Khảo sát liên quan giữa các biến thể gene abcg2 và nồng độ axit uric máu ở người trưởng thành

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƯỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH LÝ BẢO NGỌC KHẢO SÁT LIÊN QUAN GIỮA CÁC BIẾN THỂ GENE ABCG2 VÀ NỒNG ĐỘ AXIT URIC MÁU Ở NGƯỜI TRƯỞNG THÀNH LUẬN VĂN THẠC SĨ Y HỌC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH, NĂM 2021 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƯỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH LÝ BẢO NGỌC KHẢO SÁT LIÊN QUAN GIỮA CÁC BIẾN THỂ GENE ABCG2 VÀ NỒNG ĐỘ AXIT URIC MÁU Ở NGƯỜI TRƯỞNG THÀNH NGÀNH: KHOA HỌC Y SINH (SINH LÝ HỌC) MÃ SỐ: 8720101 LUẬN VĂN THẠC SĨ Y HỌC NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: TS.BS ĐỖ ĐỨC MINH THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH, NĂM 2021 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu riêng tơi, kết nghiên cứu trình bày luận văn trung thực, khách quan chưa công bố nơi Tác giả luận văn Lý Bảo Ngọc i MỤC LỤC Lời cam đoan i Danh mục chữ viết tắt thuật ngữ Anh – Việt iv Danh mục bảng vii Danh mục hình .ix ĐẶT VẤN ĐỀ Chương 1: TỔNG QUAN Y VĂN 1.1 Axit uric 1.2 Những nghiên cứu nồng độ axit uric máu 10 1.3 Gene ABCG2 biến thể gene ABCG2 .17 Chương 2: ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU .34 2.1 Thiết kế nghiên cứu 34 2.2 Thời gian địa điểm nghiên cứu 34 2.3 Đối tượng nghiên cứu .34 2.4 Cỡ mẫu nghiên cứu 35 2.5 Định nghĩa biến số nghiên cứu 36 2.6 Phương pháp công cụ đo lường, thu thập số liệu 38 2.7 Quy trình nghiên cứu 39 2.8 Phương pháp phân tích liệu 42 2.9 Đạo đức nghiên cứu 44 Chương 3: KẾT QUẢ .46 3.1 Đặc điểm đối tượng nghiên cứu .46 3.2 Tỉ lệ biến thể Q141K, Q126X, V12M gene ABCG2 người Việt Nam trưởng thành 51 3.3 Mối liên quan biến thể V12M, Q141K, Q126X gene ABCG2 với nồng độ axit uric máu người Việt Nam trưởng thành 58 Chương 4: BÀN LUẬN 71 KẾT LUẬN – KIẾN NGHỊ 95 i TÀI LIỆU THAM KHẢO PHỤ LỤC 1: PHIẾU THU THẬP SỐ LIỆU PHỤ LỤC 2: BẢN THÔNG TIN DÀNH CHO NGƯỜI THAM GIA NGHIÊN CỨU VÀ CHẤP THUẬN THAM GIA NGHIÊN CỨU PHỤ LỤC 3: BẢNG TÓM TẮT ĐẶC ĐIỂM ĐỐI TƯỢNG NGHIÊN CỨU PHỤ LỤC 4: KẾT QUẢ GIẢI TRÌNH TỰ GENE ABCG2 PHỤ LỤC 5: DANH SÁCH ĐỐI TƯỢNG THAM GIA NGHIÊN CỨU PHỤ LỤC 6: CHẤP THUẬN CỦA HỘI ĐỒNG ĐẠO ĐỨC v DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT VÀ THUẬT NGỮ ANH – VIỆT Viết tắt ABCG2 ACR Tiếng Anh Tiếng Việt ATP – binding cassette Đại gia đình protein vận subfamily G member chuyển phụ thuộc ATP American College of Rheumatology Hội thấp khớp Hoa Kỳ ATP Adenosine triphosphat Năng lượng ATP BCRP Breast cancer resistance protein Protein đề kháng ung thư vú BMI Body mass index Chỉ số khối thể bp Base pair Cặp base DNA Deoxyribonucleic acid Acid deoxyribonucleic EDTA Ethylene diamin tetraacetic acid eGFR EULAR ESC ExAC FEUA Estimated glomerular filtration rate Acid ethylene diamin tetraacetic Độ lọc cầu thận ước tính European League Against Liên hiệp Thấp khớp Châu Rheumatism Âu European Society of Cardiology Hiệp hội Tim mạch Châu Âu Exome Aggregation Cơ sở liệu exome Consortium database người Fraction excretion of urate Phân suất xuất axit uric niệu Viết tắt GWAS HPFS IDI & WPRO Tiếng Anh Tiếng Việt Geneome – wide association Nghiên cứu tương quan toàn studies nhiễm sắc thể Health Professionals Follow – Nghiên cứu theo dõi up Study chuyên gia sức khỏe International Diabetes Institude & Regional office for the Western Pacific Hiệp hội Đái tháo đường nước Châu Á IL Interleukin Interleukin MSU Monosodium Urate Monosodium Urate NHANES National Health and Nutrition Examination Survey Chương trình khảo sát sức khỏe dinh dưỡng quốc gia Hoa Kỳ PCR Polymerase Chain Reaction Phản ứng chuỗi trùng hợp RNA Ribonucleic acid Acid ribonucleic SLC Solute carrier family SNP Single nucleotide polymorphism UUE Urinary urate excretion XDH Xanthine dehydrogenease XO Xanthine oxidase Họ gia đình protein mang hịa tan Điểm đa hình đơn nucleotide Độ thải axit uric Gene mã hóa protein xanthine dehydrogenease Men xanthine oxidase i Viết tắt XOR Tiếng Anh Xanthine oxidoreductase Tiếng Việt Men xanthine oxidoreductase ii DANH MỤC CÁC BẢNG Bảng 1.1 Tần số alen Q141K, V12M, Q126X số chủng tộc 26 Bảng 2.1 Biến số độc lập nghiên cứu 36 Bảng 2.2 Biến số phụ thuộc nghiên cứu .38 Bảng 2.3 Trình tự mồi dùng để khuếch đại trình tự exon gene ABCG2 40 Bảng 3.1 Kết đặc điểm đối tượng nghiên cứu 46 Bảng 3.2 Mối tương quan nồng độ axit uric máu BMI, huyết áp tâm thu, huyết áp tâm trương (N = 150) .51 Bảng 3.3 Thống kê kiểu gene, tần số alen, tỉ lệ biến thể đa hình V12M, Q141K, Q126X gene ABCG2 (N = 150) 52 Bảng 3.4 Bảng tần số haplotype V12M Q141K nghiên cứu (N=150) 53 Bảng 3.5 Mối liên quan haplotype V12M, Q141K nồng độ axit uric máu 53 Bảng 3.6 Mối liên quan giới tính kiểu gene đa hình V12M, Q141K nghiên cứu (N = 150) 55 Bảng 3.7 Mối liên quan BMI kiểu gene đa hình V12M, Q141K nghiên cứu (N = 150) .56 Bảng 3.8 Mối liên quan tuổi kiểu gene đa hình V12M, Q141K nghiên cứu (N = 150) .57 Bảng 3.9 Mối liên quan kiểu gene đa hình V12M nồng độ axit uric máu (N = 150) .58 Bảng 3.10 Mối liên quan kiểu gene đa hình Q141K nồng độ axit uric máu (N = 150) 60 Bảng 3.11 Mối liên quan nồng độ axit uric máu số alen nguy đa hình V12M, Q141K, Q126X 62 Bảng 3.12 Mối liên quan biến thể V12M, Q141K gene ABCG2 với nồng độ axit uric máu theo giới tính .63 ii Bảng 3.13 Mối liên quan biến thể V12M, Q141K gene ABCG2 nồng độ axit uric máu theo BMI 66 Bảng 3.14 Mối liên quan kiểu gene đa hình V12M nồng độ axit uric máu giới nữ (N = 112) 67 Bảng 3.15 Mối liên quan kiểu gene đa hình Q141K nồng độ axit uric máu giới nữ (N = 112) 68 Bảng 3.16 Mối liên quan nồng độ axit uric máu số alen nguy đa hình V12M, Q141K, Q126X giới nữ 69 Bảng 4.1 Tần số alen biến thể V12M, Q141K, Q126X gene ABCG2 78 Bảng 4.2 Tần số haplotype V12M, Q141K Q126X 81 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh STT V12M Q141K Q126X Giới Tuổi Huyết áp tâm Huyết áp tâm BMI Nồng độ axit tính (năm) thu (mmHg) trương (mmHg) (kg/m2) uric máu (mg/dl) 33 AA CC CC Nữ 35 100 60 21.4 4.30 34 AG CC CC Nam 33 130 88 26.7 6.99 35 AG AC CC Nam 31 129 85 23.8 4.29 36 AA CC CC Nam 35 130 72 24.4 3.17 37 GG AC CC Nữ 28 100 68 22.9 4.54 38 AG CC CC Nữ 31 112 71 18.4 4.20 39 AA CC CC Nữ 40 121 68 25.8 5.31 40 AA AC CC Nữ 29 115 65 20.0 4.12 41 AG CC CC Nữ 34 124 84 21.6 4.56 42 AA AC CC Nữ 40 112 63 25.1 4.90 43 GG AA CC Nữ 35 114 62 19.4 5.90 44 AG CC CC Nữ 34 112 71 21.6 4.14 45 AA AA CC Nữ 29 100 60 17.8 4.66 46 AA CC CC Nữ 39 127 75 23.6 4.44 47 AG CC CC Nữ 25 100 63 19.9 4.15 48 AA CC CC Nữ 31 110 72 24.0 5.35 49 AG AC CC Nữ 40 120 63 28.4 4.52 Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh STT V12M Q141K Q126X Giới Tuổi Huyết áp tâm Huyết áp tâm BMI Nồng độ axit tính (năm) thu (mmHg) trương (mmHg) (kg/m2) uric máu (mg/dl) 50 AG AC CC Nữ 36 115 68 20.0 5.09 51 GG AC CC Nữ 31 108 62 22.7 4.39 52 AG AA CC Nữ 34 142 87 22.7 5.65 53 AA CC CC Nữ 40 101 61 25.5 4.84 54 GG AC CC Nữ 35 127 72 23.9 5.58 55 GG CC CC Nữ 40 104 75 21.8 4.44 56 AG AC CC Nam 38 148 90 25.2 6.62 57 GG CC CC Nữ 39 126 100 27.7 4.09 58 AA CC CC Nữ 40 132 113 23.2 4.52 59 AG AC CC Nữ 28 100 67 18.7 4.14 60 GG AC CC Nữ 41 118 80 26.7 4.25 61 AG AC CC Nữ 38 100 70 21.6 5.48 62 GG AC CC Nam 50 120 80 21.0 5.31 63 AG AC CC Nữ 47 100 60 18.0 5.30 64 AG CC CC Nữ 40 107 73 22.2 4.24 65 AG CC CC Nữ 29 110 70 21.4 4.40 66 GG CC CC Nữ 28 110 72 20.7 5.78 Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh STT V12M Q141K Q126X Giới Tuổi Huyết áp tâm Huyết áp tâm BMI Nồng độ axit tính (năm) thu (mmHg) trương (mmHg) (kg/m2) uric máu (mg/dl) 67 GG AA CC Nữ 50 117 77 20.2 4.34 68 GG CC CC Nữ 32 106 77 25.8 5.95 69 GG AA CC Nữ 54 133 80 24.1 4.34 70 GG AC CC Nữ 31 103 60 19.1 3.45 71 AG CC CC Nữ 28 110 80 20.0 4.40 72 AA CC CC Nữ 27 105 60 18.6 4.35 73 AG CC CC Nam 35 109 64 23.1 5.31 74 GG AC CC Nữ 34 128 76 20.7 5.30 75 GG AC CC Nữ 40 126 78 18.7 3.95 76 AG AC CC Nữ 45 143 86 21.5 4.93 77 AA CC CC Nữ 39 129 79 18.8 4.76 78 GG AC CC Nữ 43 126 83 27.6 4.79 79 AG AC CC Nữ 54 120 80 23.8 4.17 80 GG CC CC Nữ 44 100 63 22.5 5.33 81 AA AC CC Nam 40 126 70 25.8 4.69 82 AG CC CC Nữ 34 109 73 18.8 6.00 83 GG AA CC Nữ 25 106 75 17.0 5.20 Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh STT V12M Q141K Q126X Giới Tuổi Huyết áp tâm Huyết áp tâm BMI Nồng độ axit tính (năm) thu (mmHg) trương (mmHg) (kg/m2) uric máu (mg/dl) 84 AA CC CC Nữ 52 124 82 24.7 5.33 85 AG CC CC Nam 36 130 90 24.4 6.49 86 AG CC CC Nữ 36 119 69 20.8 5.82 87 AG AC CC Nữ 48 100 60 20.3 3.77 88 AG CC CC Nữ 35 124 75 23.7 4.30 89 GG AC CC Nữ 32 100 70 19.1 5.51 90 GG CC CC Nữ 37 100 60 20.5 4.00 91 AA CC CC Nữ 59 129 72 25.0 3.93 92 AG AC CC Nữ 53 135 80 22.9 4.42 93 AA CC CC Nữ 60 138 90 19.5 4.56 94 GG AC CC Nam 52 130 90 25.4 7.16 95 AG AC CC Nữ 46 125 64 24.0 4.34 96 GG CC CC Nữ 41 122 70 22.9 4.14 97 GG AC CC Nữ 49 140 90 23.5 5.73 98 AG CC CC Nữ 40 100 60 23.0 5.55 99 AG AC CC Nữ 56 120 75 24.4 5.83 100 AA CC CC Nam 31 126 70 24.9 6.76 Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh STT V12M Q141K Q126X Giới Tuổi Huyết áp tâm Huyết áp tâm BMI Nồng độ axit tính (năm) thu (mmHg) trương (mmHg) (kg/m2) uric máu (mg/dl) 101 AG AC CC Nam 41 124 76 22.7 6.83 102 AG AC CC Nam 31 136 80 34.3 5.60 103 AA AA CC Nam 35 130 90 22.6 6.76 104 AG AC CC Nữ 23 122 75 19.8 5.30 105 GG AA CC Nữ 32 126 82 23.9 5.73 106 AG CC CC Nữ 27 110 70 18.6 4.83 107 AG AC CC Nữ 44 120 80 22.9 5.41 108 GG AC CC Nữ 27 100 60 17.8 5.43 109 GG AC CC Nam 34 136 96 22.9 6.42 110 AA CC CC Nam 42 136 84 28.1 5.31 111 AA CC CC Nam 37 121 84 25.0 5.95 112 GG AC CC Nam 40 136 71 24.1 6.71 113 GG CC CC Nữ 26 135 79 24.5 5.97 114 AA CC CC Nữ 35 110 70 18.4 3.83 115 AA CC CC Nam 29 120 64 21.1 6.61 116 AG AC CC Nữ 24 105 63 19.7 4.61 117 AG CC CC Nữ 28 130 85 22.9 5.33 Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh STT V12M Q141K Q126X Giới Tuổi Huyết áp tâm Huyết áp tâm BMI Nồng độ axit tính (năm) thu (mmHg) trương (mmHg) (kg/m2) uric máu (mg/dl) 118 GG AA CC Nữ 37 104 65 18.5 4.47 119 AG AC CC Nữ 29 115 80 18.9 5.26 120 GG CC CC Nữ 35 100 70 23.0 5.65 121 AG CC CC Nữ 39 128 97 22.7 4.88 122 AG CC CC Nữ 33 112 65 17.5 4.62 123 AG AC CC Nữ 30 110 74 20.3 3.65 124 GG AA CC Nữ 35 110 65 22.9 4.62 125 AG AC CC Nữ 28 114 62 19.6 5.90 126 GG AC CC Nữ 29 99 73 17.1 4.52 127 GG CC CC Nữ 28 110 70 21.5 5.67 128 AG AC CC Nữ 36 124 71 19.7 4.89 129 GG AC CC Nam 33 140 90 23.0 6.44 130 AG AC CC Nữ 34 100 70 22.3 5.78 131 AG CC CC Nữ 25 120 80 16.2 3.36 132 AG CC CC Nữ 38 124 74 20.5 4.64 133 AA CC CC Nam 33 134 80 26.4 6.51 134 GG AC CC Nữ 33 100 60 19.7 4.09 Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh STT V12M Q141K Q126X Giới Tuổi Huyết áp tâm Huyết áp tâm BMI Nồng độ axit tính (năm) thu (mmHg) trương (mmHg) (kg/m2) uric máu (mg/dl) 135 GG AC CC Nữ 34 138 62 22.2 4.14 136 AG AC CC Nam 38 122 76 22.3 6.37 137 AG CC CC Nữ 42 114 75 24.1 4.77 138 AG AC CC Nữ 42 122 76 24.0 4.69 139 GG CC CC Nữ 36 100 60 19.7 3.45 140 AG AC CC Nữ 35 97 60 16.4 3.38 141 GG AA CC Nữ 37 130 80 21.8 5.51 142 AG AC CC Nữ 36 100 70 19.8 4.66 143 GG CC CC Nữ 36 118 80 27.4 4.24 144 AA CC CC Nữ 26 100 60 16.6 5.14 145 AG AC CC Nữ 24 100 70 20.3 5.30 146 GG CC CC Nữ 37 90 60 21.9 3.72 147 AG CC CC Nữ 29 100 60 17.5 4.47 148 AG CC CC Nữ 39 110 65 22.5 4.35 149 AG AC CC Nữ 38 95 60 20.3 4.07 150 GG AC CC Nữ 51 127 76 26.2 4.59 Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh PHỤ LỤC 4: KẾT QUẢ GIẢI TRÌNH TỰ GENE ABCG2 Kết điện di kiểm tra sản phẩm khuếch đại exon gene ABCG2 Kết giải trình tự Sanger xác định kiểu gene đa hình Q141K Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Kết giải trình tự Sanger xác định kiểu gene đa hình V12M Kết giải trình tự Sanger xác định kiểu gene đa hình Q126X Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh PHỤ LỤC 5: DANH SÁCH ĐỐI TƯỢNG THAM GIA NGHIÊN CỨU Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh PHỤ LỤC 6: CHẤP THUẬN CỦA HỘI ĐỒNG ĐẠO ĐỨC Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn