18% Tại Việt Nam, VPTM dao động từ 20% - 52% VPTM nguyên nhân hàng đầu gây tăng tỉ lệ tử vong (26% - 72%), kéo dài thời gian nằm viện (41 so với 23 ngày nhóm có khơng VPTM) tăng chi phí điều trị (5 – 10 lần) VPTM định nghĩa viêm nhu mô phổi xảy sau 48 thở máy qua nội khí quản qua khai khí quản Chẩn đoán VPTM thiết lập dựa chứng lâm sàng vi sinh Việc xác định vi khuẩn gây bệnh thông qua cấy định lượng bán định lượng đàm hút qua nội khí quản đơn qua nội soi phế quản Việc định danh vi khuẩn nhuộm Gram, ni cấy, đặc tính mọc phản ứng sinh hóa chuẩn mực Tuy nhiên phương pháp vi sinh kinh điển áp dụng trường hợp sau Vi khuẩn Gram âm khó mọc, mọc chậm; vi khuẩn biểu vài đặc tính sinh hóa Cũng vi khuẩn yếm khí, vi khuẩn khơng cấy bệnh lý nhiễm khuẩn có kết cấy âm tính, bệnh nhân sử dụng kháng sinh trước Chẩn đốn phân tử, ngày nay, trở thành phương pháp tham chiếu để chẩn đoán vi sinh học nhiều bệnh lý hơ hấp Vai trị giải trình tự gene 16S-rRNA định danh vi khuẩn chứng tỏ áp dụng rộng rãi lâm sàng Phương pháp giải trình tự gene 16S-rRNA phát hệ vi sinh đường hô hấp người khỏe bệnh nhân Tại Việt Nam số liệu từ nghiên cứu định danh vi khuẩn dựa sinh học phân tử bệnh nhân VPTM chưa nhiều chưa hệ thống đầy đủ Ngày nay, vi khuẩn đa kháng kháng sinh thách thức toàn cầu Đặc biệt quốc gia Á Châu, kể Việt Nam Tỉ lệ A baumannii kháng Carbapenem tăng lên nhanh chóng 6,7% (2001); 8% (2004); 80% (2010); 90% (2012) Tuy nhiên, kháng sinh đồ định lượng MIC que E-test chưa áp dụng rộng rãi số liệu chưa hệ thống đầy đủ Các vi khuẩn mang gene SHV, TEM, IMP, OXA, NDM thủy phân phổ rộng cephalosporin thường gặp Trong nước, việc tiếp cận có hệ thống gene kháng thuốc vi khuẩn yếu gây VPTM chưa ghi nhận hệ thống hóa đầy đủ Ở Việt Nam, chưa có nghiên cứu áp dụng giải trình tự hệ việc xác định vi khuẩn gây VPTM mẫu dịch rửa phế quản phế nang Chúng đặt câu hỏi nghiên cứu: (a) Có khác biệt định danh vi khuẩn gây VPTM hai phương pháp định danh vi khuẩn dựa vào kiểu hình giải trình tự gene 16SrRNA; (b) Giá trị MIC tỉ lệ đề kháng kháng sinh nhóm vi khuẩn gây VPTM phân bố nào?; (c) Tỉ lệ vi khuẩn yếu gây VPTM mang gene kháng thuốc có mối liên quan vi khuẩn mang gene kháng thuốc với MIC hay không? Trả lời câu hỏi nghiên cứu cung cấp kiến thức quan trọng qui mô đề kháng kháng sinh xác lập tác nhân liên quan đến VPTM, giúp cho việc điều trị bệnh nhân tốt Mục tiêu nghiên cứu: Xác định đặc điểm vi khuẩn gây viêm phổi thở máy kỹ thuật giải trình tự gene 16S-rRNA, có so sánh với phương pháp định danh vi khuẩn dựa vào nhuộm Gram, ni cấy phản ứng sinh hóa Đánh giá MIC tỉ lệ đề kháng kháng sinh nhóm vi khuẩn gây viêm phổi thở máy Xác định gene kháng thuốc vi khuẩn gây viêm phổi thở máy kỹ thuật PCR mối liên quan với MIC Tính cấp thiết đề tài Viêm phổi thở máy nguyên nhân hàng đầu gây tăng tỉ lệ tử vong, kéo dài thời gian nằm viện tăng chi phí điều trị Việc xác định xác, nhanh tác nhân vi khuẩn gây viêm phổi thở máy mang tính tiên lượng Giải trình tự gene 16S-rRNA đặc hiệu định danh vi khuẩn, ngày nay, áp dụng phổ biến Phương pháp sinh học phân tử khơng thơng qua cấy, khắc phục hạn chế vi sinh truyền thống Vi sinh kinh điển định danh vi khuẩn dựa vào kiểu hình gặp khó khăn trong trường hợp sau: vi khuẩn Gram âm khó mọc, mọc chậm; vi khuẩn biểu vài đặc tính sinh hóa, vi khuẩn yếm khí Các vi khuẩn khơng cấy bệnh lý nhiễm khuẩn có kết cấy âm tính, bệnh nhân sử dụng kháng sinh trước Đề kháng kháng sinh thách thức toàn cầu, đặc biệt quốc gia Á Châu có Việt Nam A baumannii, P aeruginosa K pneumoniae vi khuẩn hàng đầu gây viêm phổi thở máy gây đa kháng kháng sinh Việc thực kháng sinh đồ định lượng MIC que E-test dựa vi khuẩn phân lập từ bệnh nhân viêm phổi thở máy chưa áp dụng thường qui Hơn tỉ lệ vi khuẩn mang gene kháng thuốc mối liên quan với MIC chưa thống kê cách đầy đủ Hiện Việt Nam chưa có cơng trình nghiên cứu áp dụng giải trình tự gen 16S-rRNA hệ thống PGM Ion Torrent cho định danh vi khuẩn gây viêm phổi thở máy Chính tiến hành thực nghiên cứu Những đóng góp luận án Cơng trình nghiên cứu chúng tơi phát lồi vi khuẩn diện đường hô hấp bệnh nhân viêm phổi thở máy mà chưa công bố trước đây, đặc biệt vi khuẩn yếm khí Bênh cạnh cơng trình nghiên cứu chúng tơi cịn cung cấp MIC sáu loại kháng sinh chủ lực thường sử dụng lâm sàng tất vi khuẩn gây viêm phổi thở máy Đặc biệt nồng độ MIC colistin A baumannii Ngồi cơng trình nghiên cứu chúng tơi cịn cung cấp tranh chung cho bác sĩ lâm sàng gene kháng thuốc vi khuẩn yếu gây viêm phổi thở máy mối liên quan với MIC Từ giúp cho bác sĩ lâm sàng nhận định mức tác nhân vi khuẩn gây viêm phổi thở máy nhận biết gene kháng thuốc vi khuẩn gây viêm phổi thở máy Đồng thời giúp cho bác sĩ lâm sàng dễ dàng lựa chọn kháng sinh liều lượng cách sử dụng cho bệnh nhân viêm phổi thở máy có hiệu tốt Bố cục luận án Luận án có 108 trang Ngoài phần đặt vấn đề (2 trang), kết luận kiến nghị (4 trang), luận án gồm chương Chương - Tổng quan tài liệu (29 trang), chương - Đối tượng phương pháp nghiên cứu (16 trang), chương - Kết nghiên cứu (28 trang), chương - Bàn luận (29 trang) Luận án có 33 bảng, biểu đồ, sơ đồ, 117 tài liệu tham khảo (22 tiếng Việt 95 tiếng Anh) Chƣơng 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Định nghĩa: Viêm phổi thở máy (VPTM) viêm nhu mô phổi xảy sau 48 thở máy qua nội khí quản qua khai khí quản 1.2 Tỉ lệ mắc: dao động từ 10% đến 52% 1.3 Tỉ lệ tử vong: Có thể lên tới 76% 1.4 Bệnh nguyên: 1.4.1 Định danh vi khuẩn dựa vào kiểu hình: Có nhiều yếu tố khác ảnh hưởng đến tác nhân gây VPTM Tùy thuộc vào dân số nghiên cứu ICU khác nhau, thời gian nằm viện thời gian nằm ICU phương pháp chẩn đoán chuyên biệt sử dụng cho kết vi sinh gây VPTM khác Ở nhiều nghiên cứu cho thấy nhiễm khuẩn hô hấp vi khuẩn Gram âm Các nghiên cứu nước cho thấy ba tác nhân vi khuẩn gây VPTM hàng thường gặp A baumannii, K pneumoniae P aeruginosa 1.4.2 Định danh vi khuẩn dựa sinh học phân tử: Các phương pháp áp dụng dựa a-xít nucleic tiếp tục sử dụng phổ biến chẩn đoán bệnh lý nhiễm khuẩn Chúng trở thành phương pháp tham chiếu để chẩn đoán vi sinh học nhiều bệnh lý hô hấp Các phương pháp vượt trội phương pháp vi sinh kinh điển Các kỹ thuật phân tử chẩn đốn nhiễm khuẩn hơ hấp tập trung vào hệ thống phát đa mồi PCR giải trình tự gene 16S-rRNA cho thấy tính hữu dụng chuyên biệt định danh vi khuẩn thường gặp, vi khuẩn yếm khí, vi khuẩn hiếm, vi khuẩn mọc chậm, vi khuẩn cấy bệnh lý nhiễm khuẩn cho kết cấy âm tính Áp dụng kỹ thuật cao chẩn đốn vi khuẩn học khơng cung cấp chẩn đốn bệnh nguyên bệnh truyền nhiễm mà hỗ trợ chọn lựa thời gian dùng kháng sinh công tác kiểm soát nhiễm khuẩn thật hiệu Hơn nữa, sinh học phân tử giúp hiểu biết tốt dịch tễ bệnh học vi khuẩn vi khuẩn định danh xét nghiệm kiểu hình 1.5 Các yếu tố nguy cơ: Có thể xuất phát từ bệnh nhân can thiệp như: tuổi, bệnh nền, bỏng, chấn thương thuốc dùng 1.6 Chẩn đoán: Theo khuyến cáo hiệp hội bệnh lý truyền nhiễm Hoa Kỳ Hội Lồng Ngực Hoa Kỳ 2016 Các tiêu chuẩn bao gồm thâm nhiễm phổi xuất kèm theo chứng lâm sàng Thâm nhiễm phổi có nguồn gốc từ phổi gồm có khởi phát sốt, khởi phát tiết đàm mủ, khởi phát tăng bạch cầu máu khởi phát giảm oxy hóa máu bệnh nhân thở máy sau 48 1.7 Thực kháng sinh đồ 1.7.1 Kháng sinh đồ khuếch tán: Trên đĩa giấy có tẩm kháng sinh nồng độ định áp dụng rộng rãi 1.7.2 Kháng sinh đồ định lƣợng MIC: Kỹ thuật định lượng đo nồng độ ức chế tối thiểu vi khuẩn một, cho nồng độ định kháng sinh Kết cho biết xác độ nhạy cảm kháng sinh vi khuẩn 1.8 Ứng dụng sinh học phân tử phát gene kháng thuốc: Men β – lactamase vi khuẩn Gram âm tiết ra, thủy phân hệ kháng sinh β – lactam chế thường gặp gây đề kháng kháng sinh lâm sàng Sự diện đặc tính men đóng vai trị quan trọng việc lựa chọn điều trị kháng sinh thích hợp Do trước việc tiếp cận cấu trúc phân tử men β – lactamase phức tạp, gây khó khăn lớn việc xếp loại men β – lactamase, chí bị trùng lắp nhóm Ngày nay, với phát triển công nghệ sinh học phân tử, việc tiếp cận dễ dàng đến trình tự a xít amin, xác định gene mã hóa men lâm sàng Chƣơng 2: ĐỐI TƢỢNG VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 2.1 Thiết kế nghiên cứu: Nghiên cứu tiến cứu mô tả cắt ngang 2.2 Địa điểm nghiên cứu: Khoa ICU nội, ICU ngoại phòng Đột quị khoa Nội Thần Kinh bệnh viện Nhân Dân Gia Định 2.3 Thời gian nghiên cứu: Từ tháng 11/2014 đến 9/2015 2.4 Đối tƣợng nghiên cứu: Dân số mục tiêu: Bệnh nhân nằm khoa bệnh nặng có thở máy Dân số chọn mẫu: Bệnh nhân nằm điều trị khoa kể 2.5 Cỡ mẫu cơng thức tính cỡ mẫu Cơng thức tính cỡ mẫu: n = Z2(1-α/2)p(1-p)/d Sau tính tốn làm tròn n = 220 2.6 Tiêu chuẩn chọn mẫu 2.6.1 Tiêu chuẩn chọn vào nghiên cứu: Sau 48 thở máy, bệnh nhân có thâm nhiễm mới, lan tỏa tiến triển X-quang ngực kèm ≥ tiêu chuẩn: T0 ≥ 38oC, ≤ 36oC; tăng tiết đàm đàm đổi màu; tăng tiêu thụ oxy: tăng FiO2 ≥ 20%/ngày ≥ ngày liền, tăng PEEP ≥ cmH2O/ngày, ≥ ngày liền; bạch cầu máu ≥ 12.000/mm3 hay ≤ 4.000/mm3 2.6.2 Tiêu chuẩn loại ra: < 18 tuổi, xảy viêm phổi trước 48 giờ, Bệnh nhân bị nhồi máu tim 24 đầu, rối loạn nhịp thất nguy hiểm chưa kiểm sốt được, phụ nữ có thai, ghép tạng 2.7 Phƣơng pháp tiến hành: bệnh nhân nội soi phế quan ống mềm Dịch rửa phế quản chia làm hai Một gởi phòng vi cấy định lượng kháng sinh đồ khuếch tán MIC Phần hai gởi phòng sinh học phân tử Trung Tâm Pháp Y TP Hồ Chí Minh định danh vi khuẩn giải trình tự Ion Torrent PGM tìm gene kháng thuốc Chƣơng 3: KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU Trong thời gian lấy mẫu nghiên cứu từ ngày 3/11/2014 đến ngày 30/9/2015, tuyển chọn 220 bệnh nhân thở máy Các bệnh nhân tuyển chọn từ khoa Hồi Sức Tích Cực Chống Độc (ICU nội), Phẫu Thuật Gây Mê Hồi Sức (ICU ngoại) phòng Đột quị khoa Nội Thần Kinh BV NDGĐ Tất bệnh nhân thỏa tiêu chuẩn VPTM lâm sàng nội soi phế quản giường Trong có 12 bệnh nhân tuyển chọn vào nghiên cứu hai lần (do bệnh nhân tái nhập viện nhập vào khoa ICU thời gian lấy mẫu) 3.1 Đặc điểm chung Trong mẫu nghiên cứu nam giới chiếm gần 50% Tuổi trung bình 71 ± 16,7 Phần lớn bệnh nhân tuyển chọn từ khoa ICU nội (79%) (Bảng 3.1) Bảng 3.1: Đặc điểm lâm sàng bệnh nhân nghiên cứu (n = 220) Đặc điểm Thống kê Tuổi (năm; trung bình (± độ lệnh chuẩn)) 70,7 (± 16,7) Số ca (tỉ lệ %) Giới (nam) 109 (49,5) Phân loại khoa Hồi Sức Tích Cực Chống Độc 174 (79,1) Phẫu Thuật Gây Mê Hồi Sức 43 (19,5) Phòng Đột quị Khoa Nội Thần Kinh (1,4) Lý nhập viện Khó thở 92 (41,8) Rối loạn tri giác 39 (17,7) Biểu đồ 3.1 Phân tích cụm 99 lồi VK định danh giải trình tự 16S-rRNA 3.5 So sánh giải trình tự gene 16S-rRNA vi sinh kinh điển định danh VK Bảng 3.3 So sánh hai phương pháp định danh vi khuẩn dựa vào ni cấy giải trình tự hệ thống PGM Đồng thuận nuôi cấy Trực khuẩn gr (-) yếm khí PGM tùy nghi Acinetobacter spp Actinobacillus lignieresii Klebsiella spp Aeromonas spp Pseudomonas spp Calothrix desertica Staphylococcus aureus Chroococcidiopsis thermalis Burkholderia spp Erwinia psidii Haemophilus spp Shigella spp Các loài định danh Trực khuẩn gr (+) yếm khí PGM Trực khuẩn gr (-) yếm khí Atopobium rimae Alloprevotella rava Bacillus coagulans Bacteroides pyogenees Trực khuẩn gr (+) hiếu khí Catonella morbi Bacillus amyloliquefaciens Fusobacterium spp Corynebacterium striatum Pectobacterium spp Cầu khuẩn gr (+) yếm khí tùy nghi Porphyromonas spp Gemella spp Prevotella spp Granulicatella adiacens Serratia liquefaciens Rothia mucilaginosa Shewanella profunda Vagococcus entomophilus Tannerella forsythia Cầu khuẩn gr (+) yếm khí Trực khuẩn gr (-) hiếu khí Peptostreptococcus stomatis Aureimonas glaciistagni Liên cầu gr (+) yếm khí tùy nghi Diaphorobacter spp Streptococcus spp Elizabethkingia spp Cầu trực khuẩn gr (+) yếm khí tùy nghi Neisseria spp Lactobacillus spp Novosphingobium spp Cầu trực khuẩn gr (-) yếm khí tùy nghi Psychrobacter spp Gallibacterium anatis Sphingomonas spp Pasteurella spp Xoắn khuẩn gr (-) yếm khí tùy Cầu khuẩn gr (-) yếm khí nghi Rhodospirillum oryzae Veillonella parvula 3.8 Kết kháng sinh đồ 3.8.1 Kết kháng sinh đồ khuếch tán chung Gần 85% VK phân lập đa kháng (Bảng 3.5) Bảng 3.5 Kết kháng sinh đồ khuếch tán chung Kháng sinh Tỉ lệ đề kháng (n, %) Cefoperazone 14 (63,6) Ceftazidime 132 (80) Ceftriaxone 68 (88,3) Cefoperazon-Sulbactam 20 (16,8) Kháng sinh Tỉ lệ đề kháng (n, %) Cefepime 105 (75) Piperacillin-Tazobactam 97 (64,2) Imipenem 114 (70,8) Meropenem 105 (63,2) Ertapenem 15 (39,4) Amikacin 87 (53,7) Genetamycin 73 (70,1) Ciprofloxacin 86 (77,4) Levofloxacin 120 (71,8) Colistin (1,6) Ghi chú: phần trăm tính theo dịng 3.8.8 Các dạng đề kháng kháng sinh Acinetobacter baumannii, Klebsiella pneumoniae Pseudomonas aeruginosa Khuynh hướng đề kháng kháng sinh A baumannii, K pneumoniae P aeruginosa hình thành mạng lưới đa kháng kháng sinh Mỗi đường nối hai kháng sinh đại diện cho tối thiểu trường hợp bị đề kháng hai loại kháng sinh Độ dầy đường nối hai kháng sinh biểu cho mức độ đề kháng hai kháng sinh Đường nối hai kháng sinh dầy hai kháng sinh bị kháng cao Mỗi nốt trịn đại diện cho tối thiểu bệnh nhân Kích thước nốt lớn tương ứng với số lượng bệnh nhân sử dụng hai loại kháng sinh nhiều (Biểu đồ 3.4) 3.9 Kết kháng sinh đồ MIC dựa E-test 3.9.1 Kháng sinh đồ MIC A baumannii: Bảng 3.9 Kết kháng sinh đồ MIC A baumannii (n = 74) Kháng sinh Amikacin Sulbactam Colistin Nhạy n (%) Trung gian n (%) Kháng n (%) MIC≤16 µg/ml MIC=32 µg/ml MIC≥64µg/ml 12 (16,2) 10 (13,5) 52 (70,3) MIC≤4 µg/ml MIC=8 µg/ml MIC≥16 µg/ml (9,5) 26 (35,1) 41 (55,4) MIC≤2µg/ml MIC≥4 µg/ml 73 (98,6) (1,4) MIC ≤ 0,125 µg/ml Colistin MIC > 0,125 µg/ml 59 (80) 15 (20) MIC≤2 µg/ml MIC=4 µg/ml MIC≥8 µg/ml Levofloxacin (5,4) (5,4) 66 (89,2) Imipenem (4) Meropenem (4) 71 (96) (2,7) 69 (93,2) Ghi chú: tỉ lệ phần trăm tính theo dịng 3.9.2 Kháng sinh đồ MIC K pneumoniae: Bảng 3.10 Kết kháng sinh đồ MIC Klebsiella (n=39) Kháng sinh Nhạy n (%) Trung gian n (%) Kháng n (%) MIC ≤16µg/ml MIC = 32µg/ml MIC ≥64µg/ml 37 (94,9) (5,1) MIC ≤ 4µg/ml MIC = µg/ml MIC≥16µg/ml 0 38 (100) MIC ≤ 2µg/ml MIC = 4µg/ml MIC ≥ 8µg/ml Colistin 38 (100) 0 Levofloxacin 16 (41) 23 (59) MIC ≤ 1µg/ml MIC = 2µg/ml MIC ≥ 8µg/ml Imipenem 26 (67) (10) (23) Meropenem 30 (79) (13,1) (7,9) Amikacin Sulbactam Ghi chú: tỉ lệ phần trăm tính theo dịng 3.9.3 Kháng sinh đồ MIC P aeruginosa (n = 29) Bảng 3.11 Kết kháng sinh đồ MIC P aeruginosa Kháng sinh Nhạy n (%) Trung gian n (%) Kháng n (%) MIC≤16µg/ml MIC=32µg/ml MIC≥64µg/ml 10 (34,5) (6,9) 17 (58,6) MIC≤2µg/ml MIC=4µg/ml MIC≥8µg/ml 28 (96,5) (3,5) Levofloxacin (17,2) (6,9) 22 (75,9) Imipenem (20,7) (3,4) 22 (75,9) Meropenem (17,2) Amikacin Colistin Sulbactam 24 (82,8) MIC≤4µg/ml MIC=8µg/ml MIC≥16µg/ml 0 29 (100) Ghi chú: tỉ lệ phần trăm tính theo dịng 3.10 Kết PCR tìm gene kháng thuốc 3.10.1 Phân bố gene kháng thuốc phát đƣợc từ VK Acinetobacter baumannii, Klebsiella pneumoniae Pseudomonas aeruginosa Đối với Acinetobacter, ba gene kháng thuốc phát nhiều TEM, SPM, SHV Đối với Klebsiella, gene BIC phát nhiều (Bảng 3.14) Bảng 3.14 Phân bố gene kháng thuốc phát Gene kháng thuốc Acinetobacter Klebsiella Pseudomonas N (%) TEM (964bp) 23 (39,6) (13,9) SPM (271 bp) 14 (22.4) (20,9) SHV (790bp) (15,5) (13,9) (20) Gene kháng thuốc Acinetobacter Klebsiella Pseudomonas BIC (537 bp) (5,1) 15 (34,9) IMP (232bp) (5,1) (9,3) (40) KPC (798 bp) (5,1) 0 NDM (621 bp) (3,4) (40) OXA (438 bp) (1,7) (6,9) 3.10.2 Mối liên quan gene kháng thuốc đề kháng kháng sinh: Bảng 3.15 Mối liên quan gene kháng thuốc đề kháng kháng sinh Ghi chú: NA: not applicable: không áp dụng