- Công ty cổ phần Traphaco tiền thân là tổ sản xuất thuốc ty y tế đường bắt được thành lập 28/11/1972 với số lao động là 15 người.
- Năm 1981-1992 với tên xưởng sản xuất thuốc đường sắt. số lao động tăng từ 30 người lên 100 người, trong đó lao động nữ chiếm 85% đến 90%, diện tích hoạt động 817m2 tại văn phòng 75 Yên Ninh-Ba Đình-Hà Nội.
- Ngày 01/06/1993 Xí nghiệp dược phẩm đường sắt (tên giao dịch là Paphco) ra đời, có tư cách pháp nhân, có con dấu riêng tài khoản riêng, hoạt động độc lập theo nghị định 388 của chính phủ. Số vốn hoạt động rất nhỏ, chưa đầy 300triệu đồng Việt Nam, với đội ngũ CNBNV trên 100 người
- Năm 1994 do cơ cấu tổ chức sở y tế đường sắt được chuyển đổi thành sở y tế giao thông vận tải, xí nghiệp dược phẩm đường sắt cũng được đổi tên
thành công ty dược và thiết bị vật tư y tế Bộ giao thông vận tải (tên giao dịch là Traphaco)
- Năm 1999 Công ty đã có dây chuyền sản xuất đạt tiêu chuẩn GMP - ASEAN là đơn vị đầu tiên ở phía Bắc, làp một trong 6 đơn vị đầu tiên trong nước và liên doanh đạt tiêu chuẩn chất lượng của ngành sản xuất dược Việt Nam.
- Công ty là một trong những đơn vị đầu tiên trong ngành dược ở phía bắc và cũng là một trong số các doanh nghiệp đầu tiên của Bộ giao thông vận tải tiến hành nghiên cứu và thực hiện hiện cổ phần hoá thành công.
- Ngày 27/09/1999 công ty nhận được quyết định số 2566/1999 QĐ - BGVT của Bộ trưởng Bộ GTVT chuyển doanh nghiệp nhà nước - Công ty cổ phần dược và thiết bị vật tư y tế Traphaco thành công ty cổ phần với 45% vốn nhà nước.
- Ngày 05/07/2001 Công ty cổ phần dược và thiết bị vật tư y tế Traphaco đổi tên thành công ty cổ phần Traphaco
- Chi nhánh Công ty tại thành phố Hồ Chí Minh được thành lập và đi vào hoạt động tháng 6/2002
- Tháng 3/2003 được xếp hạng doanh nghiệp hạng I
- Tháng 1/2004 Công ty cổ phần Traphaco Khánh thành nhà máy sản xuất thuốc tại Hoàng Liệt - Hoàng Mai - Hà Nội, đạt tiêu chuẩn GMP - WHO, hệ thống kho đạt tiêu chuẩn GSP, hệ thống kiểm nghiệm đạt tiêu chuẩn GLP.
- Tháng 6-2006 Thành lập chi nhánh Miền Trung tại Đà nẵng
- Công ty đã đầu tư lập công ty TNHH Traphaco chuyên cung cấp dược liệu đầu vào.
- Công ty đã đầu tư xây dựng nhà máy và thành lập công ty công nghệ cao Traphaco tại Văn Lâm - Hưng Yên, Chuyên sản xuất các sản phẩm Đông dược.
- Hiện nay công ty đã áp dụng hệ thống quản lý chất lượng theo tiêu chuẩn ISO 9001: 2000; hệ thống quản lý môi trường theo tiêu chuẩn ISO 14001; 2004 vì thực hiện 55.
- Công ty đã có cơ sở vật chất, trang thiết bị kỹ thuật và lực lượng CBNVC đủ tiềm năng để công tác, hợp tác với các tập thể, cá nhân, doanh nhân trong và ngoài nước.
- Ngành nghề kinh doanh
+ Thu mua, gieo trồng, chế biến dược liệu
+ Sản xuất, kinh doanh dược phẩm, hoá chất và vật tư thiết bị y tế + Pha chế thuốc theo đơn
+ Tư vấn sản xuất dược phẩm, mỹ phẩm,
+ Kinh doanh XNK nguyên phụ liệu làm thuốc, các sản phẩm thuốc, các sản phẩm thuốc
+ Sản xuất buôn bán mỹ phẩm
+ Sản xuất buôn bán thực phẩm rượu bia, nước giải khát
+ Tư vấn dịch vụ khoa học kỹ thuật, chuyển giao công nghệ trong lĩnh vực y dược.