Về nguyên tắc các đơn vị tính thuế theo phương pháp kê khai phải phản ánh một cách trung thực, kịp thời, đầy đủ các nghiệp vụ kinh tế phát sinh vào sổ sách kế toán và hóa đơn chứng từ trên nguyên tắc ghi nhận doanh thu tính thuế. Nhưng khác hẳn với thực tế thì nhiều doanh nghiệp luôn luôn tìm cách che giấu doanh thu tính thuế. Hiện tượng này không chỉ xảy ra ở một số trường hợp mà nó còn diễn ra ở rất nhiều doanh nghiệp khác trên phạm vi cả nước và ở nhiều ngành nhiều lĩnh vực khác nhau. Việc che giấu doanh thu không phản ánh đúng thực tế hoạt động sản xuất kinh doanh của doanh nhgiệp nhằm mục đích làm giảm số thuế TNDN mà cơ sở phải nộp, việc này thường xảy ra ở một số trường hợp sau:
Lợi dụng thói quen của người tiêu dùng khi mua hàng hóa về sử dụng thường không lấy hóa đơn bán hàng hoặc thông đồng với người mua hàng hóa để ghi giá thấp hơn so với giá bán thực tế. Hình thức này thường diễn ra đối với các doanh nghiệp kinh doanh những mặt hàng như: Ô tô, xe máy, điện tử, điện lạnh…..Hoặc những doanh nghiệp sản xuất cung cấp trực tiếp cho người tiêu dùng như doanh nghiệp sản xuất đồ gỗ, đồ nhựa, cơ khí tiêu dùng, kinh doanh nhà hàng, khách sạn.. Ví dụ: Công ty TNHH Niềm Tin mã số thuế 0100236746 chuyên sản xuất lắp ráp xe máy, xe đạp, xe ô tô…. Cán bộ quản lý đã kiểm tra quyết toán thuế năm 2007 qua việc đối chiếu giữa nhật ký bán hàng, sổ cái và sổ chi tiết phải thu của khách hàng thấy giá trị ghi trên nhật kí bán hàng là 14.500.000 đồng còn giá trị ghi trên sổ chi tiết phải thu của khách hàng là 12.000.000 đồng.
Dùng kỹ thuật ghi chép doanh nghiệp phản ánh số liệu trên biên lai thanh toán hoặc hóa đơn GTGT giao cho khách hàng sai lệch với hóa đơn hay biên lai lưu tại doanh nghiệp ( nếu có đối chiếu giữa liên 1 và liên 2 là khác nhau) nhằm phản ánh sai doanh thu tính thuế.
Ví dụ: Thông qua biên bản kiểm tra quyết toán thuế năm 2007 của công ty TNHH
Phương Anh mã số thuế 0100385995 chuyên nhận hợp đồng may gia công, công ty đã ký hợp đồng may đồng phục, xuất hóa đơn giao cho khách hàng với số tiền ghi trên hóa đơn là 3.000.000 đồng nhưng hóa đơn lưu tại doanh nghiệp chỉ có 2.200.000 đồng; cán bộ quản lý đã so sánh giá bán trên hóa đơn với biểu giá hiện hành của doanh nghiệp và hợp đồng đã ký với khách hàng thấy có chênh lệch như trên.
Một số doanh nghiệp xuất vật tư hàng hóa dùng để trao đổi biếu tặng hay trả lương thưởng cho cán bộ công nhân viên nhưng không hạch toán là giá cùng loại hay tương đương mức giá trên thị trường mà chỉ hạch toán bằng đúng giá nguyên vật liệu mua vào.
Một số trường hợp doanh nghiệp không kê khai công trình xây dựng cơ bản hoàn thành nhưng cũng không xuất hóa đơn bán hàng; không kê khai thu nhập từ hoạt động cho thuê hay nhượng bán lại Tài sản hay cũng không kê khai từ hoạt động tài chính bất thường hay các khoản trợ cước, trợ giá.
Ví dụ: Trích biên bản kiểm tra quyết toán thuế của Công ty TNHH vận tải Tuấn
Hưng mã số thuế 0102209336 chuyên kinh doanh vận tải các loại hàng hóa, qua kiểm tra đối chiếu hóa đơn bán hàng với phiếu kiêm xuất kho vận chuyển nội bộ và đối chiếu các thông tin số liệu trên hóa đơn bán hàng với chứng từ vận chuyển thấy công ty xây dựng một gara ô tô trị giá 30.000.000 đồng, đến khi hoàn thành công ty không kê khai cũng không xuất hóa đơn.
Một số doanh nghiệp chưa tính tiền, chưa vào sổ các khoản tiền của doanh thu nhận trước, doanh thu bán chịu .
Ví dụ: Theo biên bản kiểm tra quyết toán thuế tại Công ty TNHH Hàn Quốc mã số
thuế 0100955275 chuyên kinh doanh chăn ga gối đệm cao cấp. Công ty đã ký một hợp đồng mua bán trị giá 110.000.000 đồng với công ty TNHH Bắc Chương Dương có mã số thuế 0100596731 và nhận trước một khoản tiền hàng là
30.000.000 đồng. Theo kết quả đối chiếu của cán bộ thuế giữa hợp đồng mua bán với số phải thu của khách hàng, doanh nghiệp có nhận trước một khoản tiền là 30.000.000 đồng nhưng công ty không hạch toán khoản tiền này vào doanh thu.