+ Nhận thức về thu hút và quản lý các nguồn vốn FDI tại các địa phương chưa đồng bộ, có khi nóng vội, thiên về lợi ích trước mắt mà chưa tính đến vấn đề chiến lược, một số địa phương khá dễ dãi trong việc cấp phép đầu tư, dẫn đến việc phá vỡ quy hoạch vùng, ngành và gây dư luận không tốt, ảnh hưởng đến lợi ích chung của đất nước. Điều này thể hiện rõ qua một số ví dụ điển hình như nhiều tỉnh lân cận nhau cùng cấp phép cho các dự án cảng biển, dự án thép, bất động sản, khai thác khoáng sản, xây dựng sân golf....hoặc cấp phép cho các dự án không phù hợp, chưa đảm bảo về vấn đề môi trường. Việc hình thành các KCN – KKT và tổ chức thu hút đầu tư ở một số địa phương còn thiếu trọng tâm, trọng điểm.
+ Công tác tổ chức thẩm định dự án chưa nhất quán. Một số địa phương chưa thực hiện việc lấy ý kiến của các Bộ, ngành liên quan trước khi cấp GPĐT đối với lĩnh vực quy định phải có ý kiến của các Bộ, ngành liên quan, hoặc những vấn đề còn tồn tại. Ngược lại có một số địa phương lại không tự quyết định việc cấp GPĐT đối với dự án thuộc thẩm quyền mà tham khảo ý kiến đối với tất cả các trường hợp cấp và điều chỉnh GPĐT, kể cả dự án có quy mô nhỏ và không thuộc lĩnh vực đầu tư có điều kiện.
+ Còn tồn tại tình trạng cấp GPĐT cho những dự án thuộc lĩnh vực đầu tư có điều kiện không đáp ứng điều kiện ràng buộc.
+ Tình trạng áp thuế sai tính chất của dự án như áp thuế ưu đãi rộng hơn quy định của pháp luật và không quy định rõ thời hạn được hưởng ưu đãi thuế.