Kho bãi là một bộ phận khơng thể thiếu được trong hoạt động giao nhận vận tải hàng hĩa, đĩ là nơi cất giữ, bảo quản trung chuyển hàng hĩa. Xây dựng một hệ thống kho bãi tiên tiến sẽ hỗ trợ đắt lực cho việc phát triển và nâng cao hoạt động kinh doanh dịch vụ giao nhận như thực hiện nghiệp vụ gom hàng lẻ, tổ chức tốt dịch vụ hậu cần… ; Thành lập khu trung tâm xử lý hàng hĩa để rút ngắn thời gian hàng hĩa đến tay người tiêu dùng.
Hệ thống kho bãi tiên tiến là hệ thống phải được quy hoạch hợp lý bố trí khoa học:
¾ Hệ thống kho phải đạt tiêu chuẩn, tối ưu diện tích sử dụng, được tổ chức xây dựng gần sân bay và phải phù hợp với tính chất lý hĩa học của từng chủng loại hàng hĩa. Qua đĩ hình thành nên các cụm kho chuyên dụng cho việc bảo quản và bảo vệ theo yêu cầu riêng của từng loại hàng như cụm kho chứa hĩa chất; Kho chứa hàng dễ cháy nổ; Kho chứa hàng thực phẩm đơng lạnh, hàng tươi sống; Kho dùng chứa hàng bao, hàng rời, hàng cĩ khối lượng lớn; Kho lạnh dùng chứa hàng thực phẩm, tươi sống… ; Kho dùng chứa hàng cơng nghệ phẩm cĩ giá trị cao, nhất là sản phẩm kỹ thuật, cơ khí, thiết bị đồng bộ…
¾ Kho phải cĩ khả năng nối mạng thơng tin với khách hàng để phục vụ cơng tác kiểm tra, lưu trữ, theo dõi từng lơ hàng từ phạm vi kho đến bất kỳ nơi nào trong nước hay ở nước ngồi trước khi đến tận kho người tiêu dùng, áp dụng kỹ thuật quản trị kho hàng bằng các phần mềm tin học chuyên dùng, kỹ thuật mã vạch như các nước tiên tiến trên thế giới.
Hiện nay kho hàng ở sân bay Tân Sơn Nhất khơng đạt tiêu chuẩn, như đã nêu ở phần trên thì kho khơng cĩ mái che khi cĩ mưa thì nhân viên giao nhận và chủ hàng phải tìm bạt để che lại và đây là điều bức xúc đối với tất cả doanh nghiệp nhưng hiện nay vẫn chưa cĩ dự án nào để nâng cấp hệ thống kho bãi. Doanh nghiệp vận tải cũng như các cơng ty xuất nhập khẩu đang trơng chờ Cục Hàng khơng dân dụng và nhà nước quan tâm cải thiện tình hình kho bãi để nâng cao chất lượng dịch vụ giao nhận vận tải hàng khơng.