Bài giảng nguyên lý hoá sinh bài 3a pgs ts bùi văn lệ

David L Nelson and Michael M Cox LEHNINGER PRINCIPLES OF BIOCHEMISTRY Sixth Edition BÀI AMINO ACID-PEPTID-PROTEINS © 2016 PGS.TS BÙI VĂN LỆ Một vài chức protein 3.1 Các acid amin Acid amin (Aa) thường tìm thấy thành phần protein (20 Aa) cấu tạo nhóm α-carboxyl, nhóm α-amino nhóm R đặc biệt thay nguyên tử α-carbon H R side chain a carbon H N amino group -NH2 C C H O OH carboxyl group -COOH Nguyên tử α-carbon tất acid amin (ngoại trừ glycine) bất đối xứng acid amin tồn hai dạng đồng phân lập thể (L;D) Đồng phân lập thể amino acid Chỉ có dạng đồng phân L với cấu hình liên quan đến cấu hình tuyệt đối phân tử L-glyceraldehyde chuẩn tìm thấy protein Các amino acids dạng D tìm thấy số peptide nhỏ,bao gồm vài peptide vách tế bào vi khuẩn vài loại kháng sinh (như penicillin) D-Glu D-Ala Acid amin chia thành nhóm dựa vào tính phân cực điện tích (ở pH 7) nhóm R 3.4 Cấu trúc protein: Cấu trúc bậc Sự khác chức protein khác thành phần trình tự acid amin Một số thay đổi trình tự xảy với protein đặc biệt ảnh hưởng khơng ảnh hưởng đến chức protein ` Các trình tự acid amin suy cách phân đoạn polypeptid thành peptide nhỏ với tác nhân biết để cắt liên kết peptide đặc hiệu; xác định trình tự acid amin phân đoạn q trình phân giải tự động hóa Edman ; sau xếp phân đoạn peptide cách tìm trình tự chồng lấp phân đoạn sinh tác nhân khác Trình tự protein suy từ trình tự nucleotide gen tương ứng DNA Direct Protein Sequencing Breaking disulfide bonds in proteins Các protein peptide ngắn (lên đến khoảng 100 acid amin) tổng hợp phương pháp hóa học Peptide tạo thành , thành phần acid amin lần bị gắn vào giá thể rắn 9-fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc) Các trình tự protein nguồn thơng tin dồi cấu trúc chức protein tiến hóa sống trái đất Các phương pháp tinh vi phát triển để theo dõi tiến hóa cách phân tích thay đổi chậm trình tự acid amin protein tương đồng ... dầu cấu peptid phức tạp ptotein có vài chức sinh học TD1: -Glutathione (g-glutamyl-L-cysteinylglycine) tripeptid tìm thấy hầu hết sinh vật có nhiều chức sinh học quan trọng tổng hợp protein, DNA,... Chúng khám phá sau nhà nghiên cứu nghi ngờ hiệu ứng sinh lý dùng thuốc phiện morphine kết từ chúng nối vối thụ quan tế bào thần kinh cho phân tử nội sinh Leu-kephaline met-kephaline pentapeptid chúng... nhóm α-carboxyl, nhóm α-amino nhóm R đặc biệt thay nguyên tử α-carbon H R side chain a carbon H N amino group -NH2 C C H O OH carboxyl group -COOH Nguyên tử α-carbon tất acid amin (ngoại trừ glycine)