Chương trình 135 giai đoạn II được Thủ tướng Chính phủ phê duyệt vào ngày 10/01/2006 để tiếp tục hỗ trợ cho các xã, thôn bản ĐBKK vùng dân tộc và miền núi phát triển, từng bước thu hẹp khoảng cách giữa các vùng, các dân tộc. Sau 5 năm thực hiện, CT 135 - II được triển khai trên địa bàn của hơn 1.958 xã; 3.274 thôn, bản ĐBKK của hơn 369/690 huyện.
Chương trình đã đạt được những kết quả quan trọng, góp phần phát triển kinh tế - xã hội các xã, thôn, bản ĐBKK vùng đồng bào dân tộc và miền núi. Trong 5 năm, ngân sách Trung ương đã bố trí 14.025,25 tỷ đồng đến nay, giá trị khối lượng hoàn thành đạt 100% vốn giao; vốn đã giải ngân 13.604,5 tỷ đồng, đạt 97,1% vốn giao.
Trong đó, đã bố trí 1.946,86 tỷ đồng hỗ trợ cho 2,2 triệu hộ với 11,8 ngàn tấn giống cây lương thực, 33 triệu giống cây công nghiệp, cây ăn quả, cây đặc sản, gần 300 ngàn con giống gia súc, hơn 1,3 triệu con giống gia cầm, 470 ngàn tấn phân bón hóa học, thuốc bảo vệ thực vật. 6.834 mô hình phát triển nông – lâm – ngư nghiệp, 81.085 máy móc phục vụ sản xuất, chế biến sản phẩm, 911.721 lượt người được tham gia các lớp tập huấn khuyến nông, khuyến lâm, thăm quan, học tập các mô hình sản xuất. Đã bố trí 8.646,07 tỷ đồng để đầu tư xây dựng 12.646 công trình cơ sở hạ tầng. Bố trí 576,16 tỷ đồng để tập huấn đào tạo cho cán bộ các cấp về kiến thức quản lý, tổ chức thực hiện chương trình, đào tạo nghề cho thanh niên.
Các cơ quan Trung ương đã tập huấn cho 3.500 lượt cán bộ từ tỉnh đến huyện tham gia quản lý, chỉ đạo CT 135 - II. Các địa phương đào tạo, bồi dưỡng nâng cao kiến thức quản lý hành chính, kinh tế, quản lý dự án, giám sát cho 178.000 lượt cán bộ xã, thôn, bản; đào tạo, tập huấn cho trên 280 ngàn lượt người dân về nội dung CT 135 - II về tiếp cận và sử dụng vốn tín dụng, kiến thức phát triển kinh tế hộ gia đình, hỗ trợ dạy nghề cho thanh niên dân tộc thiểu số; đã bố trí 1.896,92 tỷ đồng hỗ trợ kinh phí cho 926.326 lượt cháu đi học mẫu giáo, học sinh phổ thông con hộ nghèo bán trú…
Cùng với sự hỗ trợ, giúp đỡ của Trung ương, chính quyền các cấp địa phương và các tổ chức, đoàn thể; cộng đồng, người dân các xã, thôn ĐBKK đã cố gắng, nỗ lực vươn lên thoát nghèo. Sau 5 năm triển khai CT 135 - II, tỷ lệ hộ nghèo các xã, thôn bản ĐBKK giảm từ 47% năm 2006 xuống còn 28,8% năm 2010.