Các số đo cần thiết để định loại ký sinh trùng myxosporea

Một phần của tài liệu (LUẬN văn THẠC sĩ) nghiên cứu đa dạng thành phần loài myxosporea (myxozoa) ký sinh trên một số loài cá ở vùng biển ven bờ tỉnh quảng bình (Trang 29)

Nguồn: Lom and Diková (1992) A và B: Myxobolus ở phía trước và ở phía bên; C và D: Henneguya ở phía trước và phía bên; E và F: Myxidium ở phía trước và phía bên; G và H: Chloromyxum ở mặt bên hoặc từ phía đường nối (G) và phía trước (H); I: Kudoa từ phía đỉnh; J: Kudoa ở một trong những điểm phụ có thể là một đường chéo. L:

chiều dài của các bào tử, W: độ rộng của các bào tử, T: độ dày của các bào tử; AL: chiều dài của phụ đuôi, TL: tổng chiều dài của bào tử.

3.5.5. Phương pháp phân tích DNA

3.5.5.1. Phương pháp tách chiết DNA

Mẫu myxosporea được tách chiết DNA tổng số bằng DNeasy Tisue Kit (QIAgen) theo quy trình của nhà sản xuất:

1. Cho 200mg mẫu có chứa các bào tử myxosporea vào trong ống eppendorf

UV-crosslinked 1.5mL.

2. Cho thêm 180 µl buffer ATL, 20 µl Proteinase K vào ống có chứa mẫu mô tách chiết ở bước 1 và đậy nắp. Trộn đều bằng Vortex trong 15 giây. 3. Ủ mẫu ở 56ºC trong 3 tiếng hoặc qua đêm.

4. Lấy mẫu ra khỏi máy ủ, vortex nhẹ; thêm 200 µl buffer Al và vortex. 5. Ủ mẫu ở 70ºC trong 10 phút.

6. Thêm 200 µl cồn tuyệt đối và chuyển toàn bộ dung dụng này lên cột spin. 7. Ly tâm 8000 rpm trong 1 phút, loại bỏ chạy qua.

8. Thêm 500 µl buffer AW1, ly tâm ở 8000 rpm trong 1 phút, loại bỏ dung dịch chạy qua.

9. Thêm 500 µl buffer AW2, ly tâm ở 13000 rpm trong 3 phút, loại bỏ dung dịch chạy qua.

10. Đặt cột spin lên ống ống eppendorf UV-crosslinked 1.5mL, thêm 200 µl đệm AE. Để trong 1 phút và ly tâm ở 8000 rpm trong 1 phút. Dung dịch thu được có chứa DNA tổng số.

3.5.5.2. Phương pháp PCR

Nhân bản trình tự DNA của đoạn SSU rDNA (Small subunit ribosomal DNA - 18S) của các mẫu myxosporea bằng kỹ thuật PCR với hai cặp mồi 18e (5’-CTGGTTGATCCTGCCAGT-3’)-Kud6R (5’-TCCAGTAGCTACTCATCG- 3’) và Kud6F (5’-TCACTATCGGAATGAACG-3’) - 18g (5´- GGTAGTAGCGACGGGCGGCGTG-3´) (Hillis and Dixon, 1991; Whipps et

al., 2003). Thành phần phản ứng PCR gồm: H2O = 37,5 µl, Buffer = 5 µl, dNTP

= 2 µl, Primer xi và ngược = 2 µl , Template = 1,5 µl, Enzyme = 2 µl. Chu trình nhiệt bao gồm các giai đoạn: giai đoạn khởi đầu 95oC biến tính trong 5 phút, tiếp theo là 35 chu trình nhiệt 95oC/30 giây, 51oC/40 giây, 72oC/1 phút, giai đoạn cuối kéo dài 72oC trong 3 phút.

Chuẩn bị gel: cân thạch agarose hòa vào dung dịch TAE 1x. Đun trong lị vi sóng đến lúc agarose tan hoàn toàn. Để nguội đến 60oC, đổ dung dịch vào khuôn gel điện di đã được cài sẵn lược. Sau khoảng 30 - 45 phút, khi gel đã đông cứng, tháo bỏ lược ra khỏi gel và đặt bản gel vào trong bể điện di có chứa dung dịch TAE 1X sao cho bản gel ngập trong dung dịch.

Tra mẫu: trộn sản phẩm PCR với loading buffer 6x theo tỷ lệ 4:1 rồi tra vào giếng điện di.

Điện di: điện thế dùng điện di thường từ 100 - 120V. DNA chuyển từ cực âm sang cực dương. Quan sát sự di chuyển màu của loading buffer để lựa chọn thời gian điện di cho phù hợp để tránh cho mẫu DNA bị chạy ra ngoài.

Nhuộm gel: bản gen chạy xong được nhuộm trong ethidium bromide 0,5µg/ml trong 15 phút có lắc nhẹ. Sau đó chúng sẽ được rửa dưới vòi nước chảy. Soi gel trên đèn UV để đánh giá sản phẩm PCR và chụp ảnh bằng máy ảnh Canon 750D.

3.5.5.3. Phương pháp phân tích số liệu

Sản phẩm PCR rõ băng vạch được gửi đi tinh sạch và giải trình tự tại hãng Macrogen (Hàn Quốc). Dùng chương trình BLAST để so sánh mức độ tương đồng của trình tự thu được với các trình tự trên Genbank. Phân tích mối quan hệ tiến hóa phân tử của các trình tự thu được với các trình tự tương đồng trên Genbank bằng phần mềm MEGA 6 theo phương pháp Neighbor Joining (Tamura et al., 2013).

PHẦN 4. KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN

4.1. KẾT QUẢ

4.1.1. Thành phần loài trùng bào tử sợi myxosporea ở cá biển tại địa điểm nghiên cứu nghiên cứu

Kết quả nghiên cứu trùng bào tử sợi myxosporea ký sinh trên cá biển đã định loại được 14 loài thuộc 6 giống, 6 họ, 2 bộ. Trong đó, 4 lồi được phát hiện mới cho khoa học (Sphaeromyxa n.sp.1, Sphaeromyxa n.sp.2, Myxidium n.sp., Auerbachia n.sp.), 4 loài định loại đến giống (Ceratomyxa sp.1, Ceratomyxa

sp.2, Ceratomyxa sp.3, Ceratomyxa sp.4).

Thành phần loài myxosporea ký sinh được sắp xếp theo hệ thống phân loại như sau:

Ngành CNIDARIA Hatschek, 1888 Phân ngành MYXOZOA Grassé, 1970 Lớp MYXOSPOREA Bütschli, 1881 Bộ BIVALVULIDA Shulman, 1959

Họ SPHAEROMYXIDAE Lom and Noble, 1984 Giống Sphaeromyxa Thélohan, 1892

1. Sphaeromyxa n.sp.1 2. Sphaeromyxa n.sp.2 Họ MYXIDIIDAE Thélohan, 1892 Giống Myxidium Buetschli, 1882

3. Myxidium n.sp.

Họ CERATOMYXIDAE Doflein, 1899 Giống Ceratomyxa Thélohan, 1892

4. Ceratomyxa sp.1 5. Ceratomyxa sp.2 6. Ceratomyxa sp.3 7. Ceratomyxa sp.4

Giống Auerbachia Meglitsch, 1968 8. Auerbachia n.sp.

9. Auerbachia chakravartyi Narasimhamurti, Kalavati, Anuradha, Padma, 1990

Bộ MULTIVALVULIDA Shulman, 1959 Họ TRILOSPORIDAE Shulman, 1959 Giống Unicapsula Davis, 1924

10. Unicapsula andersenae Miller and Adlard, 2013 Họ KUDOIDAE Meglitsch, 1960

Giống Kudoa Meglitsch, 1947

11. Kudoa monodactyli Gunter, Cribb, Whipps and Adlard, 2006 12. Kudoa scomberomori Adlard, Bryant, Whipps and Kent, 2005 13. Kudoa megacapsula Yokoyama and Itoh, 2005

14. Kudoa kenti Burger and Adlard, 2009.

4.1.2. Mơ tả các lồi myxosporea ký sinh trên cá biển vùng biển ven bờ tỉnh Quảng Bình Quảng Bình

Ngành CNIDARIA Hatschek, 1888 Phân ngành MYXOZOA Grassé, 1970 Lớp MYXOSPOREA Bütschli, 1881 Bộ BIVALVULIDA Shulman, 1959

Họ SPHAEROMYXIDAE Lom and Noble, 1984 Giống Sphaeromyxa Thélohan, 1892

4.1.2.1. Lồi Sphaeromyxa n.sp.1

Vật chủ: Cá Bị Paramonacanthus japonicus Nơi ký sinh: Túi mật

Nơi phát hiện: Quảng Bình, Việt Nam Tỷ lệ nhiễm: 6/15

Mô tả:

Plasmodia: Các bào tử trôi nổi tự do trong mật. Bào tử trưởng thành có thể dễ dàng được quan sát bằng kính hiển vi ở độ phóng đại 40x. Bào tử chưa trưởng

thành thường đi sóng đơi với nhau và được bao bọc bởi màng mỏng. Chúng thường bám vào nhau tạo thành một khối lớn chiếm một phần đáng kể trong túi mật của vật chủ.

Bào tử: Bào tử trưởng thành có hình thoi, dạng thẳng, hai đầu của bào tử thẳng, phía bên của bào tử cong. Bào tử có các đường vân chạy dọc và song song với bào tử. Bên trong bào tử có 2 nang cực to nằm ở hai đầu đối diện của bào tử. Nang cực có hình bầu dục và có kích thước bằng nhau. Bên trong mỗi nang cực có chứa sợi nang cực ngắn, cuộn gấp lại trong nang cực khoảng 2 đến 3 nếp gấp. Chất nguyên sinh nằm tập trung ở giữa khoang bào tử giữa hai nang cực (hình 4.1).

Kích thước của bào tử và nang cực được xác định dựa trên kích thước của 25 bào tử khác nhau. Bào tử dài 14,8 ± 0,4 (14,3 - 15,5) µm, rộng 4,4 ± 0,2 (4,2 - 4,7) µm, nang cực dài 4,3 ± 0,2 (3,9 - 4,7) µm, rộng 2,7 ± 0,1 (2,4 - 3) µm. So sánh với các loài khác thuộc giống Sphaeromyxa, mẫu chúng tơi thu được có đặc điểm hình thái gần với lồi S. zaharoni thu từ cá Pterois miles ở Israel (bảng 4.1).

Hình 4.1. Lồi Sphaeromyxa n.sp.1

Bảng 4.1. Bảng so sánh kích thước của một số lồi trong giống Sphaeromyxa (Đơn vị đo: µm)

Lồi Chiều dài bào

tử Chiều rộng bào tử Độ dày bào tử Chiều dài nang cực Chiều rộng nang cực Vật chủ Cơ quan nhiễm Nơi phát hiện S. balbianii (13–16) 5 Gaidropsarus vulgaris Túi mật Pháp

S. bonaerensis 17,33 4,45 4,16 4,08 2,81 Anchoa marinii

Hildebrand Túi mật Argentina S. cannolii 17,6 5,7 4,8 3,0 Hippocampus erectus Ống mật Mỹ S. artedielli 17,8 5,4 5,4 7-10 1,5-2 Artediellus atlanticus Túi mật Na Uy

S. atherinae 14,4-16,8 3,6-4 4-5 2,4-3 Atherina boyeri Túi mật Nga

S. diacanthusa 20,9 5,37 5,1 3,67 Protonibea

diacanthus Túi mật ẤnĐộ

S. japonica (18,5–23,7) (4,3–4,5) (5,0–6,3)

3,8

Triglops scepticus Túi mật Nhật Bản

S. lomi 26,5

(23,0–29,0) (3,5–5,0) 4,1 (7,5–12,0) 9,8 (2,5–4,5) 3,5 Malacocephalus occidentalis Túi mật Borneo

S. magna (22,0–23,8) (5,5–6,4) Liparis gibbus Túi mật Nga

S. schulmani (18,6–20) (4–5,98 (4,65-

5,98)

(2,66–3,32) Salilota australis Túi mật Tây Nam

Đại Tây Dương S. zaharoni 14,5 (13,7–15,1) 4,8 (4,2–5,5) 4,8 (3,3–5,6) 3,4 (2,5–4,0)

Pterois miles Túi mật Israel

S. hellandi (20,8–26) 5,4 5,4 (7–10) (1,5–2) Molva molva Túi mật Na Uy

Sphaeromyxa n.sp.1 14,8 ± 0,4

4.1.2.2. Loài Sphaeromyxa n.sp.2

Vật chủ: Cá Chai Platycephalus indicus Nơi ký sinh: Túi mật

Nơi phát hiện: Quảng Bình, Việt Nam Tỷ lệ nhiễm: 2/3

Mơ tả:

Plasmodia: Các bào tử và plasmodia trôi nổi tự do trong mật. Với số lượng lớn, chúng làm dung dịch mật trở nên mờ đục. Các bào tử trưởng thành có kích thước lớn và hình dạng đặc trưng của giống Sphaeromyxa (phụ lục 1). Các plasmodia có cấu trúc bao gồm các bào tử chưa trưởng thành liên kết với nhau bởi các màng bao bọc chúng tạo thành các đám plasmodia có kích thước lớn trơi lơ lửng trong dung dịch mật. Các bào tử trưởng thành nằm riêng rẽ và phân bố tự do trong dịch mật.

Hình 4.2. Lồi Sphaeromyxa n.sp.2

A-C: Mặt ngang, B-D: Mặt bên; A-B: Bào tử vẽ bằng phần mềm Illustration CS2;C-D: Bào tử tươi chụp dưới kính hiển vi

Bào tử: Bào tử trưởng thành có hình thoi, dạng thẳng vặn 180º ở hai đầu, hai đầu của bào tử phẳng, phía bên của bào tử cong. Bào tử có 6 hoặc 7 đường vân sóng chạy dọc và song song với chiều vặn của bào tử. Bên trong bào tử có 2 nang cực to nằm về hai đầu đối diện nhau của bào tử. Nang cực có dạng hình thoi thon dài và có kích thước bằng nhau. Bên trong mỗi nang cực có chứa sợi nang

cực ngắn, cuộn gấp lại một cách lỏng lẻo bên trong nang cực. Chất nguyên sinh nằm tập chung ở giữa khoang bào tử giữa hai nang cực (hình 4.2).

Kích thước của bào tử và nang cực được đo trên 40 bào tử khác nhau. Bào tử dài 20,7 ± 0,8 (19,4 - 22,1) µm, rộng 5,4 ± 0,3 (4,6 - 5,7) µm, độ dày 5,2 ± 0,3 (4,6 - 5,5) µm. Nang cực dài 7,5 ± 0,6 (6,5 - 9) µm, rộng 2,9 ± 0,2 (2,4 - 3,2) µm.

So sánh với các loài khác thuộc giống Sphaeromyxa, mẫu chúng tơi thu được có đặc điểm hình thái gần với loài S. tuanfengensis thu từ cá Coilia nasus ở Trung Quốc (bảng 4.2).

Phân tích phân tử 2 lồi thuộc giống Sphaeromyxa:

Chiều dài đoạn gen 18S của loài Sphaeromyxa n.sp1 và Sphaeromyxa

n.sp2 lần lượt là 1956 bp và 1967 bp. Kết quả Blast cho thấy trình tự của lồi

Sphaeromyxa n.sp1 tương đồng cao nhất (99%) với trình tự DQ377701 của lồi Sphaeromyxa hellandi ký sinh trên loài cá Molva molva; trình tự của lồi Sphaeromyxa n.sp2 tương đồng cao nhất (99%) với trình tự KF135225 của loài Sphaeromyxa balbianii ký sinh trên cá Gaidropsarus vulgaris.

So sánh khoảng cách di truyền của loài Sphaeromyxa n.sp1 với trình tự của một số lồi trong cùng giống cho thấy chúng có sai khác rất lớn, sai khác ở 138 vị trí nucleotide tương đương 7,1% với trình tự của lồi Sphaeromyxa sp.

(KM201336), sai khác 163 vị trí nucleotide tương đương 8,2% với lồiSphaeromyxa lycodi (KC524734), sai khác 178 vị trí nucleotide tương đương 9,3% với trình tự của lồi Sphaeromyxa kenti (JX443489). Tương tự như vậy,

trình tự của lồi Sphaeromyxa n.sp2 sai khác 110 vị trí nucleotide tương đương

5,8% với loài Sphaeromyxa zaharoni (AY538662), sai khác 132 vị trí nucleotide tương đương 7,8% với lồi Sphaeromyxa longa (KM201344), sai khác 111 vị trí nucleotide tương đương với lồi Sphaeromyxa artedielli (KF135220) và sai khác 207 vị trí nucleotide tương đương với 10,8% với trình tự của lồi Sphaeromyxa kenti (JX443489). Khoảng cách di truyền giữa 2 loài Sphaeromyxa n.sp1 và

Sphaeromyxa n.sp2 là 11% (bảng 4.3).

Phân tích phân tử cho thấy Sphaeromyxa n.sp1 và Sphaeromyxa n.sp2 có quan hệ gần với 2 loài Sphaeromyxa hellandi và Sphaeromyxa balbianii (bảng 4.3, hình 4.3).Tuy nhiên, chúng lại rất khác nhau về hình thái, vật chủ và phân bố. Vì vậy, chúng tơi xác định đây là hai dạng mới cho khoa học.

Bảng 4.2. Bảng so sánh kích thước của một số lồi trong giống Sphaeromyxa (Đơn vị đo: µm)

Lồi Chiều dài bào

tử Chiều rộng bào tử Độ dày bào tử Chiều dài nang cực Chiều rộng nang cực Vật chủ Cơ quan nhiễm Nơi phát hiện S. clini 18,8 5,3 5,0 5,9 2,5 Clinus acuminatus

Túi mật Nam Phi

S. ganapatii 17,5 (16,0–19,0) 4,48 (4,0–4,8) 5,6 (4,0–6,4) 1,6 (1,6–1,8) Terapon jarbua Túi mật Ấn Độ S. lycodi 22,4 (19,6–25,3) 5,7 (4,6–6,9) 5,7 (4,5–6,2) 8,32 (5,8–9,8) 3,3 (2,5–4,5) Lycodes reticulatus Túi mật Iceland S. nesogobii 21,7 (20,5–23,7) 6,6 (6,3–7,9) 7,6 (6,8–7,9) 3,2 (3,1–3,3) Nesogobius sp. Túi mật Úc S. noblei 20 (18,5–21,5) 5,6 (5,2–6) 5 (4,8–5,2) 5,9 (5–6,5) 2,6 (2,5–2,7) Heteroclinus whiteleggii Túi mật Úc S. reinhardti (21,25–23,3) (3,75–5) Engraulis mordax Túi mật Thái Bình Dương S. tuanfengensis 22,22 (20,74–23,80) 5,4 (4,76–6,80) 8,0 (6,9–8,84) 3,6 (3,0–3,9)

Coilia nasus Túi mật Trung Quốc

S. balbianii (13–16) 5 Gaidropsarus vulgaris Túi mật Pháp Sphaeromyxa n.sp.2 20,7 ± 0,8 (19,4 - 22,1) 5,4 ± 0,3 (4,6 - 5,7) 5,2 ± 0,3 (4,6 - 5,5) 7,5 ± 0,6 (6,5 - 9) 2,9 ± 0,2 (2,4 - 3,2) Platycephalus indicus Túi mật Quảng Bình, Việt Nam

Hình 4.3. Cây phát sinh chủng loại xây dựng dựa trên trình tự đoạn 18S của một số lồi thuộc giống Sphaeromyxa

Bảng 4.3. Khoảng cách di truyền giữa các lồi trong giống Sphaeromyxa (dựa trên phân tích trình tự gen 18S) (dựa trên phân tích trình tự gen 18S)

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 1 0.00 2 0.11 0.00 3 0.10 0.01 0.00 4 0.09 0.12 0.12 0.00 5 0.09 0.11 0.11 0.01 0.00 6 0.04 0.11 0.10 0.09 0.08 0.00 7 0.10 0.05 0.05 0.12 0.11 0.10 0.00 8 0.08 0.11 0.11 0.06 0.07 0.08 0.11 0.00 9 0.10 0.07 0.07 0.12 0.11 0.10 0.06 0.11 0.00 10 0.09 0.05 0.05 0.11 0.10 0.10 0.05 0.10 0.03 0.00 11 0.34 0.36 0.35 0.34 0.34 0.34 0.35 0.33 0.34 0.34 0.00 1. Sphaeromyxa kenti JX443489; 2. Sphaeromyxa balbianii KF135225; 3. Sphaeromyxa n.sp2 QB-VN; 4.

Sphaeromyxa hellandi DQ377701; 5. Sphaeromyxa n.sp1 QB-VN; 6. Sphaeromyxa lycodi KC524734; 7. Sphaeromyxa zaharoni AY538662; 8. Sphaeromyxa sp. KM201336; 9. Sphaeromyxa longa KM201344;

10. Sphaeromyxa artedielli KF135220; 11. Ceratomyxa sp. KU726594

Sphaeromyxa balbianii KF135225

Sphaeromyxa n.sp2 QB-VN

Sphaeromyxa zaharoni AY538662 Sphaeromyxa longa KM201344 Sphaeromyxa artedielli KF135220 Sphaeromyxa kenti JX443489 Sphaeromyxa lycodi KC524734 Sphaeromyxa sp. KM201336 Sphaeromyxa hellandi DQ377701 Sphaeromyxa n.sp1 QB-VN Ceratomyxa sp. KU726594 100 100 99 95 50 94 80 100 0.05

Họ MYXIDIIDAE Thélohan, 1892 Giống Myxidium Buetschli, 1882.

4.1.2.3. Loài Myxidium n.sp.

Vật chủ: Cá Dưa xám Muraenesox cinereus Nơi ký sinh: Túi mật

Nơi phát hiện: Quảng Bình, Việt Nam. Tỷ lệ nhiễm: 10/15

Mơ tả:

Plasmodia có kích thước nhỏ từ 3 - 13 µm. Chúng nằm trong dung dịch mật và phân bố khắp túi mật. Bào tử không làm cho dịch mật bị đục, tuy nhiên sự xuất hiện nhiều các plasmodia làm cho dịch mật trở nên vàng hơn.

Bào tử trưởng thành có hình bầu dục và nhọn ở 2 đầu. Bề mặt của bào tử có các đường chạy dọc. Mỗi bào tử chứa 2 nang cực hình trịn và có kích thước bằng nhau. Phần nhọn của nang cực có xu hướng bám về 2 đầu nhọn của bào tử. Bên trong mỗi nang cực có các sợi nang cực. Quan sát trên kính hiển vi ở độ phóng đại 1000x, các sợi nang cực cuộn lại thành 4 đến 5 vịng dọc theo trục của nang cực (hình 4.4).

Hình 4.4. Lồi Myxidium n.sp

Bảng 4.4. Bảng so sánh kích thước của một số lồi trong giống Myxidium (Đơn vị đo: µm)

Tên lồi Vị trí

nhiễm

Kich thước bào tử Kích thước nang

cực

Vật chủ Nơi phát

hiện

Chiều dài Chiều rộng

M. oviforme Túi mật 11 8–8,5 4,5 ×3 Apogon rex mullorum Ý

M. papernae Túi mật 11,4 (9,6-14,4) 7,0 (4,8-8,0)

3,3 (3,2-4,8)

Liza macrolepis Ấn Độ

M. parvoviforme Túi mật 8-11 5,5-7 3 Sciaena hololepidota Nam Phi

M. triangulum Thận 8,0-8,5 5,6-6,6 2,5-3×3,0 Lateolabrax japonicus Hàn Quốc

M. therapon Túi mật 9-12 4 2-3 × 1-2 Therapon carbo,Therapon hillii Anh

M. qiantangense Thận 6,1-6,5 6,5-6,8 4,4-,8 ×2,4 Lateolabrax japonica Trung

Quốc M. melanostigmum Túi mật 23,7 (20,0-26,0) 4,3 (3,0-6,5) 6,5 (5,0-8,0) Melanostigma pammelas Mỹ Myxidium n.sp. Túi mật 15,4 ± 0,8 (13,2-17,3)

6,3 ± 0,3 (5,8-7,2) 3,5 ± 0,2 (3-4,1) Muraenesox cinereus Quảng

Kích thước của bào tử và nang cực được đo trên 30 mẫu. Bào tử dài 15,4 ± 0,8 (13,2 - 17,3) µm, rộng 6,3 ± 0,3 (5,8 - 7,2) µm, bán kính của nang cực là 3,5 ± 0,2 (3 - 4,1) µm. Kết quả so sánh kích thước cho thấy lồi nghiên cứu khác với tất cả các lồi có đặc điểm hình dạng tương đồng (bảng 4.4).

Phân tích di truyền: Trình tự đoạn gen 18S rDNA của bào tử Myxidium

n.sp. trong nghiên cứu này có độ dài 1957 bp. Kết quả BLAST cho thấy trình tự này có độ tương đồng cao nhất (99%) với loài Myxidium coryphaenoideum

(DQ377697). Lồi Myxidium n.sp có khoảng cách di truyền với các loài: Myxidium hardella (AY688957), Myxidium chelonarum (DQ377694), Myxidium baueri (JX467674) là 11% (bảng 4.5; hình 4.5).

Mặc dù mẫu Myxidium thu ở Quảng Bình có quan hệ phân tử gần với loài

Một phần của tài liệu (LUẬN văn THẠC sĩ) nghiên cứu đa dạng thành phần loài myxosporea (myxozoa) ký sinh trên một số loài cá ở vùng biển ven bờ tỉnh quảng bình (Trang 29)