Một trong những vấn ựề lớn khi lai tạo giống cà chua kháng
begomovirus là khả năng kháng của các alen khác nhau trong các khu vực có mặt các begomovirus khác nhau. Vấn ựề này ựã ựược ựiều tra với một số dòng ở nhiều ựịa ựiểm thử nghiệm. Dòng giống TY52 (mang gen Ty-1) với tắnh kháng có nguồn gốc từ S. chilense LA1969, ựược phát triển ở Israel, kháng vừa phải với TYLCV. Khi ựánh giá ở Guatemala, nơi có các Begomovirus
genome kép với áp lực virus rất cao thì dòng này lại mẫn cảm. Khi ựánh giá trong tám ựịa ựiểm ở đông Nam Á và tại Florida, Mỹ, TY52 mẫn cảm ở bảy
Trường đại học Nông nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦ 22
ựịa ựiểm, kháng vừa ở một ựịa ựiểm [24]. đối với dòng H24 mang gen Ty-2
ToLCV từ S. habrochaites f. glabratum, các thử nghiệm cho thấy nó kháng ựược tại năm ựịa ựiểm và mẫn cảm hoặc kháng nhẹ ở bốn ựịa ựiểm khác [24].
Trong số chắn nguồn gen ựược thử nghiệm tại AVRDC, chỉ có S. chilense
LA1932 kháng ựược tại tất cả tám ựịa ựiểm ở đông Nam Á (Green và Shanmugasundaram, 2007). LA1932 cũng kháng ựược tại các ựịa ựiểm khảo sát ở Florida, Mỹ [24]. Accession này mang cả 3 gen kháng: Ty-1, Ty-3 và Ty-4.
Trong ựó, Ty-3 quyết ựịnh khoảng 60% biến dị kiểu hình kháng, ựiều này chứng tỏ Ty-3 là gen chịu trách nhiệm chắnh ựối với tắnh kháng TYLCV [24].
Như vậy, tại các ựịa ựiểm khác nhau, nơi có sự phân bố khác nhau của các loài begomovirus và có các ựiều kiện khắ hậu khác nhau thì khả năng kháng của các dòng giống kháng là khác nhau. Những nghiên cứu trên cho rằng gen Ty-1
và Ty-2 chỉ tạo ựược tắnh kháng vừa và chịu ựược một số chủng virus. Trong khi gen Ty-3 từ S. chilense ựã tạo nên tắnh kháng cao ở nhiều nơi, trong ựó có đông Nam Á. Ứng dụng marker phân tử sẽ giúp phát hiện các gen kháng và chọn lọc các cây kháng trong các phép lai trở lên dễ dàng hơn. Cho ựến nay chỉ có gen
Ty-1, Ty-2 và Ty-3 là ựã có marker dựa trên PCR ựược sử dụng phổ biến [34]. Do ựó, những nghiên cứu ban ựầu với mục ựắch chọn tạo giống cà chua kháng virus xoăn vàng lá nên tập trung vào những gen này.