Hiện nay một vài văn bản pháp lý trong lĩnh vực thu và quản lý thu NSNN còn nhiều bất cập, thiết nghĩ Bộ Tài chính nên xem xét và sửa đổi sao cho phù hợp với tình hình thực tế hiện tại.
Ví dụ: Trong thông tư số 328/2016/TT-BTC ngày 26/12/2016 hướng dẫn thu và quản lý các khoản thu NSNN qua KBNN, điểm 2, điều 3 có quy định “về nguyên tắc, các khoản thu NSNN phải được nộp qua ngân hàng hoặc nộp tiền mặt tại KBNN” như vậy khách hàng tới KBNN nộp tiền, KBNN phải có trách nhiệm thu. Trong khi đó, Thông tư số 136/2018/TT-BTC ngày 28/12/2018 sửa đổi, bổ sung một số điều của thông tư số 13/2017/TT-BTC ngày 15/02/2017 của Bộ Tài chính quy định quản lý thu, chi bằng tiền mặt qua hệ thống, Bộ Tài chính quy định “các đơn vị, tổ chức kinh tế có tài khoản tại NHTM thực hiện nộp ngân sách bằng hình thức thanh toán không dùng tiền mặt hoặc nộp bằng tiền mặt tại NHTM để chuyển nộp vào tài khoản của KBNN” (Điểm 1, điều 1). Như vậy có nghĩa là khách hàng là các đơn vị, tổ chức kinh tế không được nộp tiền mặt tại KBNN. Vậy nên Bộ Tài chính nên xem xét sửa đổi thông tư 328/2016/TT-BTC ngày 26/12/2016 phù hợp hơn.
Bên cạnh đó, Bộ Tài chính cũng nên cập nhật các phương thức thu NSNN mới, mẫu giấy nộp tiền vào NSNN, phân định trách nhiệm giữa KBNN và cơ quan thu khi thu NSNN.
Bộ Tài chính cũng nên tăng cường thanh tra, kiểm tra giám sát công tác thu và quản lý thu để tránh sai sót, chiếm dụng NSNN, có biện pháp xử lý với các trường hợp làm sai nhằm nêu gương.