Thực hiện Nghị quyết của Quốc hội nước Cộng hoà xã hội chủ nghĩa Việt Nam, tỉnh Hà Nam được tái lập từ 01/01/1997. Ngày 16/12/1996 Tổng Giám đốc Ngân hàng nông nghiệp Việt Nam ký Quyết định số 515/NHNo-02 về việc giải thể Chi nhánh Ngân hàng nông nghiệp tỉnh Nam Hà, thành lập Chi nhánh Ngân hàng Nông nghiệp tỉnh Hà Nam và Chi nhánh Ngân hàng nông nghiệp tỉnh Nam Định. Khi mới thành lập Ngân hàng nông nghiệp tỉnh Hà Nam chỉ có 04 phòng: Phòng kế hoạch tín dụng, Tổ chức hành chính, Kế toán ngân quỹ, Kiểm soát và bộ phận chuyên trách Ngân hàng phụ vụ người nghèo. Đồng thời Ngân hàng nông nghiệp Hà Nam lúc đó có 05 chi nhánh trực thuộc, gồm Ngân hàng nông nghiệp các huyện: Lý Nhân, Duy Tiên, Thanh Liêm, Kim Bảng, Bình Lục. Ngân hàng nông nghiệp tỉnh Hà Nam có trụ sở tại số 52, đường Trần Phú, phường Quang Trung, thành phố Phủ Lý, tỉnh Hà Nam. Đến năm 1998 theo quyết định của Ngân hàng Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn (NHNo&PTNT) Việt Nam, Ngân hàng nông nghiệp tỉnh Hà Nam đổi tên thành NHNo&PTNT tỉnh Hà Nam.
Đến năm 2001, các phòng NHNo&PTNT tỉnh Hà Nam được thành lập theo đúng tinh thần Quyết định số 169 ngày 17/9/2001 của Chủ tịch HĐQT
NHNo&PTNT Việt Nam.
Những năm vừa qua, NHNo&PTNT Hà Nam đã có những hoạt động tích cực trong việc cơ cấu lại bộ máy quản lý cũng như các phòng ban. Hiện nay, với một mô hình tổ chức hợp lí, ngân hàng đã tập trung vào việc phát huy vai trò và năng lực của từng bộ phận cũng như từng cá nhân trong việc thúc đẩy hoạt động của ngân hàng ngày càng phát triển. Đội ngũ cán bộ được trẻ hoá và có trình độ chuyên môn
cao, nghiệp vụ vững vàng, 75% cán bộ ngân hàng có trình độ đại học trở lên, 100% có trình độ ngoại ngữ và tin học cơ bản.
Hiện nay, mạng lưới hoạt động của NHNo&PTNT Hà Nam hiện nay bao gồm: Hội sở chính, 6 chi nhánh (gồm NHNo&PTNT các huyện Lý Nhân, Duy Tiên, Bình Lục, Thanh Liêm, Kim Bảng và NHNo&PTNT thành phố Phủ Lý), 01 PGD trực thuộc NHNo&PTNT tỉnh và 09 phòng giao dịch trực thuộc NHNo các huyện.
Hiện tai, Hội sở chính của NHNo&PTNT Hà Nam có Giám đốc, 02 Phó giám đốc và 07 phòng nghiệp vụ: Tín dụng, Ke toán và Ngân quỹ, Ke hoạch tổng hợp, Kiểm tra - kiểm soát nội bộ, Hành chính và nhân sự, Dịch vụ và Marketing, Điện toán; hoạt động theo Quyết định số 1377/QĐ/HĐQT-TCCB ngày 24 tháng 12 năm 2007 của HĐQT NHNo&PTNT Việt Nam ban hành Quy chế tổ về chức và hoạt động của Chi nhánh NHNo&PTNT Việt Nam. Về nhân sự, NHNo&PTNT Hà Nam có 291 cán bộ, viên chức; trong đó 60 người tại Hội sở tỉnh chính và 231 người tại các chi nhánh huyện, Thành Phố.