Sự hình thành và phát triển của BHTGVN liên quan trực tiếp đến bối cảnh trong nước và quốc tế.
Bối cảnh trong nước: Trong giai đoạn từ năm 1988 đến năm 1990 hàng loạt hợp tác xã tín dụng đô thị bị đổ vỡ trên toàn quốc gây ra những bất ổn về kinh tế, chính trị và ảnh hưởng nghiêm trọng đến niềm tin của dân chúng đối với hệ thống tài chính - ngân hàng. Khi niềm tin của người gửi tiền giảm xuống, họ có xu hướng không gửi tiền tích lũy tại ngân hàng mà giữ tại nhà hoặc mua vàng tích trữ tại nhà. Điều này gây ảnh hưởng đến quá trình huy động vốn cung cấp cho nền kinh tế. Đứng trước thách thức lấy lại niềm tin nơi người gửi tiền, khi triển khai mô hình Quỹ tín dụng nhân dân theo Quyết định 390/QĐ-TTg ngày 27 tháng 7 năm 1993 của Thủ tướng chính phủ, quy tắc bảo hiểm trách nhiệm của QTDND đối với các khoản tiền gửi có kỳ hạn đã được ban hành. Theo quyết định này, Bảo Việt đã triển khai nghiệp vụ BHTG, đây là khởi đầu của chính sách BHTG tại nước ta. Tuy nhiên, hoạt động BHTG do Bảo Việt thực hiện bộc lộ nhiều hạn chế như thiếu tính chuyên nghiệp, không theo thông lệ quốc tế, không đảm bảo được các điều kiện hoạt động thành công của tổ chức BHTG.
Bối cảnh quốc tế: Cuộc khủng hoảng kinh tế năm 1997 tuy không ảnh hưởng nhiều đến kinh tế Việt Nam nhưng cũng có những tác động nhất định đến hoạt động ngân hàng Việt Nam. Trong giai đoạn này, một số nước ở khu vực Châu Á đã sử dụng các tổ chức BHTG rất hiệu quả để củng cố niềm tin của người gửi tiền, tham gia vào hoạt động tái cấu trúc hệ thống ngân hàng, góp phần vào việc củng cố nền kinh tế. Đồng thời, nhiều quốc gia cũng nhận thấy rằng nếu có tổ chức BHTG thì có thể tránh cho quốc gia của họ những cuộc khủng hoảng tài chính. Hơn thế nữa, cũng trong thời kỳ này hệ thống BHTG trên thế giới phát triển mạnh mẽ và cũng có ảnh hưởng đến Việt Nam.
Với bối cảnh trong nước và quốc tế như vậy, để bảo vệ người gửi tiền và đảm bảo sự phát triển an toàn, lành mạnh của hoạt động tài chính - ngân hàng việc cần có một tổ chức BHTG hoạt động chuyên nghiệp là thật sự cần thiết, đáp ứng được yêu cầu khách quan của thị trường tài chính cũng như toàn bộ nền kinh tế. Vì vậy, trong Khoản 1 Điều 17 Luật các tổ chức tín dụng ban hành năm 1997 đã quy định “Tổ chức tín dụng có trách nhiệm tham gia tổ chức bảo toàn tiền gửi hoặc BHTG”. Đây là cơ sở quan trọng để tổ chức BHTG ra đời. Điều này cho thấy quyết định thành lập tổ chức BHTG của Chính phủ là phù hợp với xu thế của thế giới cũng như tình hình thực tiễn tại Việt Nam.
Đứng trước hiện thực đó, Chính phủ đã ban hành Nghị định số 89/1999/NĐ- CP về BHTG. Tiếp đó, Thủ tướng Chính phủ ký Quyết định số 218/1999/QĐ-TTg ngày 09/11/1999 về việc thành lập BHTGVN. BHTGVN bắt đầu đi vào hoạt động từ ngày 07/7/2000 và là tổ chức duy nhất tại Việt Nam triển khai hoạt động BHTG cho đến thời điểm hiện tại. Ngày 28/11/2002, Văn phòng Chính phủ đã ban hành công văn số 6634/VPCP-QHQT thông báo ý kiến của Thủ tướng Chính phủ cho phép BHTGVN tham gia làm thành viên của Hiệp hội BHTG Quốc tế