Theo Thõn Thị Hải Hà thị trường thuốc Việt Nam rất phong phỳ, cú trờn 10.000 mặt hàng với khoảng 1000 hoạt chất. Đõy là một thuận lợi để bệnh viện lựa chọn được cỏc loại thuốc phự hợp với nhu cầu của mỡnh. Tuy nhiờn việc lựa chọn thuốc cũn nhiều bất cập:
+ Do những ảnh hưởng tiờu cực của một số hoạt động marketing khụng lành mạnh gõy ảnh hưởng đến việc lựa chọn thuốc.
+ Hoạt động quảng cỏo cho thuốc sản xuất trong nước cũn chưa thực sự phổ biến, dẫn đến nhiều hạn chế cho việc lựa chọn thuốc nội vào danh mục thuốc bệnh viện.
+ Việc truy cập trực tuyến thụng tin thuốc phạm vi toàn cầu ở Việt Nam cũn hạn chế do vấn đề chi phớ cao dẫn đến khú khăn trong việc cập nhật thụng tin thuốc.
Trong việc xõy dựng kế hoạch đấu thầu, bệnh viện gặp khú khăn trong việc xõy dựng giỏ kế hoạch do biến động giỏ trờn thị trường. Việc phờ duyệt kế hoạch đấu thầu thường kộo dài, gõy chậm chễ cho quỏ trỡnh đấu thầu. Số lượng cỏc mặt hàng trong danh mục mời thầu, cỏc mặt hàng tham dự đấu thầu, số lượng cỏc nhà thầu càng ngày càng tăng qua cỏc năm, mỗi mặt hàng phải đỏnh giỏ nhiều tiờu chuẩn. Cỏc tiờu chuẩn chưa được cụ thể húa bằng điểm, do đú cụng việc đấu thầu ngày càng trở nờn nặng nề. Việc tiến hành xột chọn bằng thủ cụng tốn nhiều thời gian và nhõn lực, dễ xảy ra sai sút, nhầm lẫn.
Khối lượng cụng việc trong đấu thầu rất lớn, phải kiểm soỏt nhiều loại văn bản, tài liệu khiến thời gian đấu thầu kộo dài, đũi hỏi tiờu tốn nhõn lực trong điều kiện nhõn lực dược ở bệnh viện luụn thiếu [15].
Việc xõy dựng DMTBV hàng năm chủ yếu vẫn dựa vào sử dụng của năm trước, DMTCY của Bộ Y tế và kinh nghiệm của cỏc bỏc sỹ, chưa cú những đỏnh
giỏ cụ thể, số lượng hoạt chất đa dạng với nhiều biệt dược được sử dụng trong bệnh viện sẽ làm cho cụng tỏc cung ứng, quản lý thuốc của khoa dược gặp nhiều thỏch thức, dễ nảy sinh nhiều vấn đề phức tạp. Theo nghiờn cứu của Hoàng Thị Minh Hiền [ ].
Cũng theo nghiờn cứu của Hoàng Hồng Hải , Vũ Bớch Hạnh thỡ bệnh viện vẫn chưa xõy dựng được phỏc đồ điều trị chuẩn, cỏc bỏc sĩ cũn chủ yếu điều trị theo kiến thức và kinh nghiệm của mỡnh [20], [21].