Cỏc trƣờng hợp hoàn thuế GTGT:
Thứ nhất, cơ sở kinh doanh nộp thuế GTGT theo phƣơng phỏp khấu trừ thuế nếu cú số thuế GTGT đầu vào chƣa đƣợc khấu trừ hết trong thỏng (đối với trƣờng hợp kờ khai theo thỏng) hoặc trong quý (đối với trƣờng hợp kờ khai theo quý) thỡ đƣợc khấu trừ vào kỳ tiếp theo. Trƣờng hợp lũy kế sau ớt nhất 12 thỏng tớnh từ thỏng đầu tiờn hoặc sau ớt nhất 4 quý tớnh từ quý đầu tiờn phỏt sinh số thuế GTGT đầu vào chƣa đƣợc khấu trừ hết mà vẫn cũn số thuế GTGT đầu vào chƣa đƣợc khấu trừ hết thỡ cơ sở kinh doanh đƣợc hoàn thuế.
Thứ hai, là cơ sở kinh doanh mới thành lập từ dự ỏn đầu tƣ đó đăng ký kinh doanh, đăng ký nộp thuế GTGT theo phƣơng phỏp khấu trừ, hoặc dự ỏn tỡm kiếm thăm dũ và phỏt triển mỏ dầu khớ đang trong giai đoạn đầu tƣ, chƣa đi vào hoạt động, nếu thời gian đầu tƣ từ 1 năm (12 thỏng) trở lờn thỡ đƣợc hoàn thuế GTGT của hàng hoỏ, dịch vụ sử dụng cho đầu tƣ theo từng năm.
Trƣờng hợp, nếu số thuế GTGT luỹ kế của hàng hoỏ, dịch vụ mua vào sử dụng cho đầu tƣ từ 300 triệu đồng trở lờn thỡ đƣợc hoàn thuế GTGT.
Thứ ba, hoàn thuế GTGT đối với dự ỏn đầu tƣ mới. Trƣờng hợp cơ sở kinh doanh đang hoạt động thuộc đối tƣợng nộp thuế GTGT theo phƣơng phỏp khấu trừ cú dự ỏn đầu tƣ mới (trừ dự ỏn đầu tƣ xõy dựng nhà để bỏn) cựng tỉnh, thành phố, đang trong giai đoạn đầu tƣ thỡ cơ sở kinh doanh thực hiện kờ khai riờng đối với dự ỏn đầu tƣ và phải kết chuyển thuế GTGT đầu vào của dự ỏn đầu tƣ để bự trừ với việc kờ khai thuế GTGT của hoạt động sản xuất kinh doanh đang thực hiện. Số thuế GTGT đƣợc kết chuyển của dự ỏn đầu tƣ tối đa bằng số thuế GTGT phải nộp của hoạt động sản xuất kinh doanh trong kỳ của cơ sở kinh doanh.
Thứ tƣ, đối tƣợng đƣợc hoàn thuế GTGT là cơ sở kinh doanh trong thỏng (đối với trƣờng hợp kờ khai theo thỏng), quý (đối với trƣờng hợp kờ khai theo quý) cú hàng hoỏ, dịch vụ xuất khẩu nếu thuế GTGT đầu vào của hàng húa, dịch vụ xuất khẩu chƣa đƣợc khấu trừ từ 300 triệu đồng trở lờn thỡ đƣợc hoàn thuế GTGT theo thỏng, quý; trƣờng hợp trong thỏng, quý số thuế GTGT đầu vào của
hàng húa, dịch vụ xuất khẩu chƣa đƣợc khấu trừ chƣa đủ 300 triệu đồng thỡ đƣợc khấu trừ vào thỏng, quý tiếp theo.
Thứ năm, cơ sở kinh doanh nộp thuế GTGT theo phƣơng phỏp khấu trừ thuế đƣợc hoàn thuế GTGT khi chuyển đổi sở hữu, chuyển đổi doanh nghiệp, sỏp nhập, hợp nhất, chia, tỏch, giải thể, phỏ sản, chấm dứt hoạt động cú số thuế GTGT nộp thừa hoặc số thuế GTGT đầu vào chƣa đƣợc khấu trừ hết.
Thứ sỏu, hoàn thuế GTGT đối với cỏc chƣơng trỡnh, dự ỏn sử dụng nguồn vốn hỗ trợ phỏt triển chớnh thức (ODA) khụng hoàn lại hoặc viện trợ khụng hoàn lại, viện trợ nhõn đạo. Trong đú, đối với dự ỏn sử dụng vốn ODA khụng hoàn lại: chủ chƣơng trỡnh, dự ỏn hoặc nhà thầu chớnh, tổ chức do phớa nhà tài trợ nƣớc ngoài chỉ định việc quản lý chƣơng trỡnh, dự ỏn đƣợc hoàn lại số thuế GTGT đó trả đối với hàng hoỏ, dịch vụ mua ở Việt Nam để sử dụng cho chƣơng trỡnh, dự ỏn.
Thứ bảy, đối tƣợng đƣợc hƣởng quyền ƣu đói miễn trừ ngoại giao theo quy định của phỏp luật về ƣu đói miễn trừ ngoại giao mua hàng húa, dịch vụ tại Việt Nam để sử dụng đƣợc hoàn số thuế GTGT đó trả ghi trờn hoỏ đơn GTGT hoặc trờn chứng từ thanh toỏn ghi giỏ thanh toỏn đó cú thuế GTGT.
Thứ tỏm, là ngƣời nƣớc ngoài, ngƣời Việt Nam định cƣ ở nƣớc ngoài mang hộ chiếu hoặc giấy tờ nhập cảnh do cơ quan cú thẩm quyền nƣớc ngoài cấp đƣợc hoàn thuế đối với hàng hoỏ mua tại Việt Nam mang theo ngƣời khi xuất cảnh.
Thứ chớn, cơ sở kinh doanh cú quyết định xử lý hoàn thuế của cơ quan cú thẩm quyền theo quy định của phỏp luật và trƣờng hợp hoàn thuế GTGT theo điều ƣớc quốc tế mà CHXHCN Việt Nam là thành viờn.