Tổng hợp số liệu của trạm khí tượng Điện Biên Phủ trong 5 năm từ 2015- 2019 cho thấy: huyện Mường Nhé nằm trong khu vực địa lý Tây Bắc thuộc dãy Hoàng Liên Sơn, khí hậu nhiệt đới ẩm gió mùa, có độ ẩm dồi dào và có lượng mưa lớn. Nhiệt độ trung bình năm là 21,60C, lượng mưa trung bình 2.213 mm/năm, độ ẩm bình quân là 82%, tổng tích ôn cả năm từ 7.500 - 8.3900C.
Mùa mưa từ tháng 5 đến tháng 10 chiếm 80 - 90% lượng mưa cả năm tập trung vào các tháng 7, tháng 8 và tháng 9, gió thịnh hành vào mùa này là gió Tây Nam. (gió Lào). Thuận lợi cho sự phát triển của cây lâm nghiệp trong công tác phát triển rừng, tuy nhiên mùa này việc tuần tra kiểm soát lại gặp nhiều khó khăn do lượng mưa lớn, kéo dài gây sạt lở đường và nguy cơ lũ ống, lũ quét.
Mùa khô từ tháng 11 đến tháng 4 năm sau, hầu như không có mưa hoặc mưa rất ít. Hướng gió thịnh hành là gió Đông - Bắc lạnh và khô. Đây là thời điểm bất lợi cho sự phát triển của lây rừng và các loài cây công nghiệp trên địa bàn do thời tiết khô hanh kéo dài, ngày nắng nóng đêm lạnh có xuất hiện sương muối làm chế cây. Thời gian này công tác quản lý bảo vệ rừng khó khăn hơn cả, đặc biệt là công tác phòng cháy, chữa cháy rừng do là mùa khô nguy cơ cháy cao, đặc biệt là thời gian nhân dân đốt nương để chuẩn bị cho vụ mới. Bên cạnh đó tình trạng phá rừng làm nương, lấn chiếm đất rừng cũng gia tăng mạnh trong thời gian này.