Luận án tiến sĩ: Nghiên cứu thực trạng và một số yếu tố liên quan đến bệnh quanh răng ở học sinh 12 14 tuổi tại huyện Quế Phong tỉnh Nghệ An, hiệu quả can thiệp (2016 2017)

Luận án tiến sĩ: Nghiên cứu thực trạng và một số yếu tố liên quan đến bệnh quanh răng ở học sinh 12 14 tuổi tại huyện Quế Phong tỉnh Nghệ An, hiệu quả can thiệp (2016 2017)Luận án tiến sĩ: Nghiên cứu thực trạng và một số yếu tố liên quan đến bệnh quanh răng ở học sinh 12 14 tuổi tại huyện Quế Phong tỉnh Nghệ An, hiệu quả can thiệp (2016 2017)Luận án tiến sĩ: Nghiên cứu thực trạng và một số yếu tố liên quan đến bệnh quanh răng ở học sinh 12 14 tuổi tại huyện Quế Phong tỉnh Nghệ An, hiệu quả can thiệp (2016 2017)Luận án tiến sĩ: Nghiên cứu thực trạng và một số yếu tố liên quan đến bệnh quanh răng ở học sinh 12 14 tuổi tại huyện Quế Phong tỉnh Nghệ An, hiệu quả can thiệp (2016 2017)Luận án tiến sĩ: Nghiên cứu thực trạng và một số yếu tố liên quan đến bệnh quanh răng ở học sinh 12 14 tuổi tại huyện Quế Phong tỉnh Nghệ An, hiệu quả can thiệp (2016 2017)Luận án tiến sĩ: Nghiên cứu thực trạng và một số yếu tố liên quan đến bệnh quanh răng ở học sinh 12 14 tuổi tại huyện Quế Phong tỉnh Nghệ An, hiệu quả can thiệp (2016 2017)Luận án tiến sĩ: Nghiên cứu thực trạng và một số yếu tố liên quan đến bệnh quanh răng ở học sinh 12 14 tuổi tại huyện Quế Phong tỉnh Nghệ An, hiệu quả can thiệp (2016 2017)Luận án tiến sĩ: Nghiên cứu thực trạng và một số yếu tố liên quan đến bệnh quanh răng ở học sinh 12 14 tuổi tại huyện Quế Phong tỉnh Nghệ An, hiệu quả can thiệp (2016 2017)Luận án tiến sĩ: Nghiên cứu thực trạng và một số yếu tố liên quan đến bệnh quanh răng ở học sinh 12 14 tuổi tại huyện Quế Phong tỉnh Nghệ An, hiệu quả can thiệp (2016 2017)Luận án tiến sĩ: Nghiên cứu thực trạng và một số yếu tố liên quan đến bệnh quanh răng ở học sinh 12 14 tuổi tại huyện Quế Phong tỉnh Nghệ An, hiệu quả can thiệp (2016 2017)Luận án tiến sĩ: Nghiên cứu thực trạng và một số yếu tố liên quan đến bệnh quanh răng ở học sinh 12 14 tuổi tại huyện Quế Phong tỉnh Nghệ An, hiệu quả can thiệp (2016 2017)Luận án tiến sĩ: Nghiên cứu thực trạng và một số yếu tố liên quan đến bệnh quanh răng ở học sinh 12 14 tuổi tại huyện Quế Phong tỉnh Nghệ An, hiệu quả can thiệp (2016 2017)Luận án tiến sĩ: Nghiên cứu thực trạng và một số yếu tố liên quan đến bệnh quanh răng ở học sinh 12 14 tuổi tại huyện Quế Phong tỉnh Nghệ An, hiệu quả can thiệp (2016 2017)Luận án tiến sĩ: Nghiên cứu thực trạng và một số yếu tố liên quan đến bệnh quanh răng ở học sinh 12 14 tuổi tại huyện Quế Phong tỉnh Nghệ An, hiệu quả can thiệp (2016 2017)Luận án tiến sĩ: Nghiên cứu thực trạng và một số yếu tố liên quan đến bệnh quanh răng ở học sinh 12 14 tuổi tại huyện Quế Phong tỉnh Nghệ An, hiệu quả can thiệp (2016 2017)Luận án tiến sĩ: Nghiên cứu thực trạng và một số yếu tố liên quan đến bệnh quanh răng ở học sinh 12 14 tuổi tại huyện Quế Phong tỉnh Nghệ An, hiệu quả can thiệp (2016 2017)Luận án tiến sĩ: Nghiên cứu thực trạng và một số yếu tố liên quan đến bệnh quanh răng ở học sinh 12 14 tuổi tại huyện Quế Phong tỉnh Nghệ An, hiệu quả can thiệp (2016 2017)Luận án tiến sĩ: Nghiên cứu thực trạng và một số yếu tố liên quan đến bệnh quanh răng ở học sinh 12 14 tuổi tại huyện Quế Phong tỉnh Nghệ An, hiệu quả can thiệp (2016 2017)Luận án tiến sĩ: Nghiên cứu thực trạng và một số yếu tố liên quan đến bệnh quanh răng ở học sinh 12 14 tuổi tại huyện Quế Phong tỉnh Nghệ An, hiệu quả can thiệp (2016 2017)

1 ĐẶT VẤN ĐỀ Bệnh quanh (BQR) nói riêng, bệnh miệng nói chung nghiên cứu từ thời Hyppocrate (460 -372 trước công nguyên) Nhưng hiểu biết bệnh hạn chế thời gian dài, đến cuối kỷ 19 số nhà y học như: Pere mô tả BQR chưa đầy đủ, Fones mô tả bệnh BQR cách đầy đủ lâm sàng sinh bệnh học Sau nghiên cứu Pere Fones đến nghiên cứu BQR phát triển rộng khắp giới [33] Ngày nay, với tiến khoa học kỹ thuật, tìm chế bệnh sinh BQR, kết hợp với việc vệ sinh miệng cách khoa học, làm giảm đáng kể BQR nói riêng bệnh miệng nói chung [14], [54] Bệnh quanh răng, bệnh phổ biến giới, lứa tuổi, thành phần xã hội [36] Ngay Hoa Kỳ, nước có y học phát triển, dân trí cao tỷ lệ mắc BQR 50%, chí tới 90% [52], [66] Việt Nam nước chậm phát triển, điều kiện kinh tế cịn nhiều khó khăn, điều kiện vệ sinh miệng chưa tốt, nhận thức người dân BQR nhiều hạn chế làm cho BQR khơng khơng giảm mà có xu hướng tăng cao năm gần đây, ảnh hưởng cách sinh hoạt người dân có nhiều thay đổi Đặc biệt vùng sâu, vùng xa, công tác nha học đường chưa quan tâm thỏa đáng tỷ lệ bệnh miệng, BQR cịn cao[23], [33], [53] BQR dẫn đến viêm tủy răng, viêm tủy xương hàm, nhiễm trùng huyết ngun nhân gây Việc chẩn đốn nguyên gây BQR có nhiều kỹ thuật chuyên sâu, đại như: Sinh học phân tử, miễn dịch học, kỹ thuật RAPID ID 32A định danh vi khuẩn [10], [15], [59] Tại Nghệ An nói chung Quế Phong nói riêng, huyện miền núi điều kiện kinh tế cịn khó khăn, đa số người dân đồng bào dân tộc thiểu số như: Người Thái, người Tày người Kinh xây dựng kinh tế Công tác vệ sinh miệng học đường chưa quan tâm, thiếu thốn nguồn lực cho cơng tác chăm sóc y tế, huyện có y sỹ chuyên khoa hàm mặt Kết hợp với nhận thức người dân bệnh miệng cịn Vì vậy, yếu tố nguy cho bệnh miệng phát triển Nhưng chưa có cơng trình nghiên cứu có tính chất quy mơ đầy đủ tình trạng BQR địa bàn, mức độ ảnh hưởng bệnh đến cộng đồng sao? đối tượng học sinh 12-14 tuổi Để giải vấn đề trên, thực đề tài: Nghiên cứu thực trạng số yếu tố liên quan đến bệnh quanh học sinh 12 -14 tuổi huyện Quế Phong, tỉnh Nghệ An, hiệu can thiệp (2016 -2017), nhằm mục tiêu nghiên cứu sau: Mô tả thực trạng số yếu tố liên quan đến bệnh quanh học sinh 12 - 14 tuổi trường trung học sở huyện Quế Phong, tỉnh Nghệ An năm 2016 Đánh giá hiệu can thiệp giáo dục truyền thông điều trị bệnh quanh Chƣơng 1: TỔNG QUAN 1.1 Đại cƣơng bệnh quanh 1.1.1 Đặc điểm giải phẫu tổ chức học vùng quanh Cấu trúc giải phẫu quanh gồm: Lợi, dây chằng quanh - Lợi: Là niêm mạc biệt hóa, bám vào cổ chân xương ổ Lợi có loại biểu mơ sừng hóa biểu mơ khơng sừng hóa, có tổ chức liên kết, giàu mạch máu thần kinh Bên lợi dịch lợi, bình thường ít, viêm số lượng dịch tăng, dịch lợi giúp tăng cường miễn dịch tế bào qua hình thức thực bào [33] - Dây chằng quanh răng: Là bó sợi liên kết, dày 0,17 - 0,25 mm Một đầu bám vào xương răng, đầu bám vào xương ổ Giữa ổ cho vùng quanh đảm bảo vững trắc liên kết xương xương ổ [33] Dây chằng quanh có thành phần gồm: Các tế bào dây chằng quanh răng; Sợi liên kết dây chằng quanh Chất dây chằng quanh (chất nền) có chất hóa học Proteoglycans glycoprotein giống tổ chức liên kết riêng Trong vùng kẽ tế bào tạo xương răng, tạo cốt bào, hủy cốt bào, tế bào biểu mơ cịn sót lại (mallassez) bao Hertwing Vùng kẽ cịn có hệ thống thần kinh mạch máu [33] - Mạch máu: Rất phong phú, cung cấp từ ba nguồn là: Từ động mạch răng; Các nhánh động mạch liên xương ổ chân vào dây chằng quanh răng; Các nhánh động mạch màng xương phía thân qua niêm mạc mặt mặt xương ổ răng…tạo hệ thống mạch máu quanh [33] - Mạch bạch huyết: Mạch bạch huyết tạo mạng lưới dày đặc, nối tiếp với bạch huyết lợi vách xương ổ - Thần kinh: Dây chằng quanh chịu chi phối nhóm thần kinh cảm giác giao cảm Chức đảm bảo liên kết sinh lý bình thường xương ổ răng, truyền lực nhai vào xương hàm, cảm thụ kích thích thần kinh…[33] - Xương răng: Là dạng đặc biệt xương, có nguồn gốc trung mơ, khơng có hệ thống Havers mạch máu Xương bao phủ ngà chân răng, đa số trường hợp (65%) phần men phủ bề mặt men cổ Ở người trưởng thành, chất hữu xương Phần chân răng, lớp xương khơng có tế bào tạo xương Phần có chứa tế bào tạo xương, làm cho lớp xương dày lên theo tuổi Quá trình hoạt động tạo xương điều tiết tế bào tạo xương gen di truyền nhân tế bào tạo xương [33] Xương có tầm quan trọng đặc biệt chức năng: Là chỗ bám cho dây chằng quanh răng, nối vào xương ổ Xương khơng có khả tiêu sinh lý thay đổi cấu trúc xương khác thể tiêu sản số trường hợp bất thường hay bệnh lý [33] - Xương ổ răng: Là phần hình thành huyệt xương hàm bao bọc quanh chân mô chống đỡ quan trọng tổ chức quanh Xương ổ gồm xương thành ổ bao quanh chân xương phía ngồi, xương xốp chống đỡ [33] bao gồm: + Thành xương ổ xương đặc bề mặt thành xương ổ tiếp xúc với vùng dây chằng quanh răng, chụp Xquang đường cản quang liên tục gọi Lamina dura hay màng cứng Màng cứng Lamina dura có nhiều lỗ sàng qua mạch máu từ xương vào vùng quanh ngược lại [33] Hình 1.1 Cấu trúc vùng quanh [33] + Thành xương ổ lớp xương vỏ màng xương che phủ Cấu trúc lớp xương vỏ giống xương đặc khác, gồm hệ thống Havers, độ dày lớp vỏ thay đổi theo vị trí [33] + Xương xốp nằm thành xương ổ sàng, bao gồm mạng lưới bè xương mỏng xen kẽ khoang tủy mỡ Vùng lồi củ xương hàm góc xương hàm có tủy tạo máu Các tế bào chịu trách nhiệm tái cấu trúc: Tạo cốt bào; Tạo tế bào xương non, tế bào xương trưởng thành hủy cốt bào [33] + Bình thường mào ổ nằm cổ giải phẫu 0,5 -1 mm, xương ổ chịu lực nén thích hợp củng cố vững chắc, chịu lực nén mức có tượng tiêu vơi Q trình tiêu phục hồi ln cân ln đảm bảo chức năng, cân dẫn đến bệnh lý quanh [33] 1.1.2 Khái niệm bệnh quanh Bệnh quanh loại bệnh phức tạp, bệnh lý bao gồm hai q trình viêm thối hóa, có tổn thương khu trú lợi tổn thương tổ chức quanh (lợi, dây chằng quanh răng, xương ổ xương răng…), tổn thương không điều trị kịp thời dẫn đến biến chứng như: Áp xe quanh răng, viêm tủy ngược dịng, lung lay dẫn tới rụng răng, số trường hợp dẫn đến viêm mô tế bào hay viêm xương hàm biến chứng xa viêm khớp, viêm nội tâm mạc, ung thư hóa [14], [15], [33] Nguyên nhân vệ sinh miệng không tốt, không cách Căn nguyên gây bệnh quanh vi khuẩn ưa khí, vi khuẩn kỵ khí, vi khuẩn bán kỵ khí, vi nấm phổ biến Candida Candida albicans nguyên vi sinh khác [14], [15], [33] Hình 1.2 Hình ảnh bệnh quanh [33] 1.1.3 Phân loại bệnh quanh Việc phân loại BQR có ý nghĩa quan trọng việc chẩn đốn , tiên lượng làm kế hoạch điều trị Có nhiều cách phân loại BQR, theo xu hướng chung quan điểm đại, người ta chia BQR làm loại bệnh lợi bệnh cấu trúc chống đỡ răng: - Các bệnh lợi bao gồm bệnh có lợi như: Viêm lợi, túi lợi sâu, tụt lợi - Các bệnh cấu trúc chống đỡ bao gồm bệnh liên quan tới cấu trúc chống đỡ giây chằng quanh răng, xương ổ xương Phân loại theo hội nghị quốc tế BQR năm 1999 Hội nghị đưa bảng phân loại bao gồm nhóm bệnh đây: Các bệnh lợi viêm lợi, túi lợi sâu, lợi bám; Viêm quanh mạn; Viêm quanh phá hủy; Viêm quanh biểu lộ bệnh toàn thân; Các bệnh viêm quanh hoại tử; Các áp xe vùng quanh răng; Viêm quanh tổn thương nội nha; Các biến dạng tình trạng mắc phải hay trình phát triển 1.2 Sơ lƣợc lịch sử nghiên cứu bệnh quanh 1.2.1 Trên Thế giới Năm 1850, Pere mô tả BQR Năm 1920, Fones mô tả bệnh BQR cách đầy đủ Sau nghiên cứu Pere Fones đến nghiên cứu bệnh BQR phát triển rộng khắp giới, từ nghiên cứu giải phẫu, sinh bệnh học BQR, phương pháp điều trị bệnh BQR, kể nghiên cứu ứng dụng kỹ thuật y học chuyên sâu…[33], [42], [60] Năm 2000 Drancourt CS sử dụng kỹ thuật RFLP-PCR với gen mồi 16S ribosoma để định danh loài vi khuẩn mảng bám răng, ông phát nhóm lồi vi khuẩn kỵ khí bán kỵ khí có mảng bám dịch sâu Sau năm 2000 kỹ thuật phát triển rộng khắp giới [59] Năm 2016 Xiang Y Han CS ứng dụng kỹ thuật kết hợp với kỹ thuật Sequencing định danh vi khuẩn dịch sâu mảng bám Kết ông phát nhóm lồi vi khuẩn gây bệnh, vai trị bật nhóm lồi vi khuẩn kỵ khí bán kỵ khí [97] như: Streptococcus spp; Staphylococcus spp; Micromonas micros; Veillonella spp; Enterococcus faecalis; Prevotella oralis 1.2.2 Tại Việt Nam Việc nghiên cứu BQR phát triển mạnh mẽ năm gần đây, số lượng đề tài, phong phú đối tượng nghiên cứu phương pháp kỹ thuật sử dụng nghiên cứu, nghiên cứu cộng đồng nghiên cứu chuyên sâu miễn dịch, sinh học phân tử PCR định danh loài vi khuẩn dịch sâu mảng bám Các nghiên cứu dịch tễ học bệnh quanh răng: Tạ Quốc Đại (2006), nghiên cứu thực trạng bệnh sâu răng, viêm lợi kiến thức, thái độ, thực hành học sinh 12 tuổi huyện Thanh Trì, quận Đống Đa thành phố Hà Nội năm 2005 [12] Nguyễn Ngọc Nghĩa (2010), nghiên cứu số đặc điểm bệnh miệng học sinh tiểu học huyện Văn Chấn – tỉnh Yên Bái năm 2009 [25] Trần Tấn Tài (2016), nghiên cứu thực trạng bệnh sâu hiệu giải pháp can thiệp cộng đồng học sinh tiểu học Thừa Thiên Huế [29] Trương Thị Hoài An (2013), đánh giá tình trạng miệng học sinh khiếm thị trường phổ thông đặt biệt (PTĐB) Nguyễn Đình Chiểu TP Hồ Chí Minh [1] Nguyễn Quang Huy (2009), Nghiên cứu tác dụng số chất thứ cấp từ thực vật lên vi khuẩn gây sâu Streptococcus mutans [17] Nguyễn Thị Thúy Anh (2011), nghiên cứu khả kháng khuẩn số loài thực vật [4] Nhìn chung nghiên cứu Việt Nam năm gần phát triển mạnh mẽ số lượng cơng trình, đa dạng lĩnh vực nghiên cứu Các cơng trình tập trung vào phân tích, đánh giá thực trạng bệnh miệng người Việt Nam [13], [16], [25] Nhiều nghiên cứu kết ứng dụng biện pháp chẩn đoán, kỹ thuật can thiệp điều trị bệnh Nhiều cơng trình nghiên cứu tập trung vào ứng dụng kỹ thuật chuyên sâu giới áp dụng cho người Việt chẩn đoán điều trị bệnh BQR [11], [14] kể đối tượng nhạy cảm HIV/AIDS, ung thư…[1], [2], [18] 1.3 Dịch tễ học bệnh quanh 1.3.1 Tình hình bệnh quanh giới Theo điều tra Mỹ 1962, tỷ lệ BQR lứa tuổi 20: Nam 12,0%, nữ 8,0%; Lứa tuổi 40: Nam 40,0%, nữ 20,0%; Lứa tuổi 60: Nam 60,0%, nữ 38,0% [33] 10 Năm 1988, Bae CS khám 554 người Trung Quốc tuổi 60 -80, kết cho thấy: Hầu hết mặt lại bám dính > mm, 10,0 - 30,0% bám dính > mm [45] Douglass C.W CS (1990), khám 1151 người Bang New England – Mỹ, kết cho thấy: Tỷ lệ chảy máu lợi 85,0%, túi lợi sâu > mm 87,4%, bám dính > mm 94,8% [58] Các nhà khoa học có chung nhận định: Mảng bám tỷ lệ thuận với tuổi, tỷ lệ bám dính, tỷ lệ BQR, chảy máu lợi….cũng tăng dần theo tuổi Tỷ lệ phát bệnh miệng so với số thực tế khiêm tốn là hình ảnh tảng băng chìm Tỷ lệ bệnh mức độ nhẹ cao tổn thương sớm tiến triển nặng thêm thối lui, ung thưu hóa [47] Hiện nay, nhà khoa học sâu nghiên cứu liên quan bệnh miệng với yếu tố thuận lợi chế độ ăn uống, béo phì, đái đường, tình trạng miễn dịch thể: - Năm 2015, Marta Novotna tổng hợp nhiều nghiên cứu bệnh nha chu sâu trẻ em bị tiểu đường tuýp 1, số nghiên cứu cho thấy có liên quan đái đường Tuyp bệnh nha chu Tuy nhiên số nghiên cứu lại chưa tìm thấy mối liên quan Một số nghiên cứu phát có khác biệt nhóm đái đường Tp khơng đái đường Tp tỷ lệ thành phần loài vi khuẩn miệng có vai trị kiểm sốt chuyển hóa bệnh tiểu đường đến sức khỏe nha chu Ông có khuyến cáo để có kết luận chắn vai trò vi khuẩn đái đường tuýp với bệnh nha chu sâu cần có nghiên cứu sâu hơn, diện rộng [79] Rufi Murad Patel (2016), nghiên cứu nồng độ can-xi, phosphatase độ pH nước bọt liên quan đến bệnh nha chu trẻ em Châu 151 Query Sbjct Query 549 61 Sbjct Query 609 121 Sbjct Query 669 181 Sbjct Query 729 241 Sbjct Query 789 301 Sbjct 849 AACGATGAGTGCTAGGTGTTAGGCCCTTTCCGGGGCTTAGTGCCGCAGCTAACGCATTAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AACGATGAGTGCTAGGTGTTAGGCCCTTTCCGGGGCTTAGTGCCGCAGCTAACGCATTAA GCACTCCGCCTGGGGAGTACGACCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GCACTCCGCCTGGGGAGTACGACCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCG CACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTG ACATCCCTCTGACCACTCTAGAGATAGAGTTTTCCTTCGGGACAGAGGTGACAGGTGGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ACATCCCTCTGACCACTCTAGAGATAGAGTTTTCCTTCGGGACAGAGGTGACAGGTGGTG CATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACC CCTATTGTTAGTTGCCATCATTGAGTTGGGCACTCTAGCGAGACTGCCGGTAATAAACCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CCTATTGTTAGTTGCCATCATTGAGTTGGGCACTCTAGCGAGACTGCCGGTAATAAACCG 60 Query 361 GAGGAAGGTGGGGATGA ||||||||||||||||| Sbjct 909 GAGGAAGGTGGGGATGA 608 120 377 925 668 180 728 240 788 300 848 360 908 >15A_VAF Uncultured bacterium clone nbw29b08c1 16S ribosomal RNA gene, partial sequence Sequence ID: GQ062194.1Length: 1306Number of Matches: Related Information Range 1: 733 to 1108GenBankGraphicsNext MatchPrevious Match Alignment statistics for match #1 Score Expect Identities Gaps Strand 673 bits(364) 0.0 372/376(99%) 0/376(0%) Plus/Plus Query Sbjct Query 733 64 Sbjct Query 793 124 Sbjct Query 853 184 Sbjct Query 913 244 Sbjct Query 973 304 Sbjct 1033 ATGAATGTTAGCCGTCGGGCAGTATACTGTTCGGTGGCGCAGCTAACGCATTAAACATTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ATGAATGTTAGCCGTCGGGCAGTATACTGTTCGGTGGCGCAGCTAACGCATTAAACATTC CGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATGAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAG CGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCTAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCTCTTGACATTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCTCTTGACATTC GGGGTATGGGCATTGGAAACGATGTCCTTCAGTTAGGCTGGCCCCAAAACAGGTGCTGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GGGGTATGGGCATTGGAGACGATGTCCTTCAGTTAGGCTGGCCCCAAAACAGGTGCTGCA TGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCT CGCCCTTAGTTGCCAGCATTTAGTTGGGCACTCTAAGGGGACTGCCGGTGATAAGCCAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CGCCCTTAGTTGCCAGCATTTAGTTGGGCACTCTAAGGGGACTGCCGGTGATAAGCCGAG 63 Query364 AGGAAGGTGGGGATGA379 |||||||||||||||| Sbjct1093AGGAAGGTGGGGATGA1108 792 123 852 183 912 243 972 303 1032 363 1092 >16A_VAF Agrobacterium tumefaciens strain IESE:ST5 16S ribosomal RNA gene, partial sequence Sequence ID: KU962127.1Length: 1424Number of Matches: Related Information Range 1: 707 to 1075GenBankGraphicsNext MatchPrevious Match Alignment statistics for match #1 Score Expect Identities Gaps Strand 544 bits(294) 8e-151 344/369(93%) 0/369(0%) Plus/Plus Query Sbjct Query 707 61 Sbjct Query 767 121 Sbjct Query 827 181 Sbjct Query 887 241 Sbjct Query 947 301 Sbjct 1007 TTAGCCGTCGGGCAGTATACTGTTCTGTGGGGCACCTAACGCATTAAACATTCCCCCTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TTAGCCGTCGGGCAGTATACTGTTCGGTGGCGCAGCTAACGCATTAAACATTCCGCCTGG GGAGTACGGGCGCGAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCCCACAAACGGTGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGA GCATGTGGTTTAATTCTAAGCAACGCGCAAAAACTTACCAGCTCTTGACATTCCGGGTAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAAAACCTTACCAGCTCTTGACATTCGGGGTAT GGCCATTGAAAACGATGTCCTTCAGTTAGGCTGGCCCCAAAACAGGTGCTGCATGGCTGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GGGCATTGGAGACGATGTCCTTCAGTTAGGCTGGCCCCAGAACAGGTGCTGCATGGCTGT CCTCATCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAACTCCCGCAACGAGCGCCCCCCTCGCCCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCGCCCTT AGTTGCCAGTATTTAGTTGGGCACTCTAAGGGGACTGCCGGTGATAAGCCAAGAGGGAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AGTTGCCAGCATTTAGTTGGGCACTCTAAGGGGACTGCCGGTGATAAGCCGAGAGGAAGG 60 766 120 826 180 886 240 946 300 1006 360 1066 Query361 GGGTGATGA369 ||||||||| Sbjct1067TGGGGATGA1075 152 >18A_VAF Streptococcus sp clone P21b-01-T7 16S ribosomal RNA gene, partial sequence Sequence ID: KP294820.1Length: 939Number of Matches: Related Information Range 1: 232 to 609GenBankGraphicsNext MatchPrevious Match Alignment statistics for match #1 Score Expect Identities Gaps Strand 621 bits(336) 4e-174 364/378(96%) 0/378(0%) Plus/Plus Query Sbjct Query 232 61 Sbjct Query 292 121 Sbjct Query 352 181 Sbjct Query 412 241 Sbjct Query 472 301 Sbjct 532 AAACAATGAGTGCTAGGTGTTGGACTCTTTCAGGGGTTTAGTGCCGCAGCTAACGCATTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AAACGATGAGTGCTAGGTGTTAGACCCTTTCCGGGGTTTAGTGCCGCAGCTAACGCATTA AGCACTCCGCCTGGAGAGTACGACCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AGCACTCCGCCTGGGGAGTACGACCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCC GCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCAAAGCAACGCAAAAAACCTTACCAGGTCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAAAACCTTACCAGGTCTT GACATCCCTATGACCGCTCTAAAAATAGAGTTTTCCTTCGGGACAAAAGTGACAGGTGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GACATCCCTCTGACCGCTCTAGAGATAGAGTTTTCCTTCGGGACAGAGGTGACAGGTGGT GCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAAC CCCTATTGTTAGTTGCCATCATTCAGTTGGGCACTCTATCGAGACTGCCGGTAATAAACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CCCTATTGTTAGTTGCCATCATTCAGTTGGGCACTCTAGCGAGACTGCCGGTAATAAACC 60 291 120 Query 361 GGAGGAAGGAGGGGATGA 378 |||||||||||||||||| Sbjct 592 GGAGGAAGGTGGGGATGA 609 351 180 411 240 471 300 531 360 591 >19A_VAF Morococcus cerebrosus culture-collection KCOM:2186 16S ribosomal RNA gene, partial sequence Sequence ID: KX096267.1Length: 1463Number of Matches: Related Information Range 1: 793 to 1163GenBankGraphicsNext MatchPrevious Match Alignment statistics for match #1 Score Expect Identities Gaps Strand 686 bits(371) 0.0 371/371(100%) 0/371(0%) Plus/Plus Query Sbjct Query 793 61 Sbjct Query 853 121 Sbjct Query 913 181 Sbjct Query 973 241 Sbjct Query 1033 301 Sbjct 1093 TGTCGATTAGCTGTTGGGCAGCATGACTGCTTAGTAGCGAAGCTAACGCGTGAAATCGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TGTCGATTAGCTGTTGGGCAGCATGACTGCTTAGTAGCGAAGCTAACGCGTGAAATCGAC CGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGACCCGCACAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGACCCGCACAAG CGGTGGATGATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CGGTGGATGATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATGT ACGGAATCCTCCAGAGACGGAGGAGTGCCTTCGGGAGCCGTAACACAGGTGCTGCATGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ACGGAATCCTCCAGAGACGGAGGAGTGCCTTCGGGAGCCGTAACACAGGTGCTGCATGGC TGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTC ATTAGTTGCCATCATTAAGTTGGGCACTCTAATGAGACTGCCGGTGACAAGCCGGAGGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ATTAGTTGCCATCATTAAGTTGGGCACTCTAATGAGACTGCCGGTGACAAGCCGGAGGAA 60 Query 361 852 120 Sbjct 1153 912 180 972 240 1032 300 1092 360 1152 >20A_VAF Streptococcus sp NPS 308 DNA, complete genome Sequence ID: AP017652.1Length: 1924728Number of Matches: Related Information Range 1: 15646 to 15983GenBankGraphicsNext MatchPrevious Match Alignment statistics for match #1 Score Expect Identities Gaps Strand 619 bits(335) 1e-173 337/338(99%) 0/338(0%) Plus/Plus GGTGGGGATGA ||||||||||| GGTGGGGATGA 371 1163 153 Query Sbjct Query 15646 61 Sbjct Query 15706 121 Sbjct Query 15766 181 Sbjct Query 15826 241 Sbjct Query 15886 301 Sbjct 15946 GTGCCGCAGCTAACGCATTAAGCACTCCGCCTGGGGAGTACGACCGCAAGGTTGAAACTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GTGCCGCAGCTAACGCATTAAGCACTCCGCCTGGGGAGTACGACCGCAAGGTTGAAACTC AAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGC GAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCCTCTGACCGCTCTAAAGATAGAGTTTTCCTTCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCCTCTGACCGCTCTAGAGATAGAGTTTTCCTTCG GGACAGAGGTGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GGACAGAGGTGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTA AGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTATTGTTAGTTGCCATCATTCAGTTGGGCACTCTAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTATTGTTAGTTGCCATCATTCAGTTGGGCACTCTAGC GAGACTGCCGGTAATAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGA 338 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GAGACTGCCGGTAATAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGA 15983 60 15705 120 15765 180 15825 240 15885 300 15945 >21A_VAF Streptococcus sp NPS 308 DNA, complete genome Sequence ID: AP017652.1Length: 1924728Number of Matches: Related Information Range 1: 15633 to 15983GenBankGraphicsNext MatchPrevious Match Alignment statistics for match #1 Score Expect Identities Gaps Strand 623 bits(337) 9e-175 348/353(99%) 2/353(0%) Plus/Plus Query Sbjct Query 15633 61 Sbjct Query 15692 121 Sbjct Query 15752 181 Sbjct Query 15812 241 Sbjct Query 15872 301 Sbjct 15932 TTTCCGGGGATTTAGTGCCGCAGCTAACGCATTAAGCACTCCGCCTGGGGAGTACGACCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TTTCCGGGGTTTTAGTGCCGCAGCTAACGCATTAAGCACTCCGCCTGGGGAGTACGACCG CAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTA ATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCCTCTGACCGTTCTAGAGAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCCTCTGACCGCTCTAGAGAT AGAGTTTTCCTTCGGGACATAGGTGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AGAGTTTTCCTTCGGGACAGAGGTGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGT GAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTATTGTTAGTTGCCATCATTGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTATTGTTAGTTGCCATCATTCAG TTGGGCACTCTAGCGAGACTGCCGGTAATAAACCGGAGGAAGGTGGGGGATGA 353 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TTGGGCACTCTAGCGAGACTGCCGGTAATAAACCGGAGGAAGGTGGGG-ATGA 15983 60 15691 120 15751 180 15811 240 15871 300 15931 >22A_VAF Granulicatella adiacens gene for 16S ribosomal RNA, strain: GF02 Sequence ID: LC125191.1Length: 1492Number of Matches: Related Information Range 1: 814 to 1177GenBankGraphicsNext MatchPrevious Match Alignment statistics for match #1 Score Expect Identities Gaps Strand 673 bits(364) 0.0 364/364(100%) 0/364(0%) Plus/Plus Query Sbjct Query 814 61 Sbjct Query 874 121 Sbjct Query 934 181 Sbjct Query 994 241 Sbjct Query 1054 301 Sbjct 1114 TGCTAAGTGTTGGAGGGTTTCCGCCCTTCAGTGCTGCAGTTAACGCATTAAGCACTCCGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TGCTAAGTGTTGGAGGGTTTCCGCCCTTCAGTGCTGCAGTTAACGCATTAAGCACTCCGC CTGGGGAGTACGACCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGCGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CTGGGGAGTACGACCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGCGG TGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAAGTCTTGACATCCTTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAAGTCTTGACATCCTTT GACCACTCTAGAGATAGAGCTTTCCCTTCGGGGACAAAGTGACAGGTGGTGCATGGTTGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GACCACTCTAGAGATAGAGCTTTCCCTTCGGGGACAAAGTGACAGGTGGTGCATGGTTGT CGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATTACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATTACT AGTTGCCAGCATTGAGTTGGGCACTCTAGTGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AGTTGCCAGCATTGAGTTGGGCACTCTAGTGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGT 60 Query 361 873 120 Sbjct 1174 933 180 993 240 1053 300 1113 360 1173 GGGG |||| GGGG 364 1177 154 >26B_VAF Streptococcus sp oral taxon 064 strain 2-83 16S ribosomal RNA gene, partial sequence Sequence ID: KU351679.1Length: 1524Number of Matches: Related Information Range 1: 851 to 1189GenBankGraphicsNext MatchPrevious Match Alignment statistics for match #1 Score Expect Identities Gaps Strand 555 bits(300) 3e-154 326/339(96%) 0/339(0%) Plus/Plus Query Sbjct Query 851 61 Sbjct Query 911 121 Sbjct Query 971 181 Sbjct Query 1031 241 Sbjct Query 1091 301 Sbjct 1151 AGTGCCGCAGTTAACGCATTAAGCACTCCGCCTGGGGAGTACGACCGCAAGGTTGAAACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AGTGCCGCAGCTAACGCATTAAGCACTCCGCCTGGGGAGTACGACCGCAAGGTTGAAACT CAAAGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACG CGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCCTCTGACCGCTCTAAAAATAAAGTTTTCCTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCCTCTGACCGCTCTAGAGATAGAGTTTTCCTTC GGGAAAAAGGTGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GGGACAGAGGTGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTT AAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTATTACTAGTTGCCAGCATTCAGTTGGGCACTCTAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTATTGTTAGTTGCCATCATTCAGTTGGGCACTCTAG TGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGA 339 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CGAGACTGCCGGTAATAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGA 1189 60 910 120 970 180 1030 240 1090 300 1150 >28B_VAF Agrococcus sp STR21 16S ribosomal RNA gene, partial sequence Sequence ID: KX214233.1Length: 731Number of Matches: Related Information Range 1: 187 to 562GenBankGraphicsNext MatchPrevious Match Alignment statistics for match #1 Score Expect Identities Gaps Strand 684 bits(370) 0.0 375/377(99%) 2/377(0%) Plus/Plus Query Sbjct Query 187 60 Sbjct Query 247 120 Sbjct Query 307 180 Sbjct Query 367 240 Sbjct Query 427 300 Sbjct 487 GTTGGGTACTAGATGTGGGGACCATTCCACGGTCTCCGTGTCGTAGCTAACGCATTAAGT ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GTTGGGAACTAGATGTGGGGACCATTCCACGGTCTCCGTGTCGTAGCTAACGCATTAAGT TCCCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TCCCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCA CAAGCGGCGGAGCATGCGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCAAGGCTTGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CAAGCGGCGGAGCATGCGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCAAGGCTTGAC ATATACGAGAACGCGCTGGAGACAGCGAACTCTTTGGACACTCGTATACAGGTGGTGCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ATATACGAGAACGCGCTGGAGACAGCGAACTCTTTGGACACTCGTATACAGGTGGTGCAT GGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTC GTCCTATGTTGCCAGCACGTCATGGTGGGAACTCATGGGATACTGCCGGGGTCAACTCGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GTCCTATGTTGCCAGCACGTCATGGTGGGAACTCATGGGATACTGCCGGGGTCAACTCGG >30B_VAF grococcus sp SS14.8 16S ribosomal RNA gene, partial sequence Sequence ID: KC160779.1Length: 1484Number of Matches: Related Information Range 1: 798 to 1164GenBankGraphicsNext MatchPrevious Match Alignment statistics for match #1 Score Expect Identities Gaps Strand 678 bits(367) 0.0 367/367(100%) 0/367(0%) Plus/Plus 59 246 119 306 179 366 239 426 299 486 359 546 Query360AGGAAGGTGGGGGATGA376 ||||||||||||||||| Sbjct547AGGAAGGTGGGGGATGA562 155 Query Sbjct Query 798 63 Sbjct Query 858 123 Sbjct Query 918 183 Sbjct Query 978 243 Sbjct Query 1038 303 Sbjct 1098 TAGATGTGGGGACCATTCCACGGTCTCCGTGTCGTAGCTAACGCATTAAGTTCCCCGCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TAGATGTGGGGACCATTCCACGGTCTCCGTGTCGTAGCTAACGCATTAAGTTCCCCGCCT GGGGAGTACGGCCGCAAGGCTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GGGGAGTACGGCCGCAAGGCTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCG GAGCATGCGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCAAGGCTTGACATGTACGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GAGCATGCGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCAAGGCTTGACATGTACGAG AACGCGCTGGAGACAGCGAACTCTTTGGACACTCGTATACAGGTGGTGCATGGTTGTCGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AACGCGCTGGAGACAGCGAACTCTTTGGACACTCGTATACAGGTGGTGCATGGTTGTCGT CAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCGTCCTATGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCGTCCTATGT TGCCAGCACGTCATGGTGGGAACTCATGGGATACTGCCGGGGTCAACTCGGAGGAAGGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TGCCAGCACGTCATGGTGGGAACTCATGGGATACTGCCGGGGTCAACTCGGAGGAAGGTG 62 Query 363 857 122 Sbjct 1158 917 182 977 242 1037 302 1097 362 1157 GGGATGA ||||||| GGGATGA 369 1164 156 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ VIỆN SỐT RÉT - KÝ SINH TRÙNG - CÔN TRÙNG TRUNG ƢƠNG THÁI DOÃN THẮNG Tên đề tài luận án: NGHIÊN CỨU THỰC TRẠNG VÀ MỘT SỐ YẾU TỐ LIÊN QUAN ĐẾN BỆNH QUANH RĂNG Ở HỌC SINH 12 -14 TUỔI TẠI HUYỆN QUẾ PHONG, NGHỆ AN, HIỆU QUẢ CAN THIỆP (2016 -2017) Chuyên ngành : Dịch tễ học Mã số : 972 01 17 LUẬN ÁN TIẾN SĨ Y HỌC Cán hƣớng dẫn khoa học: PGS TS Lê Ngọc Tuyến PGS TS Đoàn Huy Hậu HÀ NỘI, 2018 157 LỜI CẢM ƠN Tơi xin bày tỏ lịng biết ơn sâu sắc tới PGS TS Lê Ngọc Tuyến, PGS TS Đồn Huy Hậu, tận tình dẫn giúp đỡ em học tập nghiên cứu hoàn thành luận án Tôi xin trân trọng cảm ơn! PGS TS Trần Thanh Dương Viện trưởng Ban Giám đốc Viện Sốt rét – Ký sinh trùng – Côn trùng Trung ương PGS TS Cao Bá Lợi, toàn thể cán Phòng Khoa học – Đào tạo Viện Sốt rét – Ký sinh trùng – Côn trùng Trung ương tận tình giúp đỡ em suốt thời gian học tập nghiên cứu GS TS Phạm Ngọc Đính, PGS TS Nguyễn Mạnh Hùng, PGS TS Lê Xuân Hùng, PGS TS Nguyễn Ngọc San, PGS.TS.Hồng Vũ Hùng có ý kiến quý báu giúp em hoàn thiện luận án Sở Y tế tỉnh Nghệ An, Sở Giáo dục Đào tạo tỉnh Nghệ An, ban giám hiệu toàn thể giáo viên trường trung học sở Mường Nọc, Thơng Thụ Châu Thơn nhiệt tình giúp đỡ em hoàn thành luận án Em xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc đến Bố, Mẹ, vợ con, gia đình bạn bè đồng nghiệp động viên khích lệ em vượt qua khó khăn hồn thành luận án Luận án bước đầu hành trình khát khao tìm chi thức khoa học Những lời cảm ơn khơng đủ kể hết tình cảm thạt cao quý, tình cảm theo em suốt đời khơng thay đổi! Thái Dỗn Thắng 158 LỜI CAM ĐOAN Tơi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu riêng tôi, số liệu, kết nghiên cứu luận án trung thực, xác chưa công bố công trình khác, sai tơi xin hồn tồn chịu trách nhiệm Tác giả luận án Thái Doãn Thắng 159 MỤC LỤC ĐẶT VẤN ĐỀ Chƣơng 1: TỔNG QUAN 1.1 Đại cương bệnh quanh 1.1.1 Đặc điểm giải phẫu tổ chức học răng, vùng quanh 1.1.2 Khái niệm bệnh quanh 1.1.3 Phân loại bệnh quanh 1.2 Sơ lược lịch sử nghiên cứu bệnh quanh 1.2.1 Trên Thế giới 1.2.2 Tại Việt Nam 1.3 Dịch tễ học bệnh quanh 1.3.1 Tình hình bệnh quanh giới 1.3.2 Tình hình bệnh quanh Việt Nam 11 1.4 Một số đặc điểm sinh bệnh học quanh 12 1.4.1 Mảng bám 12 1.4.2 Cao 13 1.4.3 Vi khuẩn mảng bám 14 1.4.4 Đáp ứng miễn dịch thể 16 1.5 Một số nguyên nhân gây bệnh quanh 18 1.5.1 Nguyên nhân gây bệnh lợi 18 1.5.2 Nguyên nhân gây viêm quanh mạn 18 1.6 Một số yếu tố liên quan đến bệnh quanh 19 1.6.1 Các yếu tố xã hội 19 1.6.2 Các yếu tố tự nhiên 20 1.7 Chẩn đoán bệnh quanh 21 1.7.1 Chẩn đoán lâm sàng 21 1.7.2 Chẩn đoán cận lâm sàng 22 1.7.3 Các số đánh giá tình trạng bệnh quanh 22 1.7.4 Điều trị bệnh quanh 28 160 1.8 Phòng bệnh quanh 29 Chƣơng 2: ĐỐI TƢỢNG VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 31 2.1 Đối tượng, địa điểm, thời gian nghiên cứu 31 2.1.1 Đối tượng nghiên cứu 31 2.1.2 Địa điểm nghiên cứu 31 2.1.3 Thời gian nghiên cứu 33 2.2 Phương pháp nghiên cứu 33 2.2.1 Thiết kế nghiên cứu 33 2.2.2 Phương pháp nghiên cứu mơ tả có phân tích 33 2.2.3 Nghiên cứu can thiệp 37 2.2.4 Sơ đồ thiết kế nghiên cứu 37 2.3 Các kỹ thuật sử dụng nghiên cứu 40 2.3.1 Kỹ thuật khám lâm sàng điều tra tình trạng bệnh quanh 40 2.3.2 Kỹ thuật nuôi cấy vi khuẩn 46 2.3.3 Kỹ thuật PCR định danh loài vi khuẩn 47 2.3.4 Kỹ thuật vấn cộng đồng 50 2.4 Phương tiện, vật liệu nghiên cứu 50 2.4.1 Phương tiện, vật liệu khám điều trị 49 2.4.2 Phương tiện, vật liệu phục vụ kỹ thuật nuôi cấy định danh vi khuẩn 50 2.5 Các tiêu đánh giá 52 2.6 Phương pháp nhập phân tích số liệu 55 2.7 Đạo đức nghiên cứu 55 Chƣơng 3: KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU 56 3.1 Thực trạng số yếu tố liên quan bệnh quanh học sinh 12 -14 tuổi trường trung học sở huyện Quế Phong, tỉnh Nghệ An năm 2016 56 3.1.1 Thực trạng bệnh quanh 56 3.1.2 Một số yếu tố liên quan đến tình trạng bệnh quanh 72 161 3.2 Hiệu can thiệp điều trị giáo dục vệ sinh phòng bệnh quanh đối tượng nghiên cứu 77 3.2.1 Tình trạng bệnh quanh trước sau can thiệp 77 3.2.2 Độ sâu túi lợi 77 3.2.3 Chỉ số cao 78 3.2.4 Chỉ số mảng bám 78 3.2.5 Chỉ số nhu cầu điều trị (CPITN) 81 Chƣơng 4: BÀN LUẬN 84 4.1 Thực trạng số yếu tố liên quan bệnh quanh học sinh 12 -14 tuổi trường trung học sở huyện Quế Phong, tỉnh Nghệ An năm 2016 84 4.1.1 Một số thông tin đối tượng nghiên cứu 82 4.1.2 Thực trạng bệnh quanh học sinh 12 -14 tuổi trường trung học sở huyện Quế Phong, tỉnh Nghệ An năm 2016 85 4.1.3 Kết xác định loài vi khuẩn gây bệnh quanh kỹ thuật PCR giải trình tự gen 94 4.1.4 Một số yếu tố liên quan với tình trạng bệnh quanh đối tượng nghiên cứu 97 4.2 Hiệu can thiệp điều trị kết hợp giáo dục sức khỏe vệ sinh miệng đối tượng nghiên cứu 103 4.2.1 Tình trạng bệnh quanh trước sau can thiệp 104 4.2.2 Nhu cầu điều trị bệnh miệng trước sau can thiệp 109 KẾT LUẬN 111 TÍNH KHOA HỌC, TÍNH MỚI CỦA ĐỀ TÀI 114 TÍNH THỰC TIỄN CỦA ĐỀ TÀI DANH MỤC CÁC CƠNG TRÌNH KHOA HỌC LIÊN QUAN TRỰC TIẾP ĐẾN NỘI DUNG CỦA LUẬN ÁN ĐÃ ĐƢỢC CÔNG BỐ TÀI LIỆU THAM KHẢO PHỤ LỤC 162 DANH MỤC CÁC TỪ VIẾT TẮT Tiếng Việt CR Cao MBR: Mảng bám MBVK: Mảng bám vi khuẩn NXB: Nhà xuất QR: Quanh BQR: Bệnh quanh VSRM: Vệ sinh miệng Tiếng Anh DNA: Deroxy Ribonucleic Acid RNA: Ribonucleic Acid PCR: Polymerase Chain Reaction- Phản ứng chuỗi trùng hợp RFLP: Restriction Fragment Length Polymorphism- Đa hình đoạn cắt giới hạn WHO: World Health Organization- Tổ chức y tế giới GI: Gingival Index- Chỉ số lợi OHI-S: số vệ sinh miệng đơn giản CPITN: Community periodontal index of treatment needds- Chỉ số nhu cầu điều trị 163 DANH MỤC HÌNH Hình 1.1 Cấu trúc vùng quanh Hình 1.2 Hình ảnh bệnh quanh Hình 1.3 Vi khuẩn mảng bám 15 Hình 2.1 Bản đồ Huyện Quế Phong 32 Hình 2.2 Sơ đồ thiết kế nghiên cứu 39 Hình 2.3 Các đại diện khám đánh giá số lợi GI (Gingival Index) 41 Hình 2.4 Đánh giá số vệ sinh miệng đơn giản OHI-S (Oral hygiene index) 41 Hình 2.5 Tiêu chuẩn ghi số mảng bám 40 Hình 2.6 Bộ dụng cụ khám 49 Hình 3.1 Tỷ lệ viêm lợi chung đối tượng nghiên cứu (n =653) 57 Hình 3.2 Tỷ lệ số lợi (n = 83) 59 Hình 3.3 Tỷ lệ học sinh có độ sâu túi lợi > mm 60 Hình 3.4 Tỷ lệ có mảng bám chung đối tượng nghiên cứu (n=653) 62 Hình 3.5 Tỷ lệ nhiễm Fluor chung (n = 653) 64 Hình 3.6 Tình trạng sâu (n =653) 65 Hình 3.7 Tỷ lệ nhu cầu điều trị (n =653) 66 Hình 3.8 Hình ảnh khuẩn lạc mọc đĩa mơi trường ni cấy 67 Hình 3.9 Ảnh điện di sản phẩm PCR nhân bội AND đoạn 16S gen ARN ribosomal 67 164 DANH MỤC BẢNG Bảng 2.1 Đánh giá cho điểm số lợi Gingival Index (GI) 43 Bảng 3.1 Một số thông tin đối tượng nghiên cứu (n =653) 56 Bảng 3.2 Tỷ lệ viêm lợi ba trường (n = 653) 56 Bảng 3.3 Phân bố tỷ lệ viêm lợi theo giới tính (n=653) 57 Bảng 3.4 Phân bố tỷ lệ viêm lợi theo nhóm tuổi (n = 653) 58 Bảng 3.5 Tỷ lệ số viêm lợi (n = 83) 58 Bảng 3.6 Tỷ lệ học sinh có độ sâu túi lợi >2 mm (n=653) 59 Bảng 3.7 Tổng hợp tỷ lệ bệnh quanh (n=653) 60 Bảng 3.8 Tình trạng khớp cắn tương quan đối tượng nghiên cứu (n = 653) 61 Bảng 3.9 Tỷ lệ có mảng bám chung đối tượng nghiên cứu (n=653) 62 Bảng 3.10 Tỷ lệ mảng bám theo nhóm tuổi 63 Bảng 3.11 Tỷ lệ mức độ mảng bám (n = 479) 63 Bảng 3.12 Tỷ lệ học sinh có nhiễm Fluor theo lứa tuổi (n=653) 64 Bảng 3.13 Phân bố mức độ nhiễm Fluor ( n = 217) 65 Bảng 3.14 Tỷ lệ số nhu cầu điều trị (n = 653) 66 Bảng 3.15 Kết giải định danh vi khuẩn (n = 64) 69 Bảng 3.16 Tổng hợp kết định danh vi khuẩn (n =64) 70 Bảng 3.17 Thực trạng kiến thức, thực hành vệ sinh miệng học sinh (n = 653) 71 Bảng 3.18 Liên quan hiểu biết nguyên nhân gây bệnh quanh với tình trạng bệnh quanh 72 Bảng 3.19 Liên quan thường xuyên ăn bánh kẹo, đồ với tình trạng bệnh quanh 72 Bảng 3.20 Liên quan sử dụng nguồn nước không hợp vệ sinh với tình trạng bệnh quanh 73 165 Bảng 3.21 Liên quan học vấn bố với tình trạng bệnh quanh đối tượng nghiên cứu 73 Bảng 3.22 Liên quan học vấn mẹ với tình trạng bệnh quanh đối tượng nghiên cứu 74 Bảng 3.23 Liên quan thực hành chải tình trạng bệnh quanh 74 Bảng 3.24 Liên quan số lần chải với tình trạng bệnh quanh 75 Bảng 3.25 Liên quan sử dụng kem có, khơng có Fluor với tình trạng bệnh quanh 75 Bảng 3.26 Liên quan sử dụng không sử dụng bàn chải với tình trạng bệnh quanh 76 Bảng 3.27 Hiệu điều trị viêm lợi sau 15 ngày 76 Bảng 3.28 Độ sâu túi lợi trước can thiệp sau can thiệp 15 ngày, tháng 12 tháng 77 Bảng 3.29 Chỉ số cao trước can thiệp sau can thiệp 15 ngày, tháng 12 tháng 78 Bảng 3.30 Chỉ số mảng bám trước sau can thiệp 15 ngày, tháng 12 tháng 79 Bảng 3.31 Tỷ lệ mức độ mảng bám thời điểm sau 15 ngày, 12 tháng sau can thiệp 80 Bảng 3.32 Chỉ số nhu cầu điều trị sau can thiệp 12 tháng so với trước can thiệp 81 ... số yếu tố liên quan đến bệnh quanh học sinh 12 -1 4 tuổi huyện Quế Phong, tỉnh Nghệ An, hiệu can thiệp (2016 -2 017), nhằm mục tiêu nghiên cứu sau: Mô tả thực trạng số yếu tố liên quan đến bệnh quanh. .. quanh giãn rộng 1.7.3 Các số đánh giá tình trạng bệnh quanh Để quản lý BQR, số sử dụng rộng rãi là: Chỉ số lợi, số quanh răng, số bệnh quanh răng, số nhu cầu điều trị quanh cộng đồng, số vệ sinh. .. quanh học sinh 12 - 14 tuổi trường trung học sở huyện Quế Phong, tỉnh Nghệ An năm 2016 Đánh giá hiệu can thiệp giáo dục truyền thông điều trị bệnh quanh 3 Chƣơng 1: TỔNG QUAN 1.1 Đại cƣơng bệnh quanh