Sau đây là các trường [DragenRNA_Settings] hiện có và thơng tin mơ tả.
TrườngBắt buộcMơ tả
SoftwareVersion Có Phiên bản phần mềm DRAGEN hiện được cài đặt trên hệ thống. Sử dụng cả ba số ngun có trong tên phiên bản. Ví dụ: 3.5.7.
Phiên bản phần mềm phải khớp với phiên bản được chỉ định trong mục BCLConvert_Settings. ReferenceGenomeDir Có Tên hệ gen tham chiếu. Ví dụ: hg38_noalt_with_
decoy. Sử dụng tên của hệ gen tham chiếu tại
/usr/local/illumina/genomes. Để sử dụng hệ gen tham chiếu tùy chỉnh, hãy xemTrợ giúp trực tuyến về ứng dụng Reference Builder for Illumina Instruments v1.0.0.
RnaGeneAnnotationFile Không Tệp chứa chú giải gen RNA. Chỉ cho phép ký tự chữ và số. Nếu không được cung cấp, tệp chú giải mặc định có trong hệ gen tham chiếu được chỉ định sẽ được sử dụng.
MapAlignOutFormat Không Cách định dạng của tệp đầu ra. Các giá trị được phép là bam hoặc cram. Nếu khơng có giá trị nào được chỉ định, giá trị mặc định là khơng có. KeepFastq Khơng Để lưu các tệp đầu ra FASTQ, hãy nhậptrue
(đúng). Để xóa các tệp đầu ra FASTQ, hãy nhập
false(sai).
DifferentialExpressionEnable Không Để bật biểu hiện gen khác biệt, hãy nhậptrue
(đúng). Nhậpfalse(sai) để loại trừ biểu hiện gen khác biệt khỏi q trình phân tích.
Tài liệu số 1000000109376 v05 VIE
Chỉ dùng cho mục đích nghiên cứu. Khơng dùng trong các quy trình chẩn đốn.
Sau đây là các trường [DragenRna_Data] hiện có và thơng tin mơ tả.
TrườngBắt buộcMơ tả
Sample_ID (ID_mẫu) Có ID của mẫu. ID mẫu có thể chứa tối đa 20 ký tự chữ và số. ID phân biệt chữ hoa và chữ thường. Phân tách từng mã định danh bằng dấu gạch ngang. Ví dụ: Sample1-DQB1-022515. ID mẫu phải khớp với ID được chỉ định trong mục BCLConvert_Data.
Comparison<N> Không Giá trị đối chứng hoặc so sánh cho mỗi mẫu. Nếu khơng có giá trị đối chứng hoặc so sánh cho mẫu thì mẫu đó được chỉ định làna(khơng áp dụng). Tất cả các mẫu được đánh dấu là mẫu chứng sẽ được so sánh với tất cả các mẫu được đánh dấu là mẫu so sánh. Giá trịN phản ánh nhóm so sánh của các mẫu.