TYLCV
Zamir và cộng sự (1994) ựã ựược lập bản ựồ gen Ty-1 trên nhiễm sắc thể số 6 với các RFLP marker TG297 và TG97 sử dụng các quần thể ựược tao ra từ phép lai giữa dòng mẹ mẫn cảm cảm M82-1-8 S. lycopersicum với accession kháng TYLCV S. chilense LA1969 [35]. Các cây ựồng hợp tử cho các alen từ S.chilense tại TG297 và TG97 là kháng cao và không tạo ra triệu chứng bệnh. Các marker dựa trên locus TG97 liên kết chặt với gen Ty-1 ựã ựược phát triển tại Hebrew University of Jerusalem, Israel.
Hình 2.7. Gen Ty-1 nằm trên NST số 6
(Zamir và cộng sự, 1994) [35]
Hình 2.8. Vị trắ gen Ty-2 trên nhiễm
sắc thể số 11(Hanson và cộng sự, 2000) [24]
Trường đại học Nông nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦ 19
Locus Ty-2 ựã ựược lập bản ựồ trên nhiễm sắc thể số 11 với các RFLP marker TG393 và TG36 sử dụng dòng giống H24 có nguồn gốc từ S. habrochaites như một nguồn kháng [24]. Hiện nay, một số marker dựa trên PCR cho vùng DNA chuyển vào từ S. habrochaites ựã ựược phát triển. CAPS marker TG105A cho thấy khả năng khuếch ựại mạnh và cắt hạn chế sản phẩm PCR bằng enzyme TaqI ựã tạo ra các band ựa hình cho S. habrochaites và S. lycopersicum. Một marker dựa trên PCR khác là T0302 cũng ựược phát triển cho locus Ty-2 mà không phải dùng enzyme giới hạn. Phân tắch liên kết cho thấy TG105A và T0302 liên kết chặt với nhau, khoảng cách của các marker này với gen Ty-2 là xấp xỉ 10 cM [25].
Một locus kháng begomovirus ựã ựược lập bản ựồ ở khoảng giữa marker cLEG-31-P16 và 1079 trên nhánh dài của nhiễm sắc thể số 6, và ựược xác ựịnh là Ty-3. Ji và cộng sự [25] ựã xác ựịnh rằng các locus Ty-3 ựịnh vị trong một khu vực bao gồm locus FER (25 cM, BAC clone 56B23, AY678298). Các trình tự cho các gen G8 của BAC clone 56B23 là khác nhau ựối với các dòng có nguồn gốc từ S. chilense LA2779 và LA1932. để phân biệt hai introgression này, một từ LA2779 ựược chỉ ựịnh là Ty-3 và một từ LA1932 ựược chỉ ựịnh là Ty-3a. Một marker ựồng trội FLUW25 (SCAR marker) ựã ựược báo cáo [25] phát hiện ựược các alen Ty-3 và Ty-3 (có nguồn gốc từ S. lycopersicum), nhưng không phát hiện ựược alen Ty-3a (Ji và cộng sự, 2007c) [27]. để khắc phục vấn ựề này, nhóm tác giả trên ựã phát triển marker ựồng trội P6-25 (SCAR marker) phát hiện ựược các alen Ty-3, Ty-3,
Ty-3a [27]. Khi sử dụng cặp mồi P6-25F2/R5 này ựể sàng lọc một vài giống lai từ các công ty giống thương mại, các tác giả ựã nhận ựược mảnh PCR 660 bp từ 3 giống thương mại, các mảnh này ựược giải trình tự và cho thấy 100% tương ựồng với ựoạn từ S. chilense LA1969. Introgression mới ựược phát hiện có nguồn gốc từ S.chilense LA1969 này ựược gọi là Ty-3b [27].
Trường đại học Nông nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦ 20
Hình 2.9. Gen Ty-3 nằm trên NST số 6 (Ji và cộng sự, 2007b) [26]
Hình 2.10. Gen Ty-4 nằm trên trên NST số 3 ( Ji và cộng sự (2009) [28]
Ji và cộng sự (2009) [28] ựã phát hiện một introgression S. chilense
14 cM trên nhánh dài của nhiễm sắc thể số 3 trong một số dòng giống kháng có nguồn gốc từ LA1932. Sau ựó, một locus kháng begomovirus mới là Ty-4 ựã ựược lập bản ựồ với các marker vào khoảng 2,3 cM giữa C2_A4g17300và C2_A5g60160 trong vùng introgression [28]. Phân tắch quần thể phân ly về locus Ty-3 và Ty-4 ựã chứng minh rằng Ty-3 giải thắch 59,6% biến dị kiểu hình kháng (phenotypic variation), trong khi Ty-4 chỉ giải thắch cho 15,7%, ựiều này gợi ý rằng Ty-4 tạo ra một hiệu lực kháng TYLCV nhỏ hơn. Các dòng tái tổ hợp mang cả Ty-3 và Ty-4 có mức kháng cao hơn với TYLCV [27].
Anbinder và cộng sự (2009) [14] ựã lập bản ựồ một QLT lớn và bốn QLT phụ nhỏ góp phần tạo nên tắnh kháng TYLCV trong dòng giống TY172
Trường đại học Nông nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦ 21
có nguồn gốc từ S. peruvianum. QLT lớn ựược ựặt tên là Ty-5, ựược lập bản ựồ trên nhiễm sắc thể số 4 trong vùng lân cận của marker SINAC1 và chịu trách nhiệm 39.7 - 46.6% biến dị kiểu hình. Các QLT nhỏ, bắt nguồn từ các cha mẹ kháng hoặc mẫn cảm, ựược lập bản ựồ trên nhiễm sắc thể số 1, 7, 9 và 11, và chịu trách nhiệm 12% biến dị trong mức nghiêm trọng triệu chứng, bổ sung cho gen Ty-5 [14].
Hình 2.11. Bản ựồ khoảng cách cM giữa các marker gen Ty-5 trên nhiễm sắc thể 4 [14]