Kết quả xác định kiểu gen P khi chạy sản phẩm RT – PCR trên gel agarose 2%
Hình 20. Kết quả điện di trên gel agarose xác định kiểu gen P
*Chú thích: Giếng 7 là thang chuẩn
Qua hình 20 cho thấy kết quả chạy điện di 12 mẫu thu đƣợc 11 băng có kích thƣớc 224 bp (tƣơng ứng với kiểu gen P[8]), chỉ có giếng số 4 không xuất hiện băng
200bp 300bp 400bp 500bp 100bp 224bp
Luận văn Thạc sĩ Nguyễn Phương Thuý
nên chƣa biết đƣợc kiểu gen P của mẫu này. Kết quả thu đƣợc này phản ánh sự phổ biến của kiểu gen P[8] tại bệnh viện nhi Khánh Hòa năm 2010.
a) Sự phân bố kiểu gen P lưu hành tại bệnh viện nhi Khánh Hòa
Kết quả phân tích 292 mẫu xác định kiểu gen P thu đƣợc ở bảng 11 nhƣ sau:
Bảng 12. Tỷ lệ lƣu hành các kiểu gen P tại bệnh viện nhi Khánh Hòa năm 2010 Kiểu gen
Tổng số P4 P8
Tổng số
Số mẫu 4 288 292
Tỷ lệ (%) 1.37 98.63 100,00
Từ kết quả thu đƣợc theo bảng 12 chúng tôi có đồ thị hình 21 nhƣ sau:
Hình 21. Tỷ lệ các kiểu gen P tại bệnh viện nhi Khánh Hòa năm 2010 Theo bảng 12 và biểu đồ hình 21 cho thấy trong tổng số 292 mẫu đƣợc xác định kiểu gen P có 288 mẫu xác định là kiểu gen P[8] chiểm tỷ lệ 98,63%, còn kiểu gen P[4] chiếm tỷ lệ 1,37%. Ngoài ra không tìm thấy các kiểu gen khác trong các mẫu phân tích.
Luận văn Thạc sĩ Nguyễn Phương Thuý
b) Sự phân bố các týp P lưu hành theo khu vực
Bảng 13. Sự phân bố các kiểu gen theo khu vực trong cả nƣớc Địa Điểm Bệnh viện nhi Trung ƣơng Bệnh viện nhi Khánh Hòa Bệnh viện nhi Hồ Chí Minh Kiểu gen và tỷ lệ (%) P4 27 (9,34) 4 (1,37) 0 (0,00) P6 4 (1,38) 0 (0,00) 1 (0,33) P8 254 (87,89) 288 (98,63) 293 (97,02) Pmix 4 (1,38) 0 (0,00) 7 (2,32) Pnt 0 (0,00) 0 (0,00) 1 (0,33) Tổng 289 292 302 * Chú thích:
Pmix: kiểu gen P hỗn hợp của P4, P6 và P8 Pnt: kiểu gen P không xác định được
Từ bảng 13 chúng ta có đồ thị hình 22 nhƣ sau:
Hình 22: Sự phân bố các kiểu gen theo khu vực trong cả nƣớc
Chủng P Tỉ lệ (%)
Luận văn Thạc sĩ Nguyễn Phương Thuý
Từ kết quả phân tích thu đƣợc ở bảng 13 nhận thấy tỷ lệ P[8] lƣu hành phổ biến ở cả 3 miền với tỷ lệ tƣơng ứng của miền Bắc, Trung, Nam lần lƣợt là 87,89%, 98,63% và 97,02%, tuy nhiên tỷ lệ này có sự khác biệt giữa các miền. So sánh sự khác biệt tỷ lệ P[8] giữa miền Bắc với miền Trung và Nam thu đƣợc giá trị P tƣơng ứng lần lƣợt là 0,0000 và 0,000024 đều nhỏ hơn 0,05, nhƣ vậy sự khác biệt giữa miền Bắc với hai miền còn lại có ý nghĩa thống kê. Tỷ lệ giữa miền Trung và Nam không có ý nghĩa thống kê với P = 0,1797 > 0,05. nhƣ vậy có thể kết luận rằng chủng P[8] lƣu hành ngày càng phổ biến theo chiều từ Bắc vào Nam.
Trong số các kiểu gen P có sự khác biệt rõ ở kiểu gen P[4]. Trong đó miền Bắc tỷ lệ cao nhất chiếm 9,34%, miền Trung chiếm tỷ lệ thấp với 1,37% trƣờng hợp và miền Nam không xuất hiện kiểu gen P[4]. Sự khác biệt giữa miền Bắc với miền Trung, Nam và miền Trung với miền Nam có ý nghĩa thống kê với giá trị P tƣơng ứng lần lƣợt là 0.0000 ; 0,0000 và 0.0411. Nhƣ vậy tỷ lệ kiểu gen P[4] tăng dần theo chiều từ Nam ra Bắc.
Các kiểu gen còn lại chiếm tỷ lệ nhỏ và có sự phân bố đồng đều ở cả 3 miền, đặc biệt kiểu gen P không xác định đƣợc chỉ xuất hiện tại miền Nam với 1 mẫu chiếm 0,33%, so sánh với số liệu công bố từ năm 2007 đến 2009 [3] thấy rằng tỷ lệ chủng P không xác định kiểu gen ở cả 3 miền xuất hiện năm 2010 với số mẫu thấp nhất. Nhƣ vậy có xu hƣớng lƣu hành phổ biến các kiểu gen P[8] và P[4] trong cả nƣớc.
c) Sự phân bố kiểu gen P lưu hành theo thời gian
Để đánh giá xu hƣớng biến đổi các kiểu gen P theo thời gian chúng tôi tiến hành so sánh với số liệu thống kê dịch tễ của bệnh viện nhi Khánh Hòa đã công bố những năm trƣớc đây tại Việt Nam, kết quả thu đƣợc ở bảng 14 nhƣ sau:
Luận văn Thạc sĩ Nguyễn Phương Thuý
Bảng 14. Tỷ lệ các kiểu gen P lƣu hành theo thời gian
Thời gian Các kiểu gen P và tỷ lệ lƣu hành (%)
P8 P4 Pmix Pnt Tổng 2009 256 11 8 19 294 87,07 3,74 2,73 6,46 100,00 2010 288 4 0 0 292 98,63 1,37 0,00 0,00 100,00
Từ kết quả thu đƣợc tại bảng 14 chúng tôi có đồ thị hình 23 nhƣ sau:
Hình 23. Sự phân bố kiểu gen P theo thời gian
Từ đồ thị hình 23 nhận thấy sự lƣu hành kiểu gen P[8] lƣu hành phổ biến và ổn định tại Việt Nam với tỷ lệ dao động từ 87,07 % tới 98,63% vào năm 2010. Các kiểu gen P[4] xuất hiện với tỷ lệ rất thấp. Các trƣờng hợp mang kiểu gen P hỗn hợp và tỷ lệ chủng P không xác định đƣợc kiểu gen chiếm tỷ lệ nhỏ lần lƣợt là
Chủng P Tỉ lệ (%)
Luận văn Thạc sĩ Nguyễn Phương Thuý
2,73% và 6,46% ở năm 2009, còn năm 2010 không thấy có các kiểu gen này trong các mẫu nghiên cứu.