Thứ nhất, đội ngũ cán bộ thanh toán quốc tế của Sở giao dịch I NHCTVN hiện nay có trình độ tơng đối cao nhng không đồng đều. Loại L/C đợc mở chủ yếu tại Sở là L/C không huỷ ngang, L/C chuyển nhợng nên khả năng thực hiện thanh toán bằng các loại L/C khác phức tạp hơn nh L/C giáp lng, L/C tuần hoàn,... còn nhiều hạn chế do thiếu kinh nghiệm. Lĩnh vực thanh toán quốc tế nói chung và thanh toán quốc tế theo phơng thức tín dụng chứng từ nói riêng rất phức tạp, để có thể vận dụng hiệu quả, đòi hỏi các thanh toán viên không chỉ giỏi về qui trình nghiệp vụ mà phải có sự am hiểu về thị trờng, về nghiệp vụ bảo hiểm, nghiệp vụ vận tải cũng nh luật lệ, tập quán kinh doanh... của các nhà sản xuất và ngân hàng nớc ngoài. Tuy nhiên, đây cũng là một hạn chế của đội ngũ cán bộ làm công tác thanh toán quốc tế của Sở hiện nay.
Thứ hai, mặc dù trang thiết bị đã đợc cải thiện nhiều trong thời gian gần đây nhng rõ ràng công nghệ hiện tại của Sở vẫn còn nhiều hạn chế. Các chơng trình máy tính là các chơng trình mua của các nớc Đông Nam á, hay bị hỏng hóc, lại thiếu cán bộ tin học giỏi nên việc khắc phục sự cố thờng rất khó khăn. Việc bảo vệ các chơng trình vi tính khỏi sự tấn công của vi rút máy tính cũng cha đợc thực sự coi trọng, do đó có nhiều buổi làm việc bị trì hoãn rất lâu do hệ thống máy tính bị vi rút tấn công không hoạt động đợc.
Thứ ba, công tác điều tra, theo dõi diễn biến của thị trờng, nắm bắt xu hớng phát triển của nền kinh tế và nhu cầu, thị hiếu của khách hàng tuy đã đợc quan tâm phát triển nhng không thờng xuyên, việc chủ động xây dựng kế hoạch tiếp cận khách hàng đã có nhng cha mạnh để có thể đáp ứng kịp thời nhu cầu của khách hàng về vốn cũng nh các dịch vụ thanh toán khác. Thêm vào đó việc theo dõi, phân tích đối thủ cạnh tranh còn diễn ra tự phát.
Thứ t , quy trình thanh toán là nhân tố tác động trực tiếp đến thanh toán theo phơng thức tín dụng chứng từ. Bất kì một sai sót nhỏ nào trong quá trình thực hiện quy trình nghiệp vụ cũng có khả năng dẫn đến rủi ro trong thanh toán. Hơn nữa quy trình thanh toán đơn giản nhng vẫn đảm bảo an toàn, chính xác trong thanh toán sẽ tạo đợc sự hấp dẫn khách hàng. Tuy nhiên quy trình nghiệp vụ thanh toán L/C xuất nhập khẩu đang đợc áp dụng tại Sở, theo em vẫn còn nhiều phức tạp và cha hoàn thiện.
-Hiện nay trong thanh toán L/C xuất khẩu, Sở cha áp dụng hình thức chiết khấu miễn truy đòi. Việc này tuy rằng sẽ đem lại sự an toàn hơn cho ngân hàng nhng sẽ không linh hoạt và ít kích thích khách hàng đến với ngân hàng.
Khi tiến hành mở L/C, việc doanh nghiệp không có đủ tiền để kí quỹ là việc xảy ra thờng xuyên bởi vốn của doanh nghiệp luôn đợc quay vòng để sản xuất, kinh doanh do đó doanh nghiệp phải làm thủ tục vay vốn để kí quỹ hoặc làm cam kết thanh toán. Trong cả hai trờng hợp trên ngân hàng phải tiến hành thẩm định tình hình tài chính của doanh nghiệp xem doanh nghiệp có đủ khả năng thanh toán hay không. Và thời gian doanh nghiệp chờ đợi thủ tục thẩm định của ngân hàng nhiều khi rất lâu, có thể làm gián đoạn quá trình sản xuất, làm mất cơ hội kinh doanh của họ.
Trong trờng hợp tài khoản VND của khách hàng còn đủ để thanh toán cho L/C nhập khẩu, họ phải làm thủ tục uỷ nhiệm chi để trích tiền từ tài khoản tiền gửi VND sang tài khoản kí quỹ mở L/C và làm hợp đồng mua bán ngoại tệ để thanh toán cho L/C đó. Với quy trình nh vậy, số chứng từ xuất trình nhiều thêm và thời gian chờ đợi cũng lâu hơn sẽ tạo cảm giác phức tạp trong quy trình nghiệp vụ đối với khách hàng.