Bai 5 tin sinh hoc
Bai 5 tin sinh hoc
... cố gắng xác định vị trí một gene.
•
Bởi vì các sai khác tồn tại trong trình tự khởi đầu của các sinh
vật với mã di truyền khác nhau, ORF sẽ được xác định khác
nhau.
CÔNG CỤ VÀ CÁCH THỰC HiỆN
Bài giảng Tin sinh học: Chương 4 - ThS. Nguyễn Thành Luân
... cây phát sinh loài
Ý phát sinh loài
Các trong cây phát
sinh
Các pháp xây cây phát
sinh loài
Các cây phát sinh loài
Bioinformatics ...
Parsimony bằng cách vẽ ra mọi trƣờng hợp
có thể có về cây phát sinh loài đó:
•4 loài -> 3 cây
5 loài -> 15 cây
•6 loài -> 1 05 cây
• Sau đó vẽ sơ đồ cột...
Bài giảng Tin sinh học: Chương 3 - ThS. Nguyễn Thành Luân
... chung nguồn
gốc là DNA polymerase ở người và tinh tinh
• So sánh đột biến (X và Y) được gom góp qua giai
đoạn phân kỳ của người và tinh tinh (khoảng 5tr
năm trước)
• Không thể tính toán được ... xứng (A<->T, G<-
>C) (5)
– Lỗi khoảng trống (gap) ( -5)
– Lỗi 2 đoạn khoảng trống (0)
Trình tự DNA mặc định
Cách tính điểm
3/26/2013
10
Tin sinh học trả lời mối quan
hệ h...
Bài giảng Tin sinh học: Chương 2 - Thạc sĩ. Nguyễn Thành Luân
... dữ liệu sinh học cơ bản
• Các công cụ tìm kiếm dữ liệu
• Phân loại CSDL Tin sinh học
WHAT ARE DATABASES
Cơ sở dữ liệu là gì?
• Là tổ chức các chuỗi thông tin theo dạng tệp
• Thông tin có ... nguồn CSDL trình tự protein duy trì
sự hợp tác bởi Viện Tin sinh học Thụy Sĩ (the Swiss
Institute for Bioinformatics-SIB) và Viện Tin Sinh học
Châu Âu (EBI-European Bioinformati...
Bài giảng Tin sinh học: Chương 1 - ThS. Nguyễn Thành Luân
... cần nghiên cứu tin sinh học?
Các lĩnh vực nghiên cứu ứng dụng của
tin sinh học
Các công cụ, kỹ năng phục vụ cho tin
sinh học
Các thuật ngữ sử dụng trong các ứng
dụng tin sinh học
3/8/2013 ...
Thuật ngữ Tin sinh học lần đầu tiên được
công nhận toàn thế giới vào năm 1991.
3/8/2013
5
GIỚI THIỆU CƠ BẢN
VỀ TIN SINH HỌC
CHƢƠNG I
TỔNG QUAN CHƢƠNG I
Lịch sử &a...
Bai giang tin sinh hoc 2
... trình t sinh h cế ự ọ
45
Một số mã số truy cập của RefSeq database
1. mRNAs and Proteins
NM_123 456 Curated mRNA
NP_123 456 Curated Protein
NR_123 456 Curated non-coding RNA
XM_123 456 Predicted ...
gattctcacttggtctgctgcaaggacgcggaccattaaaactgttcatggcccttgtggcgttctcgt
ttcctaacaatcccaccaacagcagggatactaaaaagatggggaacgatcaaaaaatcaaaagct
atcaatgtcttgagagggttcaggaaagagattggaaggatgctga...
Bai giang tin sinh hoc 3
... khi chưa
bắt cặp với DNA khuôn Tmprimer =59 .9+0.41*(%GC)-600/
(chiều dài nucleotide) khi mồi chưa bắt cặp với DNA,
thường nhiệt độ nóng chảy từ 55 - 65
0
C.
2. Nhiệt độ bắt cặp:
Tanneal:Là ... hoặc RNA của các sinh vật (chúng
ta sẽ biết tự nucleotide của sinh vật) từ đó thiết kế
phản ứng mồi theo trình tự đã giải.
Chúng ta có thể lấy trình tự nucleotide của các sinh
vật trê...
Bai giang tin sinh hoc 4
...
phẩm-gen trong một cơ sở dữ liệu các thông tin
mẫu đã có sẵn. Thông tin này là hữu ích để trả lời
một loạt các câu hỏi sinh học khác nhau.
Giới thiệu môn học
5
Nguyên tắc trong blast
Thuật toán ... học
8
Thu thập và lựa
chọn trình tự
(protein hay
DNA, RNA)
Blast
Blastx
Giới thiệu môn học
25
Thu thập và lựa chọn tập trình tự
Trước khi thực hiện việc gióng cột, phải lựa một...
Bai giang tin sinh hoc 6
... ATTCAAAGGTACGTTGCCCC
Xóa đoạn nucleotide
Giới thiệu môn học
17
Phân tích trình tự Palindromes
5
5
3’
3’
DNA cloning, III
DNA Cloning II
Kết quả phân tích dotplot bằng blast
Giới thiệu môn học
18
Kết ... năng sinh học, và ngữ cảnh, mà
một trình tự có thể mang mang mã hoặc không mang mã
(noncoding DNA). Các trình tự DNA cũng có thể chứ
"ADN rác" (junk DNA).
Giới thiệu môn học...
Bài 5 - Tin học 10
... Delphi, C
++
Vì vậy ngôn ngữ này thích hợp với phần
đông người lập trình.
Bài 5. Ngôn ngữ lập trình
Bài 5. Ngôn ngữ lập trình
Làm thế nào để
máy tính hiểu và
trực tiếp thực hiện
được