(1) Tiếp tục rà soát công việc trùng lặp trong các khâu trước, trong và sau thông quan để đề xuất sửa đổi quy định, quy trình cho phù hợp
(2) Giải pháp đánh giá mức độ tuân thủ pháp luật của doanh nghiệp sau mỗi cuộc kiểm tra sau thông quan:
Cần quán triệt lại cho cán bộ công chức về yêu cầu của công tác kiểm tra sau thông quan là phải đánh giá được sự tuân thủ của doanh nghiệp, chứ không phải là kiểm tra xem có sai hay không sai đối với tưng tờ khai hoặc một số tờ khai. Kết luận của mỗi cuộc kiểm tra trước hết phải kết luận về sự tuân thủ của doanh nghiệp. Mạnh dạn thực hiện kiểm tra doanh nghiệp đến khi loại bỏ hết nghi vấn để khẳng định doanh nghiệp chấp hành tốt
(3) Đẩy mạnh công tác kiểm tra sau thông quan tại trụ sở doanh nghiệp:
Trước tiên cần nhận thức về sự cần thiết của kiểm tra sau thông quan tại trụ sở doanh nghiệp: Có điều kiện hơn để xác minh hồ sơ, thu thập thêm được nhiều thông tin để phục vụ công tác, xác minh dấu hiệu nghi vấn thuận lợi hơn, phát hiện được những lỗi của doanh nghiệp mà nếu kiểm tra tại trụ sở Hải quan thì không thể phát hiện được; Kiểm tra tại trụ sở doanh nghiệp sẽ rút ngắn được thời gian hơn so với kiểm tra tại trụ sở Hải quan; Làm tốt công tác
kiểm tra tại trụ sở doanh nghiệp sẽ làm giảm áp lực của khâu trong thông quan và cũng có tính chất răn đe đối với các doanh nghiệp có ý định gian lận và giảm tiêu cực trong khâu trong thông quan; Có điều kiện tuyên truyền cho doanh nghiệp hiểu rõ về chính sách pháp luật, phát hiện những bất cập, sơ hở trong chính sách, từ đó phản hồi đề xuất khắc phục; Từ công tác này có thể phát hiện thêm được nhiều Công ty chấp hành tốt pháp luật để đưa vào diện doanh nghiệp ưu tiên; Kiểm tra tại trụ sở doanh nghiệp là môi trường đào tạo có hiệu quả nhất cho công chức Hải quan làm công tác kiểm tra sau thông quan nói chung và công tác kiểm tra sau thông quan về phân loại và áp mã hàng hóa nói riêng
Xuất phát từ sự cần thiết đó cần tăng cường công tác kiểm tra sau thông quan tại trụ sở doanh nghiệp: Một trong số các nguyên nhân của tình trạng kiểm tra sau thông quan tại trụ sở doanh nghiệp còn ít có thể là do tâm lý thiếu tự tin. Vì vậy cần chuẩn bi thật kỹ cho mỗi cuộc kiểm tra của đơn vị.