Bên cạnh những yêu cầu về trình độ chuyên môn, đội ngũ công chức hành chính nhà nước đang đứng trước những khó khăn rất lớn về kỹ năng thực thi công vụ. Thực tế cho thấy không phải bất cứ công chức nào được đào tạo cũng có khả năng thực hiện tốt công việc được giao.
Kết quả điều tra đánh giá trình độ, năng lực của đội ngũ công chức cấp thành phố qua dự án “Phát triển chương trình và nguồn nhân lực đào tạo cán bộ, công chức địa phương về quản lý kinh tế trong nền kinh tế định hướng thị trường ở Việt Nam” cho thấy, cán bộ công chức hành chính nhà nước còn thiếu hụt những kiến thức và kỹ năng quản lý kinh tế thị trường. Dự án đã đưa ra 10 kỹ năng được đánh giá là quan trọng cần được đào tạo đối với công chức ở địa phương, đó là: 1. Kỹ năng ra quyết định; 2. Kỹ năng thuyết trình; 3. Kỹ năng lãnh đạo; 4. Kỹ năng sử dụng máy tính; 5. Kỹ năng ngoại ngữ; 6. Kỹ năng giải quyết vấn đề; 7. Kỹ năng soạn thảo văn bản; 8. Kỹ năng tổ chức cuộc họp; 9. Kỹ năng làm việc theo nhóm; 10. Kỹ năng giao tiếp. Lý do của sự thiếu hụt về kiến thức và kỹ năng quản lý kinh tế thị trường chủ yếu là thiếu kỹ năng, phương pháp làm việc, khả năng tư duy độc lập hạn chế, ít được tham gia các khoá đào tạo về hành chính nhà nước, kết quả là khi triển khai thực thi công vụ, nhiều công chức còn lúng túng.
Hiện nay, một tình trạng phổ biến rất đáng quan tâm ở Hải Phòng là hiện tượng chậm chễ hoặc không giải quyết thoả đáng về các vấn đề bức xúc trong cơ quan quản lý nhà nước, mà việc quy trách nhiệm thuộc về ai lại rất khó xác định. Mặc dù đội ngũ công chức hành chính nhà nước của thành phố trong những năm gần đây trình độ học vấn, chuyên môn, văn hoá nơi công sở đã tăng lên đáng kể. Nhưng năng lực thực thi công vụ, năng lực quản lý vẫn
chưa đáp ứng yêu cầu thực tiễn công việc. Quá trình ra quyết định trong các cơ quan quản lý nhà nước của thành phố còn mất nhiều thời gian, nhiều văn bản pháp quy không có hiệu lực hoặc chồng chéo, trùng lặp; nghiệp vụ kỹ thuật hành chính còn lạc hậu, nhiều công chức không hiểu rõ vị trí, vai trò, nhiệm vụ và các mối quan hệ phải thực hiện trong công việc cũng như không hiểu rõ chức năng, nhiệm vụ của tổ chức mình đang công tác.