Bộ máy kế toán tại NHCT Hà Nam tổ chức theo mô hình tập trung tại trụ sở chính. Hiện nay phòng Kế toán tài chính tại Chi nhánh gồm 14 người trong đó: có 1 trưởng phòng, 2 phó phòng, 3 giao dịch viên, 2 kế toán thẻ, 1 kế toán bù trừ liên ngân hàng, 1 kế toán nội bộ, 2 hậu kiểm và 2 cán bộ điện toán. Tổ chức bộ máy như vậy nhằm đáp ứng được nhiệm vụ mà ban giám đốc giao cho.
Nhiệm vụ chính của phòng kế toán tài chính là:
+ Thực hiện hạch toán kế toán, hạch toán thống kê và thanh toán theo pháp lệnh kế toán và quy chế hạch toán kế toán của NHNN và của Ngân hàng Công thương Việt Nam.
+ Xây dựng, quyết toán kế toán kế hoạch tài chính quỹ tiền lương của toàn chi nhánh trình NHCT Việt Nam phê duyệt
+ Quản lý, giám sát và thực hiện tốt chế độ chi tiêu tại chi nhánh.
+ Lập, tổng hợp lưu trữ hồ sơ tài liệu về hạch toán kế toán quyết toán và các báo cáo theo quy định.
+ Thực hiện toàn bộ các nghiệp vụ giao dịch thanh toán trong và ngoài nước. + Tiếp nhận, xử lý, giải đáp tất cả các yêu cầu của khách hàng liên quan đến giao dịch kế toán, thanh toán tiền gửi, tiền vay , thẻ và các dịch vụ khác của NHCT
+ Quản lý bảo quản các trang thiết bị thông tin điện toán phục vụ nghiệp vụ kinh doanh theo quy định của NHCT Việt Nam.
+Làm các báo cáo định kỳ theo quy định của NHNN và NHCT và làm các công tác khác do Giám đốc giao.
Tại chi nhánh Hà Nam, mô hình bộ máy kế toán được tổ chức theo mô hình giao dịch “nhiều cửa”. Theo mô hình này kế toán chỉ làm nhiệm vụ kiểm soát chứng từ và hạch toán và sổ sách kế toán theo quy định, tất cảc các giao dịch liên quan đến tiền mặt khách hàng phải nộp (nhận) từ quỹ chính của ngân hàng, khách hàng phải qua nhiều cửa để hoàn thành giao dịch.
Hiện nay trong điều kiện ứng dụng công nghệ hiện đại, NHCT đã thực hiện chương trình hiện đại hoá INCAS, giữa chi nhánh và các phòng giao dịch và với hội sở chính và các chi nhánh trên toàn quốc đều được nối mạng online. Mọi nghiệp vụ bất kỳ phát sinh tại chi nhánh đều được truyền tải, hạch toán và lưu trữ tại máy chủ sở chính và máy chủ tại chi nhánh.