Nếu vỡ một lý do nào đú mực nước chỉ cũn ở mức 50cm cỏch mặt đất hoặc than bựn thỡ để duy trỡ mực nước này cần liờn tục bơm vào vườn quốc gia với lưu lượng nước tương đương tổng lượng nước bốc thoỏt hơi và nước rũ rỉ mất đi. Hiện tại hệ thống cụng trỡnh quản lý nước ở VQG U Minh Thượng được chia làm 5 phõn khu để quản lý nước( Phõn khu A1, A2, A3, A4 và phõn khu B) đõy là điều kiện thuận lợi cho việc xỏc định nhu cầu nước của mỗi phõn khu để tiến hành bơm giữ ẩm cho vật liệu chỏy.
Để xỏc định được lượng nước bơm phự hợp cho mỗi phõn khu, cần phải xỏc định được lượng nước mất đi ở mỗi phõn khu thụng qua phương trỡnh cõn bằng nước. Theo kết quả nghiờn cứu của PGS.TS Vương Văn Quỳnh tại đề tài KC 08.24-2005 [17] thỡ dạng phương trỡnh cõn bằng nước cho Vườn quốc gia U Minh Thượng như sau:
R=E+S+K+D+I+U (1.12)
E: là lượng thoỏt hơi khỏi tỏn tầng cõy cao; S: là lượng thoỏt hơi nước khỏi tỏn cõy bụi;
K: là lượng bốc hơi khỏi lớp thảm khụ và mặt đất dưới tỏn thảm thực vật;
D: là lượng bốc hơi từ mặt nước tự do; I: là lượng nước rũ rỉ;
U: là biến đổi trữ lượng nước ở VQG trong thời gian nghiờn cứu. Căn cứ vào phương trỡnh cõn bằng nước đề tài KC08.24-2005 đó xỏc định được tổng lượng nước cần bơm vào Vườn quốc gia trong cả mựa chỏy là 25.523.200 m3, tương đương với bề dày lớp nước là 318 mm, trung bỡnh ngày là 180.000m3/ngày, tương đương 2mm/ngày.