Một số nguyên nhân cơ bản dẫn đến công tác thu hồi đất, giải phóng mặt bằng chậm:
- Chế độ chính sách về bồi thường thường xuyên thay đổi, đặc biệt là các văn bản, Quyết định của UBND thành phố còn nhiều mâu thuẫn chưa thống nhất, khó thực hiện đặc biệt là việc xác định loại đất được bồi thường giữa hội đồng bồi thường thành phố và các Sở ban ngành cấp thành phố chưa thống nhất dẫn đến việc lập phương án bồi thường chậm; nhiều phương án đã được phê duyệt nhưng không thể thực hiện được.
- Theo nguyên tắc công tác bồi thường giải phóng mặt bằng phải được triển khai thực hiện trong thời gian chuẩn bị đầu tư (đồng thời việc lập dự án đầu tư), khi khởi công xây dựng thì công tác tác giải phóng mặt bằng phải hoàn tất. Thế nhưng hầu hết các dự án sau khi tổ chức mặt bằng dẫn đến vừa thi công, vừa giải phóng mặt bằng cho nên một số công trình khi vướng mắc về giải phóng mặt bằng phải ngưng thi công hoặc thi công dở dang không triệt để.
- Một số phương án sử dụng vốn ngân sách nhà nước khi phương án được phê duyệt Chủ đầu tư giải quyết kinh phí để chi trả còn chậm, khi có kinh phí thì giá cả bồi thường thay đổi phải lập lại phương án.
- Công tác xây dựng các khu tái định cư phục vụ giải phóng mặt bằng phải được thực hiện trước khi lập phương án bồi thường giải phóng mặt bằng, thế nhưng trong thời gian qua việc chuẩn bị đất tái định cư không được đáp ứng được yêu cầu, có nhiều dự án quá trình thực hiện giải phóng mặt bằng phải dừng lại cho chưa bố trí dược đất tái định cư.
- Việc xây dựng bảng giá đất, tài sản phục vụ công tác giải phóng mặt bằng chưa phù hợp, không sát với thị trường (chỉ bằng 50% đến 70% giá thị trường) cho nên các hộ dân bị ảnh hưởng không chấp nhận, phát sinh nhiều kiến nghị, khiếu nại).