Tình hình hoạt động của tội phạm trong lĩnh vực hoàn thuế những năm qua luôn diễn biến phức tạp, gây thiệt hại nghiêm trọng tài sản của Nhà nước. Tuy nhiên, do làm tốt công tác nắm tình hình và dự báo trước được tình hình, lực lượng Công an thành phố Hồ Chí Minh bước đầu đã thực hiện tốt công tác phòng ngừa và đạt được những kết quả khả quan trong công tác này. Công tác phòng ngừa tội phạm trong lĩnh vực hoàn thuế của Công an thành phố Hồ Chí Minh thời gian qua được thực hiện tốt trên các nội dung cụ thể như:
- Làm tốt công tác tham mưu cho cấp ủy Đảng, chính quyền địa phương trong việc chủ động phòng ngừa tội phạm trong lĩnh vực hoàn thuế trên địa bàn.
Trong những năm qua, công tác phòng ngừa tội phạm trong lĩnh vực hoàn thuế đã tập trung vào việc phát hiện những sơ hở, thiếu sót trong công tác quản lý kinh tế nói chung và quản lý các doanh nghiệp nói riêng. Theo chức năng của mình, lực lượng Công an thành phố trên cơ sở nắm tình hình hoạt động của các doanh nghiệp trên địa bàn đã tham mưu cho Bộ Công an, cho Ủy ban nhân dân thành phố cũng như các cơ quan chức năng có liên quan về những sơ hở, thiếu sót trong công tác quản lý kinh tế, quản lý ngành, quản lý doanh nghiệp để có chủ trương biện pháp khắc phục kịp thời.
- Công tác hướng dẫn, kiểm tra, phối hợp trong phòng ngừa tội phạm trong lĩnh vực hoàn thuế trên địa bàn.
Với chức năng nhiệm vụ của mình, Công an thành phố đã thường xuyên cung cấp trao đổi thông tin cho các đơn vị liên quan, thường xuyên tổ chức tốt công tác phối kết hợp trong
tuyên truyền vận động chính sách pháp luật, trong kiểm tra hoạt động của các doanh nghiệp. Bên cạnh đó, Công an thành phố luôn thực hiện tốt công tác hướng dẫn, kiểm tra, phối hợp trong phòng ngừa tội phạm trong lĩnh vực hoàn thuế giá trị gia tăng.
Tuy nhiên, trong những năm qua, công tác phối hợp, hướng dẫn các cấp, các ngành, các doanh nghiệp trong phòng ngừa tội phạm trong lĩnh vực hoàn thuế của lực lượng Công an vẫn chưa đạt hiệu quả cao, chưa có tính thuyết phục. Chức năng của lực lượng An ninh kinh tế và Cảnh sát kinh tế vẫn còn có sự chồng lấn. Về chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn, mối quan hệ phối hợp giữa lực lượng An ninh kinh tế, Cảnh sát kinh tế, Thanh tra, kiểm tra, Toà án, Kiểm sát, Bộ đội biên phòng, Hải quan, Thuế vụ, Quản lý thị trường trong phòng ngừa tội phạm trong lĩnh vực hoàn thuế chưa được làm rõ, thậm chí còn có những vướng mắc kéo dài gây khó khăn trong hoạt động phòng ngừa tội phạm trong lĩnh vực hoàn thuế của lực lượng Công an. Mặt khác, không ít cán bộ, chiến sĩ do năng lực còn hạn chế, trình độ nhận thức về pháp luật, nghiệp vụ, ngoại ngữ… còn chưa cao, cá biệt có trường hợp còn gây cản trở, phiền hà cho các hoạt động chính đáng của các doanh nghiệp. Có một số trường hợp vi phạm pháp luật, hình sự hóa các quan hệ kinh tế, dân sự hoặc ngược lại nhằm mục đích tư lợi làm giảm lòng tin, uy tín của lực lượng Công an, gây khó khăn cho công tác tổ chức phối hợp trong phòng ngừa tội phạm trong lĩnh vực hoàn thuế.