CHƢƠNG 1 : TỔNG QUAN VẤN ĐỀ NGHIÊN CỨU
1.3. Các kỹ thuật xét nghiệm định danh và xác định nồng độ ức chế tối thiểu của
1.3.1. Các kỹ thuật định danh vi khuẩn
Định danh bằng phƣơng pháp API 20: API 20 là một hệ thống chuẩn để định
danh những trực khuẩn ngoài đường ruột, và các Gram Âm dễ ni cấy (ví dụ:
Pseudomonas, Acinetobacter, Flavobacterium, Moraxella, Vibrio, Aeromonas, vv...)
kết hợp giữa 8 test thường quy, 12 test đồng hóa, các thử nghiệm này nhằm xác định các tính chất lên men và xác định các enzyme có mặt trong vi khuẩn. Dựa vào kết quả
của các thử nghiệm và cơ sở dữ liệu của hệ thống API, ta xác định đươc căn nguyên cần tìm.
Hình 1.7. API [20]
Định danh bằng máy tự động VITEK2-compact
Dùng phương pháp đo màu để nhận biết các tính chất sinh vật hố học của vi sinh vật thông qua sự thay đổi màu của các giếng mơi trường có sẵn trong card định danh; máy sẽ giám sát sự phát triển và hoạt tính của vi sinh vật bên trong các giếng của thẻ xét nghiệm. Bộ phận quang học sử dụng ánh sáng nhìn thấy để đánh giá trực tiếp sự phát triển của vi sinh vật. Bộ phận quang học này dựa trên đọc ánh sáng ban đầu của mỗi giếng trước khi bắt đầu có sự phát triển. Máy đọc 15 phút/lần để đo sự phát triển của vi khuẩn trong mỗi giếng. Phần mềm so sánh kết quả thu được với cơ sở dữ liệu để đưa ra kết quả.
Định danh vi khuẩn bằng máy MALDI Biotyper
Nguyên lý: Mỗi lồi sinh vật đều có thành phần các protein trong ribosome rất
đặc trưng cho riêng lồi đó, gọi là dấu ấn phân tử (molecular fingerprint) của loài. Máy MALDI Biotyper sử dụng công nghệ MALDI-TOF MS để gây ion hóa và thu nhận các protein/peptide từ mẫu cần định danh, sau đó biểu diễn chúng ở dạng một phổ khối lượng (hay còn gọi là khối phổ). Bằng cách so sánh khối phổ thu được với các phổ tham chiếu có sẵn trong thư viện dữ liệu, máy MALDI Biotyper sẽ cho kết quả định danh chính xác lồi vi sinh vật.
Phương pháp định danh MALDI TOF MALDI BIOTYPER giúp nâng cao độ chính xác của kết quả xét nghiệm và rút ngắn thời gian định danh từ 8 giờ - 24 giờ xuống còn hơn vài chục giây.