Bên cạnh những thành tích, ưu điểm đã kể trên, tổ chức công tác kế toán bán hàng của công ty còn có những hạn chế cần khắc phục nhằm đáp ứng tốt hơn yêu cầu trong công tác quản lý, làm cơ sở nâng cao hiệu quả hạch toán cho công ty trong những thời gian tới.
* Về chứng từ và luân chuyển chứng từ
Mặc dù việc lập và quy trình luân chuyển chứng từ là phù hợp với những quy định hiện hành nhưng thời gian luân chuyển chứng từ từ bộ phận này sang các bộ phận khác của công ty là chậm nên đôi khi kế toán không kịp thời cập nhật thông tin. Công ty nên khắc phục tình trạng này.
* Về các hình thức chiết khấu thanh toán, chiết khấu thương mại và giảm giá hàng
bán.
Các khách hàng của công ty thường là những khách hàng mua với số lượng lớn, và thực hiện hình thức thanh toán là trả chậm, tuy nhiên việc sử dụng chiết khấu thanh toán của công ty hầu như không thực hiện. Như vậy, rất khó có thể khuyến khích khách hàng trả tiền trước, tăng nhanh vòng quay của vốn cho công ty trong việc kinh doanh.
* Về việc lập dự phòng phải thu khó đòi:
Số lượng khách hàng của công ty tương đối lớn và cũng còn nhiều đối tượng khách hàng trả chậm trong khi công ty chưa lên kế hoạch cụ thể về việc thu nợ cho từng khách hàng khiến tình trạng Nợ khó đòi khá nhiều. Điều này sẽ làm giảm hiệu
quả trong hoạt động kinh doanh của công ty. Khi khách hàng thực sự mất khả năng thanh toán, công ty mất quyền chủ động trong vấn đề tài chính.