1. Trang chủ
  2. » Luận Văn - Báo Cáo

Tổng hợp xanh một số aminophosphate mới dựa trên carbazole và hoạt tính sinh học 3

39 2 0

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

THÔNG TIN TÀI LIỆU

Nội dung

Trang 72 CHƯƠNG 3 KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 3 1 Kết quả phân tích hóa lý 3 1 1 9–Ethyl–9H–carbazole (1) Hiệu suất 91%, mp 69–71 ℃; 1H NMR (200 MHz, D1CHCl3, 25 °C, TMS) δ= 1 53 (t, J=8 0 Hz, 3H; CH3), 4 47 (q, J=7 3 Hz, 2H; CH2), 7 29–7 39 (m, 2H; Ar– H), 7 49–7 62 (m, 4H; Ar–H), 8 57 ppm (d, J= 8 0 Hz, 2H; Ar–H); GCMS mz 180M CH3 +, 195M+ 3 1 2 9–ethyl–9H–carbazole–3–carbaldehyde (2) Chất rắn màu vàng; Hiệu suất 53%; mp 90– 92 ℃; 1H NMR (200 MHz, D1CHCl3, 25 °C, TMS) δ=1 55 (t, J=8 0 Hz, 3.

CHƯƠNG : KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 3.1 Kết phân tích hóa lý 3.1.1 9–Ethyl–9H–carbazole (1): Hiệu suất 91%, mp: 69–71 ℃; 1H NMR (200 MHz, [D1]CHCl3, 25 °C, TMS): δ= 1.53 (t, J=8.0 Hz, 3H; CH3), 4.47 (q, J=7.3 Hz, 2H; CH2), 7.29–7.39 (m, 2H; Ar– H), 7.49–7.62 (m, 4H; Ar–H), 8.57 ppm (d, J= 8.0 Hz, 2H; Ar–H); GC/MS m/z 180[M-CH3]+, 195[M]+ 3.1.2 9–ethyl–9H–carbazole–3–carbaldehyde (2): Chất rắn màu vàng; Hiệu suất 53%; mp: 90– 92 ℃; 1H NMR (200 MHz, [D1]CHCl3, 25 °C, TMS): δ=1.55 (t, J=8.0 Hz, 3H; CH3), 4.49 (q, J=7.3 Hz, 2H; CH2), 7.33–7.66 (m, 4H; Ph–H), 8.10 (d, J=10.0 Hz, 1H), 8.24 (d, J=8.0 Hz, 1H), 8.69 (s, 1H), 10.17 ppm (s, 1H; CHO); GC/MS m/z: 208[M-CH3]+, 223[M]+ 3.1.3 Dimethyl (9-ethyl-9H-carbazole-3-yl)(4-methylphenyl amino) methyl phosphonate (3a) Hiệu suất 91% (0.902g); mp: 135–136℃; 1H NMR (200 MHz, [D1]CHCl3, 25 °C, TMS): δ=1.25 (t, J=7.1 Hz, 3H; N–CH2–CH3), 1.49 (t, J=6.8 Hz, 3H; P–O–CH2–CH3), 1.60 (t, J=7.1 Hz, 3H; P–O– CH2–CH3), 2.34 (s, 3H; Ph–CH3), 3.72–3.85 (m, 1H; P–O–CH2–CH3), 4.03–4.15 (m, 1H; P–O–CH2– CH3), 4.28–4.37 (m, 2H; P–O–CH2–CH3), 4.53(q, J=7.2 Hz, 2H; N–CH2–CH3), 5.13 (d, J=23.5 Hz, 1H; N–CH–P), 6.78 (d, J=8.4 Hz, 2H; Ph–H), 7.09 (d, J=8.2 Hz, 2H; Ph–H), 7.37–7.78 (m, 5H; Ar– H), 8.28 (d, J=7.7 Hz, 1H; Ar–H), 8.37 ppm (s, 1H; Ar–H); 13C NMR (50 MHz, [D1]CHCl3, 25 °C, TMS): δ=14.3,16.8, 20.8, 38.0, 57.0 (d, J=151.5 Hz; P–CH–N), 63.6, 109.0, 114.5, 119.3, 120.4, 121.0, 123.1,123.5, 125.9, 126.2, 126.5, 127.9, 130.1, 140.2, 140.7, 144.6, 144.8 ppm; IR (KBr): ṽ=3300 (N–H), 2978 (C–H, alkyl), 1617, 1520, 1486 (C=C), 1234 (P=O), 1331(C–O) 1054,1023 (C– N), 749 cm-1 (P–CH); 31P NMR (200 MHz, CHCl3/H3PO4, 25 oC, TMS):  =24.767 ppm 3.1.4 Dimethyl (9-ethyl-9H-carbazole-3-yl)(4-Bromophenyl amino) methyl phosphonate 3b Hiệu suất: 85%(0.948 g), mp:176–177℃; 1H NMR (200 MHz, [D1]CHCl3, 25 °C, TMS): δ=1.05 (t, J=7.1 Hz, 3H; N–CH2–CH3), 1.31 (t, J=7.1 Hz, 3H; P–O–CH2–CH3), 1.42 (t, J=7.2 Hz, 3H; P–O– CH2–CH3), 3.48-3.64 (m, 1H; P–O–CH2–CH3), 3.78–3.94 (m, 1H; P–O–CH2–CH3), 4.10–4.17 (m, 2H; P–O–CH2–CH3), 4.34 (q, J=7.1 Hz, 2H; N–CH2-CH3), 4.88 (d, J=23.7 Hz, 1H; P–CH), 6.54 (d, J=8.8 Hz, 2H; Ph–H), 7.15 (d, J=8.8 Hz, 2H; Ph–H), 7.23–7.56 (m, 5H; Ar–H), 8.09 (d, J=7.8 Hz, 1H; Ar–H), 8.15 ppm (s, 1H; Ar–H); 13C NMR (50 MHz, [D1]CHCl3 , 25 °C, TMS): δ=14.3, 17.0, Trang 72 38.1, 56.8 (d, J=151.5 Hz; P–CH–N), 63.9, 109.1, 110.5, 116.0, 119.4, 120.4, 121.0, 123.0, 123.6, 125.8, 126.3, 132.3, 140.2, 140.7, 145.9, 146.2 ppm; FT–IR (KBr): 3294 (N–H), 2978 (C–H, alkyl), 1596, 1489, 1387 (C=C), 1331(C–O), 1053, 1022 (C–N), 1234 (P=O), 748 cm-1(P–CH); 31 P NMR (200 MHz, CHCl3/H3PO4, 25 oC, TMS):  =24.189 ppm 3.1.5 Dimethyl (9-ethyl-9H-carbazole-3-yl)(4-Bromo-3-methylphenylamino) methyl phosphonate (3c) Hiệu suất 90% (1.048g); mp:149–150 ℃; 1H NMR (200 MHz, [D1]CHCl3, 25 °C, TMS): δ=1.05 (t, J=7.1 Hz, 3H; N–CH2–CH3), 1.30 (t, J=7.1 Hz, 3H; P–O–CH2–CH3), 1.42 (t, J=7.1 Hz, 3H; P–O– CH2–CH3), 2.22 (s, 3H; Ph–CH3), 3.48–3.61 (m, 1H; P– O–CH2–CH3), 3.81–3.94 (m, 1H; P– O– CH2–CH3), 4.09–4.16 (m, 2H; P– O–CH2–CH3), 4.34 (q, J=7.1 Hz, 2H; N–CH2–CH3), 4.88 (d, J=17.6 Hz, 1H; P–CH), 4.88 (q, J=10.9 Hz, 1H; N–H), 6.35 (dd, J=8.5 Hz, J=2.7 Hz, 1H; Ph–H), 6.57 (d, J=2.7 Hz, 1H; Ph–H), 7.17 (d, J=8.5 Hz, 1H; Ph–H), 7.22–7.57 (m, 5H; Ar–H), 8.09 (d, J=7.7 Hz, 1H; Ar–H), 8.16 ppm (s, 1H; Ar–H); 13C NMR (50 MHz, [D1]CHCl3 , 25 °C, TMS): δ=13.8, 16.3, 23.0, 37.6, 56.3 (d, J=151.5 Hz; P–CH–N), 63.3, 108.6, 112.9, 116.4, 118.9, 119.9, 120.6, 122.9, 123.1, 125.4, 125.6, 125.9, 132.6, 138.2, 139.7, 140.3, 145.7, 146.0 ppm; FT–IR (KBr): 3305 (N–H), 2978 (C–H, alkyl), 1601, 1480, 1387 (C=C), 1330 (C–O), 1233 (P=O), 1054, 1021 (C–N), 749 (P– CH); 31P NMR (200 MHz, CHCl3/H3PO4, 25 oC, TMS):  =24.265 ppm 3.1.6 Dimethyl (9-ethyl-9H-carbazole-3-yl)(4-nitrophenylamino) methylphosphonate (3d) Hiệu suất: 85% (0.900 g); mp: 177–178 ℃; 1H NMR (200 MHz, [D1]CHCl3, 25 °C, TMS): δ=1.23 (t, J=7.0 Hz, 3H; N–CH2–CH3), 1.52 (t, J=7.1 Hz, 3H; P–O–CH2–CH3), 1.61 (t, J=7.2 Hz, 3H; P–O– CH2–CH3), 3.60–3.79 (m, 1H; P–O–CH2–CH3), 3.97–4.11 (m, 1H; P–O–CH2–CH3), 4.32–4.39 (m, 2H; P–O–CH2–CH3), 4.54 (q, J=7.1 Hz, 2H; N–CH2–CH3), 5.19 (dd, J=23.2 Hz, J=7.5 Hz; 1H; P– CH), 6.08 (t, J=8.6 Hz, 1H; N–H), 6.84 (d, J=9.2 Hz, 2H; Ph–H), 7.39–7.76 (m, 6H; 2Ph–H, 4Ar–H), 8.18 (d, J=9.1 Hz, 1H; Ar–H), 8.26 (d, J=7.7 Hz, 1H; Ar–H), 8.36 ppm (s, 1H; Ar–H); 13C NMR (50 MHz, [D1]CHCl3, 25 °C, TMS): δ=14.2, 16.9, 38.1, 56.3 (d, J=152.5 Hz; P–CH–N), 64.0 (d, J= 42.5 Trang 73 Hz), 109.1, 109.3, 112.9, 119.5, 120.3, 121.0, 122.9, 123.7, 125.0, 125.7, 126.5, 139.3, 140.3, 140.8, 152.4, 152.7 ppm; FT–IR (KBr): 3268 (N–H), 2979 (C–H, alkyl), 1599 (NO2), 1482 (C=C), 1312 (NO2, C–O), 1234 (P=O), 1112, 1050, 1024 (C–N), 750 cm-1 (P–CH); 31 P NMR (200 MHz, CHCl3/H3PO4, 25 oC, TMS):  =23.130 ppm 3.1.7 Dimethyl(9-ethyl-9H-carbazole-3-yl)(4-methoxyphenylamino)methylphosphonate (3e) Hiệu suất: 84% (); mp: 128–129; 1H NMR (200 MHz, [D1]CHCl3, 25 °C, TMS): δ=1.17 (t, J=7.0 Hz, 3H; N–CH2–CH3), 1.37–1.49 (m, 6H; 2P–O–CH2–CH3), 3.72 (s, 3H; Ph–CH3), 3.81–3.90 (m, 1H; P– O–CH2–CH3), 4.00–4.09 (m, 1H; P–O–CH2–CH3), 4.22–4.34 (m, 2H; P–O–CH2–CH3) 4.58 (q, J=6.8 Hz, 2H; N–CH2–CH3), 5.25 (dd, J=24.4 Hz, J=10.3 Hz, 1H; P–CH), 6.19 (q, J= 5.4 Hz; N–H), 6.79 (d, J=8.9 Hz, 1H; Ph–H), 6.98 (d, J=8.9 Hz, 2H; Ph–H), 7.38 (t, J=7.4 Hz, 1H; Ar–H), 7.58–7.82 (m, 4H; Ar–H), 8.24 (d, J=7.6 Hz, 1H; Ar–H), 8.45 ppm (s, 1H; Ar–H); 13C NMR (50 MHz, [D1]CHCl3, 25 °C, TMS): δ=14.3, 16.8 (dd, J=11.0 Hz, J=5.8 Hz), 38.0, 57.7 (d, J=151.5 Hz; P–CH–N), 63.6 (d, J=7.0 Hz), 109.0 (d, J=5.0 Hz), 115.2, 115.8, 119.3, 120.4 (d, J=5.0 Hz), 121.0, 123.1, 123.5, 125.9 (d, J=5.0 Hz), 126.4 (d, J=18.0 Hz), 126.6, 140.2, 140.7, 140.9, 141.2, 153.0 ppm; FT–IR (KBr): 3396, 3184 (N–H), 2978 (C–H, alkyl), 1600, 1516 (C=C), 1334 (C–O), 1234 (P=O), 1053, 1028 (C– N), 752 cm-1 (P–CH); 31P NMR (200 MHz, CHCl3/H3PO4, 25 oC, TMS):  = 23.700 ppm 3.1.8 Dimethyl (9-ethyl-9H-carbazole-3-yl)(4-cyan phenyl amino)methyl phosphonate (3f) Hiệu suất: 89% (0.904 g); mp: 170-171℃; 1H NMR (200 MHz, [D1]CHCl3, 25 °C, TMS): δ=1.04 (t, J=7.0 Hz, 3H; N–CH2–CH3), 1.32 (t, J=7.1 Hz, 3H; P–O–CH2–CH3), 1.42 (t, J=7.1 Hz, 3H; P–O– CH2–CH3), 3.45–3.57 (m, 1H; P–O–CH2–CH3), 3.81–3.93 (m, 1H; P–O–CH2–CH3), 4.11–4.21 (m, 2H; P–O–CH2–CH3), 4.35 (q, J=7.2 Hz, 2H; N–CH2–CH3), 4.93 (dd, J=23.0 Hz, J=7.1 Hz, 1H; P– CH), 5.50 (t, J=8.5 Hz, 1H; N–H), 6.65 (d, J=8.6 Hz, 2H; Ph–H), 7.20-7.55(m, 7H; 2Ph–H, 5Ar–H), 8.09 (d, J=7.7 Hz, 1H; Ar–H), 8.15 ppm (s, 1H; Ar–H); 13C NMR (50 MHz, [D1]CHCl3, 25 °C, TMS): δ=14.2, 16.8 (dd, J=12.5 Hz, J=5.5 Hz), 38.1, 56.1 (d, J=152.0 Hz; P–CH–N), 63.9 (dd, J=28.5 Hz, J=6.8 Hz), 100.4, 109.2 (d, J=8.5 Hz), 114.0, 119.5, 120.2, 120.3, 120.5, 121.0, 122.9, 123.7 (d, J=2.0 Hz), 125.2 (d, J=3.5 Hz), 125.6 (d, J=5.0 Hz), 126.5, 134.0, 140.3,140.7, 150.3, 150.6 ppm; FT–IR Trang 74 (KBr): 3297 (N–H), 2981(C–H, alkyl), 2215 (Nitrile), 1606, 1531, 1489 (C=C), 1336 (C–O), 1234(P=O), 1024 (C–N) 749 cm-1 (P–CH); 31P NMR (200 MHz, CHCl3/H3PO4, 25 oC, TMS):  = 23.435 ppm 3.1.9 Dimethyl(9-ethyl-9H-carbazole-3-yl)(4-chlorophenyl amino)methyl phosphonate (3g) Hiệu suất: 85% (0.881 g); mp: 161–162 ℃; 1H NMR (200 MHz, [D1]CHCl3, 25 °C, TMS): δ=1.05 (t, J=7.1 Hz, 3H; N–CH2–CH3), 1.31 (t, J=7.1 Hz, 3H; P–O–CH2–CH3), 1.42 (t, J=7.2 Hz, 3H; P–O– CH2–CH3), 3.49-3.65 (m, 1H; P–O–CH2–CH3), 3.82–3.94 (m, 1H; P–O–CH2–CH3), 4.10– 4.17 (m, 2H; P–O–CH2–CH3), 4.34 (q, J=7.2 Hz, 3H; N–CH2–CH3), 4.88 (d, J=23.6 Hz, 1H; P–CH), 6.58 (d, J=8.8 Hz, 2H; Ph–H), 7.02 (d, J=8.8 Hz, 2H; Ph–H), 7.19–7.57(m, 5H; Ar-H), 8.09 (d, J=7.8 Hz, 1H; Ar–H), 8,16 ppm (s, 1H; Ar–H); 13C NMR (50 MHz, [D1]CHCl3, 25 °C, TMS): δ=14.3, 16.9, 38.1, 56.9 (d, J=151.5Hz; P–CH–N), 63.8, 108.6 (d, J=5.5 Hz), 115.5, 119.4, 120.3, 120.4, 121.0, 123.0, 123.3, 123.6, 125.8, 126.3, 129.4, 140.2, 140.7, 145.4, 145.7 ppm; FT–IR (KBr): 3295 (N–H), 2979 (C–H, alkyl), 1600, 1492 (C=C), 1331, 1234 (C–O), 1053, 1022 (C–N), 1234(P=O), 749 cm-1 (P– CH); 31P NMR (200 MHz, CHCl3/H3PO4, 25 oC, TMS):  =24.230 ppm 3.1.10 Dimethyl (9-ethyl-9H-carbazole-3-yl)( phenyl amino)methyl phosphonate (3h) Hiệu suất: 88% (0.845); mp:141–142℃; 1H NMR (200 MHz, [D1]CHCl3, 25 °C, TMS): δ=1.06 (t, J=7.1 Hz, 3H; N–CH2–CH3), 1.30 (t, J=7.1 Hz, 3H; P–O–CH2–CH3), 1.41 (t, J=7.2 Hz, 3H; P–O– CH2–CH3), 3.51–3.63 (m, 1H; P–O–CH2–CH3), 3.80–3.95 (m, 1H; P–O–CH2–CH3), 4.10–4.17(m, 2H; P–O–CH2–CH3), 4.34 (q, J=7.1 Hz, 2H; N–CH2–CH3), 4.95 (d, J=23.6 Hz, 1H; P–CH), 6.37 (d, J=6.4 Hz, 2H; Ph–H), 7.09 (t, J=7.9 Hz, 2H; Ph–H), 7.18–7.60 (m, 6H; Ph–H, 5Ar–H), 8.09 (d, J=7.7 Hz, 1H; Ar–H), 8.19 ppm (s, 1H; Ar–H); 13C NMR (50 MHz, [D1]CHCl3, 25 °C, TMS): δ=14.3, 16.9, 38.1, 56.8 (d, J=151.5 Hz; P–CH–N), 63.7, 109.1, 114.4, 118.7, 119.3, 120.4, 121.0, 123.0, 123.5, 125.9, 126.2, 129.6, 140.2, 140.7, 146.9, 147.2 ppm; FT–IR (KBr): 3295 (N–H), 2978 (C–H, alkyl), 1600, 1594, 1492, 1386 (C=C), 1331 (C–O), 1234 (P=O), 1053, 1022 (C–N), 748 cm-1(P–CH); 31P NMR (200 MHz, CHCl3/H3PO4, 25 oC, TMS):  =23.560 ppm Trang 75 3.1.11 Diethyl (((4-chloro-3-(trifluoromethyl)phenyl)amino)(9-ethyl-9H-carbazol-3-yl)methyl) phosphonate (3i) Hiệu suất: 90% (1.067 g), mp: 107–108℃; 1H NMR (200 MHz, [D1]CHCl3, 25 °C, TMS): δ=1.05 (t, J=7.0 Hz, 3H; N–CH2–CH3), 1.32 (t, J=9.0 Hz, 3H; P–O–CH2–CH3), 1.42 (t, J=7.1 Hz, 3H; P–O– CH2–CH3), 3.48 –3.64 (m, 1H; P–O–CH2–CH3), 3.82 –3.94 (m, 1H; P–O–CH2–CH3), 4.15 (t, J=7.1 Hz, 2H; P–O–CH2–CH3), 4.35 (q, J=6.9 Hz, 2H; N–CH2–CH3), 4.89 (dd, J=23.4 Hz, J=6.5 Hz, 1H; P–CH), 5.29 (t, J=7.4 Hz, 1H; N–H), 6.66–6.69 (m, 1H; Ph–H), 7.02–7.57 (m, 7H; 2Ph–H, 5Ar–H), 8.08 (d, J=7.7 Hz, 1H; Ar–H), 8.17 ppm (s, 1H; Ar–H); 13C NMR (50 MHz, [D1]CHCl3, 25 °C, TMS): δ=14.2, 16.8 (d, J=7.0 Hz), 38.1, 56.6 (d, J=152.5 Hz; P–CH–N), 63.8(d, J=27.5 Hz), 109.1 (d, J=4.5 Hz), 113.6, 117.4, 119.5, 120.3, 121.0, 122.9, 123.7, 125.3, 125.8, 126.4, 132.3, 140.3, 140.7, 145.5, 145.8 ppm; FT–IR (KBr): 3307 (N–H), 3049, 2977, 2931, 2904 (C–H, alkyl), 1602, 1493, 1385 (C=C), 1332 (C–O), 1234(P=O), 1050, 1021 (C–N), 750 cm-1 (P–CH); 31 P NMR (200 MHz, CHCl3/H3PO4, 25 oC, TMS): = 23.680 ppm 3.12 Dimethyl(9-ethyl-9H-carbazole-3-yl)(4-isopropylphenylamino)methylphosphonate (3j) Hiệu suất: 90% (0.916); mp: 151–152℃; 1H NMR (200 MHz, [D1]CHCl3, 25 °C, TMS): δ=1.02–1.14 (m, 9H; N–CH2–CH3, CH–(CH3)2), 1.29 (t, J=7.2 Hz, 3H; P–O–CH2–CH3), 1.41 (t, J=7.1 Hz, 3H; P– O–CH2–CH3), 2.72 (quint, J= 6.9 Hz, 1H; CH–(CH3)2), 3.57 (q, J=8.2 Hz, 1H; P–O–CH2–CH3), 3.83–3.95 (m, 1H; P–O–CH2–CH3), 4.09–4.14 (m, 2H; P–O–CH2–CH3), 4.34 (q, J=7.1 Hz, 2H; N– CH2–CH3), 4.91 (d, J=23.5 Hz, 1H; P–CH), 6.61 (d, J=8.3 Hz, 1H; Ph–H), 6.95 (d, J=8.2 Hz, 1H; Ph–H), 7.18–7.40 (m, 3H; 2Ph–H, 1Ar–H), 7.45 (d, J=7.5 Hz, 3H; Ar–H), 7.59 (d, J=8.6 Hz; 1H; Ar– H), 8.09 (d, J=7.8 Hz, 1H; Ar–H), 8.19 ppm (s, 1H; Ar–H); 13C NMR (50 MHz, [D1]CHCl3, 25 °C, TMS): δ=14.3, 16.8 (dd, J=12.0 Hz, J=6.0 Hz), 24.6, 33.5, 38.0, 57.0 (d, J=151.0 Hz; P–CH–N), 63.6 (dd, J=6.5 Hz, J=3.3 Hz), 109.0 (d, J=3.5 Hz), 114.4, 119.3, 120.4 (d, J=6.0 Hz), 121.0, 123.1, 123.5 (d, J=2.0 Hz), 125.9, 126.1 (d, J=8.5 Hz), 126.7 (d, J=3.0 Hz), 127.4, 139.1, 140.2 (d, J=2.0 Hz), 140.7, 144.9, 145.2 ppm; FT–IR (KBr): 3290 (N–H), 2980 (C–H, alkyl), 1607, 1486 (C=C), 1341(C– Trang 76 O), 1234(P=O), 1053, 1025 (C–N), 748 cm-1 (P–CH); 31 P NMR (200 MHz, CHCl3/H3PO4, 25 oC, TMS): =24.642 ppm 3.2 Hoạt tính sinh học: 3.2.1 Hoạt tính kháng khuẩn nấm: Bảng Hoạt tính kháng nấm hợp chất, 3a-j Đường kính vùng ức chế[a] Hợp chất S.cerevisiae C.albicans Nồng độ[b] 50 100 200 50 100 200 3a 11 12 – – 10 – 3b – – – – – – 3c 12 13 – 13 – 3d – – – 10 11 – 3e 11 13 – – – – 3f – – – – – – 3g – – – 10 12 – 3h 12 14 – – – – 3i 10 11 – – – – 3j 10 12 – 10 11 – Fluconazole[c] 20 Trang 77 16 [a] Đường kính lớn vùng ức chế, mm [b] Nồng độ hợp chất đầu vào, ppm [c] Nồng độ đối chứng dương, 1mg mL-1 Dấu “–” khơng có hoạt tính Bảng Hoạt tính kháng khuẩn hợp chất 3a-j Đường kính vùng ức chế Hợp chất B megaterium B cereus E.coli Nồng độ 50 100 200 50 100 200 50 100 200 3a 10 11 – – – 10 11 3b 11 12 10 11 – – – 3c – – – 11 12 – – – 3d – – – – – – – – – 3e 10 12 – – – – – – 3f 10 11 – – – – – – 3g – – – – – – 10 11 3h – – – – – – – – – 3i – – – – – – 10 11 3j – – – 10 11 – – – Ampicillin[a] 14 14 12 [a] Nồng độ đối chứng dương, 2mg mL-1 Dấu trừ “–”: khơng có hoạt tính 3.2.2 Hoạt tính ức chế tế bào ung thư vitro Trang 78 Bảng Các giá trị IC50 3a–j vitro kháng lại dòng tế bào ung thư vú, MCF–7 Hợp chất Phần trăm ức chế (%) Nồng độ [a] 100 50 3a 94.80 ±0.26 86.80 ±0.15 3b 59.80 ±1.09 3c 25 IC50 [b] 10 73.20±0.46 52.10±0.53 32.40±0.46 9.78 ±0.93 51.05±0.66 43.03±0.40 28.40±0.80 28.00±5.04 45.94± 0.66 93.20±0.53 83.18 ±0.92 70.00 ±0.53 52.58±0.55 35.80±0.66 9.39±0.64 3d 49.30±1.20 40.07 ±0.40 34.40±0.40 27.17±0.40 20.42±1.50 >100 3e 37.8±0.26 33.28±1.06 28.31±1.45 24.10±0.66 17.00±0.80 >100 3f 66.8±1.00 51.30±0.66 33.10±1.19 27.90±092 23.40±0.85 44.45±1.45 3g 49.60±1.06 40.20±0.80 30.10±1.32 23.80±0.79 16.70±1.09 >100 3h 92.40±0.05 77.43±0.80 69.85±0.30 58.98±0.53 45.40±0.80 6.38± 022 3i 57.70±1.09 51.10±1.39 46.10±0.95 38.70±1.46 28.40±1.85 41.61±0.23 3j 62.4±0.80 56.10±1.46 50.60±0.79 43.6±1.06 38.70±1.06 22.14±0.04 Đối chứng dương[c] 2.84±1.33 [a] Nồng độ, 3a–j : µM [b] Giá trị µM [c] Nồng độ đối chứng dương Camptothecin 1µM Trang 79 Bảng Các giá trị IC50 3a–j vitro kháng lại dòng tế bào ung thư phổi, A–549 Hợp chất Phần trăm ức chế (%) Nồng độ[a] 100 50 25 IC50 [b] 10 3a 49.91±1.52 45.9±1.39 41.30±1.52 31.00 ±1.09 22.10 ±0.55 88.40 ±0.36 3b 32.60±1.84 29.44 ±1.46 20.51±1.54 16.70±1.54 5.52±0.66 >100 3c 77.80±1.64 66.29±0.53 61.35±0.53 58.28±1.87 41.54±1.87 7.32±0.07 3d 33.60±0.79 28.40±0.70 16.70±0.55 12.62±0.66 8.90±0.55 >100 3e 77.00 ±0.80 69.60±1.45 66.10±0.53 59.20 ±0.95 51.10±0.95 3.82±0.01 3f 22.90±0.92 19.43±1.06 14.70±1.09 9.40 ±1.03 5.90 ±1.84 >100 3g 20.00 ±0.85 17.30±1.45 14.60±0.55 9.60±0.70 6.00±1.50 >100 3h 85.90±0.80 77.90±1.19 75.90±0.30 72.00±1.54 51.40±1.39 2.29±0.02 3i 46.40±1.24 41.20±1.05 36.40 ±0.92 30.32±1.84 26.10±0.85 >100 3j 75.40±1.09 50.30±1.09 44.80±2.25 36.90±1.20 29.2±1.19 27.58±0.81 Đối chứng dương[c] 0.58±0.17 [a] Nồng độ hợp chất, (3a-j) nồng độ µM [b] Giá trị µM [c] Đối chứng dương Camptothecin nồng độ 1µM Bảng Các giá trị IC50 3a–j vitro kháng lại dòng tế bào ung tử cung, Hela Hợp chất Phần trăm ức chế (%) IC50[b] Nồng độ[a] 100 50 3a 67.10±1.32 59.70±0.92 51.40±1.06 38.70±1.30 32.40±1.39 22.41±0.35 3b 66.60±0.66 61.30±0.95 48.40±1.24 38.70±1.30 32.40±1.39 23.89±0.40 3c 76.20±0.70 69.60±1.24 61.90±1.05 54.80±1.72 48.80±0.92 5.98±0.02 25 Trang 80 10 48.60 33.40 3d 68.40±0.85 63.10 ±0.85 54.30±0.95 ±1.32 ±1.30 16.59 ±0.20 3e 72.80±1.05 59.80±1.45 52.30±1.87 40.80±1.75 37.0 ±0.40 18.47 ±0.31 3f 83.30±1.24 69.60±1.00 64.40±1.24 56.60±1.05 51.20±1.09 5.16±0.04 3g 49.6±0.66 44.30±1.15 35.60±1.31 29.90±1.30 22.10±1.24 >100 3h 69.70±1.45 66.70 ±0.66 52.70 ±1.20 48.60±1.32 32.60±1.50 16.33±0.26 3i 70.20±1.20 66.90±1.30 58.80±1.30 54.10±1.19 46.20±0.92 7.19±0.02 3j 51.70±1.05 41.20±1.05 34.50±1.72 30.10±1.00 25.7±1.00 Drug[c] >100 2.15±0.32 [a] Nồng độ hợp chất, (3a-j) nồng độ µM [b] Giá trị µM [c] Đối chứng dương Camptothecin nồng độ 1µM 3.2.3 In silico molecular docking model Bảng Các kết docking quan trọng pose docking, 3c, 3h, đối chứng dương kháng trở lại khuẩn, nấm tương ứng silico docking model Receptor (PDB) Đặc tính độ dài liên kết hydrogen[f] Số lượng liên kết hydrogen[e] Hằng số ức chế, Ki[d] Năng lượng tự liên kết [c] Số lượng tổng số lượng[b] Cấu dạng tối ưu [a] Cấu trúc A:Gly422:H– 3c:O (2.25) A:Gly424:H– 3c:O (2.03) 3c 55.27 -7.03 6.98 6TZM A:Lys425:H– 3c:O (2.48) A:Thr426:H– 3c:O (2.10) Trang 81 Hình Giá trị IC50 3a–j, kháng tế bào ung thư MCF–7 Hình Giá trị IC50 3a–j, kháng tế bào ung thư, A–549 Hình Giá trị IC50 3a–j, kháng tế bào ung thư, HeLa Trang 96 Hình Khả ức chế (%) tế bào ung thư, MCF–7 3a-j, nồng độ từ 5-100 μM Hình Khả ức chế (%) tế bào ung thư, A-549 3a-j nồng độ từ 5-100 µM Hình 10 Khả ức chế (%) tế bào ung thư, Hela 3a-j nồng độ từ 5-100 µM 3.2.4.3 Mơ in silico molecular docking model Trang 97 3.2.4.3.1 Kháng khuẩn, nấm Các kết pose docking ligand tối ưu cấu dạng cấu trúc hoạt tính mạnh 3c 3h kháng nấm mạnh Candida albicans Saccharomyces cerevisiae tương ứng, 3b kháng lại vi khuẩn, Bacillus megaterium đối chứng dương trình bày Hình 11-18, Bảng 9-11 Hình S.1.1 S.1.20 Trong Bảng 9, giá trị âm lớn lượng liên kết vị trí hoạt động receptor docking pose 3c số chất ức chế, Ki với receptor 6TZM (6TZM: PDB) -7,03 kcal.mol-1 6,98 µM, tương ứng Các giá trị doking pose 3c chọn để phân tích cấu hình tốt liên kết với reeceptor nhúng receptor 6TZM Hình 11 Các giá trị số ức chế lượng tự liên kết cấu trúc 3c receptor tốt 6TZM Bảng tính tốn so sánh với đối chứng dương hợp chất 3c nồng độ 200µg.mL-1 (377,78 µM) có ức chế mạnh so với đối chứng dương Giá trị âm lớn lượng tự liên kết vị trí docking tốt nhất, 3c với receptor, 6TZM nhỏ so với đối chứng dương với receptor cho thấy liên kết vị trí docking 3c với receptor liên kết ổn định so với liên kết docking với đối chứng dương, Fluconazole vào receptor Giá trị lượng tự liên kết (∆G) tính dựa khác biệt tổng lực Val der Waals, liên kết hydro, tương tác tĩnh điện, tổng lượng tự xoắn, lượng hệ thống khơng liên kết Trong Hình 12, acid amin lại (residual amino acidm phạm vi, 4Å) xung quanh cấu trúc 3c ổn định xem acid amin kỵ nước: Cys-423 Ile-421 Cys-423 hình thành liên kết hydro với nguyên tử oxy liên kết đôi P=O Các acid amin ưa nước lại quan sát: Gly422, Gly-424, Arg-528, Lys-425, Asn-476, Asp-474, Asp-445, Arg-475, Asn-444, Tyr-628, Asn-446, Gln-443, Thr-427 Thr-426 Các amin acid: Gly-422, Gly-424, Lys-425 Thr-426 amino acid ưa nước liên kết với nguyên tử oxy liên kết đôi P=O, nguyên tử O nhóm O-ethyl ngang qua liên kết hydro Các tương tác khác quan trọng quan sát: Van der Waals, carbon-hydro, halogen, pi cation, alkyl, pi-alkyl khác tương tác quan trọng chứng minh khả kỵ nước Tất tương tác Hình 12 xác định giá trị tổng lượng lượng cực tiểu cấu dạng 3c docking tốt đến receptor Trong Hình Bảng 9, vị trí docking tốt docking pose 3c hình thành liên kết hydrogen với receptor 6TZM (6TZM: PDB, cấu trúc tinh thể nấm Candida albicans) Tất liên kết hydro vị trí hoạt động amino acid lại: Gly-422, Gly-424, Lys-425 Thr-426 chuỗi cấu trúc protein, 6TZM đến nguyên tử oxy liên kết đôi P=O (3 liên kết hydro) nguyên tử oxy nhóm O-ethyl Điều chứng minh nhóm phosphonate 3c hình thành phản ứng K.F có khả ức chế mạnh với receptor nấm Candida albicans Độ dài liên kết tất liên kết hydro, tạo từ docking pose 3c đến receptor ngắn so với chúng hình thành với đối chứng dương receptor, chứng minh độ dài liên kết hydro ngắn hơn, liên kết mà chúng hình thành bền Bản đồ ligand cho thấy tương tác bậc hai liên kết hydro, lập thể phủ lấp, tương Trang 98 tác chứng minh độ bền liên kết docking pose-receptor 6TZM Các đường hình màu xanh không liền nét ghi nhận hiệu ứng lập thể, steric Kích thước vịng trịn màu vàng màu xanh nguyên tử xác định cường độ tương tác phủ lấp đóng góp cản trở lập thể, Hình 14 Trong Hình 15 Bảng 10, vị trí docking tốt 3h với S cerevisiae, 3ET5 tính tốn giá trị Ki ∆𝐺 q trình docking, 0,094 µM -9,59 kcal.mol-1, tương ứng so sánh giá trị với giá trị đối chứng dương Cấu dạng 3h ức chế mạnh nấm Saccharomyces cerevisiae so với Fluconazole, ∆𝐺 âm nhỏ liên kết số ức chế, Ki cấu dạng ổn định nhất, 3h với receptor so với giá trị Fluconazole trình bày Bảng 10 Trong Hình 2, hợp chất 3h cho thấy chất ức chế cao so với Saccharomyces cerevisiae nồng độ 200 µ.mL-1 (455,38µM) so với đối chứng dương nồng độ mg.mL-1(3265 µM) hai giá trị IC50 giá trị lượng tự liên kết 3h receptor, 3ET5 docking nhỏ giá trị Fluconazole, Bảng Chỉ có liên kết hydro hình thành từ nguyên tử oxy Ser-164 với oxy ngun tử P=O liên kết đơi có độ dài liên kết 3,10 Hình 17 Bảng 10, điều chứng minh nhóm phosphonate 3h cho thấy ức chế tốt receptor Saccharomyces cerevisiae Các tâm hoạt động receptor, 3ET5 cấu dạng ổn định 3h minh họa sơ đồ 2D, Hình 16, gồm liên kết hydro (từ nguyên tử oxy Ser-164 receptor đến nguyên tử oxy liên kết đôi O = P 3h liên kết khác không quan trọng: Van der Waals, liên kết carbon-hydro, liên kết pi-donor, liên kết pi-sigma, alkyl pi-alkyl Tất tương tác tạo gía trị lượng âm cực tiểu hệ thống tương tác ligand cấu dạng 3h receptor 3ET5 Bảng 10 dẫn đến cấu trúc ổn định 3h để docking tốt tâm hoạt động protein Tất amino acid cịn lại liên kết với vị trí hoạt động 3h, liên quan đến chuỗi C ngoại trừ Asn-363 chuỗi B Bản đồ ligand xác định tương tác bậc hai 3h 3ET5 Hình 18, gồm liên kết hydro, lập thể tương tác phủ lấp, điều khiển độ bền tương tác ligand-3ET5 (13 tương tác lập thể) xác định hình thành cấu dạng bền 3h Bán kính Van der Waals nguyên tử thay đổi từ 1,70 đến 2,08, điều khiển cường độ tương tác phủ lấp tương tác khơng gian Hình 18 Cấu trúc 3h cho thấy chất ức chế tốt kháng lại nấm Saccharomyces cerevisiae nồng độ 200µg.mL-1 455,38 µM so sánh với cấu dạng 5g báo cáo trước chúng tôi.[5] 5g nồng độ 25 µM cho thấy hoạt động mạnh 3h nồng độ 455,38 µM với Saccharomyces cerevisiae Nó giải thích dựa docking pose cấu trúc khác Cấu dạng 3h 5g liên kết với nguyên tử hydro flo nhóm phenyl 3h khơng có liên kết nguyên tử halogen Trong cấu dạng tốt 5g với receptor sơ đồ 2D, nguyên tử Flo tạo liên kết không phổ biến khác Các liên kết halogen với amino acid lại Gln-353, Glu-277 Asn-350, dẫn đến 5g chất ức chế mạnh 3h nồng độ thấp, 25 µM Trong Bảng 11, giá trị 3b so với thuốc tiêu chuẩn, Ampicillin kháng trở lại vi khuẩn Bacillus megaterium, 6NVW, cấu dạng ổn định 3b cho thấy chất ức chế yếu Trang 99 so với đối chứng dương, dựa giá trị số ức chế tính tốn lượng tự liên kết 3b với receptor, 6NVW trình bày thấp so với đối chứng dương Bảng 11 Như trình bày Bảng 11 Hình S.1.13, vị trí docking 3b hình thành liên kết hydro, liên kết từ Arg-381 chuỗi B đến nguyên tử oxy liên kết đôi P = O liên kết hydrogen khác từ nguyên tử hydrogen amin bậc hai đến nguyên tử oxy Gln-23 chuỗi B Từ kết docking 3c, 3h 3b trình bày ngắn gọn Bảng 9-11 chứng minh tất liên kết hydro hình thành từ tâm hoạt động receptor đến nhóm O=P(OEt)2 nguyên tử hydro H-N bậc hai Điều có ý nghĩa việc thiết kế cấu trúc có hoạt tính sinh học Trong vitro, nồng độ 3b kháng lại Bacillus megaterium 388 µM, so sánh với nồng độ Ampicillin 5724.0 µM thấp so với Ampicillin, đường kính vùng ức chế 3b đồng dạng với thuốc ampicillin dẫn đến khả ức chế 3b nồng độ 200 µ.mL-1 (388 µM) chất ức chế tiềm Đầu vào 3j Hình 4, hoạt tính kháng trung bình B cereus nồng độ mà khơng giải thích mơ hình docking cho cấu dạng Hình 11 Cấu dạng ổn định 3c sau hồn thành docking với C.albincans, trình bày Discovery Studio 2019 Client Trang 100 Hình 12 Các tương tác cấu dạng ổn định ligand, 3c receptor, 6TZM Hình 13 Các vị trí liên kết cấu trúc 3c với vị trí hoạt động C.albincans, 6TZM, Discovery Studio 2019 Trang 101 Hình 14 Bản đồ ligand minh họa phần mềm Molegro Molecular Viewer Hình 15 Cấu dạng ổn định 3h sau hoàn thành docking với S cerevisiae, 3ET5 Hình 16 Các liên kết vị trí hoạt động 3ET5 cấu dạng ổn định 3h Trang 102 Hình 17 Các vị trí liên kết cấu hình ổn định 3h với tâm hoạt động 3ET5 Hình 18 Bản đồ ligand 3h 3ET5 Trang 103 Bảng Các kết docking quan trọng cấu dạng ổn định 3c, đối chứng dương , Fluconazole với nấm Candida albicans, 6TZM [a] Cấu dạng ∆G[b] Ki[c], số ức chế 50% Liên kết Hydrogen [d] Đặc tính độ dài[e] A:Gly422:H–3c:O (2.25) A:Gly424:H–3c:O (2.03) 3c -7.03 6.98 A:Lys425:H–3c:O (2.48) A:Thr426:H–3c:O (2.10) A:Thr426:O–drug:N (2.69) A:Asn444:N–drug:N (3.12) Drug[f] -5.09 185.6 A:Asp445:N–drug:N (2.75) A:Asn476:N–drug:N (3.10) Drug:H–Asp445:O (2.12) [a] Cấu trúc tinh thể Candida albicans thu nhận từ ngân hàng liệu protein [b] Năng lượng tự liên kết, ligand-receptor trình bày theo đơn vị kcal.mol-1 tính AutoDockTools-1.5.6rc3 [c] Hằng số ức chế, Ki tính gói AutoDockTools-1.5.6rc3 đơn vị µM [d] Số lượng liên kết hydro, Discovery Studio Client 2019 [e] Trực quan Discovery Client Studio 2019 đơn vị Angstrom, tương ứng [f] Cấu trúc Fluconazole thực lượng tối ưu phân tử gói Avogadro thơng qua phương pháp MMFF94 tính tốn docking Bảng Các kết tính tốn docking 3h, thuốc, Fluconazole kháng trở lại nấm Saccharomyces cerevisiae, 3ET5 [a] Cấu dạng 3h ∆G[b] Ki[c], số ức chế 50% -9.59 0.094 Liên kết Hydrogen [d] Đặc tính độ dài liên kết[e] C:Ser164:O–3h:O (3.10) C:Arg147:H–drug:F (2.24) Drug[b] -5.90 47.0 C:Ser164:H–drug:O (2.25) C:Val165:H–Drug:O (1.76) Trang 104 Cấu ∆G[b] dạng Ki[c], số ức chế 50% Liên kết Hydrogen [d] Đặc tính độ dài liên kết[e] Drug–C:Val165:O (2.04) [a] Cấu trúc tinh thể nấm Saccharomyces cerevisiae lấy từ ngân hàng liệu protein [b] Cấu trúc Fluconazole thực tối ưu lượng phân tử phần mềm Avogadro thông qua phương pháp trường lực - MMFF94 tính tốn docking Bảng 10 Docking pose quan trọng 3b thuốc ampicillin kháng lại khuẩn Bacillus megaterium, mã số protein, 6NVW [a] Cấu dạng ∆G[b] Ki[c], số ức chế 50% Liên kết Hydrogen [d] Đặc tính độ dài liên kết[e] B:Arg381:H–3b:O (2.23) 3b -8.03 1.30 3b:H–B:Gln23:O (2.42) B:Arg266:H–drug:O (2.45) B:Arg381:H–drug:O (2.20) Drug:H–B:Gln23 (2.15) Drug[b] -8.19 0.99 Drug:H–B:Gln23:O (2.26) Drug:H–B:Gln23:O (2.32) Drug:H–B:Asn462 (2.14) [a] Cấu trúc tinh thể vi khuẩn Bacillus megaterium tải xuống từ ngân hàng liệu protein [b] Cấu trúc Ampicillin tính tốn lượng tối ưu phân tử phần mềm Avogadro thông qua phương pháp trường lực - MMFF94 tính tốn docking 3.2.4.3.2 Kháng tế bào ung thư Các kết đáng ý việc docking tất đầu vào kháng lại ba dòng tế bào ung thư: MCF7 (6VNN), A-549 (4ADS) HeLa (5HES) trình bày Bảng 12-14 Với MCF-7 dịng tế bào ung thư 6VNN, dựa kết tính toán docking pose cấu dạng ổn định nhất, khả docking: 3i> 3c> 3h> Thuốc> 3f> 3g> 3j> 3b> 3d> 3e> 3a, dựa giá trị lượng tự âm liên kết docking pose receptor 6VNN, số ức chế, khả liên kết hydro hình thành Trong vitro, kết hợp chất cho thấy 3c, 3h 3a có hoạt tính Trang 105 mạnh kháng trở lại MCF-7 Các kết tính tốn docking pose cho thấy liên kết hydro hình thành từ amino acid lại receptor, 6VNN tới nguyên tử oxy liên kết đôi P = O, nguyên tử oxy nhóm ethoxy, hydro nguyên tử nitơ N nhóm N-H, Bảng 12 Đối với docking pose docking cấu dạng ổn định ligand 3a-j với receptor 4ASD Bảng 13, trình tự cấu dạng ổn định nhất, docking đến receptor mô tả: 3d> 3c> thuốc> 3g> 3f> 3i> 3h> 3b> 3j> 3a> 3e So sánh kết mơ hình docking thử nghiệm, 3h 3c lời giải tốt 3h đưa để giải thích mối quan hệ cấu trúc hoạt tính định lượng tốt khái niệm số ức chế, Ki 0,61µM (silico docking) giá trị IC50 2,29 µM Bảng 13 15 Đối với chất kháng tế bào ung thư cổ tử cung, HeLa, 5HES, xu hướng docking pose trình bày : 3f> 3i> 3h> thuốc> 3c> 3d> 3e> 3a> 3b> 3g> 3j Bảng 14 Dựa docking pose, khả docking trình bày: 3f> 3i> 3c so với hợp chất, cho thấy khả ức chế tiềm vitro: 3f> 3c> 3i Hợp chất 3f giải thích kết tương đương vitro mơ hình docking Ngoại trừ kiểu liên kết hydro giải thích trên, với cấu trúc 3i ổn định nhất, ba liên kết hydro hình thành từ Lys-135, Arg137 chuỗi A receptor, 5HES đến F nhóm CF3, liên kết với nhóm phenyl vị trí Bảng 14 Bảng 11 Kết docking docking pose 3a–j đến vị trí hoạt động receptor dòng tế bào ung thư vú, MCF–7(6VNN)[a] Docking pose/ ligand bền ∆G Ki, số ức chế Số lượng liên 50% kết hydrogen Đặc tính độ dài liên kết 3a -7.79 1.94 - 3b -8.53 0.562 3b:H–A:Asp473:O (2.04) C:Ala430:N–3c:O (2.83) 3c -9.39 0.132 C:Ser433:O–3c:O (2.62) 3d -9.03 0.239 - 3e -8.56 0.530 - 3f -9.93 0.052 C:Ser433:O–3f:O (2.89) 3g -9.73 0.074 C:Ser433:O–3g:O (2.84) 3h -8.92 0.289 3h:H–C:Ser433:O (2.21) Trang 106 Docking pose/ ∆G ligand bền Ki, số ức chế Số lượng liên 50% kết hydrogen Đặc tính độ dài liên kết D:Lys472:N–3h:O (2.76) C:Ser433:O–3h:O (2.67) C:Arg412:N–3i:F (3.21) 3i -9.51 0.107 C:Ser433:O–3i: N(3.00) 3i:H– C:Ser433:O(2.09) 3j -9.58 0.096 3j:H - C:Asp426:O(2.43) C:Ser433:O–drug:N (2.80) Drug[b] -8.90 0.298 D:Phe461:N–drug:O(3.12) D:Leu462:N–drug:O (2.74) [a] Cấu trúc tinh thể 6VNN (6VNN: PDB, 1.63 DOI: 10.2210 / pdb6VNN/pdb) tải từ ngân hàng liệu protein Các giá trị quan trọng tính tốn AutoDockTools-1.5.6rc3 hiển thị DSC [b] Đối chứng dương Camptothecin Bảng 12 Kết docking docking pose 3a–j đến vị trí hoạt động receptor protein đích dịng tế bào ung thư phổi, A–549 [a] Docking pose/ ∆G ligand bền Ki, số ức Số lượng liên chế 50% kết hydrogen Đặc tính độ dài liên kết 3a -8.83 0.335 - 3b -9.86 0.059 - 3c -9.47 0.145 3c:H– A:Leu840:O (2.32) 3d -10.24 0.031 A:Val899:N–3d:O (2.99) A:Asp1046:N –3d:N (2.91) 3e -8.68 0.434 Trang 107 - Docking ∆G pose/ ligand bền Ki, số ức Số lượng liên chế 50% kết hydrogen Đặc tính độ dài liên kết A:Asn923:N–3f:O (2.56) A:Asn923:N–3f: O (2.70) -8.54 3f 0.550 A:Asp1052:N–3f:N (2.71) 3f:H–A:Leu840:O (2.16) A:Asn923:N–3g:O (2.98) -8.69 3g 0.425 3g:H–A:Leu840:O (2.05) A:Asn923:N–3h:O (3.18) -8.47 3h 0.612 3h:H–A:Leu840:O (2.15) A:Tyr1082:O–3i:F (2.80) -8.49 3i 0.597 3i:H–A:His1026:O (2.09) 3j -9.21 0.178 - Drug[b] -9.38 0.133 A:Cys919:N–Drug:O (2.58) [a] Cấu trúc tinh thể 4ASD (4ASD: PDB, 2.03 doi.org/10.2210/pdb4ASD/pdb) tải xuống từ ngân hàng liệu protein Các giá trị quan trọng thực AutoDockTools1.5.6rc3 hiển thị DSC [b] Đối chứng dương Camptothecin Bảng 13 Kết docking docking pose 3a–j đến vị trí hoạt động receptor dòng tế bào ung thư, HeLa.[a] Docking pose/ ligand bền ∆G Ki, số ức chế 50% Số lượng liên kết Đặc tính độ dài liên kết hydrogen 3a -9.60 0.092 - 3b -9.29 0.154 - 3c -8.96 0.207 A:Gly23:N–3c:O (2.92) Trang 108 Docking pose/ ligand bền ∆G Ki, số ức chế 50% Số lượng liên kết Đặc tính độ dài liên kết hydrogen 3c:H–A:Asp92:O (2.18) 3d -8.95 0.275 A:Lys135:N–3d:O (2.65) A:Tyr84:O–3e:O (2.57) A:Tyr84:O–3e:O (2.69) 3e -7.68 2.36 A:Tyr84:O–3e:O (2.83) B:Arg284:N–3e:O (3.03) B:Cys285:N–3f:N (1.81) 3f -10.11 0.039 3f:H–A:Tyr84:O (2.43) 3g -9.60 0.092 No hydrogen bond 3h -9.53 0.104 3h:H–A:Arg137:O (2.25) A:Lys135:N–3i:F (3.18) 3i -9.87 0.059 A:Arg137:N–3i:F (2.75) A:Arg137:N–3i:F (3.16) 3j -8.88 0.308 Drug[b] -9.11 0.208 No hydrogen bond A:Thr82:O–drug:O (2.99) Drug:H–A:Thr82:O (2.03) [a] Cấu trúc tinh thể 5HES (5HES: PDB, 2.14 doi.org/10.2210/pdb5HES/pdb) nhận từ ngân hàng liệu protein Các giá trị thực AutoDockTools-1.5.6rc3 hiển thị DSC [b] Đối chứng dương Camptothecin Trang 109 Bảng 14 Các giá trị IC50 đầu vào 3a-j đối chứng dương kháng trở lại dòng tế bào ung thư MCF–7, A–549, HeLa, vitro Hợp chất Dòng tế bào ung thư IC50[a] MCF-7 A549 HeLa 3a 9.78 ±0.93 88.40 ±0.36 22.41±0.35 3b 45.94± 0.66 >100 23.89±0.40 3c 9.39±0.64 7.32±0.07 5.98±0.02 3d >100 >100 16.59 ±0.20 3e >100 3.82±0.01 18.47 ±0.31 3f 44.45±1.45 >100 5.16±0.04 3g >100 >100 >100 3h 6.38± 022 2.29±0.02 16.33±0.26 3i 41.61±0.23 >100 7.19±0.02 3j 22.14±0.04 27.58±0.81 115.89±0.31 Drug[b] 2.84±1.33 0.58±0.17 2.15±0.32 [a] Các giá trị tính µM [b] Đối chứng dương Camptothecin Trang 110 ... -8. 53 0.562 3b:H–A:Asp4 73: O (2.04) C:Ala 430 :N–3c:O (2. 83) 3c -9 .39 0. 132 C:Ser 433 :O–3c:O (2.62) 3d -9. 03 0. 239 - 3e -8.56 0. 530 - 3f -9. 93 0.052 C:Ser 433 :O–3f:O (2.89) 3g -9. 73 0.074 C:Ser 433 :O–3g:O... Entry(a) C:Ala 430 :N – 3c:O (2. 83) C:Ser 433 :OG –3c:O 3c 57.54 -9 .39 0. 132 3d 64. 73 -9. 03 0. 239 No hydrogen bond 3e 52.27 -8.56 0. 530 No hydrogen bond 3f 63. 22 -9. 93 0.052 3g 53. 46 -9. 73 0.074 Trang... trình bày : 3f> 3i> 3h> thuốc> 3c> 3d> 3e> 3a> 3b> 3g> 3j Bảng 14 Dựa docking pose, khả docking trình bày: 3f> 3i> 3c so với hợp chất, cho thấy khả ức chế tiềm vitro: 3f> 3c> 3i Hợp chất 3f giải

Ngày đăng: 15/07/2022, 10:32

TRÍCH ĐOẠN

TÀI LIỆU CÙNG NGƯỜI DÙNG

TÀI LIỆU LIÊN QUAN