Do tính chất nguy hiểm của bệnh nên từ rất lâu ñã có nhiều nhà khoa học trên phạm vi toàn thế giới ñầu tư công sức nhằm giải quyết bệnh cầu trùng bằng vaccine. Kết quả các nghiên cứu ñã giúp cho một số nước chế ñược vaccine cầu trùng như: Immucoc, coccivac B, D, T, Anticoc,…của Hà Lan, Pháp, Mỹ, Thái Lan, Bungari,..
Tất cả các loại vaccine dù ñược sản xuất ở nước nào ñi chăng nữa ñều là một hỗn hợp kháng nguyên của 3 chủng cầu trùng: E. tenella, E. maxima, E. necatrix. Nói chính xác hơn vaccine cầu trùng là vaccine sống nhược ñộc gồm các nguyên bào tử của 3 chủng cầu trùng ký sinh sâu trong lớp niêm mạc ruột. Hiện nay ngoài 3 chủng Eimeria trên còn có thêm 1 - 2 chủng Eimeria nữa.
Phương pháp sử dụng là cho uống qua ñường miệng lúc gà ñược 7 – 8 ngày tuổi và có thể lặp lại khi gà ñược 15 – 18 ngày tuổi.
Việc dùng vaccine chế từ các chủng có ñộc tính (Coccivac, Immucox) dễ gây ô nhiễm cho cơ sở chăn nuôi và ñưa vào những chủng có thểởñó chưa có. Còn vaccine thu ñược từ những chủng biến ñổi ñã làm giảm khả năng gây bệnh thì an toàn hơn nhưng công nghệ phức tạp hơn và giá thành cao.
Hiện nay các loại vaccine cầu trùng do các nước sản xuất ñang lưu hành tại nước ta ñã có khá nhiều cơ sở chăn nuôi sử dụng. Tuy nhiên việc sử dụng vaccine vẫn còn nhiều bất cập và kết quả thì vẫn chưa ñược như
mong ñợi.
Nhìn chung, vaccine cầu trùng hiện nay còn rất nhiều tồn tại, chưa
ñược sử dụng rộng rãi và chưa mang lại hiệu quả cao thiết thực cho người chăn nuôi.