cải tiến chất lượng cà phê

TRỪU TƯỢNG Chất lượng cà phê, bối cảnh sản xuất thừa toàn giới, phải coi tiêu chí lựa chọn để cải tiến cà phê Sau định nghĩa chất lượng tổng quan yếu tố không di truyền ảnh hưởng đến biến đổi nó, tổng quan tập trung vào yếu tố di truyền liên quan đến việc kiểm soát biến đổi chất lượng cà phê Liên quan đến phức tạp đặc điểm này, loại chất lượng khác trình bày Sau đó, khác biệt lớn loài cà phê gạch chân, chủ yếu hợp chất sinh hóa liên quan đến chất lượng (caffeine, đường, axit chlorogen, lipid) Các cách tạo giống tính trạng chất lượng cho lồi trồng, Coffea arabica Coffea canephora thảo luận, với thách thức cụ thể cho loài Đối với C arabica , việc trì chất lượng tốt giống lai nội tạng F , dòng xâm nhập từ lai Timor giống ghép thách thức Đối với C canephora , cải thiện chủ yếu dựa giống lai xen kẽ xen kẽ, sử dụng toàn biến dị di truyền có sẵn lồi Một cải thiện thu cho kích thước hạt, với mức tăng gen đáng kể chương trình nhân giống Hàm lượng hợp chất sinh hóa liên quan đến chất lượng cốc cách khác để cải thiện chất lượng Robusta.Cuối cùng, chương trình liên tục hướng tới hiểu biết tính định phân tử chất lượng cà phê, đặc biệt sử dụng ESTs cà phê, trình bày Từ khóa: Coffea spp., Các hợp chất sinh hóa, gen ứng cử viên, ESTs, nhân giống di truyền, lựa chọn hỗ trợ đánh dấu, chất lượng KẾT QUẢ Khơng có bối cảnh làm excedente de produỗóo mundial, mt Qualidade cafộ tem sido xem xột o o critộrio de seleỗóo no melhoramento dessa Cultura Apús definir Qualidade e fazer Xemeraỗừes sobre os fatores nóo genộticos afetando sua matrixỗóo, esta revisóo se concra sobre os fatores genộticos envolvidos no controle da matrixỗóo daid Em relaỗóo Complexidade Desta caracterớstica, os Diferentes tipos de Qualidade sóo apresentados Entóo, mt grande matrixỗóo dentro e entre as Espộcies de cafộ ộ Discutida, vicemente em relaỗóo aos caracteres bioquớmicos relacionados com Qualidade (cafeớna, aỗỳcares, ỏcas clorogờnicos, lipớde) Nh maneiras para melhorar estes caracteres relacionados Qualidade Nas Espécies Cultadas Coffea arabica e Coffea canephora são Discutidas, assim como os desafios Específicos a cada Espécie Para C arabica , manutenỗóo da boa Qualidade em hớ iuos interespecớficos F , linhagens geradas por introTHERão a partir Híbrido Timor, e enxertia de differades são os Princais desafios Para C canephora , o melhoramento é vicemente baseado em hí điềuos e interespecíficos, usando a variabilidade genética disponível nesta Espộcie Um avanỗo ộ obtido com o tamanho da semente, com có nghĩa ganho genético em chương trình de melhoramento O conteúdo de compostos bioquímicos relacionados com a Qualidade da bebida é uma outra maneira de melhorar a Qualidade café Robusta Finalmente, são comentados programas em andamento, direcionados para a comp Greensão định phân tử da Qualidade café, đặc biệt usando ESTs de café Palavras-chave: Coffea spp., Compostos bioquímicos, ESTs, gen candatos, melhoramento genético, Qualidade, seleỗóo h tr por marcadores GII THIU Theo bi cảnh sản xuất thừa giá thấp thị trường cà phê, cải thiện bình ổn chất lượng cà phê cung cấp cho chuỗi cà phê động lực Trong bối cảnh này, hiệu việc tích hợp chất lượng cà phê làm mục tiêu chương trình nhân giống trái ngược với tiêu chí lựa chọn thứ cấp (Van der Vossen, 2001), dựa khả để trả lời số câu hỏi: i) Chất lượng gì? ii) yếu tố ảnh hưởng đến chất lượng gì? iii) Những chiến lược sử dụng để cải thiện / trì chất lượng cà phê loại kết thu được? iv) Loại kết mong đợi thơng qua việc sử dụng công cụ genomic? Dựa câu hỏi này, viết chia thành bốn phần Đầu tiên, chúng tơi cố gắng xác định xác chất lượng Từ nơng học đến chất lượng sức khỏe cảm quan, tiêu chí ảnh hưởng đến chất lượng xác định Trong phần thứ hai, kiểm tra nguồn khác chất lượng.Trong phần thứ ba, chiến lược sử dụng kết đạt kỹ thuật nhân giống di truyền truyền thống liên quan đến chất lượng cà phê đặt cho loài trồng giống lai Trong phần cuối, tài nguyên gần có sẵn thông qua việc phát triển công cụ genomic ứng dụng chúng việc xác định gen liên quan đến yếu tố định chất lượng cà phê trình bày Chất lượng cà phê gì? Chất lượng đặc điểm khó xác định Theo từ điển nào, "đặc điểm vốn có phân biệt" Tổ chức Tiêu chuẩn hóa Quốc tế (ISO) mơ tả chất lượng "khả tập hợp đặc tính vốn có sản phẩm, hệ thống quy trình để đáp ứng yêu cầu khách hàng bên quan tâm khác" (ISO, 2000) Những đặc điểm vốn có gọi "thuộc tính" Đối với cà phê, định nghĩa chất lượng thuộc tính xem xét có lẽ phát triển qua nhiều kỷ Ngày nay, định nghĩa thay đổi theo chuỗi sản xuất đến người tiêu dùng: - cấp độ nông dân: chất lượng cà phê kết hợp trình độ sản xuất, giá dễ dàng văn hóa; - cấp độ nhà xuất nhà nhập khẩu: chất lượng cà phê liên kết với kích thước hạt, thiếu khuyết tật, tính thường xuyên việc cung cấp, trọng tải có sẵn, đặc tính vật lý giá cả; - cấp độ máy rang: chất lượng cà phê phụ thuộc vào độ ẩm, tính ổn định đặc tính, nguồn gốc, giá cả, hợp chất sinh hóa chất lượng cảm quan Cần lưu ý thị trường tiêu dùng quốc gia xác định phẩm chất cảm quan mình; - cấp độ người tiêu dùng: chất lượng cà phê liên quan đến giá cả, hương vị hương vị, ảnh hưởng đến sức khỏe tỉnh táo, nguồn gốc địa lý, khía cạnh mơi trường xã hội học (cà phê hữu cơ, thương mại công bằng, vv) ISO (2004a) xác định tiêu chuẩn cho chất lượng cà phê xanh (tiêu chuẩn ISO 9116) Nó địi hỏi số thông tin, nguồn gốc địa lý thực vật cà phê, năm thu hoạch, độ ẩm, tổng số khuyết tật, tỷ lệ đậu bị côn trùng làm hỏng kích thước hạt Các tiêu chuẩn ISO xác định phương pháp đo lường cho số phẩm chất sau: khuyết tật, độ ẩm, kích thước hạt, số hợp chất hóa học chuẩn bị mẫu để thực nếm thử cốc Các nhà nghiên cứu phải tính đến tất khía cạnh cơng việc chất lượng Chúng tơi trình bày chi tiết bốn đặc điểm chất lượng quan trọng để minh họa vấn đề hạn chế mà người ta phải đối mặt để cải thiện chất lượng cà phê Ba số đó, nghĩa độ ẩm, chất lượng vật lý cảm quan sử dụng toàn chuỗi sản xuất đó, "chất lượng sức khỏe" đặc điểm ngày người tiêu dùng tính đến 1A Độ ẩm Độ ẩm thuộc tính quan trọng số chất lượng Một khảo sát thị trường APROMA thực châu Âu vào năm 1998-1999 cho quỹ chung cho hàng hóa kết luận hạt cà phê Robusta, khuyết điểm quan trọng thương nhân người rang độ ẩm Một độ ẩm cao đậu nguyên liệu dẫn đến khiếm khuyết vật lý cảm giác Nếu đậu ướt (độ ẩm 12,5%), chúng dễ bị mốc trình bảo quản Nếu đậu khô (độ ẩm 8%), chúng hương vị Độ ẩm ảnh hưởng đến cách rang cà phê giảm cân trình rang Cà phê xanh có độ ẩm thấp có xu hướng rang nhanh so với cà phê có độ ẩm cao Độ phân giải ICO 407 khuyến nghị không nên xuất cà phê nằm giới hạn đánh giá theo phương pháp ISO 6673 Một số trường hợp ngoại lệ phép số loại cà phê đặc biệt cà phê nguyên chất Ấn Độ 1B Chất lượng vật lý Kể từ ngày tháng 10 năm 2002, Tổ chức Cà phê Quốc tế (ICO, 2002) triển khai Chương trình Cải thiện Chất lượng Cà phê (CQP) với khuyến nghị cho nước xuất Không nên xuất cà phê với đặc điểm sau: Arabica, vượt 86 lỗi 300g mẫu (phân loại cà phê xanh New York / phương pháp Brazil tương đương); và, Robusta, vượt 150 lỗi 300 gram (Việt Nam, Indonesia phân loại tương đương) Ngoài ra, ISO (2004b) thiết lập tiêu chuẩn (ISO 10470) mô tả khiếm khuyết như: - Nguyên liệu nước ngồi có nguồn gốc từ cà phê; - Ngun liệu nước ngồi có nguồn gốc khơng phải đậu, mảnh giấy da vỏ trấu; - Đậu bất thường cho hình dạng đặn / tồn vẹn; - Đậu bất thường cho xuất trực quan, chẳng hạn đậu đen; - Đậu bất thường cho hương vị cốc sau rang ủ thích hợp Kích thước hạt, định nghĩa loại theo quan điểm thương mại, yếu tố quan trọng giá có liên quan đến loại cà phê (hạt nhỏ loại mang lại giá thấp hơn) Rang lý tưởng nên thực với đậu có kích thước Khi đậu có kích thước khơng đồng rang, nhỏ có xu hướng cháy lớn có xu hướng bị rang dưới, ảnh hưởng đến hình thức bên đậu quan trọng chất lượng cốc (Barel Jacquet, 1994) 1C Chất lượng cảm quan Khi đánh giá chất lượng organoleptic, người ta phải tính đến việc người tiêu dùng có sở thích cụ thể theo quốc tịch họ dẫn đến định nghĩa không đáng tin cậy chất lượng organoleptic Ví dụ: Người Đức người Thụy Điển thích cà phê nhẹ có tính axit người Ý; Hy Lạp, Lebanon phía bắc nước Pháp, người ta tìm đến hương vị «rio» (một hương vị đặc trưng hợp chất hóa học: trichloroanisol) Ngồi ra, đặc tính organoleptic phải ổn định, đặc biệt cho nhà rang xay người tiêu dùng Việc đánh giá chất lượng organoleptic cà phê nhiệm vụ khó khăn Mùi cà phê rang xay trước thêm nước gọi hương thơm, sau đó, người ta ngửi thấy mùi hương, đánh giá thể nhận biết hương vị hương vị Đo lường chất lượng cảm quan dựa đánh giá cảm quan Hai loại phân tích thường sử dụng Cái đầu tiên, đặt tên "phân tích hedonic", đánh giá sở thích người tiêu dùng Nó phải thực nhóm gồm 60 người đánh giá tự phát đại diện cho dân số có sở thích tìm kiếm Phương pháp thứ hai gọi "phân tích mơ tả" Những người đánh giá đào tạo phân biệt cà phê cách sử dụng, ví dụ, kiểm tra hình tam giác Ba tách cà phê phục vụ, hai tách chứa cà phê.Người đánh giá phải xác định cốc Chuyên gia đánh giá mơ tả hồ sơ Đây thủ tục phức tạp sử dụng số mơ tả cụ thể Có số thuật ngữ có (Lingle, 1986; ITC, 2002; ICO, 2004), ISO sớm xây dựng danh sách mô tả cụ thể cho cà phê (Prodolliet, 2005) Chuyên gia đánh giá (ít 5) phải đào tạo để sử dụng từ vựng Đánh giá chất lượng organoleptic cà phê tập đòi hỏi;Thật vậy, hương vị thu tách cà phê kết nhiều hợp chất thơm có cà phê (hơn 800 cà phê rang) Do việc đo thành phần 800 hợp chất thơm có cà phê rang phương pháp khả thi để đánh giá chất lượng cảm quan cà phê, nên việc phát triển yếu tố dự đoán gián tiếp chất lượng cà phê organoleptic tiến hành Những yếu tố dự đoán bao gồm định lượng hợp chất hóa học có cà phê xanh (đường, lipit, protein, axit chlorogen methylxanthines) thơng qua phương pháp hóa ướt truyền thống phương pháp gián tiếp quang phổ cận hồng ngoại (Bertrand et al., 2005b) Sự phát triển công cụ dễ sử dụng hiệu cho phép kiểu hình quy mơ lớn, thành phần quan trọng việc thực chiến lược nhân giống cho chất lượng organoleptic cà phê 1D Chất lượng sức khỏe Đối với người tiêu dùng, thành phần quan trọng chất lượng hàng hóa thơ an toàn thực phẩm Cà phê chứa nhiều phân tử ảnh hưởng đến sức khỏe tỉnh táo Một số số chúng có mặt tự nhiên hạt cà phê có nguồn gốc từ phản ứng sinh hóa xảy q trình rang, loại khác Ochratoxine A (OTA) dư lượng thuốc trừ sâu hợp chất bên ngồi độc lập với thành phần hóa học hạt cà phê Mức độ dư lượng thuốc trừ sâu thường thấp cà phê (FDA, 2002) Ochratoxin A (OTA) loại độc tố độc tố Mycotoxin sản xuất số lồi nấm mốc tìm thấy đặc biệt ngũ cốc Trong cà phê, OTA sản xuất Aspergillus niger, A carbonarius A ochraceus Nó chứng minh gây tổn thương thận khối u động vật thử nghiệm Nó phân loại gây ung thư cho người Về mặt hợp chất hóa học có hạt cà phê, vài số chúng biết có hậu sức khỏe.Thành phần hóa học nhận xem xét khoa học caffeine Hầu hết người tiêu dùng tìm kiếm tác dụng kích thích hoạt động não Mặc dù có tác dụng tích cực tỉnh táo, caffeine có số tác động xảy bệnh tăng cholesterol ung thư Cà phê chứa axit chlorogen, melanoidin chất chưa biết khác xác định chất chống oxy hóa mạnh Diterpens đặc trưng cho loài Coffea (Cafestol Kahweol) chứng minh có số đặc tính tăng cholesterol liên quan đến đặc tính chống oxy hóa Tóm lại, kiến thức thu vài thành phần hậu sức khỏe, người biết đến thành phần khác chiếm tới 98% hạt cà phê rang Như kết luận cho phần này, khơng có định nghĩa đơn giản đưa cho chất lượng cà phê, mức độ người đối thoại chuỗi thị trường cà phê Các thành phần khác bao gồm theo thuật ngữ chất lượng Tuy nhiên, mức độ phức tạp này, thêm điều thứ hai: chất lượng cà phê thay đổi tùy thuộc vào yếu tố môi trường, kỹ thuật di truyền Nguồn không biến đổi gen cho chất lượng Như trình bày phần trước, chất lượng cà phê liên quan đến số thành phần Những đặc điểm đối tượng nguồn khác Một số số chúng phụ thuộc hồn tồn vào quy trình thu hoạch sau thu hoạch (ví dụ độ ẩm, số lượng khuyết tật mẻ cà phê) số khác phụ thuộc vào điều kiện khí hậu trẻ em ("terroirs"), yếu tố sinh lý di truyền 2A Thu hoạch hậu ảnh hưởng đến chất lượng Người ta đồng ý lao động hái chăn nuôi truyền thống, trái ngược với thu hoạch máy móc, tạo cà phê xanh chất lượng tốt cách giảm tỷ lệ khuyết tật mẻ cà phê Sau đó, tùy thuộc vào trình sau thu hoạch, hậu mạnh mẽ chất lượng cà phê quan sát Ví dụ, chế biến khơ thường tránh mẫu chất lượng làm tăng vị đắng rượu (Barel Jacquet, 1994) Khi đậu thu hoạch chuẩn bị, chất lượng organoleptic bị ảnh hưởng trình rang Theo hồ sơ nhiệt độ thời gian rang, mùi vị hương vị cảm nhận đồ uống khác 2B Ảnh hưởng khí hậu đến chất lượng Khí hậu, độ cao bóng râm đóng vai trị quan trọng thơng qua nhiệt độ, sẵn có ánh sáng nước thời kỳ chín Lượng mưa phân phối ánh nắng mặt trời có ảnh hưởng mạnh mẽ đến hoa, mở rộng đậu chín Ví dụ, axit chlorogen hàm lượng chất béo tìm thấy tăng theo độ cao C arabica Vai trò loại đất nghiên cứu kỹ Người ta thường thừa nhận cà phê có tính axit trồng đất núi lửa phong phú (Harding et al., 1987) 2C Sinh lý ảnh hưởng đến chất lượng Sinh lý cây, tuổi thời gian hái tất tương tác để tạo đặc tính cuối sản phẩm Thật vậy, người ta thấy tuổi cây, vị trí tỷ lệ có ảnh hưởng mạnh đến thành phần hóa học đậu xanh (Bertrand, 2002; Vaast et al., 2006) Sự trưởng thành có ảnh hưởng mạnh mẽ đến chất lượng cà phê Guyot cộng (1988) cho thấy C canephora anh đào màu vàng màu xanh hái vào cuối mùa hái có chứa đậu với mức độ trưởng thành cao so với anh đào đỏ chọn vào đầu mùa hái Điều nhìn thấy kích thước đậu, nội dung hóa học chất lượng cốc Mặt khác, C arabica Costa Rica, việc hái sớm anh đào đỏ cho loại cà phê ngon (Bertrand, 2002) Tóm lại, chất lượng cà phê đặc điểm phức tạp dựa nhiều yếu tố Bên cạnh yếu tố phi di truyền trình bày, vai trị di truyền cịn lâu khơng đáng kể Các chiến lược nhân giống cà phê có tính đến thuộc tính chất lượng trình bày đoạn Nhân giống di truyền cho chất lượng Nếu thu hoạch, quy trình sau thu hoạch sinh lý ảnh hưởng đến chất lượng cà phê, nguồn gốc di truyền (loài kiểu gen) ảnh hưởng lớn đến chất lượng cà phê Phần thứ ba chia thành ba phần nhỏ.Đầu tiên, nhìn tổng quan nhanh chóng thay đổi quan sát cấp độ giao thoa trực giác trình bày Trong phần thứ hai thứ ba, chiến lược nhân giống phát triển C arabica C canephora đưa 3A Biến thể di truyền cho chất lượng Chi Coffea bao gồm trăm lồi khác có khác biệt lớn thành phần hóa học (Clifford, 1985) Cho đến nay, C arabica C canephora nhận ý nhiều ưu thương mại họ.Sự khác biệt lớn hai loài quan sát cho hầu hết hợp chất hóa học chúng, bảng Sự thay đổi đáng kể tồn cấp độ loài Nếu thay đổi C canephora liên tục, C arabica , biến đổi chất lượng có kiểu cụ thể với đột biến thể thuộc tính chất lượng cụ thể, Caturra (lùn, suất cao liên quan đến giảm chất lượng) Maragogype (rất lớn đậu, suất thấp giá cao đánh dấu) Ngoài ra, số đột biến xác định, đặc biệt liên quan đến hàm lượng caffeine thấp, chẳng hạn C arabica giống Laurina (0,6% dm), gần hơn, Brazil, nguồn gốc người Nigeria có dấu vết caffeine (Silvarolla et al., 2004 ) 3B Nhân giống cho chất lượng C arabica Trong số kiểu gen C arabica , xác định ba nhóm thực vật: kiểu gen hoang dã từ khu vực Sudan-Ethiopia, dịng khơng xâm lấn (các loại typica Bourbon) giống xâm lấn, chủ yếu xây dựng từ kiểu gen lai Timor Cà phê sản xuất C arabica coi loại cà phê chất lượng tốt Đặc tính thiết lập rõ ràng cho giống cổ điển Caturra, Mundo Novo dòng khác thu từ lựa chọn phả hệ Vì chương trình nhân giống chọn F giống lai, dòng xâm nhập gốc ghép, số yếu tố chất lượng sửa đổi Các đoạn sau trình bày sửa đổi có chất lượng chiến lược nhân giống Sự xâm nhập chất lượng: Trong trường hợp cà phê Arabica, lựa chọn phả hệ khuyến nghị để chuyển gen kháng từ lai Timor, giống lai tự nhiên có nguồn gốc từ lai C arabica (2n = 2x = 44) C canephora , (2n = 2x = 22) Kể từ nửa sau kỷ 20, hầu hết chương trình nhân giống thực tồn giới (Brazil, Colombia, Kenya, Costa Rica, Honduras) chuyển sang tính kháng bệnh gỉ sắt ( Hemileia differatrix Berk Và Br.), Tuyến trùng rễ (Meloidogyne sp.) Bệnh cà phê Berry ( Colletotrichum kahawaeSensu Hindorf) từ giống Timor đến giống trồng C arabica Một số giống (ví dụ: cv 'Costa Rica 95', cv 'Obatã', cv 'IAPAR59') dòng cố định thu sau nhiều hệ lựa chọn phả hệ Người ta ước tính hàng trăm ngàn trồng giống Với thành cơng này, hy vọng việc nhân giống loài Arabica để kháng sâu bệnh dựa thời gian lai có nguồn gốc từ giống lai Timor Số lượng vật liệu di truyền hành tinh, xâm lấn nhiều dòng Arabica, dao động từ 8% đến 27% gen C canephora (Lashermes et al., 2000a) Do đó, dường q trình xâm nhập khơng bị hạn chế tính trạng kháng thuốc liên quan đến gen liên quan đến yếu tố định di truyền tính trạng khác Dựa đánh giá cảm quan, dòng Arabica xâm lấn tìm thấy để tạo chất lượng đồ uống tốt (BQ) tương tự tiêu chuẩn không xâm lấn (Fazuoli et al., 1977; Owuor, 1988; Castillo, 1990; Moreno et al., 1995 ; Puerta, 1998, 2000) Tuy nhiên, hầu hết người mua cà phê cho giống xâm nhập có BQ so với tiêu chuẩn 'Caturra'.Bằng cách liên kết lượng vật liệu di truyền ngồi hành tinh theo ước tính phân tích AFLP dịng có nguồn gốc lai Timor, với chất lượng đồ uống thành phần hóa học đậu, thấy kết luận cần phải kiểm duyệt Đối với giống CR95 'Veranero' số dòng trải qua lựa chọn, dường có giảm chất lượng xâm nhập Đó trường hợp với dịng T17924 cho thấy khác biệt đáng kể so với biện pháp kiểm sốt khơng xâm lấn hầu hết thành phần hóa học (trigonelline, sucrose axit chlorogen), độ axit ưu tiên nước giải khát liên quan đến kiểm soát tiêu chuẩn (Bertrand B et al., 2003) Tuy nhiên, có dịng hướng nội cho thấy khơng có khác biệt so với điều khiển khơng hướng nội Đó trường hợp với dịng T17934 T17931, khơng khác hàm lượng hóa học BQ Vì loại thứ hai thể tính kháng di truyền bệnh gỉ sắt cà phê M exigua , người ta kết luận diện gen kháng thuốc khơng có tác dụng pleiotropic chất lượng đồ uống Đây kết đáng khích lệ cho tương lai chương trình cải tiến gen dựa xâm nhập gen kháng từ C canephora thông qua lai Timor Tuy nhiên, để hiệu tránh mảnh vỡ khơng mong muốn bị nghi ngờ có ảnh hưởng tiêu cực đến BQ, lựa chọn hỗ trợ dấu hiệu cụ thể khả kháng sâu bệnh (Lashermes et al., 2000b) Mặt khác, chương trình hiệu xác định hợp chất hóa học biến thể có mối tương quan cao với khiếm khuyết chất lượng xâm nhập F giống lai chất lượng đồ uống: Từ năm 1980, số nhà nghiên cứu đề xuất việc tạo giống lai để giúp tăng đa dạng di truyền, đáng ý cách lai nguồn gốc hoang dã với giống xâm lấn không xâm lấn (Charrier, 1978) khai thác dị hợp di truyền nhóm (Walyaro, 1983; Van der Vossen, 1985; Charrier Berthaud, 1985) Nguồn gốc Ethiopia cung cấp tính kháng tuyến trùng (Anzueto cộng sự, 2001), kháng phần bệnh gỉ sắt (Gil et al., 1990) kháng CBD (Van der Vossen, 2001) có khả chất lượng đồ uống tốt Liên quan đến dị hợp tử loài, Carvalho Monaco (1969), Walyaro (1983), Ameha (1990), Bellachew (1997) sau Cilas et al (1998) chứng minh tồn cách đan xen Ở C arabica , tỷ lệ dị hợp tính tốn sở bố mẹ tốt đánh giá từ lai nhóm di truyền khác Tỷ lệ dị hợp quan sát tác giả khác thay đổi từ 10% đến 40% (Ameha, 1990; Carvalho Monaco, 1969; Fazuoli et al., 1993; Walyaro, 1983; Netto et al., 1993), ngoại trừ đáng ý dị hợp tử báo cáo Cilas et al (1998) đạt 200% Tỷ lệ dị hợp tìm thấy Trung Mỹ (22,0 đến 47,0%) tồn cầu có độ lớn quan sát phần lớn tác giả Ở Trung Mỹ Ethiopia, khác biệt suất dòng bố mẹ giống lai khơng giải thích thành phần suất, chẳng hạn số lượng nút theo trọng lượng 100 hạt giống cho hai quần thể Cuối cùng, dị hợp dường phản ánh vĩnh viễn nhánh dài (Bertrand et al., 2005a) Quần thể lai F cho thấy mức sinh thấp so với dân số dòng Trong điều kiện Trung Mỹ, khác biệt tỷ lệ sinh từ 1,2 đến 6,3% trái Trong cà phê, số hạt phụ thuộc vào khả sinh sản noãn (Louarn, 1992) Khơng thể dị hợp giải thích khả sinh sản tốt hơn, khả sinh sản lai chí cịn thấp so với dịng Khơng có khác biệt rõ ràng hàm lượng hóa chất đậu chất lượng cốc đánh giá cảm quan so sánh giống lai F với giống truyền thống ('Bourbon') điều kiện khí hậu edapho khác độ cao khác (Bertrand et al., 2006) Các giống lai F xuất hơn, tương tự vượt trội so với giống truyền thống thuộc tính định, chẳng hạn tính axit mùi thơm Về kiểm sốt tiêu chuẩn hóa, giống lai F tương đương vượt trội so với giống truyền thống Đối với caffeine, trigonelline, giống lai không khác với giống truyền thống Các giống lai cho thấy xu hướng giàu axit chlorogen chút so với giống truyền thống Đối với giống trồng truyền thống, hàm lượng lipid thay đổi theo độ cao (nghĩa tương ứng thấp độ cao thấp cao độ cao cao hơn) Mặt khác, độ cao dường không ảnh hưởng đến hàm lượng chất béo giống lai F Những giống tạo nhiều 30 đến 70% so với giống truyền thống đặc biệt mạnh mẽ Sức sống cao dẫn đến việc cung cấp chất dinh dưỡng tốt cho trái cây, độ cao Do đó, việc sử dụng giống lai F góp phần làm giảm thay đổi hàm lượng chất béo hạt cà phê, đồng thời làm giảm thay đổi chất lượng đồ uống 2003; Niggeweg, Michael, & Martin, Snook, & Jackson, 2005 ) 2004; Peterson, Harrison, Ba phân nhóm CGAs, axit caffeoylquinic (CQA; 5CQA inclu ded), dicaffeoylquinic acid (3diCQA) uloylquinic fer- axit (FQA), đại diện xấp xỉ 67%, 20% 13% toàn CGA Robusta, và, 80%, 15% 5% Ả Rập (Adriana Farah, Monteiro Bánh rán & Sê-ri 2008 ; C L Kỳ et al., 2001 ).Tổng lượng CGA tương đối thấp Arabica (4.0 e 8.4%) so với Robusta (7.0 e 14.4%) ( Bicho et al., 2013b ; C.L.; Ky, Noirot, & Hamon, 1997; Upadhyay & Mohan Rao, 2013 ) Thị trưởng thành phần CGA hai 5CQA diCQA thấp Arabica ( Bicho et al., 2013a ; M.; Clifford, 1997 ) Khi ba đồng phân diCQA trộn đều, dư vị đắng, dai dẳng vị đắng chuyển hóa phụ liên tiếp phát xuống bên lưỡi ( Upadhyay & Mohan Rao, 2013 ) Nghiên cứu cho thấy cay đắng kết hợp với hương vị diCQA 5CQA, nhiên, vị chát diCQA giảm có mặt w ith 5CQA ( Clarke & Macrae, 1985; Ohiokpehai, Brum, & Vách đá, 1982 ) Trong nước đồ uống, 5CQA ba đồng phân diCQA có ngưỡng dao động khoảng 0,05 đến 0,1 mg / mL ngưỡng caffeine 0,094 mg / mL ( Drewnowski, 2001; Upadhyay & Mohan Rao, 2013 ) So với caffeine, lượng lớn CQA (5,2 e 6,5% Ả Rập 5,5 đ 8,0% Robusta) lượng nhỏ diCQA (0,7 e 1,0% Arabica 1,4 e 2,5% Robusta) có cà phê (M Clifford, 1997 ) Cùng sau rang, (ánh sáng rang vừa với 67,7% 76,4% bị mất) có lượng CGAs cịn lại bia cà phê góp phần trọng yếu cay đắng khơng thể so với caffeine giải thích Robusta nhiều cay đắng Ả Rập Các đồng phân CGA chính, 5-CQA, di3, 5-CQA, tích lũy chủ yếu hạt cà phê chưa trưởng thành giảm đáng kể trưởng thành Ví dụ, diCQA (chủ yếu di3, 5-CQA) giảm từ 8.4% hạt cà phê xanh xuống 2,3% hạt cà phê đỏ; ngược lại, thành phần nhỏ , 3-CQA 4-CQA, tích lũy ủng hộ gres s i v ely r oughout thứ hạt đậu matu r ation ( J o e € t et al., ; Lepell e y et al., 2007 ) Tương ứng với fl ux, gen khác tái chuyển giai đoạn phát triển cụ thể Enzyme ngược dòng mã hóa PAL, C4H, 4CL, C3Hc HCT kích hoạt phát triển đậu sớm 90 e 120 DAF (ngày sau fl owering) để sản xuất thành phần tích lũy đạt đến cao nguyên 120 e 150 DAF, kích hoạt CCoAOMT gen khác quy định tái huy động hợp chất nhỏ (1/8 -CQA chuyển đổi thành di3, 5-diCQA 1/10 thành 5-FQA) luận án sinh học lignin thứ hai, chịu trách nhiệm làm cứng thành tế bào, từ 150 đến 210 DAF.Sau giai đoạn trưởng thành, mạng lưới dày đặc liên quan đến biểu hầu hết gen phenylpropanoid điều Hình Con đường sinh tổng hợp trigonelline có hạt cà phê Số lượng gen gia nhập đánh dấu bên enzyme mã hóa chữ nghiêng sinh tổng hợp € đường w ay ( Hình ) w e XPR e ssed ( Jo e t et al., ) Ở 120 e 150 DAF, fi NAL 5-CQA Nội dung tăng với HQT 4CL8 e xpr e ssion ( J o e € t et al., ) Các lo w er Nội dung C G Như C.can- ephora FRT64 so đến C.canephora FRT05 có lẽ kết biểu gen HCT cao hơn, HCT chứng minh lignin S L hình thành nhà tài trợ ( Lepelley et al., 2007 ) Chênh lệch thể Sion tương đồng gen kích hoạt giai đoạn phát triển khác có chức khác PAL1 PAL3 C.canephora thể cà phê chưa trưởng thành đánh giá cao tương quan với CGA Nội dung, Tuy nhiên, PAL2 kích hoạt exp ressed mức thấp giai đoạn trưởng thành mà corre- sponds để mơ hình tích lũy avonoid fl ( Lepelley et al., 2012 ) Tất phức tạp biểu thức góp phần vào việc NAL CGA fi Nội dung cà phê Vì thế, Là quan trọng đến hiểu đường sinh tổng hợp giai đoạn phát triển quy định quan trọng bước Có mối quan hệ trọng yếu tìm thấy nội dung CGA lượng mưa bốc hơi, mối tương quan âm nhỏ quan sát với xạ mặt trời Nhiệt độ không bỏ qua cao l y fi signi Sự khác biệt w detec t ed ( J o e € t et al., ) Một khí hậu ấm áp cung cấp vùng cà phê độ cao thấp kích hoạt tích tụ sớm thành phần tái hợp hóa ưa thích hợp chất nhỏ Một chậm trễ tích lũy 5-CQA tìm thấy vùng khí hậu mát mẻ 150 e 210 DAF phát triển hạt giống Sự tích lũy 5-CQA tìm thấy có mối tương quan tích cực với nhiệt độ Nội dung CGA tối đa chịu ảnh hưởng nhiệt độ CGA đỉnh giai đoạn khác khác khí hậu biến thể diễn viên phụ thành phần emains r trưởng thành ( J o e € t et al., ) Điều ESTS SUG g tr a nthánh thư biểu đồng quy định gen CGA luận án biosyn- chịu ảnh hưởng đậu giai đoạn phát triển nhiệt độ Dành cho ví dụ PAL2 C4H biểu tương quan tích cực với nhiệt độ 90 đ 120 DAF, Tuy nhiên, tương quan ngược quan sát thấy 120 e 150 DAF Khơng tìm thấy nhiệt độ đến tích cực tương quan với fi NAL CGA Nội dung Điều có lẽ tất cà phê từ 16 địa điểm khác (270 e 1032 m so với mực nước biển) thu hoạch lúc Có ba lý giải thích cho kết Các tiên fi Là cao độ cao với thấp nhiệt độ chậm trễcà phê hạt trưởng thành kết khác trưởng thành cho âm mưu Các thứ hai Hình Con đường sinh tổng hợp axit chlorogen hạt cà phê PAL, phenylalanine amoniac lyase; C4H, trans -cinnamate 4-hydroxylase; 4CL, 4coumarate: CoA ligase; HCT, h ydr o x y cinnamo y lCoA : shikimate / q uine h ydr o x y cinna m o y l chuyển se; HQ T , h ydr o x y cinnamo y l-CoA qu i nate h ydr o x y cinnamo y l; C H, p -coumaro y l CoA 3- hydr o xylase; CCoAOMT, caffeoyl-CoA 3- O -methyltransferase; FQT, feruloyl-CoA dập tắt feruloyl transferase Gen gia nhập số đánh dấu chữ in nghiêng bổ sung gia nhập số dán nhãn (1) e (4) trái trường hợp CGA tích lũy ưa chuộng độ cao fi c đặc hiệu Cuối không phần quan trọng, nghiên cứu không thiết kế đặc biệt cho độ cao môi trường phức tạp kết hợp yếu tố khí hậu khác T empe r ature Là positi v ely cor r phấn khởi với C G A t ent ( J o e € t et al., 2010 ) Shade tìm thấy fl uencing yếu tố 45% bóng râm (bởi độ dốc nghiêng) giảm nhẹ nội dung CGA C.arabica Costa Úc 95 tăng bóng râm từ đến 80% (bởi bóng râm thân cây) gây sụt giảm trọng yếu mức CGA C.arabica K7 ( Odeny et al, 2014; Vaast et al, 2006 ) Ngồi ra, khác biệt đến từ khác biệt kiểu gen bóng râm Đó khăn fi sùng bái đến chế tạo phần kết luận từ kết Yếu corremối liên hệ xạ mặt trời lượng mưa hàm lượng CGA đưa ( J o e € t et al., ) Bóng râm i n fl uences nảy sinh từ vi khí hậu khác tạo bóng râm thích nghi kiểu gen khác với bóng râm Bằng chứng phiên mã cần thiết để deter- mỏ trongfl ảnh hướng bóng râm CGA tích lũy Hơn nữa, bước liên quan đến sinh tổng hợp 5FQA phát hiện, loại enzyme giống CCoAOMT CCoAOMT báo cáo có liên quan Nhiều báo cáo môi trường ảnh hướng fl CGA cà phê liên quan đến vai trò CGA kháng bệnh sâu bệnh Các Enes g, PAL C4Hđiều tiết CGA sinh tổng hợp, tìm đến phải chịu mơi trường thay đổi, bao gồm stress sinh học phi sinh học ( Benveniste, Salaün, & Durst, 1978; Tovar, Romero, Girona, & Motilva, 2002 ) Tuy nhiên, khơng có nghiên cứu vai trị họ mơi trường ảnh hướng fl chất lượng cà phê thích ứng cà phê 1.1.3 Sucrose Là tiền chất hương liệu, sucrose thối hóa nhanh chóng thời gian rang tạo thành v hợp chất dễ bay không bay hơi, chẳng hạn furan, pyrazine, axit aliphatic hydroxymethyl furfural thông qua phản ứng Millard ( Grosch, 2001 , tr 68 e 89) Sucrose đóng góp 90% tổng lượng carboh ydrates phân tử thấp hạt cà phê xanh ( Knopp, Bytof, & Selmar, 2006 ) Ví dụ, loại đường phân tử thấp khác, glucose fructose làm suy giảm phản ứng với amino axit, màu xanh đậu họ hiệu có khoảng 0,5% tổng số (CL Ky cộng sự, 2000 ) Các nghiên cứu rộng rãi chuyển hóa sucrose cà chua (Solanum lycopersicum) mơ hình thích hợp cho cà phê hai thuộc lớp tiểu hành tinh nhà máy owering fl chia sẻ số lượng lớn gen thông thường Chuyển hóa Sucrose q trình phức tạp bao gồm hai bước ( Hình ): 1) phân hủy sucrose cách tổng hợp (SUS) invertase (bao gồm ba chất đồng phân thành tế bào, cytosol không bào); 2) sinh tổng hợp sucrose gen mã hóa sucrose phosphate synthase (SPS) sucrose phosphate phosphatase (SPP) tương tác với chuyển hóa hex- ose sucrose tinh bột ( Nguyễn-Quốc & Tiền sảnh, 2001 ) Hàm lượng Sucrose phụ thuộc vào kiểu gen cà phê, với 7,4 e 11,1% Arabica 4,05 e 7,05% Robusta ( Tran, Slade Le e, Furtado, Mùi & Henry, 2016 ) Sucrose không đổi giai đoạn phát triển sớm trình chuyển hóa nội nhũ, sau tăng lên trình phát triển nội nhũ tăng mạnh từ giai đoạn (quả lớn sang màu vàng) gia tăng chậm lại xuống trưởng thành Robusta tích lũylates gradua l ly thro u ghout hạt giống de v elopment ( J o e € t et al., 09; Đặc quyền cộng sự, 2008 ) Các gen điều hòa chuyển hóa sucrose thể khác q trình phát triển đậu Các hoạt động tổng hợp sucrose (CcSUS1) axit invertase (CcINV2) cao thể giai đoạn phát triển ban đầu hoạt động CcSPS1 (sucrose phosphate thase)thấp để tái tổng hợp vào cuối trình phát triển ( Privat et al., 2008 ) Các gen ứng cử viên trình chuyển hóa sucrose thể khác thơng qua phát triển hạt cà phê (bao gồm gen paroteous) Gen enco ding invertase sucrose phosphate phosphatase (SPP) cao điểm fi sta g e ( Jo e € t et al., 0 ) Điều ESTS SUG g cân sinh tổng hợp dị hóa sucrose hạt cà phê non, đáp ứng với nồng độ sucrose không đổi cà phê trẻ hoa Các cao biểu SPS phát 60 đ 90 DAF Điều Là Chìa khóa enzyme mã hóa sucrose sinh tổng hợp hạt cà phê Trong đó, gen mã hóa tế bào Tường nghịch đảo ( CWIN ) cao nguyên tương đương với vận chuyển hexose cao ( HT1) e xpr e ssion tương tự sta g e ( J o e € t et al., 0 ) Điều ngụ ý sucrose cao chứa mô (nguồn) vận chuyển sucrose đến thành tế bào Các sucrose bị phân hủy thành hexose vận chuyển HT1 đến hạt phát triển (chìm) cytosol Sự phân hủy sucrose thành hexose vận chuyển góp phần làm tăng hàm lượng sucrose hạt cà phê sau giai đoạn không đổi sucrose Phù hợp với gia tăng này, đỉnh biểu sucrose Transporter ( ST1 ) mức e D AF ( J o e € t et al., 0 ) Điều xplains e suc r ose tăng e ase cách hồi tưởng sucrose từ nguồn vận chuyển ST1 thông qua tế bào Tường đến bồn rửa ST1 biểu cao nguyên cho đến120 e 150 DAF, mức biểu thức ST2 đạt đến cao cấp độ Tuy nhiên, SUS1 phát biểu cao e D AF ( J o e € t et al., 0 ) Điều xplains e w h y sucrose w tăng đáng kể thời gian 90 e 150 DAF sau chậm lại Tất biểu gen giảm giai đoạn sau Sau đó, INV đạt tối đa khác 210 e 240 DAF SUS2và HT2 tăng bày tỏ đánh giá cao giai đoạn fi cuối Một đỉnh khác tìm thấy 210 e 240 DAF biểu thức SPS Điều làm kết tăng lên SPP biểu hiện, mà quy định phản ứng hạ lưu sucrose, nhiên, Su cr o se incr e ased trưởng thành ( J o e € t et al., 0 ) Điều ngụ ý SPS enzyme chiếm ưu kiểm soát tổng hợp sucrose Cuối cùng, tất mức biểu gen giảm xuống ngoại trừ HT2 SUS2 Từ 120 đến 150 DAF > 240 DAF, mẫu biểu gen theo sau song song với tăng dần sucrose hạt cà € phê ( J o e t et al., 0 ) Khác resea r ch pr o vide chứng cớ CWIN w a s thể phát triển hạt sớm để điều hòa tăng sinh tế bào nội nhũ tế bào phôi, đó, SUS có xu hướng biểu đến muộn sân khấu kiểm soátsinh tổng hợp lipit, tinh bột, cần lulose protein ( Ruan, 2014 ) Shade tìm thấy để giảm Su crose signi fi cantly cách trì hỗn đỉnh cao hoạt động enzyme SUS SPS kết bảng điểm SUS2 cao cà phê endo- tinh trùng Các hoạt động SS SPS tương tự tìm thấy ánh nắng mặt trời bóng râm đầy đủ 214 DAF, nhiên, gia tăng hai hoạt động enzyme 260 DAF báo cáo cà phê trồng điều trị bóng râm ( Geromel et al., 2008 ) Tuy nhiên, nghiên cứu nghiên cứu ba enzyme, bao gồm axit invertase, không cho thấy khác biệt nhiều bảng điểm Nhiều báo cáo thích nghi thực vật với nhiệt độ thấp liên quan đến gia tăng lượng đường hòa tan, đặc biệt sucrose ( Winter & Huber, 2000 ) Hoạt động protein SPS tối đa tìm thấy để đáp ứng với phơi nhiễm lạnh rau bina ( Guy, Huber, & Huber, 1992 ) Trong củ khoai tây, dạng SPS chí quan sát thấy nhiệt độ thấp ( Reimholz cộng sự, 1997 ) Người ta liệu điều xảy hạt cà phê Như trao đổi chất sucrose đa dạng phức tạp liên quan với gen đa, công việc cần thiết để chứng minh tiêu cực ảnh hướng fl bóng râm Thêm vào đó, công việc nhiều cần thiết để xác định cách kiểu gen, môi trường tương tác hai yếu tố trong- fl uences sucrose tích lũy cà phê hạt giống suốt chín 1.1.4 Lipid Lipid cà phê, dao động từ đến 17% đậu xanh c , bao gồm dầu cà phê nội nhũ: triacylglycerol (70 e 80%), este rượu diterpene axit béo (15 e 18,5%) hợp chất nồng độ thấp khác đóng góp 0,1 e 3,2% tổng lượng lipit sáp cà phê (0,1 e 0,3% tổng trọng lượng đậu ) bên ngồi hạt, đơi loại bỏ cách xử lý cơng nghệ Hình Sinh tổng hợp Sucrose hạt cà phê CWIN, Invertase vách tế bào; Vận chuyển HT, Hexose; ST, vận chuyển Sucrose; INV, invertase; SUS, Sucrose synthase; SPP, Sucrose phốt phát; SPS, Sucrose phosphate tổng hợp chẳng hạn đánh bóng, tẩy giun khử caffein làm cho thức uống cà phê hấp dẫn ( Kurzrock & Speer, 2001; Nikolova-Damyanova, Velikova, & Jham, 1998; Oestreich- Tháng một, 2010 ) Lipid cà phê đóng góp vào kết cấu miệng cảm giác thức uống họ mang avours fl vitamin tan chất béo ( Oestreich-Janzen, 2010 ) Kahweol cafestol nhóm axit béo diterpene thu hút nhiều ý tác dụng sinh lý nghịch lý chúng làm tăng cholesterol huyết có khả bảo vệ chống ung thư Tuy nhiên, tocopherols, nhóm lipit quan trọng khác hạt cà phê xanh có mặt với lượng nhỏ, cho thấy hoạt động chống oxy hóa để người ( C a vin, Holzh € sử dụng r , Constable, Ôm g ett , & Schilte r , 998; Lâm, Sparnin, & W attenbe r g, 987; Speer & K o € lling-Spee r , 0 ) Rang không thay đổi hầu hết chất béo cà phê, nhiên, họ khăn fi sùng bái để giữ lại thức uống fi cuối Trong chế phẩm lọc bình thường , ví dụ, có 0,2% lipid bia; expresso rang mạnh, lipit chiếm e 2% ( Ranheim & Hà l vorse n, 05; Speer & K o € lling-Spee r , 0 ) Một số lipid identi fi ed với lồi, ví dụ, kahweol phát chủ yếu Ả Rập 16- O -metylcafestol (16-OMC) la Duy nhât quan sát Robusta cao Nội dung lipit Là tìm Arabica so với cà phê Robusta (với lipit trung bình 15% 10%, tương ứng) Tuy nhiên, tocopherols cao hơntrong Robusta Arabica ( Oestreich-Janzen, 2010 ) Để giải thích khác biệt này, gen pro fi ling tiến hành cho fi oleosin gen (OLE1-5), mã hóa protein chứa dầu hạt chính, Coffea arabica Coffea canephora từ giai đoạn chín khác Hai gen chiếm ưu thế, OLE1 OLE- 2, tog ether với OLE-4 signi fi cantly cao thể giai đoạn phát triển Arabica Tuy nhiên, OLE-3 OLE-5 thể Robusta tất giai đoạn phát triển, ngoại trừ giai đoạn hạt cà phê xanh nhỏ, nơi tất fi ve gen OLE quan sát d có khơng có biểu ( Simkin et al., 2006 ) Điều ngụ ý Arabica bắt đầu lưu trữ dầu sớm với tỷ lệ cao Robusta Giai đoạn điểm thay đổi quan trọng chuyển hóa lipid Đối với tơi, (xem Hình ), đồng thời FATb, KASII, ASD FaTa, tổng hợp lipid cao sụt giảm mạnh axit linolenic (18: 3) tất xảy 90 e 150 DAF Axit béo synthase acyl-CoA chứng minh 90 e 120 D AF So với gen tương đồng loài khác, mức cao đáng kinh ngạc khứ (16: 0) axit linoleic (18: 2) (40%) tương quan với FATb tran- scri p tion suốt lipit tổng hợp ( J o e € t et al., 0 ) Ove r e xpr e ssion FATb chuyển gen thực vật hỗ trợ điều phần kết luận với cao palmitic ( 6: 0) tích € lũy ( D o rmann, Voelke r , & Ohlrog g đ 0 ) Hàm lượng lipid phụ thuộc vào yếu tố mơi trường, bóng râm, dẫn đến mức độ cao ( Odeny et al., 2014; Vaast et al., 2006 ) Độ cao yếu tố khác có lợi cho chất béo tích lũy ( Avelino et al., 2005 ) Hơn nữa, nghiên cứu làm việc với phương pháp điều trị nhiệt độ cực thấp thời gian ngắn phát loại gen cà phê phản ứng khác với nhiệt độ lạnh; lipid tăng số cà phê để trì tính tồn vẹn tế bào khăn fi sùng bái số kiểu gen quan sát thấy có suy thối lipid với màng bị hư hỏng ( Campos, niaQuartin, chicho Ramalho, & Nunes, 2003 ) Do đó, thú vị để xem liệu khác biệt có điều chỉnh gen kiểm sốt tích lũy lipid hay không liệu gen parote nội nhũ cà phê (hạt) có kiểu biểu phản ứng với lạnh hay khơng Cho dù bóng mát độ cao có ảnh hướng fl gen biểu nhiệt độ thấp xác định Tuy nhiên, q trình chuyển hóa li pid phức tạp cần phải làm việc đầy đủ Cho đến nay, khơng có gen mã hóa malonyl-CoA ACP transacylase ketoacyl-ACP synthase III có tìm Co f fea EST sở liệu ( J o e € t et al., 0 ) Các e r , Cần nhiều công việc để hiểu cách thành phần quan trọng tích lũy yếu tố ảnh hưởng đến chúng tích lũy Các phương pháp phân tích chất lượng cà phê tính G E Đặc điểm vật lý hóa học cà phê chịu ảnh hưởng G E trình bày tương tác G E quan sát diễn tả G E Cùng với vật lý hóa học phân tích (chất chuyển hóa), gen ứng cử viên biểu nhuận ling en- ables cation fi identi cation fi quanti bảng điểm cho thấy thành công trọng yếu việc phát khác biệt phân tử môi trường khác ( Cullum, Alder, & Hoodless , 2011 ) Curre ntly, số ngày tăng báo cáo xuất sử dụng phân tích scriptome tran- để điều tra G E uences fl cà phê Một so sánh C ả rập cha mẹ ( C canephora C euginoides ) cho thấy Arabica tra nscriptome Hình Sinh tổng hợp lipid hạt cà phê Các gen mã hóa enzyme in nghiêng * gen khơng tìm thấy sở liệu thẻ trình bày (EST) Coffea PDH, pyruvate dehydrogenase; AC, acetyl-CoA carboxylase; MAT, malonyl-CoA ACP transacylase; KAS, ketoacyl-ACP synthase; KAR, ketoacyl-ACP reductase; HAD, hydroxyacyl-acyltransferase; EAR, enoyl-ACP reductase; SAD, stearoyl-ACP desaturase; j FAT, acyl-ACP thioesterase; LACS, acyl-CoA synthetase chuỗi dài; GPAT, glycerol-phosphate acyltransferase; KCS, beta ketoacyl-CoA syha se; LPAAT, acylglycerol-phosphate acyltranferase; PAP, phosphatidat phosphatase; CPT, diacylglycerol cholinephosphotransferase; DAGAT, diacylglycerol acyltransferase; PDAT, phospholipid diacylglycerol acyltransferase; LPCAT, lysophosphatidylcholine ổn định với thay đổi nhiệt độ so với tổ tiên ( Bardil, de Almeida, Combes, Lashermes, & Bertrand, 2011 ) Thực vật, bao gồm trái cây, có độ dẻo để thích hợp với mơi trường khác Tuy nhiên, thực tế, cho dù trái cà phê Arabica có mơ hình tương tự giống ổn định điều trị mơi trường chưa fi rmed Phân tích transcriptome gần C eugenioides, cung cấp nhìn ag lobal gen bày tỏ đánh giá cao phiên mã có chức khác loại trái lá: sinh học trình liên quan đến gen logic signi fi cantly cao thể loại trái chức phân tử thấp so với lá, indi- mô Cating spec fi chức c ( Yuyama et al., 2015 ) Quan trọng học cải thiện hiểu C ả rập Tương lai học lợi ích fi t từ điều nguồn từ C eugenioides ( Yuyama cộng sự, 2015 ) Chất lượng cà phê chịu ảnh hưởng trao đổi chất hợp chất quan trọng cà phê chế phẩm cross-in chịu ảnh hưởng Sucrose, ví dụ, tiền chất sinh tổng hợp lipid protein ( Ruan, 2014 ) Phân tích transcriptome, tổng quan tất uences fl trongcàng tốt, nhằm hoàn thành toàn bảng tế bào tiết lộ mức độ biểu thay đổi kiểu gen môi trường khác Transcri ptome phân tích sử dụng cơng nghệ trình tự gen (NGS) có lợi thông lượng cao ef fi ciency so với công nghệ trước ( Reuter, Spacek, & Snyder, 2015; Trần et al, 2016 ) Những hạn chế phân tích chất lượng cà phê mô tả G E Mặc dù nhiều nghiên cứu tiến hành G E uences fl chất lượng cà phê, trình phức tạp Một lỗ hổng lớn kiến thức Đầu tiên, chủ nghĩa siêu cà phê thành phần chưa hiểu đầy đủ Cách path- chuyển hóa chính, bao gồm enzyme gen mã hóa họ cần phải identi fi ed Trong trao đổi chất caffeine, ví dụ, fi cao puri ed 7- metylxanthosin tổng hợp, mã hóa cafein sinh tổng hợp, nguồn gốc cà phê chưa phân lập ( Ogawa, Herai, Koizumi, Kusano, & Sano, 2001 ) Thứ hai, phiên mã pro fi ling sử dụng kỹ thuật giải trình tự hệ lên cần thiết để tiếp tục trao đổi chất un- derstand cà phê Giải trình tự hiệu chi phí mang lại chiều sâu phạm vi trình tự kết hợp với liệu cải thiện phân tích phần mềm tất ủng hộ rộng nging thí nghiệm gen biểu phân tích Dành cho thí dụ, Pacbio tảng giải trình tự cung cấp lâu đọc (Trung bình cộng chiều dài > 10 k) so với tảng Illumina, cho phép sử dụng tảng để tạo tài liệu tham khảo bảng điểm sở liệu đặc biệt ecially cho lồi C arabica khơng có gen tham chiếu Mặc dù có tỷ lệ lỗi cao (11%) Pacbio, độ sâu phạm vi bảo hiểm cao tránh vấn đề ( Denoeud et al., 2014 ) Thứ ba, nghiên cứu phiên mã chủ yếu phân tích với cà phê thay trái cây, nhiên, chất lượng cà phê, phân tích trái cần thiết Hơn nữa, có việc hạn chế kết hợp phân tích trao đổi chất với phân tích phiên mã để de fi ne G E fl uences chất lượng cà phê Tương lai triển vọng Thực vật có khả bật để tiến hóa thích nghi với điều kiện mơi trường khác với độ dẻo kiểu hình liên quan đến thay đổi sinh lý trao đổi chất Kiểu gen ment môi trường fl uences chụp kiểu hình phiên mã pro fi ling trình phát triển hạt cà phê Việc phát hành C canephora gen gần phiên mã nhiều việc công bố C engenioids C arabica tăng nguy tiềm ẩn việc nghiên cứu G E fl uences Arabica hay Robusta chất lượng sử dụng phân tích transcriptome Tuy nhiên, để tận dụng hội này, nghiên cứu sâu yêu cầu Thứ nhất, đường trao đổi chất cà phê cần phải hiểu đầy đủ dif giai đoạn phát triển ferent với chất chuyển hóa chủ chốt, enzym mã hóa gen identi fi ed Thứ hai, kiểu gen tác động mơi trường khác q trình chuyển hóa cà phê cần phân tích để xác định cách sử dụng kiến thức để cải thiện chất lượng cà phê Thêm nữa, điều cần thiết phải hiểu GE ảnh hưởng đến chất lượng cà phê làm để sử dụng kiến thức để cải thiện chất lượng cà phê Điều sử dụng hướng dẫn để can thiệp RNA nghiên cứu chuyển gen để kiểm soát gen chủ chốt sửa đổi fi tích lũy NAL thành phần chất lượng chủ chốt để cải thiện cà phê Tuy nhiên, người ta cần phải cân chất lượng sản lượng cà phê Ví dụ, số yếu tố mơi trường, bóng râm, chứng minh cải thiện tích cực chất lượng cà phê, chúng quan sát thấy làm giảm suất cà phê Việc giảm lượng caffeine CGA làm giảm vị đắng bia, nhiên, vấn đề cà phê nồng độ caffeine CGA thấp phép chống lại sâu bệnh Nhìn nhận Cơng trình hỗ trợ Hội đồng nghiên cứu Úc (ID DỰ ÁN: LP130100376) Hội đồng học bổng Trung Quốc (2014 e 2018) ... phần chất lượng chủ chốt để cải thiện cà phê Tuy nhiên, người ta cần phải cân chất lượng sản lượng cà phê Ví dụ, số yếu tố mơi trường, bóng râm, chứng minh cải thiện tích cực chất lượng cà phê, ... trọng xác định nồng độ chất chuyển hóa định chất lượng cà phê Chuyển hóa cà phê tính tốn G E giải thích chất lượng cao Arabica so sánh với Robusta cải thiện chất lượng cà phê bóng râm Tương tác... sử dụng kiến thức để cải thiện chất lượng cà phê Thêm nữa, điều cần thiết phải hiểu GE ảnh hưởng đến chất lượng cà phê làm để sử dụng kiến thức để cải thiện chất lượng cà phê Điều sử dụng hướng