Do số lượng doanh nghiệp phát triển với tốc độ nhanh, khối lượng công việc của mỗi cán bộ thuế ngày càng nhiều do đó để đáp ứng được yêu cầu của công việc thì ngoài sự nỗ lực của cán bộ thuế cần có sự hỗ trợ của Bộ tài chắnh và Tổng cục thuế xây dựng phần mềm để phân loại ngay từ đầu theo nguyên tắc phân tắch đánh giá rủi ro những đơn vị tương đối tốt và những đơn vị có dấu hiệu vi phạm theo các tiêu thức nhất định, như căn cứ vào loại hình doanh nghiệp, vào lịch sử vi phạm, vào các chỉ tiêu tăng giảm đột biến trên tờ khai .. , để cán bộ thuế có định hướng tập trung vào danh sách có dấu hiệu vi phạm đã được khoanh vùng để tiếp tục phân tắch đánh giá sâu thì hiệu quả thực sự của công tác kiểm tra giám sát kê khai thuế mới đạt được.
Hoàn thiện hệ thống cơ sở dữ liệu ĐTNT, kết nối toàn diện và được trang bị các công cụ phần mềm khai thác thắch hợp, nâng cao hiệu quả sử dụng, có quy trình hướng dẫn việc tập hợp thu thập, cập nhật lưu giữ và sử dụng cơ sở dữ liệu về thông tin ĐTNT để làm cơ sở cho công tác quản lý thuế nói chung và công tác kiểm tra giám sát kê khai thuế nói riêng.
Bổ sung phần mềm liên thông các phần mềm hiện có: Về cơ bản thì các ứng dụng này hiện nay đã có (BCTC, TTR, QLT, TINCC, QTT, QHS, QLCV,...) tuy nhiên điểm mấu chốt là mối liên thông dữ liệu cơ sở giữa các ứng dụng chưa tốt dẫn đến nhiều số thông tin lại phải nhập lại, không tận
dụng được nguồn dữ liệu đã có. Vắ dụ:
- Quyết định kiểm tra khi ban hành đã được cập nhật vào QLCV, tuy nhiên hiện nay nếu muốn theo dõi quá trình kiểm tra trên TTR thì phải nhập lại quyết định này.
-Thông tin về thời điểm (ngày) công bố quyết định kiểm tra chưa được liên thông sang chương trình QLT để làm cơ sở khóa, không cho phép điều chỉnh, bổ sung hồ sơ khai thuế của doanh nghiệp kể từ thời điểm sau khi quyết định kiểm tra được công bố ghi tại biên bản công bố quyết điịnh kiểm tra.
Xây dựng ứng dụng thực hiện được việc nhận dữ liệu bảng kê hóa đơn, chứng từ hàng hóa, dịch vụ mua vào, bán ra theo tờ khai thuế GTGT để cơ quan thuế làm cơ sở đánh giá, quản lý Người nộp thuế tốt hơn và rất thuận tiện trong đối chiếu xác minh.
Trang bị trang thiết bị hiện đại phục vụ công tác kiểm tra thuế, mỗi cán bộ kiểm tra thuế đều có máy vi tắnh riêng có kết nối mạng toàn ngành để phục vụ công tác tra cứu thông tin.