Bên cạnh những điểm mạnh, cơng tác quản lí giáo viên trường THCS Vạn Sơn cịn một số khó khăn, tồn tại:
- Về số lượng giáo viên của trường thì đủ nhưng lại thừa mơn này, thiếu môn khác. Việc tuyển dụng giáo viên theo kế hoạch của UBND quận Đồ Sơn cho biên chế chung tồn quận nên trường khơng chủ động trong việc tiếp nhận giáo viên phù hợp với kế hoạch phát triển của nhà trường.
- Chất lượng đội ngũ giáo viên của trường không đồng đều. Điều đó, được thể hiện ở các mặt sau: năng lực dạy học, giáo dục của một số giáo viên còn yếu, nên việc phối hợp các phương pháp giảng dạy chưa thật linh hoạt, chưa phù hợp với đối tượng học sinh, đơi khi chưa phát huy được tính chủ động, tích cực, sáng tạo của học sinh; một số giáo viên ứng xử sư phạm chưa thật hợp lý, còn cứng nhắc, quá khắt khe, thiếu sự độ lượng, khoan dung hoặc quá dễ dãi, buông xuôi nên hiệu quả giáo dục chưa cao; việc vận dụng các nguyên tắc, phương pháp, hình thức tổ chức giáo dục nhiều khi chưa phù hợp với tình hình thực tế, với tâm sinh lý học sinh hiện nay; việc tự đánh giá, tự học và tự rèn luyện của một số giáo viên còn hạn chế; việc bảo quản, khai thác, sử dụng hồ sơ dạy học ở một số giáo viên chưa đầy đủ theo quy định, chưa khoa học, chưa tạo thành một thói quen tốt hàng ngày.
- Một số giáo viên có sức khỏe khơng đảm bảo, mắc bệnh kéo dài; Một số giáo viên cao tuổi lại ngại tiếp cận công nghệ thông tin, ngại sử dụng các phương tiện hiện đại vào dạy học và chậm đổi mới phương pháp giảng dạy nên chất lượng giáo dục còn thấp hơn so với mặt bằng của tổ, của trường ảnh hưởng đến chất lượng chung của tồn trường.
- Trình độ Ngoại ngữ, Tin học của nhiều GV còn thấp, kiến thức về giáo dục trong nước và quốc tế rất hạn chế, vì vậy chưa đáp ứng được yêu cầu đổi mới giáo dục.
- Cơ sở vật chất của nhà trường còn thiếu, nhất là các phòng chức năng, phịng học bộ mơn, phịng thí nghiệm, thực hành cịn nghèo nàn, lạc hậu.
- Đời sống của giáo viên hiện nay cịn nhiều khó khăn. Cùng chế độ, chính sách cho giáo viên còn nhiều bất cập và mặt trái của nền kinh tế thị trường…, đã tác động tiêu cực tới tư tưởng, tình cảm, ý thức nghề nghiệp; giảm sút ý chí phấn đấu của một bộ phận giáo viên.