Công tác tổ chức và quản lý trong hợp tác xã có vai trò quan trọng trong toàn bộ quá trình kinh doanh và ảnh hưởng trực tiếp đến chi phí của hợp tác xã. Nếu kết hợp các yếu tố của quá trình sản xuất - kinh doanh một cách hợp lý, hợp
tác xã sẽ phát triển được sản xuất - kinh doanh, tiết kiệm được chi phí hay nói
cách khác, hợp tác xã sẽ sử dụng có hiệu quả nguyên vật liệu, lao động và tiền
vốn mà hợp tác xã bỏ ra.
Việc bố trí cũng như sử dụng nguồn nhân lực sao cho hợp lý và hiệu quả
nhất là vô cùng cần thiết, nếu năng suất lao động của hợp tác xã tăng lên, sẽ tiết
kiệm được lao động sống, hay tiết kiệm được chi phí tiền lương. Đồng thời tăng năng suất lao động sẽ có điều kiện tăng được thu nhập cho cán bộ, công nhân
viên, tuy nhiên chi phí về tiền lương sẽ phải có tốc độ tăng chậm hơn tốc độ tăng
của năng suất lao động, như vậy mới hợp lý và tiết kiệm được chi phí.
Nếu đầu tư xây dựng nhà xưởng, các cơ sở kinh doanh, mua sắm phương
tiện, các trang thiết bị, công cụ, dụng cụ… trong một giai đoạn nhất định sẽ làm
tăng chi phí của hợp tác xã. Tuy nhiên việc đầu tư hợp lý, máy móc thiết bị tốt sẽ
làm giảm chi phí nguyên vật liệu do sử dụng hiệu quả nguồn nguyên liệu đầu
vào, cũng như công tác bảo quản sản phẩm được tốt hơn có vai trò nâng cao chất lượng sản phẩm và vì vậy sẽ phát huy được tác dụng của việc đầu tư.