Phương pháp ECD

Một phần của tài liệu (Luận án tiến sĩ) nghiên cứu thành phần hóa học của cây một lá (nervilia aragoana) họ lan trân châu orchidaceae (Trang 43 - 45)

Khi các hợp chất có các tâm bất đối, phương pháp ECD có thể cung cấp một cách tiếp cận hiệu quả để xác định cấu hình tuyệt đối của chúng, bằng cách so sánh phổ của một hợp chất mới chưa biết cấu hình tuyệt đối với phổ của các hợp chất có cấu hình tương tự đã biết. Tuy nhiên, xác định cấu hình tuyệt đối bằng cách dự đoán dấu hiệu của một hoặc nhiều dải trong phổ ECD bằng cách sử dụng các quy tắc thực nghiệm, bán thực nghiệm hoặc phi thực nghiệm có thể là một lựa chọn. Một lựa chọn khác, đã được sử dụng rộng rãi hơn trong 10 năm qua, là so sánh phổ ECD được tính toán và thực nghiệm [55, 57].

Tuy nhiên, việc sử dụng nó khá hạn chế cho đến khi sự tiến bộ lớn trong tính toán ECD của lý thuyết hàm mật độ phụ thuộc thời gian (TDDFT, time-dependent density functional theory) được áp dụng. Nguyên tắc xác định cấu hình tuyệt đối của các hợp chất tự nhiên bằng tính toán ECD tương đối đơn giản, về cơ bản, phổ ECD tính toán được so sánh với phổ ECD thực nghiệm. Nếu hai tập dữ liệu rất giống nhau, thì phép gán thu được có độ tin cậy cao [58].

Tính toán ECD thường bao gồm 2 bước, bước (1) là phân tích cấu trúc của hợp chất để thu được các cấu trạng có thể có, và bước (2) là tính toán UV/ECD TDDFT của mỗi cấu trạng. Phân tích cấu trúc thường được thực hiện bằng các phương pháp Monte Carlo sử dụng cơ học phân tử (MMFF94…) và/hoặc phương pháp bán thực nghiệm (AM1…) để đánh giá năng lượng tương đối của các cấu trạng. Kết quả của các cấu trạng sau đó được tối ưu hóa hơn nữa bằng cách sử dụng các phương pháp DFT trước khi thực hiện các tính toán TDDFT của UV/ECD bằng cách sử dụng các chương trình như Gaussian, TURBOMOLE, hoặc NWChem. Để thu được phổ UV/ECD của các đồng phân, phổ UV/ECD của các đồng phân được lấy trung bình Boltzmann. Sau đó, các phổ UV trung bình được dịch chuyển để phù hợp với phổ UV thực nghiệm và các dịch chuyển tương tự cũng được áp dụng cho phổ ECD được tính toán tương ứng, trước khi so sánh phổ ECD được tính toán với ECD thực nghiệm của hợp chất được đề cập. Các bước tính toán được tóm tắt trong (Hình 1.10) [55, 57, 58].

Một phần của tài liệu (Luận án tiến sĩ) nghiên cứu thành phần hóa học của cây một lá (nervilia aragoana) họ lan trân châu orchidaceae (Trang 43 - 45)

Tải bản đầy đủ (PDF)

(119 trang)