1. Trang chủ
  2. » Nông - Lâm - Ngư

Đánh giá đa dạng di truyền và cấu trúc quần thể chanh leo (Passiflora edulis Sim.) nhập nội bằng chỉ thị ISSR và SRAP

11 5 0

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

THÔNG TIN TÀI LIỆU

Nội dung

Trong nghiên cứu này, sự đa dạng di truyền và cấu trúc quần thể của 31 mẫu giống chanh leo (Passiflora edulis Sims.) nhập nội (bao gồm loài chanh leo dại P. incarnata) đã được đánh giá thông qua sử dụng chỉ thị phân tử ISSR và SRAP.

Vietnam J Agri Sci 2022, Vol 20, No 4: 425-435 Tạp chí Khoa học Nơng nghiệp Việt Nam 2022, 20(4): 425-435 www.vnua.edu.vn ĐÁNH GIÁ ĐA DẠNG DI TRUYỀN VÀ CẤU TRÚC QUẦN THỂ CHANH LEO (Passiflora edulis Sim.) NHẬP NỘI BẰNG CHỈ THỊ SRAP VÀ ISSR Trần Đức Trung1*, Nguyễn Văn Viết2, Bùi Quang Đãng1 Viện Khoa học Nông nghiệp Việt Nam Viện Nghiên cứu Phát triển Nông nghiệp Nafoods * Tác giả liên hệ: ductrung83@gmail.com Ngày nhận bài: 14.10.2021 Ngày chấp nhận đăng: 01.03.2022 TÓM TẮT Trong nghiên cứu này, đa dạng di truyền cấu trúc quần thể 31 mẫu giống chanh leo (Passiflora edulis Sims.) nhập nội (bao gồm loài chanh leo dại P incarnata) đánh giá thông qua sử dụng thị phân tử ISSR SRAP Qua sàng lọc xác định 10/18 thị ISSR 8/15 chị thị SRAP đáp ứng tính đặc hiệu đa hình mẫu giống chanh leo Kết phân tích hệ số dị hợp tử H (0,43), hệ số thơng tin đa hình PIC (0,35) số lực phân biệt D (0,8) thị đạt mức cao, cho thấy đa dạng di truyền mẫu giống chanh leo Cây phân nhóm di truyền Neighbor-Joining kết hợp với cấu trúc quần thể STRUCTURE phân chia mẫu giống chanh leo thành phân nhóm tương quan với màu sắc nguồn gốc Phân tích AMOVA đồng thời cho thấy di truyền mẫu giống có giao thoa lớn kết lai tạo dạng chanh leo lồi thuộc chi Passiflora Kết cung cấp sở di truyền xác định nguồn gen tiềm năng, phục vụ công tác lưu giữ khai thác mẫu giống chanh leo nhập nội Việt Nam Từ khóa: Passiflora, đa dạng di truyền, cấu trúc quần thể, ISSR, SRAP Genetic Diversity and Population Structure of Passion Fruit (Passiflora edulis Sim.) Accessions Revealed by SRAP and ISSR Markers ABSTRACT Identification of potential germplasms is the crucial step for selection and breeding program of passion fruit (Passiflora edulis Sims.) In this study, genetic diversity and population structure of 31 exotic passion fruit accessions (including wild relative P incarnata accessions) were assessed using sequence-related amplified polymorphism (SRAP) and inter simple sequence repeat (ISSR) markers By primary screening for marker specificity and polymorphism, 8/15 SRAP markers and 10/18 ISSR were selected for passion fruit genotyping The heterozygosity index H (0.43), polymorphic information content PIC (0.35), and discriminating power D (0,8) were recorded at a high level implying the significant genetic diversity of the analyzed passion fruit accessions The Neighbor-Joining phylogenetic tree in combination with population structure model revealed by STRUCTURE discriminated and clustered the studied accessions into five groups which showed high accordance with the fruit color and the origin of the accessions The analysis of melecular variance (AMOVA) also indicated the high rate of intraspecific and possibility interspecific hybridization among Passiflora species These results provide essential genetic background facilitating efficient conservation and utilization of exotic passion fruit accessions in Vietnam Keywords: Passiflora, genetic diversity, population structure, ISSR, SRAP ĐẶT VẤN ĐỀ Chi Läc tiên Passiflora thuộc họ Läc tiên Passifloraceae cị 512 lồi phån bố rộng vùng khí hêu nhiệt đới, chủ yếu châu Mỹ Latinh (là nơi khởi phát), châu Phi châu Á Trong không 60 lồi thuộc chi Läc tiên có q ën được, chanh leo P edulis Sims 425 Đánh giá đa dạng di truyền cấu trúc quần thể chanh leo (Passiflora edulis Sim.) nhập nội thị SRAP ISSR số lồi có giá trð kinh tế trồng quan trọng nhiều quốc gia (Cerqueira-Silva & cs., 2018) Dựa vào màu síc hình thái quâ hương vð, chanh leo phân biệt thành hai däng: (i) chanh leo tím (P edulis f edulis) có dðch quâ sệt (0,74% tinh bột), vð chua nhẹ (pH 4,2), hương thơm dðu (ii) chanh leo vàng (P edulis f flavicarpa Deg.) có dðch quâ (0,06% tinh bột), vð chua (pH 2,8) rỗt thm Chanh leo tớm cú tớnh khỏng sõu bnh kém, sinh trưởng phát triển tối ưu điều kiện khí hêu cên nhiệt đới tương ứng, đị chanh leo vàng có tính kháng sâu bệnh khá, thích hợp trồng täi khu vực khí hêu nhiệt đới (Joy, 2010) Nhờ cò hàm lượng cao khoỏng chỗt, vitamin cng nh cỏc hp chỗt t nhiờn có hột tính sinh học, q tươi nước q chế biến từ chanh leo sân phèm có giá trð dinh dưỡng y học, thð trường ưa chuộng Chanh leo du nhêp vào Việt Nam từ khoâng 30 nëm trước chứng minh khâ nëng thích ứng với điều kiện khí hờu bõn a Trong nhng nởm gổn ồy, sõn xuỗt chanh leo dæn mở rộng Việt Nam phát triển thành ngành hàng nông sân mänh có tiềm nëng thð trường lớn, đặc biệt sân phèm chế biến Theo báo cáo Cục Trồng trọt - Bộ NN&PTNT täi Hội nghð “Thúc đèy phỏt trin sõn xuỗt chanh leo bn vng thỏng 7/2020, chanh leo trồng têp trung thành vùng ngun liệu Tây Ngun, Nghệ An, Hđa Bình, Sơn La với diện tích 8.100ha cị xu hướng tiếp tục mở rộng Giống chanh leo trồng phổ biến täi Việt Nam thuộc däng chanh leo tím cú ngun gc nhờp ni, cũ nởng suỗt v chỗt lng tt nhng tớnh khỏng sõu bnh họi kộm Trên thực tế, nëm gæn đåy dðch häi chanh leo, đặc biệt bệnh virus, trở thnh thỏch thc i vi sõn xuỗt chanh leo bn vững Chính vêy, việc chọn täo chủ động nguồn giống chanh leo đáp ứng yêu cæu sõn xuỗt l mt nhu cổu cỗp thit Thu thờp, đánh giá tiềm nëng di truyền nguồn gen chanh leo bước khởi đỉu quan trọng nhìm tìm kiếm sử dụng hiệu quâ nguồn vêt liệu cho nghiên cứu chọn, täo giống chanh leo Đánh giá tiềm nëng di truyền 426 qua kiểu hình với chỵ tiờu chỗt lng nh mu sớc hoa, mu sớc quõ, đặc tính sinh trưởng chỵ tiêu số lượng tim nởng nởng suỗt, kớch thc, lng quõ, tớnh khỏng cỏc iu kin bỗt thuờn vụ sinh (nhit, họn) hữu sinh (sâu bệnh häi) cách tiếp cên đơn giân sử dụng mô tâ đánh giá ban đæu nguồn gen chanh leo (Joy, 2010; Castro & cs., 2012; de Melo & cs., 2016) Tuy nhiên, liệu kiểu hình khơng phân ánh hết bân chỗt di truyn v cú ri ro sai s ânh hưởng điều kiện mơi trường Trong đị đánh giá kiểu gen bìng chỵ thð phân tử dựa phân ứng nhân gen PCR cò độ tin cêy cao cách tiếp cên phổ biến Trong số này, chỵ thð trội (dominant marker) với đặc điểm trung tính tiến hịa, cị tính đa hình cao, thực đơn giân nhanh chòng đặc biệt khơng cỉn biết trước thơng tin hệ gen mục tiêu lựa chọn hàng đỉu phân tích kiểu gen đối tượng thực vêt Chỵ thð ISSR (Inter Simple Sequence Repeat) chỵ thð trội phát đa hình kích thước độn DNA hai vùng chứa motif microsatellite giống hai chiều đối nghðch (Zietkiewicz & cs., 1994) Các đoän mồi ISSR, chứa motif lặp (di-), (tri-), (tetra-) (penta-nucleotide), có chiều dài 15-35 nucleotide, cho phép nâng cao nhiệt độ gín mồi để đâm bâo tính đặc hiệu phân ứng nhân PCR Chỵ thð SRAP (Sequence Related Amplified Polymorphism) phát triển để nhân bân đặc hiệu vùng mã hóa hệ gen dựa độn trình tự vùng exon giàu GC vùng intron promoter giàu AT (Li & Quiros, 2001) Giống ISSR, độn mồi chỵ thð SRAP có chiều dài 17-25 nucleotide đâm bâo tính đặc hiệu phân ứng nhân PCR Các chỵ thð ISSR SRAP áp dụng phổ biến nghiên cứu di truyn cỗp di loi liờn quan n nh danh giống, phân tích đa däng di truyền phân loọi, lờp bõn di truyn hay xỏc nh cỗu trúc qn thể nhiều lồi thực vêt khác (Al Salameen & cs., 2018; Kumar & Agrawal, 2019; Yan & cs., 2019; Yan & cs., 2019) loài thuộc chi Läc tiên nguồn gen chanh leo P edulis (dos Santos & cs., 2011; CerqueiraSilva & cs., 2015; Oluoch & cs., 2018) Trần Đức Trung, Nguyễn Văn Viết, Bùi Quang Đãng Bảng Danh sách mẫu giống chanh leo nghiên cứu TT Ký hiệu Tên mẫu giống P.ed_01 Clone A P.ed_02 Màu TT Ký hiệu Tên mẫu giống Màu Tím 17 P.ed_17 Line H15.6 Tím Line A10 Tím 18 P.ed_18 Line H2.96 Vàng P.ed_03 Line A12 Vàng 19 P.ed_19 Line H4.86 Tím P.ed_04 Line A13 Vàng 20 P.ed_20 Line H4.93 Tím P.ed_05 Line A2 Tím 21 P.ed_21 Line H5.27 Tím P.ed_06 Line A7 Tím 22 P.ed_22 NCY_No1 Vàng P.ed_07 Clone B Tím 23 P.ed_23 NCY_No2 Đỏ hồng P.ed_08 Colombia Tím 24 P.ed_24 Anonymous Vàng P.ed_09 Đài Nơng Tím 25 P.ed_25 Taiwan Vàng 10 P.ed_10 Đài Nơng Tím 26 P.ed_26 Puli Tím 11 P.ed_11 Ecuador Vàng 27 P.ed_27 Sky star Đỏ hồng 12 P.ed_12 Edulis_slim Tím 28 P.ed_28 TN Vàng 13 P.ed_13 Germany Vàng 29 P.ed_29 Yellow passion fruit Vàng 14 P.ed_14 Giant Yellow Vàng 30 P.in_01* Incarnata_1 Vàng 15 P.ed_15 Golden passion fruit Vàng 31 P.in_02* Incarnata_2 Vàng 16 P.ed_16 Line H14.6 Tím Ghi chú: *: P.in_01 P.in_02 mẫu giống chanh leo dại thuộc loài P incarnata Trong nghiên cu ny s a dọng di truyn v cỗu trỳc quæn thể méu giống chanh leo nhêp nội đánh giá, phån tích nhìm täo tâng thơng tin di truyền nguồn gen hữu ích cho cơng tác chọn täo giống chanh leo täi Việt Nam Theo thông tin nhóm tác giâ cị được, đåy kết q đỉu tiên ứng dụng chỵ thð phân tử ISSR SRAP đánh giá đa däng di truyền chanh leo täi Việt Nam PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 2.1 Vật liệu Méu non thu thêp từ 29 méu giống chanh leo P edulis méu giống chanh leo däi P incarnata lưu giữ täi vườn bâo tồn Viện Nghiên cứu Phát triển Nông nghiệp Nafoods Ký hiệu, tên méu giống thơng tin màu síc q thể bâng Bộ chỵ thð sử dụng cho nghiên cứu bao gồm 18 chỵ thð ISSR (dos Santos & cs., 2011) 15 chỵ thð SRAP (Li & Quiros, 2001) Sau sàng lọc tính đặc hiệu đa hình, chỵ thð đät u cỉu lựa chọn để đánh giá kiểu gen méu giống chanh leo (Bâng 2) 2.2 Phương pháp nghiên cứu Tách chiết DNA nhân gen PCR: Các méu làm säch nghiền nitơ lóng bìng máy nghiền líc TissueLyser II (Qiagen) trước sử dụng để tách chiết DNA bìng DNeasy Plant Mini Kit (Qiagen) theo quy trình khuyn cỏo ca nh cung cỗp Chỗt lng v nng độ DNA tổng số đánh giá thông qua điện di trờn gel Agarose 0,5%/1X TAE v o hỗp thụ quang bìng máy NanoDrop 2000 (Thermo Scientific) Phân ứng nhân gen PCR sử dụng kit 1× GoTaq Green Master Mix (Promega) chuèn bð theo hướng dén nhà cung cỗp vi 10m primer mi loọi, 30ng DNA tng số tổng thể tích 10l Phân ứng PCR thực máy chu trình nhiệt GeneAmp PCR System 9700 (Applied Biosystems) Chu trình nhiệt cho chỵ thð ISSR bao gồm chu kỳ biến tính ban đỉu 94C phút, 35 chu kỳ gồm bước biến tính 94C phút bít cặp primer nhiệt độ thích hợp (Bâng 2) phút - tổng hợp chuỗi 72C 1,5 phút, chu kỳ tổng hợp kết thúc 72C phút Đối với chỵ thð SRAP, chu trình nhiệt bao gồm chu kỳ biến tính ban đæu 427 Đánh giá đa dạng di truyền cấu trúc quần thể chanh leo (Passiflora edulis Sim.) nhập nội thị SRAP ISSR 94C phút, chu kỳ tiền tổng hợp gồm bước biến tính 94C phút - bít cặp primer 35C phút - tổng hợp chuỗi 72C phút, 30 chu kỳ tổng hợp gồm bước biến tính 94C phút - bít cặp primer 50C phút - tổng hợp chuỗi 72C phút, chu kỳ kết thúc 72C phút Sân phèm phân ứng nhân gen PCR phân giâi gel Agarose 3%/1X TAE kết quâ điện di ghi nhên bìng máy soi gel EASY Doc plus (Herolab) Các alen tương ứng với bëng điện di ghi nhên tự động bìng phỉn mềm Totallab TL120, ũ tọi mt locus nhỗt nh, mộu ging cú alen xuỗt hin c ghi nhờn l v khụng cũ alen xuỗt hin c ghi nhờn l Phõn tớch số liệu: Số liệu kiểu gen ISSR SRAP kết hợp sử dụng để phân tích chỵ số di truyền bìng phỉn mềm PowerMarker (Liu & Muse, 2005): dð hợp tử (H), hàm lượng thông tin đa hình (PIC) nëng lực phân biệt (D) Ma khoâng cách di truyền cặp méu giống chanh leo tính theo cơng thức Jaccard sử dụng cho phân tích thành phỉn (PCA) phân nhóm di truyền NeighborJoining bìng phỉn mềm DARwin6 (Perrier & Jacquemoud-Coller, 2006) Phồn tớch xỏc nh cỗu trỳc quổn th ca méu giống chanh leo thực phæn mềm STRUCTURE Version 2.3.4 (Pritchard & cs., 2000) với thơng số: số lượng qn thể dự đốn trước dựa däng chanh leo (däng quâ tím, quâ vàng däng lai quâ tím quâ vàng) 3, số lượng quæn thể tối ưu K kiểm nghiệm từ 1-9 bìng mơ hình hỗn hợp với 100.000 læn lặp burn-in 50.000 læn lặp MCMC (Markov Chain Monte Carlo) Giá trð K tối ưu theo phương pháp ca Evano v mụ hỡnh cỗu trỳc quổn th c xác đðnh bìng cơng cụ StructureSelector (Li & Liu, 2018) Phân tích AMOVA dựa giá trð PhiPT (hốn vð 999 lỉn) thực bìng cơng cụ GenAlEx 6.51b2 (Peakall & Smouse, 2012) nhìm xác đðnh phương sai di truyn hai cỗp (i) gia cỏc quổn th (ii) qn thể phân nhóm dựa giá trð K tối ưu 428 KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU 3.1 Đánh giá kiểu gen ISSR SRAP mẫu giống chanh leo nhập nội Tính đặc hiệu tính đa hình tổng số 18 chỵ thð ISSR 15 chð thð SRAP sàng lọc thông qua đánh giá kiểu gen méu giống chanh leo P.ed_12 (däng quâ tím) P.ed_14 (däng q vàng) Qua đị lựa chọn 10/18 chỵ thð ISSR 8/15 chỵ thð SRAP đáp ứng u cỉu để đánh giá kiểu gen tồn 31 méu giống chanh leo Đối với chỵ thð ISSR, số lượng alen thu nhên từ alen (TriAAC_3RC) đến 21 alen (TriAGC_3RC) với kích thước alen dao động từ 163bp đến 1.950bp Trong số chỵ thð SRAP, số lượng alen thu nhên từ alen (ME5-EM10) đến 20 alen (ME1-EM7) với kích thước alen dao động từ 101bp đến 1.369bp Số alen trung bình 18 chỵ thð ISSR SRAP 14,778 alen/chỵ thð (Hình Bâng 2) Các chỵ số di truyền 18 chỵ thð 31 méu giống chanh leo trình bày Bâng Chỵ số dð hợp tử H trung bình đät 0,43 tương ứng với 44,0% méu giống chanh leo dð hợp tử täi locus đánh giá Hệ số thơng tin đa hình PIC chỵ số nëng lực phân biệt D đặc trưng cho chỵ thð xác đðnh Theo đị giá tr PIC cao nhỗt ghi nhờn ca chợ th ME5-EM9 (0,38), thỗp nhỗt ca chợ th TriAAC_3RC (0,32) v giỏ trð trung bình 18 chỵ thð 0,35 Tương tự, chỵ thð TriCAA_3RC DiGA_3C có khâ nëng phồn bit cỏc mộu ging cao nhỗt vi giỏ tr D đät 0,93, đị chỵ thð DiCA_3YG có khõ nởng phồn bit thỗp nhỗt vi giỏ tr D đät 0,28 Giá trð D trung bình 18 chỵ thð đät 0,8 (Bâng 2) 3.2 Quan hệ di truyền mẫu giống chanh leo Dựa kiểu gen ISSR SRAP 31 méu giống chanh leo, mức độ khác biệt di truyền méu giống tính tốn dựa cơng thức Jaccard bìng phổn mm DARwin Kt quõ cho thỗy, giỏ tr mức độ khác biệt di truyền trung bình 465 cặp Trần Đức Trung, Nguyễn Văn Viết, Bùi Quang Đãng méu giống 0,523, dao động từ 0,163 (P.ed_14 P.ed_15) đến 0,921 (P.ed_17 P.in_02) Phæn lớn cặp méu giống có mức độ khác biệt di truyền không 0,5~0,7 (Hình 2A) Phân tích thành phỉn (PCA) dựa kết quâ kiểu gen ISSR SRAP cho thỗy, thnh phổn chớnh ổu tiờn giõi thớch 67,68% phương sai kiểu gen méu giống chanh leo Biểu đồ tham chiếu hai nhân tố dựa hai thành phỉn PC2 PC4 kết hợp với đặc điểm màu síc quâ phân chia 31 méu giống chanh leo thành nhóm (Hình 2B) Trong đị nhịm I bao gồm méu giống thuộc loài chanh leo däi P incarnata nhóm II gồm méu giống chanh leo tím phân tách hồn tồn Các méu giống chanh leo cịn läi (nhóm III, IV V) bao gồm câ méu giống chanh leo quâ tím, hồng vàng nhóm biểu đồ, cho thỗy mc tng quan di truyn ln hn so với méu giống thuộc nhóm I II Cây phân nhóm Neighbor-Joining dựa ma khác biệt di truyền Jaccard phân chia 31 méu giống chanh leo thành phân nhóm (Hình 3A) Tương đồng với kết q phân tích thành phỉn PCA, phân nhóm I bao gồm giống thuộc loài P incarnata tách biệt hồn tồn so với méu giống cịn läi chanh leo P edulis Phân nhóm II bao gồm méu giống chanh leo q tím, phân nhóm III bao gồm hỗn hợp 15 méu giống chanh leo quâ tím vàng dòng tuyển chọn từ chương trình lai täo Phân nhóm IV (4 méu giống) phân nhóm V (4 méu giống) méu giống chanh leo quâ vàng hồng 3.3 Cấu trúc quần thể mẫu giống chanh leo Để làm rừ cỗu trỳc quổn th tờp on mộu ging chanh leo nhêp nội, phân tích phân nhóm dựa mơ hình Bayesian tiến hành dựa kết quâ đánh giá kiểu gen ISSR SRAP Thông qua kiểm đðnh số qn thể thơng qua chỵ số delta K (K) bìng cơng thức Evanno (Li & Liu, 2018), giá trð K ứng với số quæn thể tối ưu méu giống chanh leo nghiên cứu xác đðnh (Hình 4) Số lượng qn thể dựa mơ hình phù hợp với kết q phân nhóm di truyền Neighbor-Joining (Hình 2) Ghi chú: M: 1kb DNA ladder Hình Kết điện di sản phẩm nhân gen 31 mẫu giống chanh leo thị ISSR TriACA_3RC thị SRAP ME2-EM11 429 Đánh giá đa dạng di truyền cấu trúc quần thể chanh leo (Passiflora edulis Sim.) nhập nội thị SRAP ISSR Bảng Thông tin thị ISSR SRAP lựa chọn kết đánh giá kiểu gen 31 mẫu giống chanh leo Tên thị Trình tự (5'-3') Tm (C) Số alen ISSR1 TriAAG_3RC (AAG)5RC 48 ISSR2 TriACA_3RC (ACA)5RC ISSR3 TriCAA_3RC ISSR4 ISSR5 ISSR6 TT Kích thước alen (bp) H PIC D 1309 0,44 0,33 0,86 254 1268 0,46 0,33 0,87 17 275 1597 0,46 0,36 0,93 45 579 1742 0,38 0,32 0,84 55 21 213 1950 0,48 0,33 0,86 (CA)8YG 53 17 478 1322 0,44 0,37 0,28 (GT)8YG 56 17 565 1581 0,48 0,36 0,92 (GA)8C 51 19 213 1501 0,39 0,36 0,93 Min Max 16 163 51 10 (CAA)5RC 53 TriAAC_3RC (AAC)5RC TriAGC_3RC (AGC)5RC DiCA_3YG ISSR7 DiGT_3YG ISSR8 DiGA_3C ISSR9 DiGA_3T ISSR10 DiCA_3RG SRAP1 (GA)8T 46 15 250 1344 0,32 0,36 0,91 (CA)8RG 50 15 390 1594 0,40 0,34 0,89 ME1 TGAGTCCAAACCGGATA * 20 159 1369 0,43 0,36 0,90 EM7 GACTGCGTACGAATTCAA SRAP2 ME1 TGAGTCCAAACCGGATA * 14 137 1172 0,43 0,36 0,90 EM12 GACTGCGTACGAATTATG SRAP3 ME2 TGAGTCCAAACCGGAGA * 11 139 865 0,49 0,33 0,79 EM10 GACTGCGTACGAATTCAG ME2 TGAGTCCAAACCGGAGA * 16 150 1166 0,41 0,37 0,91 EM11 GACTGCGTACGAATTCCA * 13 117 1012 0,49 0,36 0,29 * 14 101 1331 0,40 0,38 0,92 * 168 794 0,44 0,36 0,54 * 15 234 1330 0,47 0,34 0,84 14,77 254,72 1347,05 0,43 0,35 0,80 SRAP4 SRAP5 SRAP6 SRAP7 SRAP8 ME2 TGAGTCCAAACCGGAGA EM12 GACTGCGTACGAATTATG ME5 TGAGTCCAAACCGGAAG EM9 GACTGCGTACGAATTCGA ME5 TGAGTCCAAACCGGAAG EM10 GACTGCGTACGAATTCAG ME5 TGAGTCCAAACCGGAAG EM11 GACTGCGTACGAATTCCA Trung bình Ghi chú: H (Heterozygocity index): Hệ số dị hợp tử; PIC (Polymorphic Information Content): Hệ số thông tin đa hình; D (Discriminating power): Năng lực phân biệt hai mẫu giống thị; *: Nhiệt độ gắn mồi theo chu trình nhiệt chung cho thị SRAP (chi tiết phần Phương pháp nghiên cứu) Cën mô hỡnh cỗu trỳc quổn th ng vi giỏ tr K = (Hình 3B), qn thể tương ứng phân nhóm I hai méu giống thuộc lồi P incarnata Qn thể tương ứng với phân nhóm II méu giống q tím có di truyền ngun vẹn däng chanh leo tím P edulis f edulis Tương tự, qn thể tương ứng với hai phân nhóm IV V 430 méu giống quâ vàng hồng Mặc dù xác đðnh thuộc däng chanh leo vàng P edulis f flavicarpa Deg, hai quæn thể sở hữu di truyền hoàn toàn khác nhau, ớt nhỗt phọm vi b mộu ging chanh leo nghiên cứu Trong đị, qn thể tương ứng với phân nhóm III bao gồm méu giống q tím vàng với di truyền hỗn hợp Trần Đức Trung, Nguyễn Văn Viết, Bùi Quang Đãng xác đðnh däng lai hai däng chanh leo q tím (phân nhóm II) q vàng (phân nhóm IV V) Phån tích phương sai di truyền AMOVA dựa kết q phân nhóm xác đðnh qn th cho thỗy 26% bin d di truyn xõy qn thể, đị 74% biến dð quæn thể (Bâng 3) Giá trð PhiPT phõn nhúm I v phõn nhúm II l nhú nhỗt, phân nhóm II phân nhóm V lớn nhỗt (P

Ngày đăng: 29/03/2022, 10:07

TÀI LIỆU CÙNG NGƯỜI DÙNG

  • Đang cập nhật ...

TÀI LIỆU LIÊN QUAN