1.3.2.1.Trình độ quản lý vốn của cán bộ chuyên môn
Hiện nay, trong tổng số 19-23 cán bộ công chức cấp xã (tùy từng loại xã) chỉ có 1 cán bộ về tài chính - kế toán ngân sách xã, nhưng số cán bộ tham gia vào quá trình quản lý, sử dụng nguồn vốn XD NTM thì không phải chỉ có 1 cán bộ mà gồm nhiều cán bộ, bao gồm cả cán bộ xã, cán bộ thôn là những người mà không có chuyên môn về quản lý vốn. Do đó, kết quả xây dựng kế hoạch triển khai sử dụng nguồn vốn Chương trình XD NTM từ NSNN chủ yếu dựa vào năng lực của cán bộ tài chính xã, vì vậy ảnh hưởng rất lớn đến việc tổ chức quản lý sử dụng nguồn vốn Chương trình xây dựng NTM.
1.3.2.2. Việc triển khai tổ chức thực hiện các nguồn tài chính cho Chương trình XD NTM.
Trong quá trình triển khai thực hiện một số ít chủ thể tham gia Chương trình XD NTM, một số người dân thiếu tinh tinh thần trách nhiệm, thực hiện cầm chừng, không đến nơi, đến chốn, chỉ xem đây là vấn đề trách nhiệm của nhà nước và xã hội, do đó đã tác động rất lớn đến kết quả thực hiện sử dụng, quản lý nguồn vốn Chương trình XD NTM từ NSNN.
1.3.2.2. Công tác kiểm tra, giám sát
Công tác kiểm tra, giám sát quá trình sử dụng vốn đã được thực hiện tương đối nghiêm túc. Tuy nhiên, do điều kiện trình độ của cán bộ chuyên môn có mặt còn hạn chế, lơ là trong công tác giám sát, do sự thiếu minh bạch trong quá trình sử dụng nên có một số nguồn vốn chưa được quản lý chặt chẽ...Điều này, ảnh hưởng lớn đến hiệu quả công tác sử dụng vốn để thực hiện chương trình. Ngoài ra, công tác kiểm tra giám sát thiếu thường xuyên
nên dẫn đến một số nơi xảy ra tình trạng nợ đọng đối với một số công trình xây dựng cơ bản (XDCB).