Quy trình thẩm định của mỗi Ngân hàng như là một cuốn cẩm nang hướng dẫn cán bộ thẩm định thực hiện công việc một cách khách quan, khoa học và
đầy đủ. Quy trình thẩm định dự án đầu tư bao gồm nội dung, phương pháp thẩm định và trình tự tiến hành những nội dung đó. Quy trình thẩm định được xây dựng một cách khoa học, tiên tiến và phù hợp với thế mạnh và đặc trưng của Ngân hàng sẽ góp phần nâng cao chất lượng thẩm định dự án đầu tư. Nội dung thẩm định cần đề cập đến tất cả các vấn đề về thẩm định dự án đầu tư đứng trên góc độ của Ngân hàng: vấn đề đầu tư (tổng, nguồn, tiến độ), hiệu quả tài chính, khả năng tài trợ và rủi ro của Ngân hàng. Nội dung càng đầy đủ, chi tiết bao nhiêu thì càng đưa lại độ chính xác cao của kết luận đánh giá.
Phương pháp thẩm định dự án đầu tư bao gồm các chỉ tiêu đánh giá, cách thức xử lý, chế biến thông tin có trong hồ sơ dự án và những thông tin có liên quan để đem lại những thông tin cần thiết về tính khả thi tài chính của dự án cũng như khả năng trả nợ Ngân hàng. Phương pháp càng hiện đại, khoa học thì càng giúp cán bộ thẩm định, phân tích, tính toán hiệu quả của dự án nhanh chóng, chính xác, dự báo được rủi ro, làm cơ sở cho lãnh đạo quyết định tài trợ đúng đắn.
Thực tế những năm vừa qua, các Ngân hàng Thương mại đã chuyển dần từ phương pháp thẩm định dự án đầu tư cũ sang phương pháp mới hiện đại hơn từ trong việc học tập các nước phát triển hơn và có sửa đổi phù hợp với thực tế Việt Nam hiện nay.