C: Mẫu chứng âm.
3. Khi tiến hành xét nghiệm, ly tâm các ống chứa tăm bơng 1000 vịng/phút trong 1 phút
1 phút
Tách chiết DNA
1. Chuẩn bị các eppendorf 1,5 ml đánh số tương ứng với số mẫu. Bật bồn ủ nhiệt khơ ở 600C. khơ ở 600C.
2. Cho vào mỗi eppendorf 900 µl dung dịch 1. 3. Cho 100 µl huyết thanh vào mỗi ống.* 3. Cho 100 µl huyết thanh vào mỗi ống.*
Vortex mạnh eppendorf trên máy vortex ít nhất 5 giây cho tan hồn tồn protein biến tính.
Để yên 10 phút.
4. Cho 200 µl dung dịch 2. Lắc trộn thật kỹ. Lắc trộn thật kỹ.
5. Ly tâm 13.000 vịng/phút trong 10 phút ở nhiệt độ phịng.
6. Chuẩn bị các eppendorf 1,5 ml mới, đánh số tương ứng với số mẫu. 7. Chuyển 600 µl dịch nổi sang ống eppendorf 1,5 ml mới.** 7. Chuyển 600 µl dịch nổi sang ống eppendorf 1,5 ml mới.**
8. Thêm 600 µl dung dịch 3 (dung dịch 3 cần được trộn đều trước khi sử dụng). 9. Vortex nhẹ để trộn đều. 9. Vortex nhẹ để trộn đều.
10. Ly tâm 13.000 vịng/phút trong 10 phút ở nhiệt độ phịng. 11. Cẩn thận đổ bỏ dịch nổi, chỉ giữ lại cặn.*** 11. Cẩn thận đổ bỏ dịch nổi, chỉ giữ lại cặn.***
12. Thêm 900 µl dung dịch 4.
13. Ly tâm 13.000 vịng/phút trong 5 phút ở nhiệt độ phịng. 14. Cẩn thận đổ bỏ dịch nổi, chỉ giữ lại cặn. 14. Cẩn thận đổ bỏ dịch nổi, chỉ giữ lại cặn.
15. Làm khơ cặn trong 10 phút ở 60°C trong bồn ủ nhiệt khơ. 16. Hịa cặn trong 50 µl dung dịch 5. 16. Hịa cặn trong 50 µl dung dịch 5.
Nếu khơng tiến hành phản ứng PCR ngay trong ngày, bảo quản DNA tách chiết ở 2-8°C trong vịng 2-3 ngày, hoặc ở -20°C trong vịng 6 tháng.
Lưu ý :
¿ Huyết thanh phải được bảo quản ở -20oC từ khi thu đến khi thực hiện phản ứng.
¿¿ Chỉ thu dịch nổi, tránh chạm vào lớp dung dịch hơi đục (protein biến tính) ở giữa
hai pha nước và chloroform.
¿¿¿ Tránh chạm đến phần cặn cĩ màu xanh.
PCR
1. Thêm 10 µl chứng dương hoặc 10 µl của mỗi mẫu DNA tách chiết vào ống eppendorf 0,2 ml cĩ chứa các thành phần của phản ứng PCR. Thay tip mới cho mỗi eppendorf 0,2 ml cĩ chứa các thành phần của phản ứng PCR. Thay tip mới cho mỗi mẫu.
2. Đặt các eppendorf vào máy luân nhiệt
3. Cài đặt chương trình cho máy luân nhiệt như sau : HOLD 5 phút 95°C HOLD 5 phút 95°C
CYCLE (40 chu kỳ) 30 giây 94°C ; 30 giây 50°C ; 30 giây 72°C
HOLD 6 phút 72°C
Điện di
1. Chuyển mẫu đến khu vực điện di
2. Nạp 10 µl của “thang 181 cặp base” và 10 µl của chứng dương và của mỗi sản phẩm PCR trộn đều với 2 µl dung dịch nạp mẫu vào gel agarose phẩm PCR trộn đều với 2 µl dung dịch nạp mẫu vào gel agarose