Một số cấp uỷ chưa nhận thức đầy đủ vị trí, tầm quan trọng của cơng tác phát triển đảng viên nói chung và cơng tác phát triển đảng viên ở các xóm chưa có chi bộ, vai trị quan trọng của tổ chức đảng đối với cơ sở. Có cấp uỷ chậm đề ra các kế hoạch, giải pháp, biện pháp cụ thể để chỉ đạo công tác phát triển đảng viên ở những xóm chưa có chi bộ.
Vẫn cịn có một số cấp uỷ đảng và đội ngũ đảng viên chưa nhận thức đầy đủ để thực hiện phương châm, phương hướng, điều kiện, tiêu chuẩn kết nạp và nguyên tắc, thủ tục kết nạp đảng viên theo quy định của Điều lệ Đảng dẫn đến việc tạo nguồn và xét kết nạp người vào Đảng chưa đáp ứng yêu cầu về chất lượng nên gặp nhiều lúng túng trong việc tạo nguồn phát triển đảng viên, hồ sơ thủ tục làm sai phải làm đi, làm lại nhiều lần làm ảnh hưởng đến chỉ tiêu, kế hoạch của tổ chức cũng như thiệt thòi cho bản thân quần chúng xin vào Đảng.
Do đời sống kinh tế của người dân, nhất là ở vùng sâu, vùng xa, khu vực biên giới cịn gặp nhiều khó khăn nên cấp uỷ nhiều nơi cịn coi nhẹ, bng lỏng công tác phát triển đảng, quần chúng chỉ lo phát triển kinh tế, không mặn mà trong việc phấn đấu gia nhập Đảng. Hạn chế về nhận thức chính trị, về trình độ học vấn dẫn đến biểu hiện tự ty, bảo thủ, thiếu sự nỗ lực vươn lên cũng là yếu tố cản trở quá trình phấn đấu của quần chúng ảnh hưởng đến công tác phát triển đảng viên.
Tác động mặt trái của nền kinh tế thị trường đã làm thay đổi nhận thức trong quần chúng nhân dân, nhất là lực lượng thanh niên coi trọng giá trị vật chất, chạy theo lối sống thực dụng nên có những biểu hiện cũng như nhận thức lệch lạc trong việc phấn đấu vào Đảng, không thiết tha phấn đấu, tu dưỡng, rèn luyện trở thành đảng viên.
Ảnh hưởng của yếu tố tôn giáo (Đạo Tin lành mà đồng bào Mông tin theo gọi là “Vàng Chứ”, người Dao đỏ gọi là “Thìn Hùng”) và một số tơn giáo bất hợp pháp khác cũng tác động vào tâm tư, tình cảm của quần chúng nhân dân, nhất là ở những vùng sâu, vùng xa, khu vực biên giới nơi chủ yếu là đồng bào người Mông, người Dao, người Lô Lô, người Sán Chỉ… sinh sống do trình độ nhận thức hạn chế, kinh tế, văn hố, xã hội chậm phát triển lại bị các thế lực thù địch lợi dụng tôn giáo để chống phá, truyền đạo trái pháp luật lợi dụng hoạt động đạo Tin lành, dùng đạo Tin lành để “làm chuyển hoá xã hội”, “Tin lành hoá dân tộc” nhằm tạo ra lực lượng “diễn biến hồ bình” từ bên trong, tuyên truyền tư tưởng ly khai, tự trị, lập “Vương quốc người Mông”… nên cũng đã ảnh hưởng đến việc tạo nguồn phát triển đảng viên.
Một số cấp uỷ vận dụng các văn bản, quy định về công tác phát triển đảng viên cịn máy móc, cứng nhắc chưa vận dụng một cách linh hoạt vào điều kiện cụ thể của địa phương, nhất là đối với vùng đồng bào dân tộc thiểu số, xóm chưa có đảng viên, chưa có chi bộ.