Sau đây là các trường [DragenAmplicon_Settings] hiện có và thơng tin mơ tả.
TrườngBắt buộcMơ tả
SoftwareVersion Có Phiên bản phần mềm DRAGEN hiện được cài đặt trên hệ thống. Sử dụng cả ba số ngun có trong tên phiên bản. Ví dụ: 3.5.7.
Phiên bản phần mềm phải khớp với phiên bản được chỉ định trong mục BCLConvert_Settings. ReferenceGenomeDir Có Tên hệ gen tham chiếu. Ví dụ: hg38_alt_aware.
Hệ gen tham chiếu có tại
/usr/local/illumina/genomes. Để sử dụng hệ gen tham chiếu tùy chỉnh, hãy xemTrợ giúp trực tuyến về ứng dụng Reference Builder for Illumina Instruments v1.0.0.
Tài liệu số 1000000109376 v05 VIE
Chỉ dùng cho mục đích nghiên cứu. Khơng dùng trong các quy trình chẩn đốn.
TrườngBắt buộcMơ tả
DnaBedFile Có Tệp bed chứa các vùng cần nhắm mục tiêu. Bạn có thể nhập tệp bed ở định dạng tệp *.txt hoặc *.gz.
DnaGermlineOrSomatic Có Để thực hiện phân tích dịng mầm DNA Amplicon, hãy nhậpgermline(dịng mầm). Để thực hiện phân tích sinh dưỡng DNA Amplicon, hãy nhập
somatic(sinh dưỡng).
KeepFastq Không Để lưu các tệp đầu ra FASTQ, hãy nhậptrue
(đúng). Để xóa các tệp đầu ra FASTQ, hãy nhập
false(sai).
MapAlignOutFormat Khơng Cách định dạng của tệp đầu ra. Các giá trị được phép là bam hoặc cram. Nếu khơng có giá trị nào được chỉ định, giá trị mặc định là khơng có. Sau đây là các trường [DragenAmplicon_Data] hiện có và thơng tin mơ tả.
TrườngBắt buộcMơ tả
Sample_ID (ID_mẫu) Có ID của mẫu. ID mẫu có thể chứa tối đa 20 ký tự chữ và số. ID phân biệt chữ hoa và chữ thường. Phân tách từng mã định danh bằng dấu gạch ngang. Ví dụ: Sample1-DQB1-022515. ID mẫu phải khớp với ID được chỉ định trong mục BCLConvert_Data.
DnaOrRna Có Loại phân tích Amplicon cần thực hiện. Chỉ hỗ trợ phân tích ADN nếu dùng phiên bản DRAGEN v3.8. Nhậpdna.