Vĩnh Cửu nói chung và khu vực Mã Đà nói riêng là khí hậu nhiệt đới gió mùa cận xích đạo, có hai mùa, với nền nhiệt độ cao đều là điều kiện đảm bảo nhiệt lƣợng cao cho cây trồng phát triển quanh năm. Nhiệt độ bình quân 260C, nhiệt độ tối cao trung bình 280C vào tháng 4, nhiệt độ tối thấp trung bình 24,60C vào tháng 12 và 1. Lƣợng mƣa lớn (2.500-2.800mm/năm), phân bố theo mùa (mùa khô và mùa mƣa) đã chi phối mạnh mẽ nền sản xuất nông lâm nghiệp. Mùa khô kéo dài 6 tháng từ tháng 11 đến tháng 4 năm sau, lƣợng mƣa bình quân: 25,5 mm/tháng, có tháng 1 và 2 hầu nhƣ không có mƣa. Mùa mƣa kéo dài 6 tháng từ tháng 5 đến tháng 10 trong năm, lƣợng mƣa bình quân: 333mm/tháng. Độ ẩm bình quân 83%, tối cao 91% vào các tháng 8 và
9, tối thấp 73% vào các tháng 3 và 4.
Trên địa bàn xã bị phân hoá theo mùa. Mùa khô: kéo dài từtháng 11 đến tháng 6 năm sau, lƣợng nƣớc chỉ xấp xỉ 20% lƣợng nƣớc cảnăm. Mùa khô lƣợng dòng chảy nhỏnƣớc trên sông Đồng Nai xuống thấp, nên khả năng cung cấp nƣớc bị hạn chếđã gây tình trạng thiếu nƣớc cho sinh hoạt và cho nông nghiệp. Mùa mƣa: vào các tháng 7 đến tháng 10 thƣờng xuất hiện lũ, nƣớc trên sông Đồng Nai lớn có năm gây hiện tƣợng ngập úng ở khu vực địa hình thấp thuộc hạlƣu, nhất là những năm mƣa lớn Hồ Trị An xảở mức tối đa.
Hiện tại xã có hồ Trị An với lƣợng nƣớc lớn. Thƣợng nguồn gồm hai nhánh chính là Đa Nhim và Đa Dung. Do sông sâu và dốc nên khảnăng bồi đắp phù sa kém, chỉ xuất hiện giải đất phù sa chạy dọc theo ven triền sông. Phía Bắc xã có Suối Đá, suối Mã Đà, suối Sai, suối Cây Sung, suối Bà Cai và một số suối nhỏ khác, tất cả các suối trong khu vực lâm trƣờng Mã Đà cũ đều chảy theo hƣớng Đông - Tây và đổ ra sông Bé. Bên cạnh đó, trên phạm vi xã có nguồn nƣớc đáng kể từ hồ Trị An với diện tích 285 km2 (trên địa phận huyện xã Mã Đà 160 km2
) dung tích khoảng 2,542 tỷ m3 nƣớc. Trên khu vực đập nƣớc đã xây dựng nhà máy thủy điện Trị An, hồ Trị An vừa cung cấp nƣớc phục vụ nhà máy điện, vừa là cảnh quan sinh thái, vừa là nơi cung cấp thủy sản cho khu vực. Ngoài hồ Trị An còn có hồ Bà Hào, hồ có diện tích 150 ha là cảnh quan sinh thái khi khách tham quan du lịch Chiến khu D.
Theo tài liệu Quy hoạch xã có 02 nhóm chính đó là đất xám và đất đỏ vàng. Nhóm đất xám đƣợc hình thành trên phù sa cổcó địa hình cao bằng thoát nƣớc, tầng đất hữu hiệu dày từ30 đến 100 cm, thành phần cơ giới nhẹ, tỷ lệcát trong đất cao. Đất có màu xám đến xám hơi vàng, địa hình thấp ngập nƣớc đất có màu xám xanh (gley), những nơi mức nƣớc ngầm lên xuống không đều đất bị kết von. Đất nghèo dinh dƣỡng (Mùn, đạm, lân, kali). Đất xám tập trung nhiều trên địa hình đồi bằng lƣợn sóng nhẹ, thoát nƣớc thích hợp với các loại cây hoa màu và cây lâm nghiệp, đồng thời thích hợp với việc sử dụng các mục đích xây dựng, giao thông. Nhóm đất đỏ chiếm diện tích nhỏ, đất bị kết von, tầng đất mịn mỏng, đất chua và nghèo dinh dƣỡng. Khảnăng chỉ bố trí trồng các loại cây lâm nghiệp.
Mã Đà có tài nguyên nƣớc mặt và nƣớc ngầm khá phong phú. Trong đó quan ọ ất là sông Đồng Nai, có ý nghĩa trong việ ấp nƣớ ụ ụ ạ
nông nghiệp và tạo thế cân bằng sinh thái của vùng.