Phát hiện base Xác định một phát hiện base cho mỗi cụm.
Chấm điểm chất lượng Ấn định điểm chất lượng cho mỗi phát hiện base.
Đăng ký
Việc đăng ký sẽ so khớp hình ảnh với mảng hình vng xoay gồm các giếng nano trên tế bào dịng chảy có cấu trúc. Do sự sắp xếp theo thứ tự của các giếng nano, tọa độ X và Y cho mỗi cụm trong một ô được xác định trước. Vị trí cụm được ghi vào tệp vị trí cụm (s.locs) cho mỗi lần chạy.
Nếu bất kỳ hình ảnh nào trong một chu kỳ khơng được đăng ký thành cơng thì khơng có phát hiện base nào được tạo cho ơ đó trong chu kỳ đó. Sử dụng Trình xem phân tích giải trình tự để xác định hình ảnh nào đăng ký khơng thành cơng.
Trích xuất cường độ
Sau bước đăng ký, bước trích xuất cường độ tính tốn giá trị cường độ cho mỗi giếng nano trong một hình ảnh nhất định. Nếu bước đăng ký khơng thành cơng, thì khơng thể trích xuất cường độ cho ơ đó.
Hiệu chỉnh định pha
Trong phản ứng giải trình tự, mỗi sợi ADN trong một cụm kéo dài thêm một base trong mỗi chu kỳ. Định pha và tiền định pha xảy ra khi một sợi trở nên không hợp pha với chu kỳ kết hợp hiện tại.
Định pha xảy ra khi một base rơi lại phía sau.
Tài liệu số 1000000109376 v05 VIE
Chỉ dùng cho mục đích nghiên cứu. Khơng dùng trong các quy trình chẩn đốn.
Tiền định pha xảy ra khi một base nhảy lên phía trước. Hình 5 Định pha và tiền định pha
A. Đoạn đọc có base định pha B. Đoạn đọc có base tiền định pha.
RTA3 hiệu chỉnh các ảnh hưởng của định pha và tiền định pha, tối đa hóa chất lượng dữ liệu ở mỗi chu kỳ trong suốt lần chạy.