- Trong giai đoạn trước năm 2018 do KCN Đồng Văn I được hình thành đầu tiên trong các KCN trên địa bàn tỉnh, cơ sở hạ tầng hoàn thiện không đồng bộ, hệ thống xử lý nước thải xuống cấp, dẫn đến tình trạng nước thải không được thu gom, xử lý hết, quy hoạch chưa theo định hướng ưu tiên ngành nghề. Tại KCN này tập trung nhiều nhà máy sản xuất các loại hình đặc thù như sản xuất đồ mỹ ký, sản xuất sợi dây đồng, sản xuất cơ khí, thức ăn chăn nuôi….. nước thải nhiều thành phần độc hại, nguồn nước thải sau xử lý thải ra kênh A48, khí thải có nhiều thành phần vô cơ và hữu cơ khó xử lý gây nên tình trạng ô
nhiễm môi trường và ý kiến của nhân dân. Cho đến giai đoạn hiện nay tình trạng này cơ bản đã được khắc phục nhưng chất lượng nguồn nước mặt kênh A48 chưa đảm bảo quy chuẩn cho phép theo QCVN 08- MT:2015/BTNMT.
- Còn 12 CCN chưa hoàn thiện hệ thống hạ tầng cơ sở, chưa xây dựng và lắp đặt trạm xử lý nước thải tập trung dẫn đến tình trạng các doanh nghiệp thứ cấp trong CCN phải xây dựng công trình bảo vệ môi trường và xử lý chất thải phát sinh, tuy nhiên còn có đơn vị chưa xử lý triệt để, chưa đảm bảo quy chuẩn trước khi thải ra môi trường gây ô nhiễm nguồn nước, ô nhiễm môi trường không khí…
- Các cơ sở chưa chấp hành nghiêm pháp luật bảo vệ môi trường, còn tình trạng né tránh và không chịu bỏ chi phí cho công tác bảo vệ môi trường, chưa đầu tư nguồn nhân lực phù hợp, một số thủ tục hành chính về bảo vệ môi trường như báo cáo vận hành thử nghiệm các công trình xử lý chất thải, báo cáo hoàn thành các công trình bảo vệ môi trường, đăng ký chủ nguồn thải CTNH, chưa ký hợp đồng với đơn vị có tư cách pháp nhân thu gom,xử lý chất thải, công tác báo cáo quản lý CTNH, chứng từ vận chuyển CTNH, nộp phí bảo vệ môi trường đối với nước thải công nghiệp còn chậm…; chưa đầu tư xây dựng, hoặc đã xây dựng nhưng không vận hành thường xuyên công trình bảo vệ môi trường.
- Một vài đơn vị được cấp giấy phép nhập khẩu phế liệu phục vụ cho sản xuất chưa tuân thủ đầy đủ các quy định pháp luật về bảo vệ môi trường, chưa lắp đặthoàn thiện trạm quan trắc tự động đối với khí thải, nước thải, còn tình trạng chưa thu gom quản lý triệt để chất thải rắn, có thời điểm khí thải chưa đảm bảo xử lý đạt quy chuẩn trước khi xả ra môi trường …. Một số cơ sở thuộc đối tượng bắt buộc phải lắp đặt trạm quan trắc tự động đối với nước thải, khí thải nhưng chưa tiến hành đầu tư xây lắp các công trình gây khó khăn cho công tác quản lý.
- Mật độ tham gia giao thông của các phương tiện vận chuyển hàng hóa ra vào KCN, CCN tương đối lớn gây hiện tượng ùn tắc giao thông trên các tuyến đường chính trong KCN Đồng Văn I, II, đường quốc lộ 38, ngã 3 Đồng Sơn xã Liên Sơn…. góp phần gây ô nhiễm môi trường không khí, bụi và tiếng ồn tại các nút giao thông xung quanh các KCN, CCN.
- Các loại chất thải rắn phát sinh bao gồm cả CTNH tại một số cơ sở chưa thu gom, xử lý triệt để cũng góp phần gây ô nhiễm tại một số điểm trong các KCN, CCN.